主要禾谷类作物比较基因组学研究策略与进展

随着拟南芥、水稻等模式植物基因组测序计划的完成, 比较基因组学作为一门新兴学科, 近年来发展迅速, 为植物基因组的进化、结构和功能研究开辟了新的途径。文章综述了比较基因组学在作物比较遗传作图、基因结构区域的微共线性、ESTs和蛋白质水平的比较以及基于比较基因组学的基因和QTL的克隆等方面内容与研究进展, 分析了不同水平上比较基因组学研究策略的原理、特点、可行性, 以期为利用模式生物的基因和基因组数据、采用比较基因组学策略克隆作物重要性状功能基因、阐明基因组结构与进化提供帮助。     

基于高通量测序的植物群体基因组学研究进展

作为群体遗传学一种新的表现形式,群体基因组学是将基因组概念和技术与群体遗传学理论体系相结合,通过覆盖全基因组范围内的多态位点的分布式样推测位点特异性效应和全基因组效应,从而提升人们对微进化的理解。近年来,随着第二代高通量测序技术的出现和改进,完成基因组测序的植物种类迅速增加,大规模的重测序也随之开展。与此同时,在一些尚未完成基因组测序的植物物种中,也开展了一些平行测序。这些重测序和平行测序极大地促进了群体基因组学的发展,加深了人们对相关植物种群在基因组水平上的遗传多样性、连锁不平衡水平、选择作用、群体历史及复杂性状的分子机理等群体基因组学方面的认识。本文简要介绍了群体基因组学的概念、研究方法等,重点综述了基于高通量测序的植物群体基因组学的研究动态,展望了植物群体基因组学的发展前景并讨论了存在的问题,以期为相关研究提供借鉴和参考。     

细菌比较基因组学和进化基因组学

通过比较不同细菌基因组间差异性与相似性,进而深入研究其分子机理,最终与其表型特征联系起来,是为比较基因组学;不同细菌经过长期进化,其基因组在结构与功能上存在着明显的分化,并构成表型进化的遗传基础,大量细菌全基因组测序的完成,细菌进化基因组学应运而生;以比较基因组学为研究手段,细菌进化基因组学可从基因组水平深入认识物种分化、生境适应、毒力进化、耐药性产生蔓延等表型进化过程。     

金小蜂基因组学研究前沿

金小蜂不仅是重要的昆虫天敌资源,还是理想的模式生物。2010年1月15日,3种金小蜂(丽蝇蛹集金小蜂Nasonia vitripennis、吉氏金小蜂N.giraulti和长角金小蜂N.longicornis)的基因组在《科学》上发表。这一事件标志着金小蜂研究"后基因组时代"的开始。金小蜂基因组测序完成后,科学家们就利用生物信息学、比较基因组学、功能基因组学等方法,基于基因组平台,在进化遗传学、发育生物学、神经生物学、行为学等领域开展了系列研究,取得了重要进展,国际著名杂志《昆虫分子生物学》和《遗传》还以特刊的形式进行刊载。本文就金小蜂基因组学相关研究取得的进展予以扼要概述,并探讨其研究方向和发展前景。     

"中国遗传学会植物遗传和基因组学专业委员会2007年学术研讨会"成功召开

“中国遗传学会植物遗传和基因组学专业委员会2007年学术研讨会”于10月12～14日在位于浙江省金华市的浙江师范大学召开。来自国内外科研院所和高校的170余名专家学者出席了会议。中国遗传学会理事长、中国科学院副院长李家洋院士出席研讨会并致开幕词。浙江师范大学梅新林校长致词表示欢迎与祝贺。会议开幕式由中国科学院遗传发育所所长、     

人类基因组学的新战略：全基因组随机测序

人类基因组学的新战略：全基因组随机测序吴家睿（中国科学院上海生物化学研究所,上海２０００３１）关键词人类基因组ＤＮＡ测序遗传图谱物理图谱人类基因组计划（ＨＧＰ）的战略构想是,以“作图”（Ｍａｐｐｉｎｇ）为测序的基础。也就是说,首先将人类的整个基因组一...     

“《遗传学报》创刊30周年学术研讨会”征文通知

《遗传学报》是中国遗传学会和中国科学院遗传与发育生物学研究所主办、科学出版社出版的高级学术刊物 ,中国自然科学核心期刊 ,全国优秀期刊 ,全国期刊方阵“双百期刊” ,己被美国化学文摘、医学索引等国内外重要检索系统收录 .2 0 0 3年 ,适逢ＤＮＡ双螺旋结构模型发表 5 0周年暨《遗传学报》创刊 30周年 ,为此 ,将隆重举办“《遗传学报》创刊 30周年学术研讨会” .1.主办单位 :中国遗传学会 ,中国科学院遗传与发育生物学研究所 ,东南大学承办单位 :《遗传学报》、《遗传》杂志编辑室 ,东南大学医学院遗传学研究中心2 .大会主席 :中国遗传…     

