LC3和beclinl在口腔黏膜癌变过程中不同时期的变化及其意义

目的检测微管相关蛋白1轻链3(microtubule-assaiated protein 1 light chain 3,LC3)和自噬基因beclin1在口腔黏膜癌变过程不同时期的特点及表达趋势,探讨其在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)发生进展中的意义。方法采用免疫组织化学方法对19例口腔正常黏膜、9例单纯增生颊黏膜、14例异常增生颊黏膜、15例原位癌阶段颊黏膜及38例OSCC标本进行LC3及beclin1检测。结果 OSCC组LC3和beclin1阳性率显著低于正常口腔黏膜组、单纯增生组、异常增生组及原位癌组;原位癌组LC3和beclin1阳性率较上皮异常增生组虽有升高但无明显差异;LC3和beclin1在OSCC中的表达无相关性。结论 LC3和beclin1在口腔黏膜癌变的过程中表达下调,在原位癌阶段自噬活性有所增加,癌变完成后自噬能力显著降低;自噬活性的改变可能与口腔鳞癌的发生、发展相关。     

利用TCGA数据库构建肾透明细胞癌相关miRNA预后模型

利用TCGA数据库中肾透明细胞癌的miRNA与mRNA数据及临床信息,构建由miRNA组成的预后风险评分模型,并筛选与生存预后相关的miRNA-mRNA调控关系对,为研究提供理论依据。下载并整理TCGA[JP+1]数据库中肾透明细胞癌的miRNA与mRNA数据;对数据进行差异分析,将差异表达的miRNA与临床信息进行合并,利用单因素与多因素Cox回归分析,构建预后模型并进行模型评价;对模型中的miRNA进行靶基因预测,结果与差异表达的mRNA进行取交集,构建miRNA-mRNA调控网络;对网络中的mRNA进行生存分析,筛选生存相关的miRNA-mRNA调控关系对。共得到49个差异表达的miRNA与3 613个差异表达的mRNA;预后模型计算公式为:风险值(risk score)=hsa-miR-21-5p表达量×0.603＋hsa-miR-1251-5p表达量×-0.093;调控网络中共纳入31个miRNA-mRNA调控关系对;对mRNA进行生存分析,共得到7个有价值的关系对。所构建预后模型可有效预测肾透明细胞癌患者生存预后情况,筛选到的miRNA-mRNA调控关系对可为相关研究与治疗提供参考。     

中国地鼠口腔颊囊黏膜癌变过程凋亡相关基因caspase-3、caspase-9、Bax、Bcl-2的表达

目的探讨凋亡相关基因caspase-3、caspase-9、Bax、Bcl-2在中国地鼠口腔正常黏膜、上皮单纯增生、上皮异常增生和鳞状细胞癌组织中的表达及其意义。方法采用免疫组织化学法、RT-PCR检测正常中国地鼠口腔黏膜上皮、单纯增生上皮、异常增生上皮和鳞癌组织中caspase-3、caspase-9、Bax、Bcl-2蛋白及mRNA的表达。结果在口腔黏膜癌变过程中,鳞癌组织中抑制凋亡蛋白Bcl-2表达明显高于口腔正常黏膜、上皮单纯增生、上皮异常增生(P0.05);异常增生上皮caspase-3、caspase-9、Bax表达均明显高于正常组(P0.05),但随着增生程度的加重,caspase-3、caspase-9、Bax表达明显降低(P0.05)。相关性分析显示,鳞癌组织中Bcl-2与Bax、caspase-3、caspase-9呈负相关(P0.05)。RT-PCR结果表明,与正常组织相比,鳞癌组织中Bcl-2高表达,而caspase-3、caspase-9、Bax的mRNA表达显著下调(P0.05)。结论本实验在中国地鼠鳞癌组织中caspase-3、caspase-9、Bax表达降低而Bcl-2表达上升,揭示了caspase-3、caspase-9、Bax、Bcl-2表达与口腔鳞癌的发生、发展密切相关,可以为口腔颊囊黏膜癌的基因治疗提供一些线索或并为评价OSCC的生物学特征及预后提供参考。     

