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实验采用AFLP的荧光标记分析技术和常规的AFLP银染技术,对施用农药和未施用农药的狼蛛基因多态性进行分析.用4对引物扩增和银染法共检测出32条带,荧光标记技术共检测出223条带.荧光技术比银染方法在每个位点上多检测到24条带,检测效果更为理想,更适于进行遗传多样性分析和研究;对两种方法的费用和工作效率做了初步分析,AFLP荧光标记技术的检测效率是银染法的690倍,同时对AFLP荧光标记技术中低成本、高通量多重PCR体系的建立及Genescan软件数据分析中出现的一些具体问题进行了探讨. 相似文献
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本文简述AFLP分子标记的原理、方法与特点,并综述其在植物遗传多态性及系统发育学研究、基因定位及高密度遗传图谱(或物理图谱)构建和品种鉴定及抗性育种特征性状的分子标记中的应用现状和前景。 相似文献
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伯乐树(Bretschneidera sinensis Hemsl.)是主要分布于中国的濒危物种。采用AFLP分子标记对分布于中国11个省的24个伯乐树居群192个个体进行谱系地理学研究。结果显示,伯乐树有相对较高的遗传多样性水平,基因多样性指数(He)和Shannon指数(Ⅰ)分别为0.2728和0.4070。伯乐树居群间的遗传分化远大于居群内遗传分化,遗传分化系数GST=0.7138,基因流Nm=0.2005。通过聚类分析、STRUCTURE分析和BAPS分析发现,24个伯乐树居群可形成4大地理居群组和进化谱系;云贵高原东部地区居群遗传多样性较高,可能是伯乐树在中国的扩散中心和冰期避难所,伯乐树在冰期后由此向外进行居群扩散;南岭地区各居群遗传多样性水平普遍高于其他地区,与邻近地区各居群的亲缘关系较近,可能为伯乐树演化历史上的另一个冰期避难所。 相似文献
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用RAPD和AFLP的方法对中国卤虫(Artemia)种及亲缘关系的研究 总被引:18,自引:0,他引:18
利用RAPD(随机扩增多态DNA)和AFLP(扩增片段长度多态性)技术对不同种及种群卤虫的关系进行分析。 101个随机引物对4种卤虫Afranciscana、A urmiana、A sinica和A.parthenogenelica基因组DNA进行扩增,平均每个种获得751条带,其中458条带为多态性标记,每个引物提供平均74个标记信息,聚类结果表明A.sinica是不同于其他旧大陆两性生殖卤虫的一个独立的种。对来自 15个种及品系的卤虫的 AFLP分析显示了非常好的遗传多态性,采用 12对引物检测到 594条带,其中 480个为多态性标记。聚类结果表明来自西藏的两性生殖卤虫为不同于中国内陆两性生殖卤虫的新种。而孤雌生殖卤虫在进化过程中可能是多源的,中国内陆和沿海的孤雌生殖卤虫是沿着不同的途径进化的,内陆和沿海的孤雌生殖卤虫可能为不同的种。 相似文献
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51个春兰(Cymbidium goeringii)品种的AFLP遗传多样性分析 总被引:1,自引:0,他引:1
为了揭示春兰品种的遗传多样性和亲缘关系,为春兰种质资源的有效利用和开发提供依据,采用AFLP技术对51个春兰品种进行了遗传多样性分析,经筛选得到了8对条带清晰、多态性高的引物,共扩增出1315条DNA片段,其中多态性条带为1217条,平均1对引物扩增条带164条,多态性带152条,多态性位点频率为92.5%,表明春兰品种具有丰富的遗传多态性。49个品种含有特有带。51个品种间遗传相似系数变化范围为0.501~0.716,聚类分析表明,51个春兰品种共分为5个类群,来自同一地区的品种并没有聚在一起,表明春兰品种的遗传背景混乱。AFLP分子标记技术能有效地分析春兰品种的遗传多样性和亲缘关系。 相似文献
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AFLP(扩增性片段长度多态性)是一种新的DNA分子标记。与RFLP、RAPD相比,AFLP具有在一次试验中可同时观察到大量的限制性片段的优点。本文阐述了AFLP的原理和方法,综述了AFLP目前在植物遗传育种研究中的应用进展,并对AFLP技术在植物遗传育种中的应用前景提出了初步设想。 相似文献
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扩增片段长度多态性(AFLP)——一种新的分子标记技术 总被引:40,自引:0,他引:40
