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Time-Varying Coefficient Models for the Analysis of Air Pollution and Health Outcome Data
Nous présentons un modèle à coefficient dépendant du temps pour étudier la relation entre exposition aiguë (à court terme) à la pollution atmosphérique et altérations de la santé. Ce modèle permet au risque relatif de varier en fonction du temps comme cela peut se produire en cas d'interaction avec la température ou de modification de la composition en polluants, par exemple en particules solides. Le modèle fournit une estimation lissée de ces effets dépendant du temps sans qu'il soit nécessaire de spécifier une forme paramétrique particulière. Cette forme est estimée à partir des données à l'aide de fonctions spline cubiques pénalisées. Nous développons des modèles de régression de Poisson dont les coefficients sont estimés soit en maximisant une quasi-vraisemblance par une procédure itérative de moindres carrés repondérés, soit par une approche bayésienne utilisant une méthode de Monte Carlo par chaîne de Markov (MCMC). L'efficacité de ces approches pour estimer différents effets dépendant du temps est évaluée par simulations et les modèles sont appliqués aux données recueillies dans quatre villes pour l'enquête NMMAPS (Enquête Nationale Morbidité, Mortalité et Pollution Atmosphérique).     

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Determining the Effective Sample Size of a Parametric Prior
Nous présentons une définition de la taille d'échantillon efficace d'une loi a priori paramétrique dans un modèle bayésien, et proposons des méthodes pour calculer la taille efficace d'échantillon dans différents cas. Notre approche construit en premier une loi a priori choisie pour être vague dans un sens convenable, et met à jour cette loi a priori pour obtenir une suite de lois a posteriori correspondant à chacune des gammes de tailles d'échantillon. Nous calculons ensuite une distance entre chaque distribution a posteriori et la distribution a priori paramétrique, définie en terme de courbure du logarithme de chaque distribution, et la loi a posteriori minimisant la distance définit la taille d'échantillon efficace pour la loi a priori. Pour les cas où la distance ne peut pas être calculée de façon analytique, nous fournissons une approximation numérique basée sur une simulation de Monte Carlo. Nous fournissons en général des lignes de conduite pour l'application, illustrons la méthode dans plusieurs cas standards où la réponse est évidente et l'appliquons dans quelques cas moins standards.     

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A Note on Testing Separability in Spatial-Temporal Marked Point Processes
Dans l'analyse du risqué environnemental, il est usuel de supposer l'indépendance stochastique (ou séparabilité) entre les traces associées aux événements aléatoires d'un processus spatio-temporel. Schoenberg (2004, Biometrics 60, 471–481) a proposé plusieurs tests statistiques de cette hypothèse, et a utilisé des données simulées pour en évaluer la performance. Il a obtenu un test de type Cramer-Von Mises, puissant pour détecter des écarts graduels à la séparabilité, mais non uniformément puissant sur une classe large de modèles alternatifs. Nous présentons une approche semi-paramétrique pour modéliser les hypothèses alternatives de séparabilité, et obtenons une statistique de score test. Nous montrons une relation entre ce score test et certaines des statistiques proposées par Schoenberg. Plus précisément, toutes sont des versions différentes des statistiques pondérées de Cramer-Von Mises. Ceci éclaire les causes des ressemblances et des différences entre les performances des tests. Nous insistons également sur certaines difficultés au contrôle du risque d'erreur de première espèce dans le test des résidus de Schoenberg.     

REGULAR ARTICLES

Marginal Analysis of Correlated Failure Time Data with Informative Cluster Sizes
Nous nous intéressons à la modélisation de données de survie corrélées quand la connaissance de la taille des strates peut fournir une information sur le critère de jugement. Celle-ci est basée sur une approche de ré-échantillonnage au sein des strates et sur une méthode de fonction de score pondérée. Nous déterminons les propriétés asymptotiques pour les estimateurs de ré-échantillonnage au sein des strates dans le cadre d'un modèle à risques proportionnel de Cox. Nous établissons la convergence et la normalité asymptotique des estimateurs des coefficients de régression et la propriété de convergence faible des estimateurs de la fonction de base du risque cumulé. La méthode de fonction du score pondérée consiste à prendre l'inverse de la taille des strates comme poids dans la fonction de score. Nous procédons à des études de simulations pour déterminer et comparer le comportement des estimateurs pour des échantillons finis et appliquons les méthodes proposées à une étude dentaire.     