ING4和HIF-1α在口腔鳞癌中的表达及临床意义

目的:探讨人口腔鳞状细胞癌(OSCC)组织中生长抑制因子4(ING4)和缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)的表达及其临床意义。方法:选择我院确诊的口腔鳞癌患者共计65例,均经过手术治疗,术前未行放化疗,切除标本经过石蜡包埋切片,同时选取20例正常口腔黏膜作为对照。采用免疫组化S-P法检测人口腔鳞状细胞癌和正常口腔黏膜组织中ING4和HIF-1α的表达,并分析其与OSCC患者临床病理特征的相关性及人口腔鳞状细胞癌组织中ING4和HIF-1α表达的相关性。结果:OSCC组织中ING4的阳性表达率为41.5%(27/65),显著低于正常口腔黏膜组织(P0.05);OSCC组织中HIF-1α的阳性表达率为64.6%(42/65),显著高于正常口腔黏膜组织(P0.05)。ING4和HIF-1α的表达与OSCC的病理分级、TNM分期和是否有淋巴结转移显著相关(P0.05);OSCC组织中,ING4的表达与HIF-1α的表达呈显著负相关(P0.05)。结论:口腔鳞状细胞癌组织中ING4的表达下调,HIF-1α的表达上调,二者可能通过负向调控作用在口腔鳞状细胞癌的发生、发展、侵袭和转移中发挥着重要作用。     

miRNA在肝细胞癌中的研究进展和展望

微小RNA(microRNA, miRNA)是一类长度为二十几个核苷酸的内源性非编码调控RNA,通过序列特异性翻译抑制或mRNA裂解来调控基因表达,参与细胞发育、增殖、分化、凋亡等一系列重要生物学进程。近期的研究发现,miRNA具有癌基因和抑癌基因的作用,在肿瘤的发生和发展中起着重要的作用。已发现若干miRNA直接参与肝细胞癌的发生和发展,miRNA表达谱与肝细胞癌的诊断、分期、进展和预后等相关。作为一类新的分子靶标,miRNA应用于肝细胞癌的诊断和生物治疗具有广阔的前景。     

口腔癌相关蛋白质的细致功能预测

口腔鳞状细胞癌（oral squamous cell carcinoma,OSCC）是人类最常见的恶性肿瘤之一。本文结合Gene Ontology,功能先验知识,通过构建功能特异的蛋白质互相作用子网来预测口腔癌相关蛋白质的功能。我们以很高的精确率为已知部分功能的口腔癌相关蛋白质预测了更为精细的功能,这对于指导实验研究口腔癌的分子机制具有重要的价值。     

HLA-B在口腔鳞状细胞癌中的表达及意义

目的通过检测人类白细胞抗原B(human leukocyte antigen B,HLA-B)在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)原发灶、转移灶以及口腔正常黏膜、癌前病变中的表达情况,探讨其在口腔鳞癌发生、发展和淋巴道转移中的作用。方法应用免疫组织化学方法检测70例OSCC组织、14例癌前病变组织以及10例正常组织的HLA-B表达,比较OSCC的不同病理分级、TNM分期、有无淋巴结转移、原发灶和转移灶、正常及癌前病变组织HLA-B的表达情况。结果 HLA-B在正常组织、癌前病变组织、癌组织的表达逐渐下降(P0.05);其中,癌分化等级越低,HLA-B表达量越低;正常组织、癌前病变组织和高分化OSCC之间的表达无明显差异,但明显高于中、低分化OSCC(P0.05);不同T分期之间差异无统计学意义(P0.05);原发灶与转移灶HLA-B表达差异亦无统计学意义(P0.05)。但是,未出现转移的OSCC原发灶HLA-B表达高于出现转移的原发灶(P=0.069)。结论中、低分化OSCC组织HLA-B表达较正常组织、癌前病变以及高分化OSCC明显下调,与中、低分化OSCC较高的淋巴道转移率相关,提示HLA-B的表达减弱可能通过肿瘤免疫逃逸机制在OSCC淋巴道转移中有着重要意义,HLA-B表达可作为一项监测OSCC恶性程度与淋巴道转移的指标。     

