巨大DNA分子的制备与操作进展

(一) 绪言当今分子生物学中有关基因组顺序组织的研究主要是通过遗传图谱和物理图谱所提供的信息。在某些较简单的物种中,遗传图的分辨率可达单个碱基对的水平,但在其它物种如大部分寄生性原生动物中,根本就未能研究其遗传图谱,因为尚无合适的研究方法。哺乳动物遗传图谱的分辨率在5cM至25cM之间(小鼠     

植物物种基因图谱研究的新发现

最近,研究植物物种遗传的研究人员发现,某些植物物种基因组间极其相似。这是参加加州圣地亚哥的第一届植物基因组学术讨论会的学者们所报告的研究成果。会议由美国农业部及农业试验站主办的。无疑这一成果将加快植物基因组遗传图谱分析,丰富该项研究内容,因为现有遗传学知识可用于相近物种的遗传图谱分析。 同传统的植物育种不同,遗传的植物育种还刚刚开始。常规育种学家可在观察十万多个个体的基础     

林木遗传图谱构建的研究进展

高密度分子遗传连锁图谱对分析植物遗传变异、标记目标性状、数量性状定位和分子辅助选择改良性状均具重要价值.由于林木具有世代长、高度杂合、遗传负荷大等遗传特性,使其遗传图谱研究不同于其他物种,其遗传连锁图谱的构建相对复杂.目前,一些林木的遗传连锁图谱已经产生.简要综述了林木遗传图谱研究现状和策略,并对构建高质量林木遗传图谱作了展望.     

DNA分子标记在药用植物中的应用

对DNA分子标记技术在药用植物鉴定、中药质量标准化、遗传图谱构建和近缘物种进化关系等方面的研究进展进行了综述,并展望了分子标记技术在药用植物研究中的发展前景。     

简单重复序列的筛选与应用

综述目前简单重复序列再(SSR)4种筛选方法的基本原理和主要步骤;介绍SSR标记在遗传多样性分析、遗传图谱构建、物种分类和系统发育研究及比较基因组学中的应用。     

植物的比较基因组研究和大遗传系统

植物的比较基因组研究和大遗传系统沈利爽,朱立煌（中国科学院遗传研究所,植物生物技术实验室,北京１００１０１）一、前言自Ｂｏｓｔｅｉｎ［１］提出ＲＦＬＰ的概念以来遗传作图工作在许多物种中取得了长足进展。在动物中,由于人类基因组计划的实施已获得人类和小鼠的高密度遗传图谱［２,３］在该计划的带动下,牛、羊等动物［３,４］也已绘制了遗传图谱。     

微卫星标记及其在鸟类中的应用

微卫星DNA作为一种分子标记,以其诸多优点被认为是各类遗传标记中最有价值的一种。目前已被广泛应用于鸟类的研究中。本文介绍了微卫星DNA标记的分布特点、突变机制和作为分子标记的特点,并综述了微卫星DNA标记在鸟类的亲权分析及种类鉴定、遗传图谱构建及基因定位、物种进化历史揭示和遗传多样性研究中应用现状。     

林木遗传图谱研究现状及发展趋势

林木具有世代长、高度杂合、遗传负荷大等遗传特性,使其遗传图谱研究不同于其他物种。高质量林木遗传图谱,可进行林木近缘树种比较图谱研究,了解林木的基因组结构和进化历程,进行有效QTL定位研究及开展林木复杂性状的标记辅助选择。目前林木作图存在着群体较小,构建的图谱和定位的QTL存在连锁平衡,以及作图策略未充分考虑林木的遗传学特性等问题。扩大作图群体、选择高度保守的标记系统以及研究适合林木作图的理论和方法将有助于林木基因组研究向纵深发展 。     

