网络药理学与药物发现研究进展

将生物学网络与药物作用网络整合,分析药物在网络中与节点或网络模块的关系,由寻找单一靶点转向综合网络分析,就形成了网络药理学.通过系统生物学的研究方法进行网络药理学分析,能够在分子水平上更好的理解细胞以及器官的行为,加速药物靶点的确认以及发现新的生物标志物.这使得我们有可能系统地预测和解释药物的作用,优化药物设计,发现影响药物作用有效性和安全性的因素,从而设计多靶点药物或药物组合.本文综述了网络药理学的新近研究进展,介绍在生物学网络的各个层面上网络药理学的研究和应用,展望网络药理未来的发展方向,对药物发现具有重要意义.     

计算系统生物学:理论、方法及在药物研发中的应用

计算系统生物学是一个多学科交叉的新兴领域,旨在通过整合海量数据建立其生物系统相互作用的复杂网络。数据的整合和模型的建立需要发展合适的数学方法和软件工具,这也是计算系统生物学的主要任务。生物系统模型有助于从整体上理解生物体的内在功能和特性。同时,生物网络模型在药物研发中的应用也越来越受到制药企业以及新药研发机构的重视,如用于特异性药物作用靶点的预测和药物毒性评估等。该文简要介绍计算系统生物学的常见网络和计算模型,以及建立模型所用的研究方法,并阐述其在建模和分析中的作用及面临的问题和挑战。     

中药网络药理学研究中的生物信息学方法

为了更有效地治疗癌症、心血管疾病、免疫系统疾病等复杂疾病,基于分子网络的多靶点药物发现理念逐渐成为一种新的趋势,而中药整体、辨证、协同的用药观再一次引起了药物发现领域的极大兴趣。中药在治疗复杂慢性疾病方面有确切的疗效和较小的毒副作用。中药网络药理学从分子网络调控的水平上阐明中药的作用机制,为多靶点药物发现提供有益的启示和借鉴,并有可能从临床有效的中药反向开发现代多组分、多靶点新药。针对基于生物分子网络的中药药理学研究路线中的4 个步骤,介绍近年来中药网络药理学研究中相关的生物信息学方法。     

教学简笔画在药理学教学中的应用

教学简笔画是教师在教学中利用黑板,把文章的重点、难点和中心意义,以凝炼、概括的简图形式显示出来,使学生更直观、形象地理解文章内容的一种板书形式.作者认为以这种板书为媒介能有效建立教学中师生间的良性互动,从简图表达人体的细胞、组织、器官入手,讲授药物与机体之间的相互关系,直观清晰地表达药效学、药动学的有关概念,以此提高学习效率.     

系统比较方法的原理及应用

物种的大部分性状与其系统进化过程相联系,亲缘关系近的物种,其性状差异通常较小.因此在种间或更高分类单元层次研究性状之间的关系,或性状与环境间关系时需要考虑系统进化的影响,以满足常规统计分析对于样本独立性的要求.自20世纪80年代以来国际上已经陆续推出一系列的系统比较方法,其共同原理是:在推断物种间系统关系的基础上,在种间水平上比较,将原本不符合样本独立性的物种性状或环境变量数据,将其转化为适用于常规统计分析方法的彼此独立的数据,然后运用常规统计方法分析,得到排除了系统进化历史影响的物种性状间或者物种性状与环境变量间的关系.首先简单介绍了运用系统比较方法之前的建立系统关系和数据诊断这两个步骤,在此基础上阐述简单独立对比分析、Felsenstein的独立比较方法和自回归方法这3种常用的系统比较方法的基本原理、各自的特点以及它们在生态学、进化生物学等领域的应用.系统比较方法已经获得广泛的应用和认可,发现了应用常规统计分析所没有能发现的问题和规律,但在构建准确反映系统进化过程的系统关系、进化模型的选择等方面仍具有一定的局限性;而生物信息学、生物系统学的发展,以及各种相关软件的开发为系统比较方法的进一步完善发展和更为广泛的应用创造了条件.     