CXXC4、EZH2在口腔鳞状细胞癌中表达及临床意义

目的:探讨口腔鳞状细胞癌(Oral Squamous Cell Carcinoma,OSCC)中CXXC指蛋白4(CXXC finger protein 4,CXXC4)与Zeste基因增强子同源物2(Enhancer of zeste homolog 2,EZH2)的表达、相关性及与临床病理特征之间的关系,为OSCC的早期诊断、治疗、判断预后及预防等提供参考依据。方法:采用免疫组织化学S-P法检测CXXC4蛋白及EZH2蛋白在60例口腔鳞状细胞癌组织及20例非肿瘤患者正常口腔黏膜组织中的表达情况,分析二者与口腔鳞状细胞癌临床病理特征的相关性。结果:口腔鳞状细胞癌组织中CXXC4蛋白的表达率为35.0%(21/60),明显低于正常口腔黏膜组织的60.0%(12/20)(P0.05);口腔鳞状细胞癌中EZH2蛋白的表达率为70.0%(42/60),高于正常口腔黏膜组织的25%(5/20)(P0.05)。CXXC4蛋白与EZH2蛋白的表达与口腔鳞状细胞癌的病理分化程度、TNM分期及淋巴结转移等密切相关(P0.05),而与年龄、性别及肿瘤直径大小等无关。CXXC4蛋白与EZH2蛋白在OSCC中表达呈负相关(r=-0.511,P0.001)。结论:CXXC4蛋白的表达下调或缺失以及EZH2蛋白的表达上调或过表达与口腔鳞状细胞癌的发生、发展及侵袭转移有关,可能作为口腔鳞状细胞癌预后预测的参考指标。     

SRSF1和Survivin在口腔鳞状细胞癌中的表达及临床意义

目的:研究人丝氨酸/精氨酸富有剪接因子1(SRSF1)和凋亡抑制因子(Survivin)在口腔鳞状细胞癌(OSCC)组织和正常口腔黏膜(NOM)中的表达,探究两因子在OSCC中的相关性及其临床意义。方法:采用免疫组织化学SP法,检测两因子在60例OSCC组织、20例NOM组织中的表达,并结合组织学分级、淋巴结转移及临床分期等相关的信息进行相关性分析。结果:在NOM中SRSF1和Survivin低表达,在OSCC组织中均高表达,比例分别为68.3%和60%。SRSF1和Survivin与淋巴结转移、组织学分级以及临床分期之间存在统计学差异(P0.05);并且在OSCC组织中二者之间表达存在着显著正相关性,(r=0.541,P0.05)。结论:SRSF1和Survivin在OSCC中均高表达,与口腔鳞癌的发生、发展密切相关并具有协同作用。     

VEGF在口腔鳞状细胞癌中的表达及其临床意义

目的:研究血管内皮生长因子(Vascular endothelial growth factor,VEGF)在口腔鳞状细胞癌中的表达及其临床意义.方法:免疫组化EnVisionTM法检测VEGF在57例手术治疗的原发性OSCC(口腔鳞状细胞癌)中的表迭.结果:①VEGF在OSCC中的阳性表达率为40.35%.②VEGF在不同发病部位组的表达:牙龈癌>舌癌>颊癌>唇癌,组间无统计学差异(P>0.05).③VEOF在不同病理分级组、不同预后组、不同年龄组、不同性别组的表达无显著性差异(P>0.05);淋巴结转移组的表达显著高于无转移组(P<0.05).结论:虽然VEGF的高表达可能在淋巴结转移中起一定的作用,但还不能作为预测口腔鳞状细胞癌临床生物学行为及预后的可靠指标.     

口腔白斑组织癌变标志性基因筛查

口腔黏膜白斑病（oral leukoplakia,OLK）是最常见的口腔粘膜的癌前病变．OLK恶性转化率高达43%,因此加强其风险调查和监测对于该病的预防和治疗具有重要意义．本研究采用美国SuperArray公司的肿瘤基因芯片（OHS-802）检测口腔正常组织、OLK组织和口腔鳞状细胞癌（oral squamous cell carcinoma, OSCC)组织的肿瘤相关基因表达差异,旨在筛查与口腔黏膜白斑病发生和癌变相关的表达阳性基因,为探究OLK的发生及癌变机制奠定基础．将“正常组织→OLK组织→OSCC组织”连续递增2倍以上或递减2倍以上的基因确定为OLK组织癌变的标志性基因．SuperArray基因芯片、RT-PCR法和实时定量PCR结果显示,仅有3个基因（ACP-2、BCL-2、SOCS-3）表达水平连续下调2倍以上,有6个基因（CLK-3、CTNNB-1、FKBP-8、GDF-15、NF-1、XRCC-1）表达连续上调2倍以上．进一步经RT-PCR和实时定量PCR验证,其结果与SuperArray结果一致．本研究结果提示,ACP-2等9个基因可能是口腔正常黏膜组织经OLK转变为癌组织的驱动基因,可作为OLK组织、OSCC组织和口腔正常黏膜组织诊断的分子标志．     