AFLP(扩增性片段长度多态性)是一种新的DNA分子标记。与RFLP、RAPD相比,AFLP具有在一次试验中可同时观察到大量的限制性片段的优点。本文阐述了AFLP的原理和方法,综述了AFLP目前在植物遗传育种研究中的应用进展,并对AFLP技术在植物遗传育种中的应用前景提出了初步设想。 相似文献
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糙皮侧耳(Pleurotus ostreatus)的AFLP指纹图谱分析 总被引:7,自引:0,他引:7
在对糙皮侧耳(Pleurotus ostreatus)的AFLP分析条件进行优化的基础上,利用该技术建立了14株产自不同地区的糙皮侧耳:DNA指纹图谱,并进行了数据分析。结果表明,在合成的14条引物的不同组合中,引物对E-3/M-3可以产生较多的DNA多态片段,E-AGC/M-CAT引物对的扩增效果最好,共获得184条DNA扩增带,其中多态性条带i101条,占54.89%。利用UPGMA法对所获数据进行聚类分析,计算得到糙皮侧耳菌株之间的遗传距离,发现不同品种间遗传距离差异较大,从0.192到0.754,说明糙皮侧耳的遗传多样性比较丰富。绘制的指纹分析树状图表明,14个糙皮侧耳菌株被分为6个组群,其中P17和杂3的相似性系数最高,达到了81.2%,而侧5与其他菌株的亲缘关系相对最远。 相似文献
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Grabowska-Joachimiak A Kwolek D Kula A Marciniuk P 《Cytogenetic and genome research》2012,137(1):70-77
The object of this work was to analyze the karyotype structure of Rumex thyrsiflorus using differential fluorescent methods of chromosome staining (C-banding/DAPI and CMA(3)/DA/DAPI) and molecular sex markers. The results obtained were compared with data on the structure of the sex chromosomes and autosomes in R. acetosa, a model species in studies of sex determination and sex chromosome evolution in plants with an XX/XY(1)Y(2) system. A high level of similarity was found in the sex chromosome structure of the 2 species, along with small differences in their autosomal complexes. It suggests that differentiation of these 2 closely related species was not accompanied by major structural changes within their sex chromosomes. Molecular tests, however, revealed differences in the composition of male-specific repetitive sequence RAYSII, occurring in the Y(1) chromosome. Amplification of this sequence showed the presence of a single product (~700 bp) in R. acetosa and of 2 products (~600 bp and ~700 bp) in R. thyrsiflorus. The longer product (~700 bp) was also revealed in R. arifolius, another species closely related to R. acetosa. The shorter DNA fragment, characteristic of R. thyrsiflorus, differed from the common product by of a large indel with a length of 110 bp. This fragment may serve as a species-specific molecular marker useful in taxonomical and population studies as well as in further research on the sex chromosome differentiation in R. thyrsiflorus. 相似文献