利用显性分子标记和F_1群体进行林木遗传连锁图谱的构建

构建遗传图谱是当前生物学研究领域中的一个热点,进行图谱构建,林木与作物既有共性,又有各自的特点。因为进行图谱构建一是要有合适的分离群体,二是要有能揭示亲本多态性的遗传标记。两者可利用的遗传标记是一样的,但在进行作图群体构建时却存在一定差异,林木的遗传组成高度杂合,大多数林木为长期异交的树种,一般都有自交不亲合和近交衰退现象,象作物那样利用近交系或其它的高世代群体进行遗传图谱构建是不太可能的。由于研究方法的不同,以前的林木育种工作者很少留意建立和保存谱系清楚的Ｆ_２和ＢＣ_１群体,由于林木生命周期很长,建立这样一些高世代的群体也需要很长的时间,而且除了杨树、柳树等一些可在温室内水培杂交的物种,大多数林木的控制授粉杂交操作也是很困难的。因此研究过程中,等待材料的问题成为目前林木遗传图谱构建的主要限制因子之一。如何利用现成的材料和低世代群体,对林木遗传图谱构建工作的广泛开展具有重要意义。下面就这一问题作一些理论上的探讨和分析。     

EST-SSR及其在植物基因组学研究中的应用

数量迅速增加的表达序列标签已经成为开发分子标记的重要资源。EST—SSR是基于表达序列标签开发微卫星的一种新型分子标记,与基因组SSR相比,EST-SSR具有在植物物种之间可转移性的优点。目前,EST—SSR被广泛应用于植物基因组学研究如遗传图谱构建、比较作图、遗传多样性评价、种质鉴定、系统发育与进化研究等方面。该文介绍了EST—SSR原理、引物开发、实验方法,并对其物种间通用性以及其在植物基因组研究中的应用进行了评述。     

重要花卉植物高密度遗传连锁图谱构建研究进展

遗传连锁图谱是以遗传标记间重组频率为基础的染色体或基因组内位点相对位置的线性排列图,高密度遗传图谱构建可实现物理图谱和遗传图谱的整合,对促进基因图位克隆具有重要作用。利用遗传图谱可有效地提高育种效率和改良品种。重要花卉植物高遗传图谱精密度尚无法满足精细定位研究的要求,百合、紫薇、郁金香、向日葵等重要花卉高密度遗传图谱构建研究较少,制约了花卉植物分子育种研究进程。概述了高密度遗传图谱构建流程及作图方法,综述了牡丹、梅花、月季、菊花、兰花、荷花、桂花等重要花卉植物遗传图谱构建研究进展,讨论了重要花卉植物高密度遗传图谱构建存在的主要问题,对今后重要花卉植物遗传图谱构建研究的发展方向及其在育种中的应用前景进行了展望,以期为花卉植物基因定位、辅助基因组组装、比较基因组学、基因克隆、分子标记辅助育种等提供参考。     

分子标记技术及其在芸苔属植物研究中的应用

本文参考了国内外近年来最新研究进展,对分子标记概念和类型作了简要介绍;论述了分子标记技术在植物改良中的主要用途：遗传图谱的构建,基因定位,物种间基因组比较,分子标记辅助育种;较详细地介绍了芸苔属植物在分子标记方面的研究进展。     

分子标记技术及其在芸苔属植物研究中的应用

本文参考了国内外近年来最新研究进展,对分子标记概念和类型作了简要介绍;论述了分子标记技术在植物改良中的主要用途：遗传图谱的构建,基因定位,物种间基因组比较,分子标记辅助育种;较详细地介绍了芸苔属植物在分子标记方面的研究进展。     

Mapplotter——一个输出遗传图谱、图示基因型和QTL曲线图形的软件

分子遗传图谱和ＱＴＬ定位已经在动植物的数量遗传学研究和育种工作中获得广泛应用。现在 ,已经有多种商业化软件或免费软件可以应用于遗传图谱的计算或ＱＴＬ定位。但绝大多数此类软件没有提供图形化输出功能 ,或者只能在Ｍａｃｉｎｔｏｓｈ平台上获得有关遗传图谱 ,图示基因型或ＱＴＬ曲线的图形化输出〔１〕。因此在实际应用中很不方便。遗传图谱计算中应用最广的是Ｍａｐｍａｋｅｒ［２］ 或者是Ｊｏｉｎ ｍａｐ［３］。其中Ｍａｐｍａｋｅｒ可在Ｍａｃｉｎｔｏｓｈ平台上获得图形化输出 ,但在ＰＣ平台上只提供了有限的图形化输出功能。…     