结节性甲状腺肿circRNA-miRNA-mRNA调控网络的构建

基于生物信息分析筛选结节性甲状腺肿中差异表达的环状RNA(circRNA),并揭示circRNA-miRNA-mRNA调控网络在结节性甲状腺肿中的作用。从GEO数据库中检索结节性甲状腺肿组织基因芯片数据,利用R软件筛选出差异表达的circRNA。联合多个生物信息数据库预测差异表达circRNA下游的miRNA及mRNA, 并对靶mRNA进行GO及KEGG富集分析。利用STRING在线数据库及Cytoscape软件筛选核心基因。确定了2个circRNA,42个miRNA及546个mRNA。GO及KEGG富集分析表明靶mRNA主要涉及细胞生长及基因表达调控过程。基于Cytoscape软件筛选出了14个核心基因(SP1、IGF1R、RPS6KB1、SMAD2、SMAD3、SMAD4、VEGFA、CCND1、CDK2、HSPA4、HIF1A、CREB1,NR3C1和STAT5A)。最终基于2个circRNA、11个miRNA和14个核心mRNA构建了circRNA-miRNA-mRNA调控网络。结节性甲状腺肿组织中异常表达的circRNA及相关的circRNA-miRNA-mRNA调控网络可能成为结节性甲状腺肿诊断与治疗的新靶点。     

番茄活体再生中novel microRNA差异性表达谱及其靶基因的功能分析

miRNA广泛参与植物生长发育的调控,但与植物活体再生相关的miRNA研究还未见报道。本研究以不依赖外源激素发生在番茄活体植株伤口上的再生体系为实验材料,构建了愈伤组织分化过程中的小RNA文库。通过高通量测序,在对照组与活体再生组分别鉴定了82个与75个novel miRNA,其中36个差异性表达。差异表达的miRNA共预测到2 159个靶基因,通过靶基因注释,发现两个miRNA,Novel-56和Novel-128,调控与植物顶端分生组织生长相关的NAM基因。设计茎环引物对两个miRNA进行了鉴定。本研究首次鉴定了植物活体再生中的novel miRNA表达谱,揭示了活体再生中特异表达的novel miRNA,有助于更好的理解番茄活体再生机制。     

结肠癌中核内miRNA的激活调控作用研究

为了探究增强子介导的核内miRNA在结肠癌发生中的作用,本研究筛选了结肠癌中的差异表达的miRNA数据、结肠的特异性增强子数据、结肠癌中差异表达基因数据,利用细胞核内miRNA靶向增强子预测算法,筛选miRNA调控的结肠特异性增强子;利用增强子靶基因预测数据,筛选核内miRNA调控的差异表达靶基因,并且构建核内miRNA-靶基因网络,并通过网络的分析和筛选获得结肠癌中关键的致病基因,同时对网络中的靶基因进行GO的功能注释。结果表明,我们所构建的核内miRNA-激活调控靶基因网络包含miRNA-靶基因关系对2 121个,259个节点,其中包含34个下调基因、183个上调的基因,7个下调的miRNA,35个上调的miRNA。而后我们分析了网络进行的节点度的整体分布情况,发现网络中大部分的节点的度都是小于10的,仅有少量miRNA结合和部分的差异表达基因节点的度大于10。核内miRNA主要通过激活调控了一些应激反应相关的功能和,同时,抑制调控了细胞周期、细胞凋亡、细胞死亡巨噬细胞代谢等相关功能,通过激活和抑制相关功能诱发结肠癌的发生。从核内miRNA的激活调控角度研究结肠癌的发病机制,是对原有细胞浆中miRNA抑制调控机制的补充,也为结肠癌的系统研究提供了新的视野。     