DISTRIBUTION QUANTITATIVE DES DIVERS PHOSPHO-LIPIDES DANS LES NEURONES ET LES CELLULES GLIALES ISOLES DU CORTEX CEREBRAL DE RAT ADULTE

Resumé–— On décrit une méhode de préparation de neurones et de cellules gliales à partir du cortex cérébral, basée sur la dissociation du tissu à travers un tamis en nylon suivie ď une ultracentrifugation différentielle sur gradients de sucrose et de Ficoll.
On a dosé le DNA, ľazote protéque et les divers phospholipides. II ressort que le taux ď DNA par cellule est identique dans les neurones et les cellules gliales. Par contre, la quantité absolue ďazote protéique est 2.8 fois plus élevée dans les cellules gliales, celle des lipides totaux et des divers phospholipides 5-6 fois plus élevée.
La proportion de chacun des phospholipides dérminée par rapport aux phospholipides totaux est similaire dans les deux types cellulaires.     

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A Simple Local Sensitivity Analysis Tool for Nonignorable Coarsening: Application to Dependent Censoring
Les données censurées à droite ou sur certains intervalles de temps sont des cas particuliers fréquents de données dégradées (Heitjan et Rubin, 1991). Comme avec les données manquantes, les méthodes statistiques courantes qui ignorent la nature aléatoire du mécanisme de dégradation peuvent conduire à des inférences incorrectes. Nous généralisons un outil simple d'analyse de sensibilité, l'indice de sensibilité locale à la non-ignorabilité (Troxel et al., 2004), à un modèle général de dégradation. En transformant cet indice en un simple graphique on peut facilement établir la sensibilité des inférences-clés à une dégradation non ignorable. Nous illustrons la validité de la méthode sur un exemple simulé, et l'appliquons à des observations de transplantation cardiaque censurées à droite, et à un essai clinique dans la maladie HIV où le temps nécessaire pour atteindre une charge virale détectable est censuré sur certains intervalles.     

Ormieresia carcini gen. n., sp. n., Microsporidie du Crabe Méditerranéan, Carcinus mediterraneus Czerniavsky, 1884: Cycle Évolutif et Étude Ultrastructurale

RÉSUMÉ. Une nouvelle microsporidie, Ormieresia carcini gen. n., sp. n., est trouvée dans Carcinus mediterraneus Czerniavsky, 1884. Son évolution et ses ultrastructures sont étudiees.
Le cycle débute par un méronte limité par une membrane unitaire et possédant un diplocaryon. Toute la sporogonie se déroule dans la musculature de l'höte. Les stades sporogoniaux sont enveloppés dans une membrane pansporoblastique persistante. Dans chaque pansporoblaste, la sporoblastogenése (donnant naissance à 8 sporoblastes) est particulière; un plasmode sporogonial octonucléé manque. Au cours des divisions schizogoniques et sporogoniques, chaque centre cinétique est formé de 2 plaques, une incluse dans l'enveloppe nucléaire, l'autre occupant une position extranucléaire. Les sporontes en division et les sporoblastes sécrètent des substances métaboliques (granules, tubes) qui sont déposées dans l'espace pansporoblastique.
La spore uninucléée est longue et cylindrique (19,1 × 2,4 μm). Un manubrium rectiligne traverse la spore. Son extrémité postérieure se rétrécit brusquement en un filament polaire décrlvant 4 ou 5 tours de spire. L'extrémité antérieure du manubrium est attachée au capuchon polaire lui-même comprimé par un double anneau. La partie antérieure du manubrium est entourée par un polaroplaste formé d'une zone spongieuse et d'une zone lamellaire.     