基于分子对接和系统药理学小青龙汤治疗哮喘的作用机制

为从分子层面阐述小青龙汤治疗哮喘的作用机制,探索小青龙汤的潜在靶标,本研究检索中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)并根据口服生物利用度(oralbioavailability,OB)、药物相似性(drug-likeness,DL)筛选出小青龙汤的活性成分,利用Pharmmapper数据库筛选小青龙汤潜在作用靶点,挖掘CTD、Genecards数据库以筛选与哮喘相关的作用靶点,利用Cytoscape 3.6.1软件构建小青龙汤的蛋白互作网络图、化合物靶点图,并通过计算拓扑学参数找到小青龙汤中关键的作用靶点和化合物。对小青龙汤对哮喘的作用靶点进行GO分析和KEGG分析。利用iGEMDOCK软件进行分子对接,预测作用靶点和主要化合物的结合度。通过筛选得到小青龙汤活性成分、潜在作用靶点;GO分析得到43个生物学过程、11个细胞组成和9个分子功能;KEGG分析包括PI3K-Akt信号通路、HIF-1信号通路、Wnt信号通路等。初步验证和预测了小青龙汤对治疗哮喘的作用机制,并为进一步深入揭示其作用机制提供参考。     

整合代谢组学和生物信息学策略在解析中药系统复杂性中的应用

中药在化学组成方面的复杂性决定了其作用方式和作用过程的复杂性。传统研究方法缺乏系统性,使得一系列制约中药现代化发展的关键问题一直未能得到很好的解决,包括中药化学物质组表征、中药作用机制、中药方剂配伍规律以及中药毒性机制等中药系统复杂性问题。代谢组学作为一门全新的组学技术,秉承了从机体全局系统出发来考量机体内源性小分子物质与外源性干预物质（如药物）的相互作用的理念,与在中医药理论指导下的中药作用原理思路一致。近年来,人们尝试将整合代谢组学技术和生物信息学策略用于解开上述中药关键问题,并已取得了一定的成果。但其在理论挖掘、策略设计、方法开发和实践拓展诸多方面都有很多具体的工作需要进一步推进。对整合代谢组学和生物信息学策略在解析中药系统复杂性中的应用进行综述。     

蛋白质组学技术在网络药理学中的应用

蛋白质组学发展至今已日趋成熟,在生物医药相关领域研究中的应用显著增加,与之相关的样品制备技术、蛋白定量方法及先进的质谱仪器也得到了快速发展。网络药理学是近年来提出的新药发现新策略,是药理学的新兴分支学科,它从整体的角度探索药物与疾病的关联性,发现药物靶标,指导新药研发。将蛋白质组学技术应用于网络药理学研究,能使研究人员系统地预测和解释药物的作用,加速药物靶点的确认,从而设计多靶点药物或药物组合。综述了蛋白质组学技术的新近研究进展,并简单概述了其在网络药理学中的应用。     

代谢性心血管病变-生物信息学的应用北大核心CSCD

随着高通量生物学技术在生物医学研究中的广泛应用,生物信息学在生物医学研究中的应用也越来越广泛。在代谢性心血管病变研究中,从DNA到RNA,从蛋白质到小分子,再到系统水平,都能找到生物信息学成功应用的证据。本章将简要介绍DNA、RNA、蛋白质、药物、生物网络等各层面具有代表性的生物信息学方法和工具在代谢性心血管病变研究中的应用。     

量子药理学及其在我国的现状

本文试图使药物化学家和药理学家充分了解量子药理学在研究和开发新药中的作用。文中先简单说明量子药理学的兴起,尔后分四段叙述,即理论基础;扼要介绍常用的半经验方法;被计算的分子性质,特别是电荷分布和分子静电势;以及量子药理学在我国的现状。     

从系统生物学到配伍西药:中药现代化的一个核心战略

国际范围内系统生物学的兴起和发展在为中药现代化发展提供机遇的同时,更容易为西药的创新研发提供方便的手段,因为西药在分子水平上的研究基础比中药要强大得多。系统生物学对分子网络包括基因网络的深层把握将自动把西药的设计引向配伍的道路,而配伍西药可能就是中药现代化的一个终极目标。所以说中药现代化其实面临着潜在的巨大危机。如何化不利形势为有利形势,需要中药现代化的决策部门在战略战术上提出及时的应对方案。需要从国家利益的角度吸纳不同领域的研究力量并在分子水平上极大地拓展相关研究,不失时机地开展与西药配伍潜势相结合的具体研究。     

传统中国医药与现代系统生物学研究理论的殊途同归

系统生物学是研究一个生物系统中所有组成成分(基因、mRNA、蛋白质等)的构成与组分之间相互关系的学科,近年来,系统生物学作为后基因组学时代研究的一个重要内容,已广泛深入到生命科学和医药学的各个领域。而作为中国传统医学而言,似乎与之相去甚远,然而当我们对这两个新老学科基础理论进行比较时,我们发现:传统中国医药与现代系统生物学研究理论的殊途同归。有鉴于此,本文论述了系统生物学和中医学的思想起源、相互联系,基于系统生物学的发展、研究思路和方法,阐述了生物学由还原论的研究方法过渡到系统论的研究方法,强调对生命现象从系统和整体的层次进行研究和把握,对传统中医学研究方法的变革起到了推动作用,最后对系统生物学在中医药学未来发展进行了评价。     

