荧光素标记的庚型肝炎病毒基因探针的制备及应用

The sequences of HGV gene that had been reported were checked and analyzed. After comparison of HGV seqences from different virus strains, a gene fragment of 31 nucleotides (7121-7152 nt) served as a probe was labeled by fluorescein-N₆-dd ATP with terminal transferase. The specificity of HGV probe was tested by dot-blot hybridization with HCV RNA—related virus RNA, C.T DNA, HGV-RNA, and Southern-blot hybridization with RT-PCR product of HGV. Positive results obstained only from the HGV-RNA of positive sera that was confirmed by nested RT-PCR, all others were negative. The sensitivity of fluorescein-labeled probe was examined. The result showed that the fluorescein-labeled probe was able to check≥1.56 pg of target genome. The conformity of HGV-RNA detection using RT-PCR and HGV gene probe was 97.9%. The experiment suggested that fluorescein-labeled probe can be used in clinic detection and epidemic study.     

庚型肝炎病毒（HGV）NS5区部分基因的克隆和cDNA序列测定

用RT－PCR技术从一例献血员血清标本中扩增出HGV非结构区的部分基因片段,克隆后测定。cDNA序列。该序列与国外三株HGV的核苷酸同源性在90％以上;与GBV—A和GBV—B的同源性分别为44．7％和33．17％;与已发表的23个HCV全序列的相应序列比较,同源性均小于40％。结果表明,克隆的病毒株为HGV中国株。同时,用RT—PCR检测了河北固安和南京地区的115份HCV感染者标本．HGVRNA阳性率为3．47％。表明我国某些特殊人群中HGV感染率较高,是一个不容忽视的问题。     

应用RT-PCR制备登革病毒诊断基因芯片探针

根据GenBank数据库中的生物信息,利用BLAST免费分析软件找出4种型别登革病毒的保守序列及各型特异性序列,针对上述序列设计引物经RT-PCR扩增登革病毒的特异片段,利用此RT-PCR法收集探针是一种快速、简便制备基因芯片探针的实用方法。     

中国庚型肝炎病毒(HGV)全基因结构特点及其感染地理分布

分析和讨论了中国人庚型肝炎病毒（HGV）的基因结构特点及我国HGV感染的地理分布状况。中国庚型肝炎病毒株（HGVC964）基因全长9128个核苷酸,编码一个长度为2870个氨基酸残基的多聚前体蛋白。5’端有一个367bp的非翻译区,3’端非编码区为147个核苷酸。基因组中G＋C占59．9％。该株病毒与国外报道的三株HGV序列比较,核苷酸同源性为82．0％～86．2％,氨基酸同源性均大于90％。对我国部分地区的某些人群进行的分子流行病学研究表明,在我国北方、南方及广西少数民族地区也存在HGV感染。HCV自然     

安徽省不同人群及各型肝炎患者庚型肝炎病毒感染检测分析

应用酶联免疫试验（ＥＩＡ）和逆转录套式聚合酶链反应（ＲＴ－ｎＰＣＲ）对１００ 例一般人群、３８５例献血员、５４ 例血液透析患者、７２ 例乙型肝炎、４１ 例丙型肝炎２７ 例非甲－戊型肝炎患者进行检测。结果抗－ＨＧＶ 阳性率分别为２．００％ 、７．５３％ 、２７．７８％ 、１８．０６％ 、１９．５１％ 和１４．８１％ ;抗－ＨＧＶ 阳性者中ＨＧＶＲＮＡ 阳性率分别为１００．００％ 、６２．０７％ 、６６．６７％ 、６９．２３％ 、７５．００％ 和 １００．００％ ,提示本地区不同人群存在ＨＧＶ 感染。献血员、血透患者、乙型肝炎、丙型肝炎、非甲－戊型肝炎患者的ＨＧＶ 感染率显著高于一般人群,提示献血员,血透患者及ＨＢＶ、ＨＣＶ 感染者是ＨＧＶ 感染的高危人群。ＨＧＶ 常与ＨＢＶ 或ＨＣＶ 重叠／联合感染,也可单独感染。抗－ＨＧＶ 阳性者中ＨＧＶ ＲＮＡ 阳性率为８３．８２％ ,提示抗－ＨＧＶＥＩＡ 可用于ＨＧＶ 感染的检测。ＡＬＴ 正常和异常献血员中抗－ＨＧＶ 阳性率无显著性差异。     

