具交叉干涉的三点测交区间标记定位（QTL）的相关方法

本文提出在有交叉干涉条件下,在测交群体中对区间标记座位赋值后求其与待定位的数量性状表型值间的简单相关系数R,以此进行连锁测验,并且在一定条件下用R值求出该数量性状座位（QTL）与各标记座位（ML）间的重组值。     

双单倍体群体中区间分子标记定位(QTL) 的相关方法

本文提出对区间标记座位赋值后求此赋值与待定位的数量性状表型值间的简单相关系数C,以此进行连锁测验,并且在一定条件下还能用C值继而求出该数量性状座位（QTL）与各标记座位（ML）间的重组值．     

三点测交基因连锁作图计算的新方法

提出了三点测交基因连锁作图的一种新的计算方法,弥补了经典经典计算方法的不足之处,使基因连锁作图更准确。     

RIL群体区间分子标记-QTL定位的相关方法

分析了RIL群体中以分子区间标记进行QTL定位的相关方法．通过对分子标记赋值可获得与数量性状表型值的简单相关系数．然后,在此基础上进行连锁检验．此外．在特定情况下利用R值,可以估计数量性状座位(QTL)和分子标记位点(ML)间的重组值．     

三向测交分析的一点注记

木文导出了三向测交设计L,;, L21和L（或合尸;）方差分析中互作项方差分量In*统遗传学。 望。这一期望的导出使得加性遗传分量D和显性遗传分量H的估值可由同一方差分析得出,并且所有 的三向测交家系均得以利用,克服了现有三向测交分析中Lai或L‘在估计HIP‘在估计D和H时未被 利用及完全三向测交设计时D和H由两个基于不同家系资料的方差分析估出的缺陷。本文还给出了确 定显性方向的统计量F的一些其他估计方法。     

用三向测交设计估计数量性状的基因数目

本文推导出了三向洲女设计方差分析中家系总均值方差的生统遗传学期望,并证明通过这一方差 可以估计被研究性状所涉及的基因数目。在正态分布大样本的假定下,导出了基因数估值标准误的近 似表达式。文中用一个完全三向测交的实例说明了此法的应用。本文给出的期望及基因数目估计式也 完全适合于北卡罗来纳设计IH(NCm设计）     

测交后代中基因遗传关系判断的规律性

在遗传学三定律教学中,综合性习题的统习是必不可少的教学环节,是使学生掌握所学知识,提高利用遗传学知识解决实际问题能力的重要途径。这部分司题中,相当一部分是根据测交后代表现型情况判断亲代中基因的遗传关系,本文就此做一简单讨论。1两对相对性状的遗传关系的判定对于两对相对性状,或为自由组合的遗传关系（即独立遗传）,或为连锁互换的遗传关系,二者必居其一,根据测交后代表现型比例可以判定。1．l如果洲交后代有4种表现型,且比例为1：l：l：l,则两对性状（两对基因）为自由组合的遗传关系。1．2如果测交后代有4种表现型…     

构建分子标记连锁图谱的一种新方法：三点自交法

作者从数学上导出了基因作图的三点自交方法。这一方法同用三点测交法一样能提供各种作图信息,但不需要选育三隐性纯合基因亲本或品系,因而能大大提高作图功效。,从理论上证明,该方法也适合于小群体作图分子标记连锁图谱,同时用Ｆisher单一观察信息（即Ｆ信息）量证明,三点自交法是一种有效的作图方法,应用ＭＡＰＭＡＫＥＲ程序中所提供的才鼠Ｆ２群体中３３３个个体的１２个ＲＦＬＰ标记位点中前６个位点的数据对三点自交图图距计算具有与ＭＡＰＭＡＫＥＲ程序一样的功能,而且还提供了位点间的交叉干涉和位点的相引或相斥构型等信息以及紧密位点间发生负干涉作用的证据。     

基于比较基因组学的玉米ESTs定位方法

描述了以水稻基因组数据和玉米与水稻的比较遗传图谱为桥梁,基于水稻和玉米间存在的标记和序列水平上的广泛的共线性,对大量的玉米ESTs初步定位于玉米连锁群上新方法,为对ESTs开展进一步的基因组学研究和基因克隆提供参考信息。对139条玉米ESTs的定位发现,96条玉米ESTs（69%）可在水稻基因组中找到同源序列,77条ESTs（55%）可使用该策略进行定位,证实了该方法的可行性和有效性。      

葡萄无核基因定位与作图的研究

以UBC 269484和GSLP1569的序列为支点,设计合成了包括UBC 269和GSLP1在内的9条引物,以葡萄 有核亲本红地球和无核亲本红光无核的DNA为模板,对这9个引物进行筛选,结果GSLP1、39970524 5号引物和 39970524 6号引物在无核亲本红光无核上扩增出了特异标记GSLP1569、39970524 5 564、39970524 6 1538和 39970524 6 1200。用这3个特异引物在红地球、红光无核、无核白和红地球×红光无核杂交组合F1代163株杂 种的DNA样上进行PCR扩增,结果4个特异标记在F1群体中与无核主效基因共分离。4个特异标记也出现于所 用组合中无核基因原始供给者无核白上。这些标记和葡萄无核主效基因相连锁。用QTXb17遗传作图软件,对葡 萄无核主效基因S定位与作图,当P=0.01时,LOD值在32.7～46.4之间,置信界限在0.2～9.9之间。这4个 特异标记和无核主效基因S处于在同一连锁群,位于无核主效基因S的两侧,覆盖基因组12.3cM。特异标记 39970524 5 564、GSLP1569、39970524 6 1538、39970524 6 1200距S基因的遗传距离分别为0.6cM、1.2cM、 4.9cM和11.1cM。     