ACETYLCHOLINESTERASE DU MUSCLE, DE LA MOELLE EPINIERE ET DU CERVEAU DE GYMNOTE

Résumé— Dans le but d'étudier la localisation cytologique de I'AChE dans divers tissus de Gymnote, nous avons préparé un antisérum anti-AChE en utilisant une préparation commerciale partiellement purifiée, contenant une forme globulaire de l'AChE G _p. Cet antisérum réagit dans le test de double diffusion avec l'enzyme purifié G _p, mais également avec la forme globulaire spontanée G _b, ainsi qu'avec les trois espèces 'natives' asymétriques A , C et D . Nous avons mis en évidence l'existence de ces quatres formes G _b, A , C et D dans des extraits de cerveau, de moelle épinière et de muscle de Gymnote. La forme globulaire G _b est particulièrement abondante dans la moelle épinière et à un moindre degré, dans le cerveau. La distribution des espèes est identique dans le muscle et l'organe électrique. Grâce à notre antisérum, nous avom Iocalisé par immunofluorescence indirecte l'AChE dans les terminaisons nerveuses sur le muscle, dans le cytoplasme de certains neurones situés dans le centre moteur de la décharge (moelle épinière) et au voisinage du noyau central de la décharge (cerveau).     

Neglect as project: how two societies forget

La tendance est aujourd'hui à vouloir oublier les détails, voire les souvenirs, des anciennes manières de faire lorsque les idées et les modes d'action nouveaux deviennent prédominants. L'article part de l'idée que l'oubli commence par la négligence, et plus précisément par la négligence de certains modes de comportement ou signes et pratiques matérielles rappelant un passé considéré comme désormais indésirable. Dans une communauté millénariste des Caraïbes, les souvenirs et pratiques techniques du passé sont découragés par un «travail idéologique>> qui met constamment en regard l'ordre ancien et le monde nouveau dans un processus de création : l'oubli «dirigé>>. Dans un village albanais postcommuniste, en revanche, le fait de négliger une technologie apparaît comme un processus spontané plus transparent. Dans les deux cas, les souvenirs sont consubstantiels d'un monde matériel ancien, qui doit être évité ou détruit.     

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B. C . Jung , M . Jhun , and J. W . Lee              626
Ridout, Hinde et Demétrio (2001, Biometrics 57, 219–223) ont construit un test du score pour tester un modèle de régression de Poisson à inflation de zéro (ZIP) contre des alternatives binomiales négatives à inflation de zéro (ZINB). Ils précisent que le test du score utilisant l'approximation normale peut sous estimer le niveau de signification nominal notamment pour des petits échantillons. Pour y remédier, une méthode de bootstrap paramétrique est proposée. On montre que la méthode du bootstrap garde un niveau de signification proche du nominal et a une puissance uniformément plus grande que l'approximation normale existante pour tester cette hypothèse.     

L'ornementation chez l'ostracode Phalcocythere du Pakockne: résultat d'une action morphogéne antagoniste?

Les relations spatiales liant la désorganisation des rangées de fossettes en relation avec le développement des tubercules et des épines chez quatre morphes de Phalcocythere cultrata (Apostolescu, 1961) et deux morphes de Phalcocythere vesiculosa (Apostolescu, 1961) suggérent la possibilité d'une action neurosécrétrice sous la dépendance d'un ou de plusieurs génes à action antagoniste. Une extension de ce mécanisme supposé est proposée chez quelques Trachyle-berididae dans une perspective évolutive. □ Ornementation, paléogénétique, polymorphisme, Niger, ostracode.
Disorder in the organization of the rows of pits in relation to the development of tubercles and spines is analyzed in four morphotypes of Phalcocythere cultrata (Apostolescu, 1961) and two morphotypes of Phalcocythere vesinclosa (Apostolescu, 1961). This spatial linkage suggests the possibility of a neurosecretory effect controlled by one or several genes operating interactively. This hypothesis is applied to the interpretation of evolutionary patterns in some Trachyle-berididae. □ Ornament, paleogenetics, polymorphism, Niger Republic, ostracod.     

