一种考虑到不同物种同源大分子间的偶合关系的新的今祖法

今祖法可以在建立分子进化树时避免由于进化速率的差异而造成的误差。但是在实地应用中发现,在理论上应该存在的一些等式关系往往并不存在,而且在用不同物种的同源大分子作为参证时,往往竟会得到各不相同的结果。作者以前的分析表明,这是由于参证物种与被研究物种同源大分子之间的不同程度的偶合关系所造成的。据此作者提出了一种新方法,以DC′_(i_ai_b)代替今祖法中所用的d＇_(i_ai_b)来进行成聚分析,在此DC′_(i_ai_b)=d＇_(i_ai_b)-CO_(i_aj)-CO_(i_bj)(j代表参证物种),CO_(ij)则为d＇_(ij)与任意选定的一个基准数之差。这样,同时也就避免了参证物种与被研究物种同源大分子之间的偶合关系所造成的混乱。     

喉癌差异表达cDNA序列的分离与初步鉴定

分离和克隆人喉癌中新的相关基因将有助于提示喉癌的易感性与癌变机制。运用ｍＲＮＡ差异显示法对２例成人喉癌组织及配对癌旁正常组织的基因表达进行研究,分离到３５个差异显示片段;用反向Ｎｏｒｔｈｅｒｎ点杂交筛选到６个差异片段,经克隆、测序和匹配分析,得１２条不同ｃＤＮＡ序列,其中４条为新基因序列,另外８条与已知基因高度同源。将１２条ｃＤＮＡ序列固定在膜上,用来自喉癌和配对正常组织的总ｃＤＮＡ探针与其杂交和     

固氮酶结构基因在联合固氮菌Klebsiellaplanticola19—1细胞中的定位

用Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ ｐｎｅｕｍ ｏｎｉａｅｎｉｆＨＤＫ 为探针与Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ ｐｌａｎｔｉｃｏｌａ １９－１ ＤＮＡ Ｓｏｕｔｈｅｒｎ 杂交表明,Ｋ．ｐｌａｎｔｉｃｏｌａ １９－１ 中存在与ｎｉｆＨＤＫ 同源的片段。用凝胶内溶菌及电场倒转技术检测在Ｋ．ｐｌａｎｔｉｃｏｌａ １９－１ 中存在一大质粒。用Ｋ．ｐｎｅｕｍ ｏｎｉａｅ ｎｉｆ ＨＤＫ 探针与大质粒ＤＮＡＳｏｕｔｈｅｒｎ 杂交证明固氮酶结构基因定位于大质粒     

YAC修饰和原生质体融合法转移进哺乳动物细胞

应用ＤＮＡ同源重组的方法对酵母人工染色体（ＹＡＣ）进行修饰,用Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交和ＰＣＲ等方法证实ｎｅｏ基因整合于ＹＡＣ上,通过ＰＥＧ介导的原生质体融合法将一个３３０ｋｂＹＡＣ导入Ｌ９２９细胞,得到Ｇ４１８抗性克隆。     

水稻（Oryza sativa L.）核基因组存在叶绿体psbA基因的同源 …

序列比较说明、重复ＤＮＡ顺序ｐＲＲＤ９＾＊与水稻叶绿体基因组中编码ＱＢ蛋白的ｐｓｂＡ基因存在高度的同源。用ｐＲＢＤ９亚克隆片段ｐＲＲＤ９Ｒ和片段ｐＲＲＤ９Ｌ对水稻的叶绿体和核ＤＮＡ进行Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交分析,揭示了ｐｓｂＡ基因同源片段在某个进化时期由叶绿体基因组转移到水稻核基因组,而且两者在水稻进化过程中的变异程度存在明显的差异。     

分子进化的概念、理论和方法

严格地说,“分子进化”有两层含意。一层含意是 指生命起源时期的化学进化,即有机分子由简单向复 杂的演变〔们;另一层含意是指生物进化过程中,构成生 物体的大分子,如蛋白质、核酸的演变。由于分子生物 学研究的迅速进展,已经搞清了许多生物大分子的一 级结构。从某些同源蛋白质（或核酸）的比较中,人们发 现,不同生物之间,同源蛋白质（或核酸）结构上的差异 各不相同,亲缘关系近的差异较小,反之则差异较大, 即这些生物大分子象生物的表型一样,能反映物种间 的亲缘关系,体现物种的演化过程。现在,当提及分子 进化时,一般都是指后一层意思。     

人类基因组辞汇(续)

人类基因组辞汇（续）柴建华ＨｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎＰｒｏｂｅ杂交探针。一个小的ＤＮＡ（或ＲＮＡ）分子。用同位素（或非放射性染料,或荧光染料）标记后可用分子杂交的方法探测同源顺序的存在。ＨＴＦＩｓｌａｎｄＨＴＦ岛。“Ｈｐａｌｌ-Ｔｉｎｙ-Ｆｒａｇ－ｍｅｎｔ”（Ｈｐａｌｌ小片段岛）,也叫做ＣｐＧ岛。单拷贝,在脊椎动物基因组内为非甲基化位点。     

