呼吸窘迫综合征新生儿肠道菌群的改变

探究呼吸窘迫综合征新生儿肠道菌群的改变,为该类患儿的治疗提供参考。

选取我院2020年4月至2022年4月收治的83例呼吸窘迫综合征新生儿作为试验组,另选我院同期健康新生儿83例作为对照组,收集两组对象粪便标本。对比两组对象肠道菌群的变化情况。

与对照组相比,试验组患儿肠道菌群Chaol指数和Shannon指数显著降低,Ace指数显著升高,差异均有统计学意义（均P＜0.05）。两组对象肠道厚壁菌门、变形菌门、链球菌属相对丰度对比差异均有统计学意义（均P＜0.05）。

呼吸窘迫综合征新生儿肠道菌群改变较大。

     

不同健康状况百岁老人肠道菌群的差异性

探索广西不同健康状况百岁老人肠道菌群的特征。

采用1∶1病例对照研究方法,在广西长寿地区按年龄收集不同健康状况的21对百岁老人粪便和血样标本,同时收集个体一般信息和食物摄入信息;使用标准量表测量身体机能和认知功能（MMSE）,测定血生化指标,采用16S rRNA的V4–V5区序列进行高通量测序分析肠道菌群的差异。

非健康组百岁老人较健康组百岁老人肠道菌群丰度和多样性显著降低（t = 3.987、4.000、3.703,均P＜0.001）;健康组百岁老人肠道菌群中蓝藻菌门（Cyanobacteria）、黏胶球形菌门（Lentisphaerae）丰度显著高于非健康组,拟杆菌门（Bacteroidetes）丰度显著低于非健康组;健康组百岁老人肠道菌群中别样杆菌属（Alistipes）、瘤胃球菌属（Ruminococcus）、气味细菌属（Odoribacter）、厌氧菌属（Anaerotruncus）、丁酸单胞菌属（Butyricimonas）丰度显著高于非健康组;非健康组百岁老人肠道菌群中拟杆菌纲（Bacteroidia）、拟杆菌目（Bacteroidales）、拟杆菌种（Bacteroides coprophius）丰度显著高于健康组;非健康组百岁老人身体机能、MMSE评分显著降低（t = 2.775、2.058,P = 0.008、0.046）。

广西不同健康状况百岁老人肠道菌群丰度和多样性具有显著特征,健康状况良好的百岁老人可能具有更好的肠道菌群构成。

     

口服益生菌对根治性放疗宫颈癌患者放疗相关性腹泻及肠道菌群的影响

评价口服益生菌预防根治性放疗宫颈癌患者放疗相关性腹泻（RE）的有效性,并探讨益生菌对根治性放疗宫颈癌患者肠道菌群的影响。

选取2020年1月—2022年12月于广西医科大学附属肿瘤医院妇瘤科行根治性放化疗宫颈癌患者46例,随机分为口服益生菌组（OP组）和非口服益生菌组（NOP组）,每组各23例。采集两组放疗前后粪便标本,通过16S rDNA测序检测肠道菌群,分析肠道菌群多样性和组间的菌群差异。

OP组RE发生率为8.7%,NOP组RE发生率高达47.8%,两组差异具有统计学意义（P=0.009）。口服益生菌能够增加放疗病人肠道菌群丰富度,但不能逆转肠道菌群α−多样性下降（P=0.012）。放疗前后肠道菌群β−多样性差异不显著（P＞0.05）。物种丰度分析显示放疗后肠道菌群在门、科、属、种水平的组成均发生改变;特别是腹泻患者与非腹泻患者比较：放疗前惰性乳杆菌相对丰度较高,但在放疗后惰性乳杆菌相对丰度较低。

宫颈癌患者根治性放疗期间口服益生菌可有效预防放疗相关性腹泻的发生。放疗影响肠道菌群的组成,特别是显著降低肠道厌氧菌的相对丰度。

     

双相情感障碍患者健康状况与肠道菌群的相关性分析

探讨双相情感障碍（BD）患者健康状况与肠道菌群的相关性,为该类患者的治疗提供参考。

收集我院BD患者（BD组）和健康人群（健康对照组）的粪便样本,使用QIAamp^® DNA粪便抽提试剂盒进行粪便样本的总DNA提取,随后进行16S rRNA基因测序,使用主成分分析（PCoA）探究健康对照组和BD组患者肠道菌群多样性情况。采用BD患者自我报告健康问卷评估患者的健康状况。

