结构基因组学研究与核磁共振

各种生物的基因组DNA测序计划的完成,将结构生物学带入了结构基因组学时代.结构基因组学是对所有基因组产物结构的系统性测定,它运用高通量的选择、表达、纯化以及结构测定和计算分析手段,为基因组的每个蛋白质产物提供实验测定的结构或较好的理论模型,这将加速生命科学各个领域的研究.生物信息学、基因工程、结构测定技术等的发展为结构基因组学研究提供了保证.近年来核磁共振在技术方法上的进展,使其成为结构基因组学高通量结构分析中的一个关键方法.     

荧光标记法测定核糖核酸片段的核苷酸序列

核糖核酸一级结构的研究,近十几年有了很大进展。继1965年Holley用紫外吸收法,首次测定了酵母丙氨酸tRNA的一级结构之后,Sanger等人用灵敏度更高的放射性同位素体内标记的方法,测定了其它小分子量核糖核酸的一级结构。近几年,Randerath等用高     

植物中苯丙素甙成分研究进展

本文综述了天然苯丙素甙化合物研究的概况,包括分离方法,结构类型,结构测定,生物活性,生物合成途径及其在植物界的分布等。     

付里叶变换红外光谱法研究胰岛素的二级结构

付里叶变换红外光谱法测定了胰岛素的二级结构,讨论了信/噪比、谱解析、曲线拟合和吸收组分的指认对结构测定的影响。测定的胰岛素二级结构与X—光结构分析结果吻合。     

种子蛋白质亚基结构快速测定双向电泳法

介绍了还原条件与非还原条件双向电泳法,并应用此方法研究了种子蛋白质亚基结构,实验结果表明,这种双向电泳法能快速地测定种子蛋白质的亚基结构。     

草原生态学研究方法学术讨论会在成都召开

中国植物学会于1981年11月21日至27日在四川省成都市召开了有61名代表参加的草原生态学研究方法学术讨论会。大会收到包括植物群落结构调查研究、第一性生产力测定、第二性生产力测定、光合作用测定、物质与水分循环、热值测定、数学生态等有关内容的研究方法论文和报告34篇。其中有18篇论文在大会上作了报告。在小组讨论中,代表们就第一性生产力测定、水分与物质循环、光合作用测定     

核酸顺序测定研究中的一些体会

近年来,RNA顺序测定的研究进展不快。而DNA的却进展迅速。1977年出现的两种测定DNA顺序的方法,使基因的壹级结构的研究大大地向前推进了一步。化学法有其对测定试剂要求相对简单的优点。     

真核转录的结构生物学——2006年诺贝尔化学奖简介

用X射线晶体学方法测定的一系列RNA聚合酶Ⅱ复合物结构揭示了真核转录的分子机制.     

基于模板的蛋白质结构预测

基于模板的蛋白结构预测和不依赖模板的蛋白结构预测是计算预测蛋白质三维结构的两种方法,前者由于具有快速和较高准确性的优点,而得到了广泛的应用.基于模板的结构预测是通过寻找与目标蛋白序列相似并且有实验测定的结构作为模板,进而构建目标序列的结构模型的方法.文章详细综述了基于模板的结构预测方法的步骤、关键环节,并对影响结构预测...     

生物大分子结晶学中的刚体修正方法

刚体修正方法是修正生物大分子初结构的取向和位置的一个很有效的方法.本文简要地介绍了Fourier搜索法,CORELS刚体修正法及TRAREF刚体修正法三种方法,并给出了它们在不同的蛋白质结构测定中应用的结果.     

2002年诺贝尔化学奖"对生物大分子仪器分析方法的重大贡献"简介

20 0 2年诺贝尔化学奖授予了三位在生物大分子研究领域作出突出贡献的科学家 :美国科学家约翰·芬恩 ,日本科学家田中耕一以及瑞士科学家库尔特·维特里希 ,以表彰他们创造性地应用物理化学分析法对生物大分子进行结构分析测定的研究。其中芬恩和田中发明了“对生物大分子进行确认和结构分析方法”和“对生物大分子的质谱法” ,维特里希则是开创了“利用核磁共振测定溶液中生物大分子三维结构的方法”。     