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红花玉兰与玉兰亚属几个种亲缘关系的AFLP分析 总被引:1,自引:0,他引:1
应用AFLP分子标记技术对红花玉兰与玉兰亚属几个种之间的亲缘关系,以及红花玉兰的分类地位进行了分析。9对引物对7个玉兰种的36个代表样株进行选择性扩增,共得到扩增谱带874条,其中多态性谱带635条。分析结果表明:各玉兰种间,红花玉兰与白玉兰、武当木兰的遗传相似度较高;玉兰亚属种间基于AFLP分析的聚类结果与形态学对种的划分基本吻合。红花玉兰不仅形态上与其它玉兰种有明显区别,AFLP分子标记也支持红花玉兰为一个独立的新种,多瓣红花玉兰变种与红花玉兰原变种为一个种。 相似文献
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西瓜(Citrullus lanatus (Thunb.) Mansf.)种质资源的鉴定与评价是对其有效利用的基础.以往的研究表明, 西瓜是一种遗传资源特别狭窄的作物,在用同工酶、RAPD及SSR技术对西瓜种质资源进行鉴定时,发现很难将品种完全区分开来.本研究利用高效可靠的AFLP技术,对30个西瓜核心种质材料进行了遗传分析,最终建立了这30个材料的DNA指纹图谱.在该图谱中,每个材料均有其独特的"指纹",材料之间可以相互区分开来.为了进一步利用AFLP分子标记,将重要抗病种质材料"PI296341"的AFLP特异带转化成了生产上可以直接利用的SCAR标记. 相似文献
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DNA测序中常见影响因素的研究 总被引:1,自引:0,他引:1
对测序中的模板、引物、测序反应条件及测序反应纯化方法和仪器操作等进行研究。结果显示测序模板的纯度影响测序的质量 ,浓度对测序的长度有影响。引物设计时除符合一般设计原则外 ,Tm值最好在5 0℃~ 6 0℃之间 ,且无成串的G、C。改变变性、退火、延伸的时间和温度对特殊DNA模板的序列测定有较好的效果。测序反应产物的纯化有几种方法 ,以 70 %乙醇沉淀法最经济、方便。因此模板的纯度和浓度对测序成功与否起决定作用。最佳反应条件可降低成本 ,提高测序成功率 ,乙醇沉淀法是首选的测序反应产物纯化方法。仪器操作熟练、正确与否也会影响测序结果。 相似文献
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短蛸AFLP分子标记分析体系的优化与建立 总被引:3,自引:0,他引:3
本研究构建了短蛸扩增片段长度多态性(AFLP)分析体系,对DNA提取、双酶切反应、连接反应、预扩增反应、选择性扩增反应和银染等步骤进行了分析。得到了一种适于短蛸AFLP技术分析的优化体系,该体系中各优化因素为:模板DNA浓度为200 ng/μL;酶切体系中,MseI和EcoR I各加入5 units,缓冲液使用MseI buffer Tango,反应时间为3-4 h;连接最适反应时间为12 h;预扩增产物最适稀释倍数为20倍。该体系的构建为AFLP技术在短蛸分子遗传多样性研究中的应用奠定了基础。 相似文献
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萝卜品种指纹图谱SRAP与AFLP分析
总被引:1,自引:0,他引:1应用SRAP与AFLP两种分子标记技术进行了萝卜品种鉴定分析。对萝卜基因组DNA的SRAP-PCR反应体系中引物、Mg2+、dNTPs浓度进行优化,确定最优体系为引物0.3 μmol·L-1,dNTP 0.2 mmol·L-1,Mg2+ 3.0 mmol·L-1。对SRAP-PCR中的退火温度(50℃)设置了12个梯度处理,以em2-me2为引物时带型无明显差异。7个供试萝卜材料的SRAP和AFLP指纹图谱分析表明,供试材料均可被SRAP和14个AFLP引物准确鉴定,每对引物组合都产生独特的指纹图谱。11个SRAP引物组合共产生155条带,多态性条带84条。聚类分析与相对遗传距离(GD)表明,供试材料聚为4类,CB-03-2与SHCB-02-1亲缘关系最近(GD=0.054 9);齐虹大连和Heiseng的亲缘关系最远(GD=0.203 4)。基于16个AFLP标记引物组合分析结果表明,供试材料聚为3类, CB-03-2和SHCB-02-1的亲缘关系最近。SRAP与AFLP综合分析结果表明,供试材料可聚为3类,其中CB-03-2与SHCB-02-1亲缘关系最近(GD=0.047 6)。 相似文献