雄性不交换条件下F2群体区间标记——QTL定位的相关方法（英文）

提出了雄性不交换条件下F2群体区间标记定位QTL的相关方法,并且对其适用的条件进行了讨论,通过对分子区间标记进行赋值,计算在无交叉干涉条件下分子标记与表型值的简单相关系数,并在此基础上进行连锁检验,在特定条件下可以估计数量性状座位（QTL）与分子标记座位间的连锁值。     

林木数量性状基因定位中的若干问题

随着ＤＮＡ分子标记技术的迅速发展,ＱＴＬ定位已成为当前生物学研究领域的前沿。迄今已对许多种动、植物定位了许多重要性状的ＱＴＬ。这些研究促进了遗传学的发展,并将作为育种的新策略应用。与作物相比,林木ＱＴＬ定位有其特性。本文详细讨论了林木的生物学特性对ＱＴＬ定位的影响、ＱＴＬ定位的系谱设计和统计分析方法。     

微卫星标记与奶牛数量性状QTL定位

本文对奶牛产奶性能（产奶量、乳脂率、乳脂量、蛋白率、蛋白量）、乳房炎及体细胞数、繁殖性能、生产寿命等数量性状QTL定位研究进展进行了综述。 Abstract:Mapping of quantitative trait loci for some important traits (milk yield,fat percentage,fat yield,protein percentage,protein yield,clinical mastitis and somatic cell count,reproductive performance,productive life,etc.) in dairy cattle was introduced in this review.     

BC群体不同连锁模式分子区间标记QTL作图相关方法的精确度分析

该文分析了BC群体不同连锁模式分子区间标记QTL作图相关方法的精确度,提出了相应参数的适用范匿,连锁顺序的检测方法,分析步骤,为QTL作图提供了理论基础。     

A Novel Targeted Learning Method for Quantitative Trait Loci Mapping

We present a novel semiparametric method for quantitative trait loci (QTL) mapping in experimental crosses. Conventional genetic mapping methods typically assume parametric models with Gaussian errors and obtain parameter estimates through maximum-likelihood estimation. In contrast with univariate regression and interval-mapping methods, our model requires fewer assumptions and also accommodates various machine-learning algorithms. Estimation is performed with targeted maximum-likelihood learning methods. We demonstrate our semiparametric targeted learning approach in a simulation study and a well-studied barley data set.     

构建数量性状基因图谱的几种统计方法

以线性数学模型为线索,概述了用于构建数量性状基因图谱的几种主要统计方法,包括方差分析法、标记回归法、区间作图法、复合区间作图法、Jansen的复合区间作图法、双侧标记回归法以及新近发展的多区间作图法和多亲本作图法等.讨论了各种方法的优缺点. Abstract:Statistical methods for mapping QTLs were summarized, including one marker analysis, arker regression analysis,interval mapping (IM),composite interval mapping (CIM),Jansen's composite interval mapping, flanking marker regression analysis,multiple interval mapping (MIM) and multiple families mapping.Their advantages and disadvantages were discussed.     

Mapping Quantitative Trait Loci Affecting Variation in Drosophila Triacylglycerol Storage

Objective: Recent genetic studies indicate that Drosophila melanogaster could be a powerful model to identify genes involved in mammalian adipocyte differentiation and fat storage. The objective of our study was to identify quantitative trait loci (QTLs) that contribute to variation in triacylglycerol (TAG) storage in two D. melanogaster laboratory strains. Research Methods and Procedures: We used two genetic mapping procedures to identify loci with main and epistatic effects on TAG storage. First, using 68 recombinant inbred lines derived from the unrelated Oregon R and Russian 2b strains, we mapped the location of QTLs affecting TAG storage using both composite interval mapping and Bayesian epistatic methods. Second, we used the quantitative deficiency mapping procedure to identify candidate genes affecting this trait within one of the QTLs identified on the second chromosome. For both mapping experiments, flies were cultured in standard conditions. TAG content of 4‐ to 5‐day‐old flies, adjusted for live body mass and total proteins, was used as the phenotypic measure. Results: Multiple QTLs associated with variation in TAG storage were identified by the genome‐wide recombination mapping method, and some of them were sex‐specific. The QTLs had main effects, but a male‐specific epistatic interaction between two QTLs was also found. Finally, two closely linked QTLs were detected by deficiency mapping at 57E1‐57E3 and 57E4‐57F1 on chromosome 2, the first of which causes female‐specific variation in TAG between the Oregon R and 2b strains. Discussion: Our results suggest that variation in TAG storage in D. melanogaster is controlled by different genetic mechanisms and different sets of QTLs in male and female flies.