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采用真菌核糖体基因转录间隔区(ITS)通用引物,PCR分别扩增了Phytophthora sojae的5个菌株(Pg1、Pg2、Pg3、CN1和S317)和1个P. medicaginis (菌株44390)的ITS1与ITS2,并对PCR产物进行了序列测定。根据Bioedit软件中的neighbour-joining methods分析法将上述序列和Genbank中已登录的P. sojae、P. medicaginis、P. megasperma和P.trifolii等4个形态学种10个登录菌株的ITS1与ITS2碱基序列进行聚类分析。结果是聚类组与形态学种有一定差别,4个种16个菌株分成7个聚类组。结果表明,分别属于同一形态学种且可聚为一组的不同个体之间的ITS碱基序列遗传相似性最高,但是也具有一定的多样性;形态学上属于不同种的个体的ITS可以聚为一组。上述结果提示L41385可能不属于P. sojae, L41380可能属于是P. trifolii,P. megasperma仍是一个复合种。同时提示ITS DNA碱基序列可以区分形态学种。 相似文献
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大豆疫霉和苜蓿疫霉rDNA ITS序列分析 总被引:10,自引:0,他引:10
采用真菌核糖体基因转录间隔区(ITS)通用引物,PCR分别扩增了Phytophthora sojae的5个菌株(Pg1、Pg2、Pg3、CN1和S317)和1个P.medicaginis(菌株44390)的ITS1与ITS2,并对PCR产物进行了序列测定。根据Bioedit软件中的neighbour-joining methods分析法将上述序列和Genbank中已登录的P.sojae、P.medicaginis、P.megasperma和P.trifolii等4个形态学种10个登录菌株的ITS1与ITS2碱基序列进行聚类分析。结果是聚类组与形态学种有一定差别,4个种16个菌株分成7个聚类组。结果表明,分别属于同一形态学种且可聚为一组的不同个体之间的ITS碱基序列遗传相似性最高,但是也具有一定的多样性;形态学上属于不同种的个体的ITS可以聚为一组。上述结果提示L41385可能不属于P.sojae,L41380可能属于是P.trifolii,P.megasperma仍是一个复合种。同时提示ITS DNA碱基序列可以区分形态学种。 相似文献
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大豆疫霉和苜蓿疫霉rDNA ITS序列分析 总被引:6,自引:1,他引:6
采用真菌核糖体基因转录间隔区(ITS)通用引物,PCR分别扩增了Phytophthora sojae的5个菌株(Pg1、Pg2、Pg3、CN1和S317)和1个P. medicaginis (菌株44390)的ITS1与ITS2,并对PCR产物进行了序列测定。根据Bioedit软件中的neighbour-joining methods分析法将上述序列和Genbank中已登录的P. sojae、P. medicaginis、P. megasperma和P.trifolii等4个形态学种10个登录菌株的ITS1与ITS2碱基序列进行聚类分析。结果是聚类组与形态学种有一定差别,4个种16个菌株分成7个聚类组。结果表明,分别属于同一形态学种且可聚为一组的不同个体之间的ITS碱基序列遗传相似性最高,但是也具有一定的多样性;形态学上属于不同种的个体的ITS可以聚为一组。上述结果提示L41385可能不属于P. sojae, L41380可能属于是P. trifolii,P. megasperma仍是一个复合种。同时提示ITS DNA碱基序列可以区分形态学种。 相似文献
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亚热带湖泊中一种剑水蚤──Mesocyclops notius Kiefer的形态及生态学研究(英文) 总被引:4,自引:1,他引:4
本文报道了对一亚热带湖泊中的Mesocyclopsnotius的形态及生态学研究。将从扁担塘采得的标本形态学特征与Kiefer和Velde从澳大利亚的标本的形态学特征进行了比较.在扁担塘,M.notius与2种温剑水蚤──ThermocyclopstaihokuensisHarada和T.brevifurcatusHarada为春季和夏季剑水蚤的优势种,而CyclopsvincinusvincinusVljanin为冬季的优势种。 相似文献