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Line Transect Methods for Plant Surveys
En raison de la nécessité de bien quantifier la diminution de la biodiversité, on observe actuellement un regain d'intérêt pour les méthodes de suivi de l'abondance des plantes. Les suivis par transects constituent une méthode efficace de suivi pour de nombreuses espèces. Mais dans certaines circonstances, la méthode ne fonctionne pas bien, par exemple quand les sites d'étude sont petits, quand les plantes ont des distributions très agrégées, ou quand les plantes qui se trouvent sur la ligne ne sont pas facilement détectables. Pour résoudre ces problèmes, nous utilisons une stratégie basée sur des transects croisés combinés à des méthodes qui exploitent l'information additionnelle que fournissent de tels plans expérimentaux. Cette méthode est illustrée avec des données provenant d'une colonie de primevères coucou.     

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Random Effects Modeling Approaches for Estimating ROC Curves from Repeated Ordinal Tests without a Gold Standard
Estimer la pertinence d'un diagnostic médical constitue une difficulté majeure en l'absence d'un test de référence (gold standard). Quoique la littérature scientifique abonde en la matière pour les tests diagnostiques répétés binaires, elle s'avère beaucoup plus pauvre en travaux applicables aux tests ordinaux. A cela fait exception le travail de Zhou et al. (2005), proposant une méthodologie pour estimer des courbes ROC sans gold standard, à partir des données répétées issues de tests diagnostiques ordinaux. Mais cette méthodologie repose sur l'hypothèse d'indépendance des résultats aux tests, conditionnellement au vrai diagnostic. Je propose donc ici des approches de modélisation à effets aléatoires intégrant la dépendance des tests ordinaux entre eux, et je montre, au travers de résultats asymptotiques et de simulations, toute l'importance de bien prendre en compte cette dépendance. Ces modélisations, ainsi que l'importance de la dépendance entre les tests, sont illustrées par une réanalyse des données présentées par Zhou et al. (2005) sur le cancer utérin.     

Estimating larger carnivore numbers from track counts and measurements

Résumé Avoir conscience de l'abondance des grands carnivores est très important pour la gestion de leur conservation. Cependant, l'évaluation directe des nombres de carnivores est souvent difficile, nècessitant beaucoup d'argent et de temps, ce qui importe que l'échantillonnage indirect est une alternative fiable et valable. Les techniques de recensement à distance se sont montrèes économiques, renouvelables, et objectives. Nous avons donc estimé le nombre de grands carnivores de six espèces dans une superficie assez petite au nord de l'Afrique du Sud, en comparant trois méthodes d'échantillonnage basèes sur des décomptes des traces et mesures: (i) une approche qualitative, où les individus furent identifiés de manière subjective en étudiant les différences dans les mesures des traces; (ii) une approche quantitative qui se sert de la forte corrélation linéaire de la densité des traces à la densité des carnivores démontrée dans d'autres études; et (iii) une approche quantitative qui impliquent des analyses répétées de la variance et des post-enquêtes sur les mesures des traces afin de disposer des données statistiques pour identifier les différences entre des services des traces. Les trois méthodes fournirent des résultats comparables qui semblent raisonnables et qui peuvent être une bonne indication du vrai nombre de grands carnivores dans la zone de l'étude. Les rèsultats étayent la fiabilité des estimations indirectes de l'abondance de grands carnivores basés sur les données des traces, et sont prometteurs pour des futures recherches et pour la conservation de ces animaux.     