BD患者肠道菌群Shannon指数（P = 0.020 5）、Chao指数（P = 0.025 1）和Simpson指数（P = 0.020 8）显著低于健康对照组（均P＜0.05）。加权的Unifrac PCoA分析表明,BD组患者肠道菌群相似性低于健康对照组。两组对象肠道菌群门水平上有差异的菌群为放线菌门和厚壁菌门;属、种水平上的差异菌群有普氏粪杆菌、梭状芽胞杆菌和瘤胃球菌属。两组对象在功能性身体健康（PCS）、心理健康（MCS）、睡眠质量（PSQI）、抑郁（PHQ-9）、焦虑（GAD-7）和狂躁（ASRM）的平均总成绩上差异均有统计学意义（均P＜0.05）。BD患者的功能性身体健康得分与肠道放线菌门、厚壁菌门、拟杆菌属、梭状芽胞杆菌呈负相关,与普氏粪杆菌以及瘤胃球菌属呈正相关。

健康对照组和BD组患者的肠道菌群结构大致相似,BD患者的肠道菌群多样性低于健康对照组,BD患者健康状况与肠道菌群存在一定的相关性。

     

人体肠道菌群对二甲基亚砜的体外降解作用——

通过二甲基亚砜（DMSO）与肠道菌群相互作用机制的研究,为DMSO的降解及其在药物研究中的应用提供肠道菌群方面的理论依据。

采用分批发酵、气相色谱、气质联用和高通量测序技术研究DMSO的降解量与肠道菌群结构间的关系。

发酵液中主要检测到甲硫醚、二甲基砜、二甲基二硫醚及甲基硫代磺酸甲酯等DMSO相关代谢产物;与其他他汀相比,生理浓度氟伐他汀组菌群的DMSO降解效果最佳,可能与Proteobacteria及Solobacterium和Escherichia-Shigella等菌群的相对丰度增加有关。不同肠道菌群产二甲基硫醚（DMS）水平差异明显,DMS分解可能与硫代谢途径相关,涉及的微生物主要是Desulfovibrio。

人体肠道菌群可降解DMSO,其降解效率可能与Escherichia-Shigella的相对丰度有关,降解产物对人体肠道菌群结构无影响。

     

急性胃肠功能损伤患者肠道菌群及其代谢产物的分析

分析重症患者合并急性胃肠功能损伤（AGI）的肠道菌群变化的特征。

采用观察性研究方法,选择2021年1月至2022年12月本院重症监护病房收治的患者36例,根据是否发生AGI分为AGI组（n = 18）和non-AGI组（n = 18）,记录入科时患者急性生理与慢性健康状况评分Ⅱ和序贯器官衰竭评估评分,测定患者入科时超敏C反应蛋白、降钙素原以及第1次粪便样本的乙酸、丙酸、丁酸的水平,通过16S rDNA测序分析粪便样本的菌群多样性,比较两组患者肠道菌群差异。

AGI组患者肠道乙酸、丙酸、丁酸水平较non-AGI组显著降低,差异均有统计学意义（均P＜0.05）。AGI组患者肠道菌群alpha多样性显著低于non-AGI组。在细菌门分类水平上,两组患者肠道菌群差异无统计学意义;属水平比较,AGI组患者肠道菌群中肠球菌属、埃希—志贺菌属的相对丰度显著高于non-AGI组（均P＜0.05）,non-AGI组中双歧杆菌属相对丰度显著升高（P＜0.05）。

合并AGI重症患者肠道代谢功能失衡,菌群结构发生改变,为益生菌辅助治疗重症患者提供一定临床研究依据。

     

基于高通量测序分析哮喘小鼠呼吸道菌群的变化

通过高通量测序分析哮喘模型小鼠呼吸道菌群的变化情况。

将12只SPF级BALB/c雄性小鼠随机分为对照组和模型组, 每组6只。采用卵清蛋白致敏方法建立哮喘小鼠模型后, 进行支气管组织切片病理学观察, ELISA法检测血清IgE水平, 测定肺指数, 采集咽拭子后提取DNA行高通量测序分析。