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生态形态学特征是生物在选择压力下长期进化的结果,对生物的生存和繁衍具重要影响。为使种间竞争最小化,同质环境中关系密切的物种一般具有不同的生态形态学特征,以实现对有限资源的分割。1983—2012年,对高寒草甸生态系统中常见的9种雀形目鸟类的生态形态学特征所进行的研究结果表明:9种雀形目鸟类的各个生态形态学特征指标均具有显著差异;~92.0%的个体被正确归类,除小云雀(Eremophila alpestris,79.2%)外,其余各物种判别正确率均较高(84.5%~100%),9个物种被分成5个集团(guild)。各集团独特的生态形态学特征与集团内物种的栖息地环境和取食行为相关,最终解释了各个物种如何在高寒草甸生态系统中实现共存。 相似文献
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描述了分布于中国热带、亚热带地区的丛赤壳科皱赤壳属Rugonectria一新种。对中国材料进行形态学和DNA序列分析相结合的研究表明,它们与日本报道的栗生皱赤壳R. castaneicola较为接近,但存在形态学和DNA序列上的明显差异,代表该属一个新种。 相似文献
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《基因组学与应用生物学》2017,(7)
蚋的种类繁多,其不同发育虫期在形态学上具有高度的相似性,通过形态学特征对虫株进行鉴定具有极大的困难,且目前尚无公认的分类系统。从分子水平结合形态学特征对蚋科类群进行整理,应能使蚋科昆虫鉴定更为准确,分类系统更能反映其生物谱系。以COⅠ基因的特定区段作为"条形码"为生物编码,可实现物种鉴定的便捷、准确及自动化。本研究对15株蚋科昆虫进行了形态学鉴定及基于COⅠ基因序列的系统发育分析。研究中共采集并成功羽化出蚋科虫株15株,其中14株完成形态学鉴定,COⅠ基因序列分析验证了形态学鉴定结果;L1虫株因操作过程中成虫尾器被破坏,未完成完整形态学鉴定,COⅠ基因序列分析提示其可能为一未知新种或未报道过COⅠ基因序列的已知种。研究结果显示,蚋的形态学鉴定极度依赖鉴定者的经验和熟练的技术,严重制约了蚋的鉴定、分类研究的发展,COⅠ基因序列分析能较好建立蚋亚属内种间关系。 相似文献
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目的报告国内首例多育赛多孢菌致鼻窦炎,并探讨致病菌的鉴定及其对抗真菌药物体外敏感性。方法取患者左侧上颌窦分泌物进行真菌培养和形态学鉴定,分离菌株β-球蛋白、rDNAITS序列分析确切鉴定,对分离菌进行7种抗真菌药体外药敏试验。结果根据菌株的形态学特点和基因序列结果鉴定为多育赛多孢菌。体外药敏试验显示该菌对7种抗真菌药物耐药。结论多育赛多孢菌所致的真菌病较少见,其确切鉴定靠形态学特征和基因分析。该菌株对多种抗真菌药物耐药。 相似文献
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利用透射电子显微镜(TEM)和原子力显微镜(AFM)观察流感病毒(H1N1),探讨AFM在病毒形态研究中的应用,为病毒形态学研究提供一种新型、简便、快捷的工具.TEM采用磷钨酸负染方法,AFM采用轻敲模式在大气常温下扫描成像,并对主要指标长度(直径)、Ra、Rq等进行测量.两种方法最终得到相似的形态学结果,流感病毒呈球状、丝状,并有一些形状介于两者之间.TEM提供了流感病毒二维图像,可见钉状突起,AFM则呈现了流感病毒三维图像,且可见病毒表面有凹凸不平的特征和边缘有齿轮状的突起,同时获得表面粗糙度等可以量化指标.与TEM观察相比,原子力显微镜是一种制样简单、观察直观的新型病毒形态学研究工具,其表征参数可以作为病毒形态学研究的量化指标. 相似文献
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采集内蒙古荒漠草原沙化梁地羊柴Hedysarum laeve根围土样,采用形态学方法、聚丙酰胺凝胶电泳(denatured gradient gel electrophoresis,DGGE)技术和二代测序(next generation sequencing,NGS)技术分析羊柴根围AM真菌群落组成和多样性。结果表明,应用NGS共鉴定AM真菌3纲4目10科18属,DGGE鉴定2纲2目2科5属,形态学鉴定1纲2目2科3属。AM真菌分类等级越低,NGS、DGGE和形态学鉴定结果差异越大,尤其在属水平上差异显著。与NGS技术相比,形态学和DGGE方法所反映AM真菌种类主要为优势菌种,显著低估了AM真菌物种组成并高估其丰度,分子测序是对形态学分类的补充和完善。 相似文献