标记基因探针的快速简易制备

在基因探针制备过程中,常通过琼脂糖电泳分离目的DNA片段和载体,然后采用电洗脱、冻融等方法回收并纯化目的片段,再作同位素或非同位素标记。为减轻非特异性本底,往往还需要分离出标记探针,以去除游离标记物,整个过程比较繁琐费时。我们在工作中尝试了一种简便的方法,将探针的制备、回收、纯化     

HBV—C基因探针的制备及应用

应用ＰＣＲ技术扩增出ＨＢＶ ＤＮＡ Ｃ基因片段并与ｐＡＴ１５３质粒重组,转化到Ｅ．ｃｏｌｉ ＲＲＩ中,经体内扩增,提纯,用光生物系标记,制备了Ｃ基因的重组质粒探针。该探检测灵敏度在Ｓｏｕｔｈｅｒｎ印迹中达１ｐｇ,在点印迹中为５ｐｇ。用此探针以Ｓｏｕｔｈｅｒｎ印迹方式配合ＰＣＲ技术检测乙肝病人血清中的ＨＢＶ ＤＮＡ,在５３例ＰＣＲ产物电泳检测阴性的样品中,Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交又检出１８例阳性。     

荧光素标记JH12.6探针进行的人DNA指纹图分析

采用荧光素标记和鲁米诺化学发光技术,建立了ＤＮＡ指纹图的分析方法。用该方法标记ＪＨ１２．６探针获得了清晰易读、分辨率高的人ＤＮＡ指纹图。经对云南省７８名无关个体进行ＤＮＡ指纹图分析,计算出无关个体的相关机率为７．４×１０（－１１）,平均等位基因频率为０．０９。比较同位素（３２）Ｐ标记方法表明,用荧光素标记ＪＨ１２．６探针进行人ＤＮＡ指纹图分析,具有简便、快速、安全、经济的特点,可在法医学鉴定及其它领域里推广应用。     

应用逆转录PCR检测海产贝壳类中的甲型肝炎病毒

污染水体中生长的贝壳类是传播甲型肝炎的重要媒介之一,本文介绍了用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测贝壳类中甲型肝炎病毒(HAV)的方法。贝壳类中HAV的浓集回收采用洗脱-沉淀法并加以改进,30g贝肉中的病毒浓集回收在1.5~2.0m l上清液中。RT-PCR检出限为回收样品经二次扩增后10-2稀释度。从7种39份采自大连近海海域的贝壳类样品中,用该法检测出阳性样品4种10份,阳性率为26%。说明各种贝壳类有不同程度的污染。     

香茄环斑病毒HC—RT—PCR—ELISA检测

番茄环斑病毒（ToRSV)是我国对外检疫一类有害生物。目前国内尚无存在的报道。PCR技术是一种快速灵敏的植物病毒检测方法,但核酸内的聚合酶抑制物会导致漏检现象。而只通过凝胶电泳进行结果判定会出现假阳性,这两方面限制了PCR技术在对外检疫中的应用,利用共价结合在PCR管壁上的引物特异性杂交诱捕核酸粗提液中的靶标核酸,洗掉杂质及抑制物质,在同一管内作RT-PCR,凝胶电泳检测液相产物的同时对固相产物进行杂交检测。提高了结果的可靠性及灵敏度。利用所建立的HC-RT-PCR-ELISA成功地从法国进口葡萄苗中检出ToRSV。本方法可用于其他植物病毒及转基因产品的检测。     

In Situ Detection of a PCR-Synthesized Human Pancentromeric DNA Hybridization Probe by Color Pigment Immunostaining: Application for Dicentric Assay Automation

We report a low cost and efficient method for synthesizing a human pancentromeric DNA probe by the polymerase chain reaction (PRC) and an optimized protocol for in situ detection using color pigment immunostaining. The DNA template used in the PCR was a 2.4 kb insert containing human alphoid repeated sequences of pancentromeric DNA subcloned into pUC9 (Miller et al. 1988) and the primers hybridized to internal sequences of the 172 bp consensus tandem repeat associated with human centromeres. PCR was performed in the presence of biotin-11-dUTP, and the product was used for in situ hybridization to detect the pancentromeric region of human chromosomes in metaphase spreads. Detection of pancentromeric probe was achieved by immunoenzymatic color pigment painting to yield a permanent image detected at high resolution by bright field microscopy. The ability to synthesize the centromeric probe rapidly and to detect it with color pigment immunostaining will lead to enhanced identification and eventually to automation of various chromosome aberration assays.     