基于SLAF-seq技术的动物基因组应用及进展

近年来随着测序技术的迅速发展,简化基因组中的SLAF-seq是一种既经济又高效的、且在全基因组范围内挖掘SNP位点的测序技术。该技术已广泛应用于群体进化分析、遗传图谱的构建和QTL定位等大样本群体研究。该文综合国内外文献介绍SLAF-seq技术在动物基因组研究方面的应用,分析SLAF-seq技术在动物学中的发展方向并做出展望,以期为动物的遗传学和物种保护等相关研究开启一扇新的大门。     

水稻单核苷酸多态性及其应用现状

单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms, SNPs）在水稻中数量多,分布密度高,遗传稳定性高。水稻SNPs的发现方法主要有对样本DNA的PCR产物直接测序、从SSR区段检测SNPs和从基因组序列直接搜索等。目前已有多种基因分型技术运用到了水稻SNPs检测,SNPs检测的高度自动化使水稻SNPs基因分型非常方便。单核苷酸多态性在水稻遗传图谱的构建、基因克隆和功能基因组学研究、标记辅助选择育种、遗传资源分类及物种进化等方面的应用具有巨大潜力。     

乌拉尔图小麦的遗传学研究进展

乌拉尔图小麦(T．urartu)是四倍体小麦和普通小麦A基因组的供体,它在普通小麦的发育和进化中起着关键的作用。本文首先介绍了该物种的发现、形态特征和在分类学上的位置,然后从遗传多样性、它与小麦属内其它种的关系、构建基因组文库和1Ay高分子量麦谷蛋白亚基基因的研究等方面综述了乌拉尔图小麦的遗传学研究进展。为了加快普通小麦遗传学、发育和进化、新品种选育等方面的研究,本文建议今后应重点从挖掘优异基因、构建遗传图谱及分离探针和微卫星引物等方面对乌拉尔图小麦作进一步的研究。     

番茄和桃基因组的微同线性研究

番茄和桃是茄科和蔷薇科的重要模式植物.近年来, 随着它们基因组测序工作的展开, 相关基因组序列快速累积, 为番茄和桃遗传图谱和物理图谱的比较分析及深入了解其进化关系提供了可能.文章对番茄和桃的基因组进行了比较, 通过番茄遗传图谱与桃物理图谱、番茄物理图谱与桃遗传图谱以及番茄物理图谱与桃物理图谱等3个层面的数据比对分析, 结果揭示在这两个基因组间存在着大量的微同线性片段.这些同线性片段中所包含的保守同源基因对的数目较少(总计297个同线性片段中仅有36个片段包含有两个以上的同源基因对).这些同线性片段都是小范围的, 并且有部分微同线性片段在不同的染色体或者BAC contig之间构成了一个相互关联的网络结构.通过与番茄的EST文库比对, 发现了9个与果实发育和成熟相关的微同线性基因.这些微同线性基因的发现对于进一步研究这两个亲缘关系比较远的物种在果实发育与成熟方面的共性提供了线索.     

微卫星DNA标记技术及其在植物研究中的应用

微卫星DNA(或简单重复序列,simplesequencerepeats,SSR)是继RFLP、RAPD等分子标记后出现的第二代分子标记技术。随着分子生物学的发展,微卫星标记技术在植物基因组中的应用越来越广泛。由于SSR具有多态性高,呈共显性遗传,遵守孟德尔式分离,在数量上没有生物学的限制,实验操作简单,对样品质量要求不高等特点,因此被广泛用于植物遗传图谱的构建、基因定位、构建指纹图谱、遗传多样性及物种进化与亲缘关系的研究等方面。     

大白菜分子遗传图谱构建研究进展

构建大白菜连锁遗传图谱可为其基因组结构分析和比较提供有力工具,可有效应用于数量性状基因定位,基因图位克隆和分子标记辅助育种等研究,因此,构建一张高密度的大白菜遗传图谱具有重要意义。主要从作图群体和分子标记技术两个方面综述大白菜类遗传图谱的研究进展。