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Sensitivity Analysis: Distributional Assumptions and Confounding Assumptions
Dans la présentation de diverses méthodes pour évaluer la sensibilité des résultats de la régression à une variable de confusion non mesurée, Lin et al. (1998) utilisent une hypothèse d'indépendance conditionnelle pour en déduire des relations algébriques entre l'effet de la véritable exposition et l'effet de l'exposition apparente dans un modèle réduit qui ne contrôle pas la variable de confusion non mesurée. Néanmoins, Hernán et Robbins (1999) ont noté que si les covariables mesurées et la confusion non mesurée affectent ensemble l'exposition d'intérêt, alors la principale supposition d'indépendance conditionnelle qui est utilisée pour en déduire les relations algébriques ne peut pas se produire. Un résultat particulier de Lin et al. n'est pas reliéà la supposition d'indépendance conditionnelle mais seulement à des suppositions concernant l'additivité. Il peut être montré que cette dernière supposition est satisfaite pour une famille entière de distributions même si les covariables mesurées et la variable de confusion non mesurée affectent ensemble l'exposition d'intérêt. Ces considérations clarifient le contexte approprié dans lequel des techniques d'analyse de sensibilité pertinentes peuvent être appliquées.     

New species of Barwing Actinodura (Passeriformes: Sylviinae: Timaliini) from the Western Highlands of Vietnam

On the basis of field observations and museum diagnosis of two specimens collected from Ngoc Linh in the Western Highlands (sometimes termed Central Highlands) of Vietnam, we here describe a new species of Actinodura. This species is most closely related to A. ramsayi of Burma, China, Laos, Thailand and Vietnam. Among other differences, it has a distinctive black crown - a feature otherwise unknown in the genus Actinodura , of which it is the southernmost known taxon. It occurs in montane evergreen forest from at least about 1100–2400 m asl and is likely to occur widely in this habitat and at this altitude elsewhere in the Western Highlands and in adjacent Laos. We present notes on the taxonomic affinities, ecology, behaviour and conservation of this new species.
A partir d'observations effectuées sur le terrain et de l'analyse en laboratoire de deux spécimens collectés au Mont Ngoc Linh dans le massif de Kontum, nous décrivons ici une nouvelle espèce du genre Actinodura. Cette espèce est la plus proche de A. ramsayi de Chine, Birmanie, Laos, Thaïlande et Viêt-nam. Elle possède une calotte noire distincte, un caractère jusqu'à présent inconnu du genre Actinodura dont elle occupè l'atire la plus mAeridionale connue. Cette espèce vit dans la forêt sempervirente de montagne entre 1100 m et 2400 m d'altitude et se trouve probablement dans un habitat et à une altitude similaires dans les montagnes environnantes du massif de Kontum et du Laos adjacent. Nous présentons ici des informations sur la taxonomie, l'écologie, le comportement et la conservation de cette nouvelle espèce.     

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On the Nonidentifiability of Population Sizes
Lorsqu'un modèle de mélange non paramétrique est utilisé pour prendre en compte l'hétérogénéité des probabilités de capture entre individus, la taille de la population n'est pas identifiable (Link 2003). Holzmann et al. (2006) ont discuté des conditions sous lesquelles une sous-famille de distribution de mélange est identifiable. Link (2006) a montré que la non-identifiabilité peut se produire dans des sous-familles identifiables. Je démontre qu'il existe une sous-famille dans laquelle chaque distribution de mélange est déterminée par son mélange et que la taille de la population admet une limite inférieure qui peut être utilisée pour construire un intervalle de confiance.     

L'ACÉTYLCHOLINE ET L'ADRÉNALINE CHEZ LES INVERTÉBRÉS

1^o. Le tableau 2 résume ce que l'on sait sur la présence ďacétylcholine et de cholinestérase chez les Invertébrés, ainsi que sur la sensibilityé. des tissus àľacétylcholine et aux poisons qui paralysent ľaction de cette substance.
2^o. La présence de nerfs cholinergiques est démontrée chez les Annélides ( Armicolu, Aphrodite, Lumbricus, Hirudo ), et les Siponculiens ( Sipuncuh ), chez les 1 Iolot huries, chez un seul mollusque ( Venus mercenaria ).
3^o. Ľexistence de nerfs cholinergiques est inconcevable chez les Cœntérés.
4^o. Chez les Arthropodes (Crustacés, Insectes et Arachnomorphes) tout porte à croire que les nerfs ne transmettent pas ľ'excitation par ľintermédiaire ľacétykholine.
5^o. Chez leo Mollusques, àľexception de Venus mercenaria , tous, les essais de démonstration de nerfs cholinergiques ont échoué.
6^o. Ľexistence de nerfs adrénergiques chez les Annélides est très probable, mais non encore certaine; de tels nerfs existent vraisemblablement chez les Céphalopodes et chez ľaplysie.
7^o. Le cmur et les tissus des Invertébrés manifestent pour ľadrénaline et les amines syrnpathicomimétiques une sensibilityé non spécifique, le plus souvent faibie.     