与对照组比较, 模型组小鼠血清IgE水平明显升高(P < 0.05), 肺指数明显上升(P < 0.05), 可见支气管上皮粘膜有水肿, 少量淋巴细胞浸润, 平滑肌增生。模型组小鼠呼吸道菌群与对照组比较, 菌种丰度升高, 厚壁菌门较对照组减少(P < 0.05), 放线菌门和变形菌门增多(P < 0.05), 菌群结构有明显差异。

哮喘小鼠存在呼吸道微生态菌群失衡。

     

当归提取物对慢性湿疹小鼠相关菌群的影响

观察当归提取物对慢性湿疹的治疗作用。

将昆明小鼠采用2,4-二硝基氯苯诱导慢性湿疹模型,取30只8周龄SPF级昆明小鼠按随机数表法分为正常空白组、湿疹模型组以及当归高、中、低剂量治疗组,每组6只。空白对照组、湿疹模型组小鼠给予生理盐水,其他各治疗组小鼠给予高、中、低剂量的当归提取物灌胃。比较各组小鼠右耳肿胀程度、两耳质量、小鼠左右耳中部厚度、搔抓次数及耳组织病理学变化,采用16S高通量测序观察肠道菌群变化。

相比湿疹模型组,当归提取物能减轻湿疹小鼠耳肿胀程度（P＜0.01）;随着当归提取物浓度的增加,小鼠搔抓指数及耳厚度均显著减小（均P＜0.01）,两耳质量趋于一致,肠道厚壁菌门水平逐渐恢复且趋于空白对照组。HE染色结果显示,当归提取物治疗后小鼠耳组织表皮角化、水肿、淋巴细胞浸润及真皮血管扩张充血等病理现象均有不同程度缓解,测序结果显示慢性湿疹小鼠相关的肠道菌群随当归治疗出现一定程度的变化。

当归提取物对小鼠慢性湿疹模型具有一定的治疗作用,对相关菌群有一定的恢复作用,且可能成为慢性湿疹的主要治疗药物。

     

高摄入红肉通过改变肠道菌群加重小鼠溃疡性结肠炎

观察高摄入红肉对小鼠肠道菌群及溃疡性结肠炎（ulcerative colitis,UC）的影响,并探讨可能的发生机制。

40只Balb/c小鼠随机分为4组：对照组、高红肉组、DSS组和高红肉+DSS组,每组10只小鼠,对照组、DSS组小鼠给予普通饲料,高红肉组、高红肉+DSS组小鼠给予高红肉饲料,均饲养8周;此8周的最后9天开始对DSS组、高红肉+DSS组小鼠给予3% DSS诱导UC。采用实时荧光定量PCR检测小鼠肠道菌群,采用体质量变化、疾病活动指数及HE染色指标评价小鼠UC严重程度,运用Western Blot方法检测小鼠肠道巨噬细胞M1型极化的特征细胞因子。

与对照组相比,高红肉组小鼠肠道厚壁菌门、粪杆菌属及普拉梭菌的丰度显著降低,拟杆菌门、拟杆菌属的丰度显著升高。与DSS组相比,高红肉+DSS组小鼠体质量显著下降,疾病活动指数显著升高,结肠组织病理评分显著升高;与DSS组相比,高红肉+DSS组小鼠TNF-α、IL-1β及IL-6细胞因子表达显著升高。

高摄入红肉导致肠道菌群改变加重小鼠UC。

     

圈养食叶猴的肠道菌群特征

充分认识圈养食叶猴的肠道菌群组成特征, 为饲养管理方法的改进提供参考依据。

通过MiSeq高通量测序平台对3个物种的19个个体[黑叶猴(n=5)、川金丝猴(n=9)和西非黑白疣猴(n=5)]的肠道菌群16S rRNA V4-V5区进行测序和分析。

食叶猴肠道菌群以厚壁菌门和拟杆菌门为优势菌门, 瘤胃菌科、普氏菌科、理研菌科和毛螺菌科为优势菌科, 普氏菌属、密螺旋体属和瘤胃球菌属为优势菌属; 食叶猴物种间肠道菌群组成存在显著差异, 肠道菌群按照宿主物种聚类, 而不受环境因素的影响。

