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Poroyko V Hejlek LG Spollen WG Springer GK Nguyen HT Sharp RE Bohnert HJ 《Plant physiology》2005,138(3):1700-1710
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Large-scale transcriptome analysis in chickpea (Cicer arietinum L.), an orphan legume crop of the semi-arid tropics of Asia and Africa 总被引:1,自引:0,他引:1
Hiremath PJ Farmer A Cannon SB Woodward J Kudapa H Tuteja R Kumar A Bhanuprakash A Mulaosmanovic B Gujaria N Krishnamurthy L Gaur PM Kavikishor PB Shah T Srinivasan R Lohse M Xiao Y Town CD Cook DR May GD Varshney RK 《Plant biotechnology journal》2011,9(8):922-931
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利用深度测序技术检测玉米根系和叶片中已知的microRNAs 总被引:2,自引:0,他引:2
microRNA(miRNA)是一类具有20~24nt核苷酸长度的非蛋白质编码的内源小分子RNA,它在植物生长发育和逆境胁迫响应等过程中发挥着重要作用。文章利用基于Illumina/Solexa原理的小分子RNA深度测序技术,结合生物信息学的方法对玉米根系和叶片中已知miRNA的类型、丰度及靶基因进行了分析。研究发现,在根系中共检测到92个已知的miRNA,分别属于18个miRNA家族,其表达丰度在1~105943之间;在叶片中,共发现86个已知的miRNA,分别属于17个miRNA家族,其表达丰度在1~85973之间。靶基因预测结果表明,根系中的18个miRNA家族共靶向54个蛋白,进一步的功能预测发现,这些基因涉及了转录调控、物质能量代谢、电子传递、胁迫响应和信号转导等过程。以上研究结果表明,就已知的miRNA而言,无论是miRNA的类型还是表达丰度,在玉米根系和叶片中都存在较大差异。 相似文献