不同日龄大白猪视黄酸受体α基因组织表达

研究采用RT-PCR方法对大白猪的视黄酸受体α基因在1日龄、90日龄、180日龄、270日龄和360日龄的心、肝、胃、脾、肾、肺、大肠、小肠、肌肉、子宫、卵巢共11个组织的表达情况进行了研究。结果表明,RARαmRNA在肝、脾、肾、大肠、小肠、子宫和卵巢中持续表达,其中脾、大肠和小肠是持续高表达;180日龄时,所有组织的RARαmRNA的表达量普遍降低;360日龄时,所检的11个组织均高水平表达该基因。     

大白猪不同脂肪部位脂质代谢相关基因的表达差异分析

脂肪沉积决定于脂肪酸合成、转运和分解代谢的动态平衡。为比较猪(Sus scrofa domesticus)不同脂肪部位脂质代谢差异和不同性别间的差别,筛选与脂肪沉积能力显著关联的相关酶基因,本研究检测大白猪(Large White pigs)脂质代谢相关生化指标、肌内脂肪(intramuscular fat)含量,皮下脂肪、腹部脂肪和肾周脂肪组织间脂肪酸合成酶基因ACC,脂肪酸转运酶基因CPT1A和CD36,以及脂肪酸分解酶基因HSL和LPL的转录表达水平,分析目标基因与血清生化指标和肌内脂肪含量的相关性,比较在不同脂肪组织间的基因表达差异。结果表明,血清甘油三酯(triglycerides)、总胆固醇(total cholesterol)和肌内脂肪含量在不同性别大白猪中均无显著性差异(P>0.05)。相关性分析表明,大白猪公猪腹部脂肪中ACC基因表达量与甘油三酯含量呈显著正相关(P<0.05),皮下脂肪中HSL基因表达量与甘油三酯含量呈显著负相关(P<0.05);大白猪母猪腹部脂肪中ACC基因表达量与甘油三酯含量呈极显著正相关(P<0.01)。实时定量PCR结...     

SSH 法结合定量 PCR 技术研究双肌臀猪 肌肉组织的差异表达基因

利用抑制性消减杂交技术 (suppression subtractive hybridization , SSH) 成功地构建了双肌臀与非双肌臀大白猪肌肉组织差异表达的消减 cDNA 文库,获得有效克隆 686 个. 对整个文库测序分析,共获得 587 条有效序列. 利用 BLAST 在线软件与 GenBank、 GenBank EST 和 Tigr Porcine EST 等数据库进行同源序列比较,发现其中有 11 个未知新序列,可能代表“双肌臀”大白猪肌肉组织特异表达的新基因. 对文库中所包含的兰尼啶受体基因 (RYR1)、钙依赖性蛋白激酶 基因 (CAMK2)、人类胰岛素生长因子结合蛋白 -7 基因 (IGFBP7),以及 695号、 882号和480号3个新基因进行了实时荧光定量 PCR 检测,结果显示： RYR1、 CAMK2 及 IGFBP7 基因在双肌臀猪肌肉组织 RNA 池中的表达量,分别为对照的非双肌臀猪肌肉组织 RNA 池中表达量的 1.87、 1.90 和 1.85 倍; 695 号、 882 号和 480 号 3 个新的 ESTs 在双肌臀猪肌肉组织 RNA 池中的表达量为非双肌臀猪肌肉组织 RNA 池中表达量的 1.48、 1.44 和 1.78 倍. 这提示我们,上述基因的上调表达很可能与猪双肌臀性状的发生有密切的关系,可以作为研究该性状的候选基因.     