紫外辐射诱发NIH3T3细胞调亡时DNA断裂的特性

用常规琼脂糖凝胶电泳ＵＶＢ照射后培养不同时间的ＮＩＨ３Ｔ３细胞ＤＮＡ,两个样本均未出现凋亡梯形带,而用相同条件处理拽明小鼠胸腺细胞ＤＮＡ出现的典型的梯形带。再用反转电场琼脂糖凝胶电泳（ＦＩＧＥ）ＵＶＢ照射后培养不同时间的ＮＩＨ３Ｔ３细胞ＤＮＡ,发现ＤＮＡ先断裂成低于２３ｋｂ的大分子片段,然后进一步断裂成小分子片段,但始终未出现梯形带,说明ＤＮＡ并不总是从核小体之间断裂的。     

鳄梨冷藏过程中体外转译和基因表达的研究

鳄梨果实经低温贮藏一定时期,从中提取ＲＮＡ,进行体外转译和同源探针杂交分析,以研究冷藏过程中特写基因的表达时期和水平。并用纯化出的冷藏果实的ｍＲＮＡｓ,构建其ｃＮＤＡ文库。对文库作了初步筛选,２４个含ｃＤＮＡ插入片段的菌落能差示地与贮藏前和７℃贮藏的ｍＲＮＡ合成的探针杂交。３个纤维素酶ｃＤＮＡ能很好杂交,２个与鳄梨乙烯形成酶ｃＤＮＡ有同源性。     

用gFM31探针进行谷子品种的指纹分析

用高度多态性探针ｇＦＭ３１对５９个谷子（ＳｅｔａｒｉａｉｔａｒｌｉｃａＢｅａｕｖ．）品种（包括地方品种、育成品种及品系）进行ＤＮＡ指纹分析,共鉴别出５８种类型,而黑谷和黑粒１５１６给出完全相同的带型,二者有可能是同一材料。通过对ｇＦＭ３１ＤＮＡ序列分析,未发现其中有小卫星ＤＮＡ和微卫星ＤＮＡ序列。该探针虽在谷子品种中显示很高的多态性,但与禾谷类的其他物种的ＤＮＡ杂交信号微弱,表现出较强的谷子基因组特异性。     

水稻重复DNA顺序克隆pRRD3的研究

用ＤＮＡ复性动力学方法克隆到一个水稻（ＯｒｙｚａｓａｔｉｖａＬ．）中度重复ＤＮＡ顺序。不同限制性内切酶消化和Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交分析显示,这段重复ＤＮＡ顺序以串联加散布的形式存在于水稻基因组中;序列分析表明在它内部含有一个典型的植物启动子序列ＴＧＴＡＴＡＡＡＴＡ;以ｐＲＲＤ３克隆片段作探针,对水稻３４个品种进行拷贝数测定,在野生稻与栽培稻、籼稻与粳稻之间均存在拷贝数上的明显差异;对ＡＡ基因组不同亚型水稻ＤＮＡ进行Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交分析,得到基因组亚型特异的杂交带谱,说明该重复顺序是研究水稻进化和分类的一个有用探针。     

通过微切—扩增建立植物（蚕豆Vicia faba）染色体区段特异性基…

以蚕豆根尖为材料,采用改良方法制备染色体标本,在光镜下切割分离一段大Ｍ染色体核仁组织区（ＮＯＲ）特定区段,通过单一引物－－聚合酶链式反应法随机扩同切ＤＮＡ后,获得近６０μｇＤＮＡ。经琼脂糖电泳分析测定扩增产物分子片段大小介于２００－９００ｂｐ。以地主新标记蚕豆总体ＤＮＡ。作为探针与扩增产物进行Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交,证实扩增得到的ＤＮＡ与蚕豆ＤＮＡ同源,来自微切染色体。部分扩增产物经ＥｃｏＲＩ酶切后     

拟南芥DNA探针的比较基因组原位杂交揭示的拟南芥与远缘植物基因组间的同源性

采用生物素标记的拟南芥基因组DNA探针在75%杂交严谨度下对双子叶植物番茄、蚕豆和单子叶植物水稻、玉米、大麦的染色体进行了比较基因组荧光原位杂交（comparative genomic in situ hybridization,cGISH）分析,以揭示拟南芥与远缘植物基因组间的同源性.cGISH信号代表了拟南芥基因组DNA中的重复DNA与靶物种染色体上同源序列的杂交.探针DNA在所有靶物种的全部染色体上都产生了杂交信号.杂交信号为散在分布,并呈现随基因组增大,杂交信号增多,且分布更加分散的趋势.所有靶物种的核仁组织区（NOR）都显示了明显强于其他区域的杂交信号,表明拟南芥基因组DNA探针可用于植物NOR的物理定位.在所有的靶物种中,信号主要分布在染色体的臂中间区和末端,着丝粒或近着丝粒区有少数信号分布.大麦染色体显示了与C-和N-带不同的独特的cGISH信号带型,表明此探针可用于不同植物染色体的识别.这些结果表明,拟南芥基因组与远缘植物基因组之间,除rDNA和端粒重复序列外,还存在其它同源的重复DNA;一些重复DNA序列在被子植物分歧进化为单子叶和双子叶植物之前就已存在,虽经历了长期的进化过程,至今在远缘物种之间仍保持了较高的同源性.结果还提示,大基因组中古老而保守的重复DNA在进化过程中发生了明显的扩增.     