宿主物种是决定肠道微生物组成的重要因素, 食叶猴肠道菌群特征反映了宿主对其食性的适应。

     

血液恶性肿瘤患者肠道菌群分析

目的 将血液恶性肿瘤患者肠道菌群与健康个体进行比较,观察血液肿瘤患者肠道菌群结构的变化,探讨肠道菌群与血液恶性肿瘤发生发展的联系。方法 收集血液恶性肿瘤患者与健康志愿者粪便样品,提取样品中菌群总DNA,然后通过变性凝胶梯度电泳（DGGE）技术分析肠道菌群多样性和差异性。结果 血液恶性肿瘤组与健康组肠道菌群的DGGE指纹图谱有明显差异。与正常组相比,患者组肠道大肠埃希菌呈现过度增长趋势,有益菌柔嫩梭菌减少或缺失,某些患者肠道内一些细菌呈现特异性增长,如粪肠球菌、硫磺肠球菌、约氏不动杆菌等。结论 与健康对照组相比,血液恶性肿瘤患者肠道菌群结构与多样性发生改变,这可能为血液恶性肿瘤早期抗感染提供实验依据。     

ERIC-PCR指纹图谱技术分析糖尿病小鼠肠道细菌群落变化

目的通过比较1型糖尿病模型组和空白对照组雄性小鼠肠道菌群结构的变化,探索糖尿病造模与肠道菌群的关系。方法收集造模2周后空白对照组(n=5)、STZ造模成功组(n=5)和造模不成功组(n=3)ICR小鼠的新鲜粪便样品,提取粪便样品的总DNA,ERIC-PCR扩增形成DNA指纹图谱,借助多变量统计分析方法研究各组样品肠道菌群结构上的异同。结果ERIC-PCR指纹图谱结合偏最小二乘法(PLS-DA)分析表明造模成功组和造模不成功组小鼠的肠道菌群结构显著区别于空白对照组,而造模不成功组小鼠的肠道菌群结构与造模成功组仍有一定的区别。结论STZ诱导的1型糖尿病会造成小鼠的肠道菌群结构的变化,而部分小鼠造模失败可能与这些小鼠的肠道菌群结构有关。     

两种饲料对巴马香猪肠道菌群多样性的影响

目的研究正常混合饲料和玉米面对巴马香猪肠道菌群多样性的影响。方法使用PCR-DGGE技术研究其肠道菌群的多样性,16SDNA测序技术研究其差异性。结果食用同种饲料的巴马香猪DGGE谱带相似性较高,同时存在个体差异;2种饲料食养的巴马香猪肠道菌群丰富度和多样性指数差异无显著性,而均匀度差异有极显著性;16SDNA测序显示,混合饲料组和玉米面组的特异性菌种分别为 Coprococcus eutactus.Clostridium bartlettii 和 B ifidobacterium animalis subsp.Streptococcus infantarius subsp 。结论不同饲料可导致巴马香猪肠道菌群产生差异。     

口服肝素与小鼠肠道菌群的相互作用

口服肝素药物的开发需要系统地理解口服肝素与肠道菌群之间的互作过程。通过荧光体视镜观察荧光素标记的肝素经小鼠口服后在体内的分布情况,利用高效液相色谱法检测肝素在模拟胃肠液中的稳定性和体外培养肠道菌群模拟肠道菌对肝素的降解作用,发现口服肝素主要分布在小鼠胃肠道内,在体外模拟胃肠液条件下肝素结构稳定,但能够被添加肝素的厌氧培养基培养后的肠道菌群降解。为了进一步揭示口服肝素对健康小鼠肠道菌群的影响,利用Illumina MiSeq高通量测序技术测定口服肝素后C57BL/6J小鼠粪便菌群的16S rRNA序列,与口服生理盐水的小鼠粪便菌群进行对比,发现口服肝素的小鼠粪便菌群的生物多样性降低;在门水平上,菌群结构差异不显著;而在属水平上,别样杆菌属Alistipes、副萨特氏菌属Parasutterella和艾克曼菌属Akkermansia相对丰度增高,而嗜胆菌属Bilophila、肠杆菌属Enterorhabdus、瘤胃梭菌属Ruminiclostridium、普雷沃氏菌科Prevotellaceae_UCG_001、瘤胃梭菌属Ruminiclostridium-9、拟杆菌属Bacteroides、Lachnoclostridium、Candidatus_Saccharimonas、Intestinimonas和Dubosiella的相对丰度减少,表明口服肝素能够影响小鼠肠道菌群结构。此外,实验发现口服肝素对小鼠无明显毒副作用,具有较高安全性。研究结果将为开发肝素口服递送策略提供新的思路,为口服肝素类药物的开发提供参考。     