基因组学与昆虫抗药性研究

主要综述近年来基因组学技术在昆虫抗药性研究中的应用以及取得的新成果、新进展。基因组学是对生物体整个基因组结构、功能及其进化的研究。遗传连锁作图、定位克隆、数量特性位点作图、微阵列分析及转录沉默等 ,是近年来常用的基因组学研究技术。研究表明 ,应用基因组技术不仅能揭示新的昆虫抗药性机制 ,发现并定位、克隆新的抗药性基因 ,还有助于发现新型的杀虫剂作用靶标 ,改进昆虫抗药性的检 (监 )测技术以及加深人们对昆虫抗药性进化的认识等。     

“中国科学院遗传发育所期刊工作会议”在京召开

<正>2010年5月29–30日,"中国科学院遗传发育所期刊工作会议"在北京召开。中国科学院遗传发育所所长、中国遗传学会副理事长兼秘书长、《遗传学报》(JournalofGeneticsandGenomics,JGG)、《遗传》主编薛勇彪研究员主持会议,中国遗传学会副秘书长安锡培、中国遗传学会办公室主任王长城、两刊编辑部全体编辑人员及中国遗传学会办公室相关工作人员参加了会议。     

欢迎订阅《遗传学报》、《遗传》杂志

《遗传学报》、《遗传》杂志是中国遗传学会和中国科学院遗传与发育生物学研究所主办的学术期刊,中文生物学核心期刊,已被美国化学文摘、生物学数据库、生物学文摘、医学索引以及俄罗斯文摘杂志等20余种国内外重要检索系统与数据库收录。刊物内容涉及遗传学、发育生物学、基因组与生物信息学以及分子进化等领域,读者对象为基础医学、农林牧渔、生命科学各领域的科研、教学、开发人员,大学生、研究生、中学生物教师等。     

欢迎订阅《遗传学报》和《遗传》杂志

《遗传学报》、《遗传》杂志是中国遗传学会和中国科学院遗传与发育生物学研究所主办、科学出版社出版的核心期刊,已被美国化学文摘（CA）、生物学数据库（BIOSIS）、生物学文摘（BA）、医学索引（Medical Index）、俄罗斯文摘杂志（AJ）以及NCBI、CABI等20多种国内外重要检索系统与数据库收录。刊登内容包括遗传学、发育生物学、基因组学、细胞生物学以及分子进化。读者对象为基础医学、农林牧渔、生命科学领域的科研与教学人员、研究生、大学生、中学生物学教师等。     

中国遗传学会植物遗传和基因组学专业委员会2005年学术研讨会成功召开

中国遗传学会植物遗传和基因组学专业委员会主办的2005年学术研讨会于6月17～19日在吉林省长春市亚泰国际俱乐部召开。研讨会由中国农业科技东北创新中心、东北师范大学、吉林省遗传学会、中国科学院遗传与发育生物学研究所、植物基因组学国家重点实验室承办。李振声院士主持会议开幕式,中国遗传学会理事长、中国科学院副院长李家洋院士致开幕词。吉林省人大常委会副主任刘淑莹、吉林省科学技术协会副主席戴昕、东北师范大学副校长杨忠教授也分别致词表示祝贺。     

欢迎订阅2014年《遗传》北大核心CSCD

《遗传》杂志是中国遗传学会和中国科学院遗传与发育生物学研究所主办、科学出版社出版的学术期刊,中文核心期刊、中国精品精品科技期刊,已被美国医学索引(MEDLINE)、生物学数据库(BIOSIS)、生物学文摘(BA)、化学文摘(CA)、俄罗斯文摘杂志(AJ)以及NCBI、CABI等20多种国内外重要检索系统与数据库收录。刊登内容包括遗传学、发育生物学、基因组学、分子进化、遗传工程以及生物技术等领域有创新性的研究论文、新技术新方法、学科热点     

《遗传学报》和《遗传》杂志

《遗传学报》、《遗传》杂志是中国遗传学会和中国科学院遗传与发育生物学研究所主办、科学出版社出版的核心期刊，已被美国化学文摘（CA）、生物学数据库（BIOSIS）、生物学文摘（BA）、医学索引（MedicalIndex）、俄罗斯文摘杂志（AJ）以及NCBI、CABI等20多种国内外重要检索系统与数据库收录。刊登内容包括遗传学、发育生物学、基因组学、细胞生物学以及分子进化。读者对象为基础医学、农林牧渔、生命科学领域的科研与教学人员、研究生、大学生、中学生物学教师等。[第一段]     