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Corylus mandshurica Maxim. & Rupr. 和 C. sieboldiana Blume 在中国和俄罗斯一直被处理为独立的种。本文对来自不同标本室的这两个种的腊叶标本及野外采集的大量叶片进行了形态学分析,以确定形态分化是否足够成为建立种的依据。对采自中国、韩国和日本覆盖两个种分布区的153份标本的18个形态学性状进行了统计,以构建数据矩阵用于主成分分析。结果表明,包含C. sieboldiana 复合体的数据单位(entities)在所有的形态学性状上均呈现出广泛的重叠区域。叶片和果实性状分析结果表明类群间缺乏分异性。基于形态学性状不足以把 C. mandshurica 从C. sieboldiana 中分离出去,并给予种的等级,也就是说这两个类群在形态上没有完全分化,而且它们的分布区也是相连的。 因此,应该把C. mandshurica作为C. sieboldiana 的种下分类群处理。C. sieboldiana在韩国南部和日本的具短总苞的植物常常被处理为独立的种或变种,但实际上应该作为C. sieboldiana 内的变型处理,因为总苞性状高度变异,即使在同一个体上也是如此。 相似文献
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传统稻鱼系统中“田鲤鱼”的形态特征 总被引:1,自引:0,他引:1
稻田养鱼是一种重要的传统农业系统,养殖在稻田中的鲤鱼,在长期的自然选择和人工选择下逐渐形成了适应于稻田浅水环境的“田鲤鱼”.本研究以具有千年历史的全球重要农业文化遗产系统“青田稻鱼共生系统”和“从江稻鱼鸭系统”的青田田鱼和从江田鱼为范例,通过采样对两种“田鲤鱼”进行传统形态学分析和地标几何形态学分析;采用线粒体基因构建系统发育树;通过数据库数据提取和采样测量对两种“田鲤鱼”和其他常见鲤鱼种群或品系进行传统形态学聚类分析.传统形态学分析和地标几何形态学分析表明,青田田鱼和从江田鱼在形态上存在差异,与青田田鱼相比,从江田鱼尾部长而窄,体型较细长,尾部长度占身体长度比例小.对这两种田鱼及养殖于其他水体的其他鲤鱼种群进行系统发育树分析表明,青田田鱼和从江田鱼在遗传上是独立的种群;但形态聚类分析表明,这两种田鱼归为一类,明显不同于其他鲤鱼种群或品系,与其他鲤鱼种群的差异主要表现在背鳍和尾鳍上.这些研究结果说明,长期生活在稻田环境的青田田鱼和从江田鱼在遗传和形态上均明显不同于其他水体养殖鲤鱼种群,且青田田鱼和从江田鱼之间形态上存在差异. 相似文献
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石果衣属Endocarpon和盾鳞衣属Placidium是瓶口衣科Verrucariaceae的重要组成部分。本研究应用形态学与分子系统学相结合的方法对该两属进行分类学研究,共发现新种1个:盘形盾鳞衣Placidium patellare,中国新记录种3个:卷边石果衣Endocarpon adsurgens,新白色石果衣Endocarpon neopallidulum和罗杰氏石果衣Endocarpon rogersii。本文提供了详细的形态学特征描述与特征图片。 相似文献
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【目的】基于几何形态学方法定量分析库蠓亚属中3个近似种(刺螫库蠓Culicoides punctatus、灰黑库蠓Culicoides pulicaris和新替库蠓Culicoides newsteadi)翅的形态变化规律,以期进行准确鉴定。【方法】运用几何形态学标点(Landmark)对3种库蠓的翅进行量化分析,并结合主成分分析法(Principal component analysis,PCA)、典型变量分析法(Canonical variate analysis,CVA)、薄片样条(Thin-plate spline,TPS)及聚类分析法对3种库蠓翅进行分析比较,探讨其形态变异。【结果】3种库蠓的翅在翅型、翅脉结构上存在着显著差异,主要发生在径中横脉、径室区,以及翅基部和端部。【结论】几何形态学能够作为一种工具对蠓科昆虫进行种间关系及分类研究。 相似文献