不同生长阶段舜皇山土猪肠道微生物组成与多样性

目的 挖掘肠道微生物在舜皇山土猪耐粗饲及抗病等方面的作用,为舜皇山土猪的饲养与保护以及益生菌的开发提供理论依据.方法 采集3个生长阶段的舜皇山土猪粪便样品,各4～5组,进行16SrDNA V3-V4区基因高通量测序,分析其微生物的组成及多样性.结果 舜皇山土猪肠道微生物主要由拟杆菌门(Bacteroides)、厚壁菌门...     

Microbial treatment in chronic constipation

Chronic functional constipation is a kind of common intestinal disease that occurs in children, adults and elderly people. This disease not only causes great influence to physiological function, but also results in varying degrees of psychological barriers. At present, constipation treatments continue to rely on traditional methods such as purgative therapy and surgery. However, these approaches can disrupt intestinal function. Recent research between intestinal diseases and gut microbiota has gradually revealed a connection between constipation and intestinal flora disturbance, providing a theoretical basis for microbial treatment in chronic constipation. Microbial treatment mainly includes probiotic preparations such as probiotics, prebiotics, synbiotics and fecal microbiota transplantation (FMT). Due to its safety, convenience and curative effect, probiotic preparations have been widely accepted, especially gradually developed FMT with higher curative effects. Microbial treatment improves clinical symptoms, promotes the recovery of intestinal flora, and has no complications during the treatment process. Compared with traditional treatments, microbial treatment in chronic constipation has advantages, and is worthy of further promotion from clinical research to clinical application.     

性激素变化对小鼠肠道菌群构成的影响

肠道菌群在维持宿主免疫和消化系统功能方面发挥着重要作用,肠道菌群的多样性和丰富度是衡量宿主健康状况的重要生理指标。性激素对动物生长发育发挥重要作用,但其对肠道菌群构成影响的相关实验研究相对较少。本研究以模式生物小鼠（Mus musculus）为对象,探究性激素的变化对小鼠肠道菌群构成的影响。采用外科手术方式建立小鼠去势模型,通过16S r RNA高通量测序技术,研究性激素对小鼠肠道菌群构成的影响。研究结果表明,雌性小鼠和雄性小鼠去势后,性激素水平显著下降。肠道菌群在门水平上,正常小鼠和去势小鼠肠道细菌群落均由拟杆菌门（Bacteroidetes）、厚壁菌门（Firmicutes）、变形菌门（Proteobacteria）、埃普西隆杆菌门（Epsilonbacteraeota）、髌骨细菌门（Patescibacteria）、放线菌门（Actinobacteria）、软壁菌门（Tenericutes）、脱铁杆菌门（Deferribacteres）、酸杆菌门（Acidobacteria）和蓝藻细菌门（Cyanobacteria）组成,主要菌群为厚壁菌门和拟杆菌门物种,两门占物种相对丰度百分比...     