Etude Ultrastructurale de la Sporulation de Paramarteilia orchestiae gen. n., sp. n., Parasite de l'Amphipode Orchestia gammarellus (Pallas)

RESUME. L'individualisation de 2 spores bicellulaires à partir d'un měme pansporoblaste caractérise la sporulation du parasite de l'Amphipode Orchestia gammarellus (Pallas) précédemment décrit sous le nom de Marteilia sp. Cette sporulation le distingue des espèces du měme genre parasite d'Hutres qui sont toutes caractérisées par la production de spores tricellulaires. Les conditions semblables dans lesquelles les pansporoblastes paraissent se differencier à partir d'une cellule souche dans laquelle ils poursuivent leur évolution vers la sporogenèse ainsi que divers caractères cytologiques communs, nous incitent à maintenir tous ces parasites dans une měme famille mais à placer celui de l'Amphipode dans un genre différent. Nous proposons de le nommer Paramarteilia orchestiae gen. n., sp. n.
Ces parasites ne peuvent ětre maintenus dans les Protozoaires en raison de leur évolution vers la pluricellularité et de l'individualisation de ces éléments somatiques que représentent la cellule souche primaire, les pansporoblastes et cellules sporales (à l'exception des sporoplasmes). Il semble logique de les inclure dans l'embranchement des Myxozoaires créé par Grassé pour les Myxosporidies et Actinomyxidies qui différencient également des spores pluricellulaires et des éléments somatiques. Les centrioles à 9 singlets de P. orchestiae ainsi que les cellules primaires uninucléées, quel que soit le nombre de pansporoblastes qu'elles contiennent, peuvent ětre considérés comme des caractères résiduels d'Unicellulaires.     

BIOMETRIC PRACTICE

Simple, Defensible Sample Sizes Based on Cost Efficiency Il est d'usage de choisir une taille d'échantillon garantissant une puissance de test de 80% ou plus, sans prendre en compte le coût impliqué. Mais dans la pratique les chercheurs comme les financeurs ne peuvent souvent pas ignorer les coûts. Nous proposons ici et nous justifions une nouvelle approche pour choisir la taille d'échantillon en fonction de la rentabilité, définie comme le rapport de la valeur scientifique et/ou pratique projetée de l'étude à son coût total. Nous montrons que la valeur projetée d'une étude, pour une large variété de définitions de cette valeur, offre des rendements marginaux décroissants quand la taille de l'échantillon augmente. Nous pouvons alors définir deux choix simples qui peuvent être défendus comme étant plus rentables que tout échantillon de taille supérieure. La première méthode choisit la taille d'échantillon qui minimise le coût moyen par sujet. La deuxième choisit la taille d'échantillon qui minimise le coût total divisé par la racine carrée de la taille d'échantillon. Cette dernière méthode est en théorie plus justifiable pour des études innovantes, mais elle reste raisonnablement satisfaisante et peut se justifier aussi dans d'autres cas. Par exemple, si la valeur projetée de l'étude est proportionnelle à la puissance du test d'une hypothèse donnée et que le coût total est une fonction linéaire de la taille d'échantillon, alors cette méthode garantit une puissance supérieure à 90% ou une rentabilité supérieure à celle de tout échantillon assurant cette puissance. Ces méthodes sont faciles à appliquer, basées sur des données fiables, et bien justifiées. Elles devraient donc être considérées comme des solutions acceptables pour remplacer les méthodes classiques courantes.