群体基因组学方法:从经典统计学到有监督学习

群体遗传学的一个主要研究目标是理解突变、自然选择、遗传漂变、群体结构和数量变化等进化力量如何共同影响基因组中的遗传变异.通过分析DNA序列多态数据,可以推测曾经作用于基因组的各种力量,进而探讨生物演化的过程.近年来,随着第二代DNA测序技术的快速革新,群体遗传学进入了基因组学时代,相关的方法在不断发展,并可将群体基因组学方法分为经典统计学方法和新兴的机器学习方法.前者包括经典群体遗传学统计量、单一统计量或多统计量联合检测自然选择、群体历史与自然选择的联合估计以及基于溯祖树和祖先重组图的方法.后者主要基于有监督学习,为群体基因组时代的大数据分析带来了全新范式.本文从理论基础出发,全面回顾了群体基因组学方法发展变化的历程,着重介绍了该领域的最新进展,并就未来的发展方向进行了展望.     

中国遗传学会植物遗传和基因组学专业委员会2005年学术研讨会成功召开

中国遗传学会植物遗传和基因组学专业委员会主办的2005年学术研讨会于6月17—19日在吉林省长春市亚泰国际俱乐部召开。研讨会由中国农业科技东北创新中心、东北师范大学、吉林省遗传学会、中国科学院遗传与发育生物学研究所、植物基因组学国家重点实验室承办。李振声院士主持会议开幕式,中国传学会理事长、中国科学院副院长李家洋院士致开幕词。吉林省人大常委会副主任刘淑莹、吉林省科学技术协会副主席戴昕、     

乳酸菌基因组学研究进展

伴随着高通量测序技术的快速发展和测序成本的降低,越来越多的微生物基因组全序列测定得以实现,从基因组学的层面了解乳酸菌的遗传结构和组成,进而分析和掌握其生物学功能已经逐渐成为可能.迄今为止已经有22株乳酸菌的基因组完成测序并公开发表,还有至少12株测序工作仍在进行中.本文在分析相关文献和生物信息数据基础上,从乳酸菌基因组特点、代谢多样性、进化及共线性四个方面对乳酸菌基因组学研究进展进行了总结,旨在为乳酸菌研究和应用提供参考.     

芸薹属植物基因组学研究进展

芸薹属是十字花科植物300多个属中最为重要的一个属,是我国栽培面积最大的蔬菜作物。拟南芥和芸薹属在十字花科中两者的亲缘关系最近,通过它们之间的比较作图,两者之间的共线性被大量发现。模式植物拟南芥全基因组测序已经完成,这为芸薹属作物的基因组研究提供了便利条件。芸薹属作物的功能基因组学能够进一步明确不同发育时期基因的功能,为解释芸薹属的进化提供基因证据。就芸薹属植物在比较基因组学、功能基因组学最新进展,特别是芸薹属与模式植物拟南芥在基因组之间的相互关系进行了综述。     

《遗传》杂志征稿启事

《遗传》杂志是中国遗传学会和中国科学院遗传与发育生物学研究所主办、科学出版社出版的学术刊物,中国自然科学核心期刊,已被美国化学文摘、生物学文摘、医学索引、俄罗斯文摘杂志和《中国学术期刊文摘》等20余种国内外重要检索系统与数据库收录。在您投稿之前,请了解下列事项:1.征稿范围:遗传学、发育生物学、基因组学等领域有创新性的研究论文;遗传学研究的新技术与新方法;学术讨论、专家论坛以及遗传学热点问题的综述。2.稿件要求:中文稿件请附详细的中英文摘要。题目应简洁明快;名词术语使用规范;蛋白质和基因符号注意正斜体、大小写;…     

重叠群物理图谱的构建及其应用

人类对各种生物的基因组结构和功能的研究都需要确定DNA序列在染色体上的位置.与遗传图相比,物理图反映了基因或DNA标记之间在染色体上的真实距离.依其作图方法分为三类,即限制性酶切图谱、重叠群图谱和DNA序列图谱.重叠群物理图是将获得的大片段克隆,如YAC、BAC克隆,依其在染色体上的真实顺序排列而成,主要应用于基因组测序、重要基因的图位克隆、靶分子标记开发及比较基因组学研究等,特别是为那些由于缺乏合适的作图群体而不能建立遗传图的物种提供了一个重要的从事基因组学研究的平台.本文综述了近年来重叠群物理图构建研究的主要进展,比较分析了不同重叠群物理图谱构建方法的特点,提出了改进物理作图质量的建议,认为应根据基因组不同区域的特点,综合特异性探针的杂交、PCR筛选、酶切指纹分析、BAC克隆STC延伸、BAC末端测序等多种方法才能完成重叠群的构建.此外,物理图的构建还应努力整合各种基因组的资源和数据,如遗传连锁图、分子细胞遗传图、DNA序列图、EST数据等,这将有助于提高其在基因组学研究中的使用价值及应用范围.文章最后对重叠群物理图的发展趋势进行了展望.