中药抗肿瘤作用的研究进展

应用中草药抗肿瘤的研究很早就已是医学科技工作者的重要研究领域;但是,近年来中草药抗肿瘤的研究变的越来越火热,越来越深入,许多研究工作已经不单纯局限于抗肿瘤的基本活性,更多的研究已经深入到抗肿瘤作用机理的层面;本文从中药有效成分对诱导肿瘤细胞凋亡、抑制肿瘤血管的生长、诱导肿瘤细胞分化、逆转肿瘤细胞多药耐药性、提高机体免疫力等方面对中药抗肿瘤研究的当前状况进行了综述,具体情况如下：     

中医药参与干细胞研究特色及进展

干细胞因其具有自我更新、在特定的诱导条件下可以分化为多种工作细胞及向损伤组织迁移的能力,受到越来越多研究者的关注。近年来,有关传统中医药参与干细胞的研究已见诸多报道,本文回顾了近年来中医药参与干细胞研究的诸多报道,总结了得出了在中医经典理论指导下中医药参与干细胞研究多以补肾、益气类中药为主,以中药复方、单味中药以及中药有效组分的形式进行研究,结果表明中药可以影响干细胞的生物学特性及功能,能参与完成干细胞动员、迁移、归巢、增殖、分化等各个环节,传统的中医理论可以拓宽干细胞研究的思路,有望解决干细胞研究中的诸多难题,提示中医药在干细胞研究领域中具有较大的潜能,中医药联合干细胞治疗在临床应用中具有较大的应用前景。     

中药学专业微生物学教学新模式的研究与实践

结合中药学专业的特点和教学内容为教学对象服务的原则,以提高教学质量为目标,我们进行了中药学专业微生物学课程结构和教学内容的改革.创建了教学新模式,突出以人为本,把课程传授的知识和技能定位在学生未来学习、思维、联系新事物桥梁的基础上,对应将教学内容分为基础知识、相关知识、应用知识三部分,充分体现三基(基础理论、基本知识、基本技能),强化针对性、先进性扣启发性,以使学生构建可满足21世纪需求和可持续发展的合理的知识结构.     

Pathways through the Border of Biomedicine and Traditional Chinese Medicine: A Meeting of Medical Systems in a Japanese Psychiatry Department

This article examines a meetingof biomedicine and Traditional Chinese Medicine(TCM) in the context of a psychiatry departmentin a Japanese national medical school. Themeeting is explored through stories of fourindividuals, the professor of the departmentand three Chinese physicians studying asexchange students. Global structures of medicalauthority are revealed in the way eachparticipant follows a different trajectorythrough this space, positioning themselves byvirtue of the medical epistemologies theyembody. The particular geography of thismeeting between systems allowed for aproductive synthesis of diagnostic techniques,quite different from the more commontherapeutic syntheses. This synthesis isparticularly important for contemporarypsychiatry because of its ability to attend todimensional as opposed to categorical aspectsof mental health.     

中医学跨越“卡夫丁峡谷”的可能性

西医学是从自然哲学模式,经近代生物医学模式而发展到现代生物心理社会医学模式的,而中医学仍处于古代自然哲学医学模式的历史阶段,与现代生物-心理-社会医学模式同形而异质。在现代,中医学要么通过生物医学的＂卡夫丁峡谷＂而追随在西方医学之后,要么消解于西方现代医学之中,要么跨越生物医学的＂卡夫丁峡谷＂而直接跃迁至现代医学。而实现跨越的两个基本条件是实现中医学基础理论的创造性转化与中医文化的大众化。     

一种气射流型中医按压方法与仪器

本文介绍一种根据中医推拿的按压手法研制的气射流按压仪,通过控制气压的大小和气射流脉冲频率来模拟按压手法。在对人体手部穴位的试验中我们发现,无论控制多少气压值,在离喷口一定距离处能感受的力最大,此段距离应该是仪器对穴位进行治疗的最佳距离。我们通过更精确的实验和轴对称亚声速等温自由射流的工程计算解释了这个现象并为确定这个距离提供理论依据。     

兽医中药在宠物临床上的应用

本文系统综述了我国兽医中药在宠物临床上的应用历史及概况。从兽医中药起源,到中药在宠物临床上的古今应用。重点针对宠物临床中常见病、多发病如犬猫皮肤寄生虫病、皮肤真菌病、胃肠道疾病、传染病、肝胆疾病、心肺疾病、腰病以及虚弱性疾病等等进行了归纳总结。同时指出,随着宠物饲养社会功能的变化,宠物中药将会伴随着宠物市场的扩大迎来更大的发展空间。