用质量控制狭缝式杂交法检测妇女宫颈上皮中人乳头瘤病毒（HPV）DNA

本文报道一种能对ＨＰＶ进行较为准确分型的ＤＮＡ杂交程序和方法,它具有如下特点,１．由于简化了实验程序,标本消耗减少,因此该方法尤其适用于小组织活检标本（１－２ｍｇ）中ＤＮＡ同源序列检测。２．敏感性高。由于标本消耗减少,使ＨＰＶ检出率大为提高,与斑点杂交技术相比,敏感性提高１、６倍;３．型别特异性强,由于改变了实验条件及在实验过程中实行严格的质量控制,明显减少了不同ＨＰＶ型别的交叉反应,甚至在部分再     

杂交测序——DNA测序新策略

杂交测序──ＤＮＡ测序新策略陈尚武,马涧泉（中山医科大学生化教研室,广州５１００８９）关键词ＤＮＡ,测序,杂交人类基因组计划要求改进ＤＮＡ测序方法,促进了测序技术的发展,一种全新的测序方法──杂交测序（ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇｂｙｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏ...     

真核生物转录因子对DNA序列的识别

真核生物转录因子对ＤＮＡ序列的识别杨岐生（浙江大学生物科学与技术系,杭州３１００２７）关键词真核生物转录因子,蛋白质－ＤＮＡ识别研究蛋白质和ＤＮＡ两类生物大分子的相互作用,以阐明基因表达、调控及信息传递的分子机制,是认识生命活动本质的核心问题。本文介...     

DNA芯片制作原理及其杂交信号检测方法

文章讨论了ＤＮＡ芯片的制作原理和杂交信号的检测方法。依其结构,ＤＮＡ芯片可分为两种形式,ＤＮＡ阵列和寡核苷酸微芯片。ＤＮＡ芯片的制作方法主要有光导原位合成法和自动化点样法。ＤＮＡ芯片与标记的探针或ＤＮＡ样品杂交,并通过探测杂交信号谱型业实现ＤＮＡ序列或基因表达的分析。适应于ＤＮＡ芯片的发展,同时出现了许多新型的杂交信号检测方法。主要有激光荧光扫描显微镜、激光扫描共焦显微镜、结合作用ＣＣＤ相机的荧光     

一种能表现水稻基因组DNA分化特征的重复DNA顺序

用ＤＮＡ 复性动力学方法克隆到一个水稻中度重复顺序。Ｓｏｕｔｈｅｒｎ 杂交、限制性内切酶分析及序列分析资料表明,该重复顺序在水稻基因组中具有串联重复和散布状态两种存在方式。以该ＤＮＡ 片段作探针,用Ｓｏｕｔｈｅｒｎ 杂交方法分析了多种野生稻种和栽培稻品种的基因组分化特征。某些限制性内切酶消化过的水稻ＤＮＡ,其图谱呈现出多达４０ 条以上的杂交带,包括强杂交带和弱杂交带两种类型。重复实验结果证明,强杂交带表现为ＢＢＣＣ染色体组型特异而弱带则在栽培稻各品种间显示出丰富的多态性,表明该重复顺序片段在水稻理论研究和育种实践中可能具有重要意义     

应用染色体涂染法建立人和黑叶猴（Semnopithecus francoisi）的染？…

应用荧光原位杂交技术中的染色体涂染法,以生物素标记的除Ｙ染色体外的人全部整务染色ＤＮＡ特异性探针与黑叶猴的中期分裂相杂交,建立了人与黑叶猴之间的染色体同源性。除人的１,２,６,１６和１９号染色体特异探针分别与黑叶猴的２条非同源的染色体杂交外,其余人染色体特异探针与黑叶猴的１条染色体杂交,其中有两对人染色体特异探针分别杂交同一条黑叶猴染色体。     

应用基因组原位杂交及RFLP标记鉴定小麦中的的大麦染色体

用生物素（Ｂｉｏｔｉｎ－１６－ｄＵＴＰ）标记的大麦Ｂｅｔｚｅｓ基因组ＤＮＡ作探针,以普通小麦中国春总ＤＮＡ作封阻进行基因组原位杂交（Ｇｅｎｏｍｅ ｉｎ ｓｉｒｕ ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ,简称ＧＩＳＨ）,从１３株小麦－大麦杂交后代中鉴定出２个含有３条大麦Ｂｅｔｚｅｓ２Ｈ染色体的材料（２ｎ＝４３）;２个２Ｈ单体异代换系（２ｎ＝４２）;７个２Ｈ二体异代换系（２ｎ＝４２）。用已定位有小麦第２部分同源群