DAPK1、hTERT在口腔鳞癌中的表达及其临床意义研究

目的:探讨凋亡相关蛋白激酶1(DAPK1)、端粒酶催化亚单位(hTERT)在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的表达,并探讨其临床意义。方法:应用免疫组织化学方法检测DAPK1、hTERT在93例OSCC组织及10例癌旁正常组织中的表达,并分析其与OSCC临床病理参数之间的关系及其在OSCC浸润前沿中的作用。结果:癌旁正常组织中DAPK1的表达显著高于OSCC组织中DAPK1的表达,且高、中、低分化OSCC组织中DAPK1的表达比较均有显著差异(P0.05),OSCC浸润前沿组织中DAPK1的表达低于非前沿部分(P0.05),而DAPK1的表达与OSCC浸润前沿的IFG总分无显著相关性(P0.05)。癌旁正常组织中hTERT的表达显著低于OSCC组织中hTERT的表达(P0.05),且高、中、低分化OSCC组织中hTERT的表达比较均有显著差异(P0.05);OSCC浸润前沿组织中hTERT的表达高于非前沿部分(P0.05),且与OSCC浸润前沿的IFG总分有关(P0.05)。DAPK1、hTERT的表达均与OSCC患者的性别、年龄、淋巴结转移无显著相关性(P0.05)。结论:口腔鳞状细胞癌组织,特别是其前沿组织中DAPK1的表达显著下调和hTERT的表达明显上调,可能通过阻碍口腔鳞状细胞癌细胞凋亡,共同促进口腔鳞状细胞癌的生长、分化和浸润。     

MicroRNA与肺癌发生、诊断及治疗

微小RNA(miRNAs)是一大类小的非编码RNA,它通过与靶mRNA 3′非翻译区部分互补配对来调节特定基因的表达。近来研究表明,miRNA可作为癌基因或抑癌基因在肺癌发生发展过程中起重要作用。比较癌组织和非癌组织中miRNA表达谱的差异可筛选出部分miRNA分子作为肺癌诊断和预后判断的潜在生物标记。调节具有致癌或抑癌功能的miRNA表达可能成为肺癌治疗新方法,而结合传统放化疗及其敏感性miRNA标志也为肺癌治疗研究提供了新的策略。该文对miRNA在肺癌发生与发展、基因诊断和治疗中的作用做一综述。     

星形细胞瘤生存预后相关miRNA-mRNA调控关系对筛选

利用GEO数据库中的芯片数据,筛选与星形细胞瘤生存预后相关的miRNA-mRNA调控关系对,为后续研究提供理论支持.下载芯片数据利用R语言进行差异表达分析,得到星形细胞瘤较正常组织表达显著改变的miRNA与mRNA;通过miRNA靶基因预测,将靶基因与差异表达mRNA取交集,明确mRNA与miRNA之间的关系;利用GE...     

具核梭杆菌通过Toll样受体促进口腔鳞状细胞癌发生发展的研究进展

口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)是常见的恶性肿瘤,其发病率和致死率位于口腔肿瘤的首位。目前,世界范围内约四分之一的恶性肿瘤与微生物感染相关。牙周主要致病菌具核梭杆菌(Fusobacterium nucleatum,F.nucleatum)可促进食管癌和结直肠癌恶性转化,并且与口腔鳞状细胞癌的发生发展密切相关。F.nucleaum通过与OSCC细胞外膜受体的相互作用,上调Toll样受体表达,调节免疫因子IL-6、IL-8等,实现对OSCC发生发展的影响。本研究将对Toll样受体在F.nucleaum促进OSCC发生发展中的作用机制作一综述。     

肾透明细胞癌相关微小RNA的研究进展

微小核糖核酸(miRNAs)是一类长约22个核苷酸的非编码单链小核糖核酸分子,miRNA通过与靶mRNA 3'端非翻译序列完全或部分互补结合,导致靶mRNA降解或转录后翻译抑制,从而调控靶基因的表达.最新研究显示人类血清/血浆中miRNA表达稳定,并在肿瘤患者血清中发现多种miRNA,其中的一些已经被证实与肾癌发生及发展相关,以往miRNA与肾癌的研究方.向多集中于肾癌组织,尽管发现很多有差异的miRNA,但不同研究者之间的结果常难以相互验证,而最近研究证实血清miRNA具有组织相关性和器官特异性,并对某些肿瘤具有高敏感性和特异性,因此其有望成为新的肿瘤标志物.肾癌是国内泌尿系统的第二常见恶性肿瘤,而且其近年来发病率和死亡率有逐年增高的趋势.由于肾透明细胞癌是肾癌的主要亚型,因此本文就血清miRNA在肾透明细胞癌的表达及其作用的研究进展作一综述.