PCR方法制备地高辛标记DNA探针检测中国对虾非包涵体型杆状病毒

A pair of primers created from information of PmNOBⅢ genome DNA Sal I fragment produced a 355bp band by using Penaeus chinensis non occluded baculovirus (PcNOBV),the WSBV isolate from P.hinensis in mainland China,as the DNA template.The specific PCR product was cloned,sequenced and labeled with digoxigenin (DIG)DNA labeling kit(Boehringer Mannheim).The DIG labeled fragment was tested by dot blot hybridization for sensitivity and specificity with purified PcNOBV nucleocapsid,PcNOBV infected shrimp tissues and healthy shrimp tissues.The detection limit of the DNA probe is 6.8pg of purified PcNOBV DNA.No hybridization signals were observed using DNA from healthy shrimp as template.Healthy P.chinensis,artificially infected P.chinensis and pond reared adult P.chinensis were screened for PcNOBV infection by both PCR and the hybridization assay.The results showed a good relationship between PCR and the hybridization assay.These findings demonstrate that the DIG labeled probe can be used as a sensitive,specific and cost effective reagent for detection of PcNOBV.     

生物素标记GFV－cDNA探针的制备及在检测葡萄扇叶病毒上的应用

以整合到质粒中的ＧＦＶ－ｃＤＮＡ为模板经ＰＣＲ合成了生物素标记的ＧＦＶ单、双链探针。用合成的探针对提纯的ｃＦＶ－ＲＮＡ＿２、感染ＣＦＶ的昆诺藜叶及１８株而萄进行ＤＮＡ－ＲＮＡ杂交检测表明：检测提纯病毒ＲＮＡ＿２的灵敏度为１．５ｐｇ／斑点,感染ＧＦＶ的昆诺藜提取液最高稀释度可达４０９６０倍;１１株显示典型扇叶症状的样品杂交结果均为阳性,且汁液稀释４００～８００倍仍能测出,７株不显示典型扇叶症状的葡萄中３株受到ＧＦＶ的侵染。单、双链探针最适使用浓度分别为１／２００及１／１００。     

复合探针荧光定量PCR法检测布鲁氏菌的实验研究

目的：建立用复合探针荧光定量PCR快速检测布鲁氏菌的方法。方法：研究根据BSCP31基因编码31KDa的布鲁氏杆菌表面蛋白的核苷酸序列设计特异引物,通过PCR法的特异性、灵敏度和重复性研究,建立了复合探针荧光定量PCR检测布鲁氏菌的方法。用于布鲁氏菌病的筛选和诊断。结果：结果表明该检测方法的特异性为100％,最低可检出10个拷贝的质粒DNA分子,可对1×10^1-1×10^6拷贝范围内的模板进行定量,最低可检测至1×10^2CFU／ml细菌。该方法的精密度好,阳性质控品和阴性质控品不同时间测定三次及同一时间五次重复实验结果CV值均小于5％。结论：本研究建立的复合探针实时荧光定量PCR检测布鲁氏杆菌的方法,可对布鲁氏病原菌进行快速检测,对布病的筛选和确诊具有重要意义。     

应用DIG标记探针杂交检测IBDV

本试验用地高辛（Ｄｉｇｏｘｉｇｅｎｉｎ,ＤＩＧ）标记的探针建立了核酸杂交检测传染性法氏囊病病毒（ＩＢ－ＤＶ）的方法,并在敏感性方面同琼脂扩散试验进行了比较。探针来源于ＩＢＤＶＳＴＣ－ｌｌ９和ＳＴＣ－２４３ｃＤＮＡ。杂交方法的敏感性试验表明,核酸杂交可以检测到０．１ｐｇ的ＩＢＤＶＲＮＡ;与多个毒株核酸的杂交则显示出标记的探针可以作为通用试剂用于ＩＢＤＶ早期感染的诊断;而同琼脂扩散试验的比较则说明,杂交方法比常规的免疫沉淀反应敏感１０４倍以上。除此之外,由于杂交方法特异以及非放射性探针操作方便,因而具有很大的应用前景。     

应用生物素标记DNA探针检测伪狂犬病病毒的研究

应用生物素标记ＤＮＡ探针检测伪狂犬病病毒的研究王琴,郭万柱,阴文奇（四川农业大学动物科技学院,四川雅安,６２５５０１４）关键词伪狂犬病毒,核酸,杂交,检测核酸杂交技术已广泛用于检测畜禽疱疹病毒和其它动物病毒,已报道ＰＲＶ－ＤＮＡ的探针方法有ＲＮＡ－Ｄ...