地衣芽胞杆菌BL63516对抗生素诱导的菌群紊乱小鼠肠黏膜屏障功能的影响

目的 探索地衣芽胞杆菌BL63516对肠道菌群和肠黏膜屏障功能调节的效果和可能机制,为临床疾病的治疗提供新思路。方法 采用健康清洁级雄性BALB/C小鼠30只构建动物模型,将小鼠分为3组（每组10只）,分别为对照组（CON组）、头孢曲松钠灌胃组（CS组）和地衣芽胞杆菌BL63516治疗组（BL组）,除CON组外其余两组小鼠给予300 mg/mL头孢曲松钠0.2 mL,2次/d灌服8 d,短期大量服用抗生素以建立肠道菌群紊乱模型。第9天起BL组小鼠给予地衣芽胞杆菌干预连续8 d。第17天摘眼球处死小鼠,取血、结肠、粪便样本。ELISA方法检测小鼠血清及肝脏组织中的细胞因子及LPS水平。PCR-变性梯度凝胶电泳方法及16S rRNA高通量测序测定小鼠肠道菌群结构。结果 地衣芽胞杆菌干预后小鼠血清LPS水平较模型组显著降低,屏障功能改善。且地衣芽胞杆菌治疗后BL组肠道菌群丰富度和多样性显著升高,菌群结构有所改变。结论 实验结果提示地衣芽胞杆菌BL63516可以有效改善抗生素所致的小鼠肠道菌群失调,对肠屏障功能有一定调节作用。     

罗伊乳杆菌对小鼠血清细胞因子含量和肠道菌群的影响

目的 探讨罗伊乳杆菌对小鼠免疫力及肠道菌群的影响。方法 将50只昆明系小鼠按体重随机分成5组：空白对照组、低剂量组、中剂量组、高剂量组和发酵上清液组。空白对照组灌胃等量生理盐水,其余各组分别灌胃罗伊乳杆菌菌液及发酵液上清21 d后,眼球取血收集血清,采用ELISA法检测IL-2、IFN-γ、IgA和IgG含量;采用16S rRNA基因高通量测序分析小鼠肠道菌群变化。结果 与对照组相比,其余各组小鼠血清IL-2、IFN-γ、IgA和IgG的水平均明显升高,粪便菌群丰度有所增高,多样性降低。与对照组相比,低剂量组和中剂量组小鼠粪便菌群结构无显著差异,而高剂量组和发酵上清液组小鼠粪便菌群结构差异显著。结论 罗伊乳杆菌可以增强小鼠免疫力,提高菌群丰度,改变小鼠肠道菌群结构。     

Clostridium,Bacteroides and Prevotella associates with increased fecal metabolites Trans-4-Hydroxy-L-proline and Genistein in active pulmonary tuberculosis patients during anti-tuberculosis chemotherapy with isoniazid-rifampin-pyrazinamide-ethambutol (HRZE)

PurposeTo investigated the changes of gut microbiome and fecal metabolome during anti-tuberculosis chemotherapy with isoniazid (H)-rifampin (R)-pyrazinamide (Z)-ethambutol (E).Patients and methods(1) In this study, we recruited 168 stool specimens from 49 healthy volunteers without M. tuberculosis (Mtb), 30 healthy volunteers with latently infected by Mtb, 41 patients with active tuberculosis (ATB), 28 patients with 2-month HRZE treatment and 20 patients with 2-month HRZE followed by 4-month HR treatment. (2) We used 16S rRNA sequencing and an untargeted Liquid Chromatograph Mass Spectrometer-based metabolomics to investigate the changes of gut microbiome and the alteration of fecal metabolome, respectively, during anti-TB chemotherapy.ResultsMtb infection can reduce the diversity of intestinal flora of ATB patients and change their taxonomic composition, while the diversity of intestinal flora of ATB patients were restored during anti-TB chemotherapy. Especially, family Veillonellacea and Bateroidaceae and their genera Veillonella and Bacteroides significantly increased in the gut microbiota during anti-TB chemotherapy. Additionally, Mtb infection dynamically regulates fecal metabolism in ATB patients during anti-TB chemotherapy. Interestingly, the altered abundance of fecal metabolites correlated with the altered gut microbiota, especially the change of gut Clostridium, Bacteroides and Prevotella was closely related to the change of fecal metabolites such as Trans-4-Hydroxy-L-proline and Genistein caused by Mtb infection or anti-TB chemotherapy.ConclusionAnti-TB chemotherapy with HRZE can disrupt both gut microbiotas and metabolome in ATB patients. Some specific genera and metabolites are depleted or enriched during anti-TB chemotherapy. Therefore, revealing potential relevance between gut microbiota and anti-TB chemotherapy will provide potential biomarkers for evaluating the therapeutic efficacy in ATB patients.Supplementary InformationThe online version contains supplementary material available at 10.1007/s12088-022-01003-2.