长白山阔叶红松林结构多样性的初步研究

在林业可持续发展的背景下,对森林实施生态系统管理,必须保护和维持森林的生物多样性。这就要求在森林调查和经营过程中增加林分结构多样性方面的内容,因此必须充分认识森林结构包括的内容,并研究制订简便实用的结构多样性指标。本文采用目测分层盖度结合无样地点四分法取样进行林分结构因子调查,设计了一套简便的林分结构指标体系,并对长白山红松阔叶混交林及其次生林进行了林分结构多样性的测定研究。结果表明：基于分层盖度构建的林分垂直多样性指数和水平结构异质性指数,可以较好地表示林分的基本结构特征,同时借助点四分法测定的物种多样性指数和对倒木、站干、林隙等的统计,可以较全面地描述阔叶红松林的林分结构因素。应用该方法测定不同的原始林样地的林分结构,得到的林分结构指标与其他林分结构因素的描述,同常规林学调查结论一致并更全面;同时对不同采伐方式的林分结构进行了测定,结合相应的常规指标测定对比,表明该结构指数不但能较好地表示群落的空间结构特征,同时也能对比不同经营方式对林分结构造成的影响,如择伐方式比皆伐方式对林分的结构影响相对较小而且结构恢复时间较短,从而说明对阔叶红松林这种复层异龄混交林的森林类型而言,择伐是一种更适合的通过结构调控进行生态系统管理的方式。在对生态系统进行经营管理过程中,采用该方法能有效地说明林分的垂直结构复杂性和水平结构异质性及重要的林分结构因子存在状况,因而更适合当前森林生态系统管理的要求。文章进一步分析了林分结构指标待改进的部分与研究方向。     

蛋白质二级结构的实测与预测

蛋白质二级结构的实测和预测在理论和实践上都有重要意义。常用实测方法为圆二色性,红外及二维核磁共振。讨论了各种圆二色性计算方法的优点和缺陷,介绍了二维核磁共振测二级结构的主要方法,讨论了Chou和Fasman预测法的优劣。建议用多种方法测定并结合预测结果分析,得出恰当结论。     

用化学方法降解肽链N-末端被封闭的残基及其鉴定

在测定蛋白质或多肽的一级结构时,常会遇到N-末端被封闭的情况,使Edman降解试剂失去作用,无法用正常的降解程序进行蛋白质或多肽的一级结构的测定。N-末端受封闭的种类很多,其中主要是乙(甲)酰化和焦谷氨酰环化。它们大量存在于自然界的蛋白质或活性多肽中,也有部分是在处理过程中通过化学反应形成的。目前对N-末端酰化的肽链结构除了用质谱法等物化方法测定外,几乎没有别的更好的方法,至于焦谷氨酰残基环化的肽     

蛋白质二级结构的真空紫外圆二色性研究

利用同步辐射真空紫外圆二色谱仪和特制的样品池,测定溶液中蛋白质的真空紫外圆二色谱,测定波长低至175nm,并应用一种新的计算法分析计算了蛋白质5种二级结构的含量,所得结果与用X射线衍射法测定的结果一致.讨论了获得好的真空紫外圆二色谱的几个重要因素.结果表明,真空紫外圆二色法是目前测定溶液中蛋白质二级结构的较好方法之一.     

生态系统营养动态的网络透视法（续）

生态系统营养动态的网络透视法（续）张晓爱（中国科学院西北高原生物研究所,西宁８１０００１）４生态系统结构的测定４．１垂直结构的测定定量描述生态系统营养结构的一般有效方法是用一种定量指数使不同生态系统之间的比较和探测生态系统内部变化趋势成为可能,如演替...     

生物高分辨电子显微学进展

生物高分辨电子显微学是近年来发展起来的一种可与X射线晶体学相媲美的测定生物大分子高分辨结构的方法．它克服了一些限制X射线晶体学应用的困难,可以直接对非晶体状态的生物大分子或仅能形成二维晶体的蛋白进行结构测定．这一技术主要包括高分辨电子显微象的获得与电子显微象解析．文章就这一技术应用中的一些问题：自然结构的保持、辐射损伤、低衬度、低信噪比等进行了讨论．     

一个从中等分辨率电子云密度图确定蛋白质主链C~α原子座标的方法

本文叙述了一个简单的从中等分辨率电子云密度图确定蛋白质骨架结构的方法.方法的第一步是依据蛋白质结构已知的立体化学参数以及密度图上代表侧链的密度的位置来确定C~α原子位置.第二步是用Hendrickson分子叠合法将螺旋区的结构标准化.这个方法对于无法得到合用的高分辨率衍射数据或相角的蛋白质结构的测定是有用的.     

用碱水解的方法测定蛋白质的消光系数

在蛋白质结构与功能的研究中,有时蛋白质溶液的浓度是一个重要的参数.紫外吸收法是测定蛋白质溶液浓度最为常用的方法,而已知蛋白质的消光系数是用紫外吸收法准确测定蛋白质溶液浓度的前提条件.在0.1 mol/L NaOH溶液中,蛋白质发生碱性水解,因而蛋白质溶液可以看作是色氨酸和酪氨酸的二元体系.以此为依据,给出了用碱水解的方法测定蛋白质消光系数的方法.这一方法操作步骤简便易行,蛋白质消光系数的计算公式简单明了.用这一碱水解的方法分别测定了几种氨基酸组成不同的蛋白质的消光系数,与文献数据对照,得到了令人满意的结果,测定误差均小于±5％.     

胰岛素作用原理研究近况

我国科学工作者在1965年首次用化学方法全合成了具有全部生物活力的结晶牛胰岛素,开辟了人工合成蛋白质的新时期,也促进了我国对胰岛素的深入研究。1973年,我国科学工作者又测定了1.8埃分辨率猪胰岛素分子的三维结构,为胰岛素结构与功能