视黄醇结合蛋白及其基因的分子生物学

视黄醇结合蛋白（RBP）是一类维生素A（VitA）的运载蛋白,参与血清和细胞内视黄醇/视黄酸的转运,是疏水小分子结合蛋白家族的成员。这类RBP主要在肝脏中合成并释放入血液进而进入各种组织。血清RBP通过与视黄醇、前白蛋白及细胞表面受体相互作用,在VitA 的储存、代谢、转运到周围靶器官中具有重要功能;细胞RBP则主要在细胞内发挥类似作用。本文介绍了视黄醇结合蛋白的作用机理、组织定位和发育性表达,还介绍了视黄醇结合蛋白基因的结构、染色体定位以及与动物繁殖性能的关系。Abstract: Retinol-binding proteins (RBPs) are a kind of circulating carrier proteins for serum and cellular retinol and retinol acid, which are lipid-soluble vitamins, and are members of hydrophobic binding protein family. Serum RBPs were synthesized primarily in liver, then was released into blood streams, and then to various tissues. Under the interaction with substances such as retinol, pre-albumin and the receptors of cellular surface, they play important roles in storage, metabolism of VitA and transport of VitA to the target cells. Cellular RBPs play the similar function as serum RBPs in intracell. This review introduces action mechanism, tissue localization and developmental expression of retinol-binding proteins. This review also introduces the structure, chromosome mapping and their relationships with reproductive performance of retinol-binding protein genes.     

视黄醇结合蛋白研究

人视黄醇结合蛋白 (ｒｅｔｉｎｏｌｂｉｎｄｉｎｇｐｒｏ ｔｅｉｎ ,ＲＢＰ)由 1 84个氨基酸组成 ,分子量 2 1ｋｄ ,是单链、疏水小分子结合蛋白 ,属于脂肪酸结合蛋白家族成员。ＲＢＰ在肝脏中合成 ,释放入血后与视黄醇 (ＲＯＨ)、甲状腺素运载蛋白(ＴＴＲ)以 1∶1∶1的比例形成三元复合物 ,是体内运送视黄醇至其特定靶组织的运载蛋白[1] 。ＲＢＰ的ｍＲＮＡ在肝中的含量最高。ＲＢＰ只有受到视黄醇的刺激才分泌 ,视黄醇的缺乏会阻断细胞内合成的ＲＢＰ由内质网到高尔基体的转运 ,从而影响ＲＢＰ的分泌 ,而且分泌入血的ＲＢＰ量也受到视黄醇…     

大花白猪对高温适应性的研究

试验观测4,5月龄大花白公、母猪在每天控温38～40.5℃连续5h 共21天的行为、生理指标、血液生化指标和生长发育的变化,以同龄长白公、母猪为对照.高温期大花白猪停止走动,四肢伸展侧卧,呼吸频率增加,次数比长白猪相对减少9.5～220.9次/min,差异显著(P<0.05),肛温38.9～39.4℃未见上升,母猪仍有发情征候,公猪爬跨动作.对精饲料食欲正常,饮水量增加,皮温随气温变化,生长发育减慢.长白猪亦有类似表现和增加“打泥”行为.高温期大花白猪的血液生理、生化指标均在正常值范围内变动,淋巴细胞占58～85%,比正常值高.其呼吸频率在试验结束后1周内就能恢复到与预试期气温相同时的水平.     

大麦黄矮病毒GAV株系外壳蛋白基因在大肠杆菌中的高效表达

大麦黄矮病毒 (ＢＹＤＶｓ)是一种由蚜虫专化性传播的循回非增殖型单链正义ＲＮＡ病毒 ,是黄症病毒属 (Ｌｕｔｅｏｖｉｒｕｓ)的代表成员。ＢＹＤＶＧＡＶ是我国的主流株系之一 ,它与美国的ＢＹＤＶＭＡＶ有较强的血清学关系 ,但美国的ＭＡＶ仅由麦长管蚜传播 ,而我国的ＧＡＶ除麦长管蚜传播外 ,还可由麦二叉蚜传播[1,2 ] 。近年来 ,有关麦蚜传播病毒专化性的研究已成为ＢＹＤＶ的研究热点[3 ] 。ＢＹＤＶ病毒的传播涉及病毒粒子表面成分与蚜虫体内专化性受体的相互作用 ,ＢＹＤＶ病毒粒子表面主要成分是ＣＰ ,另外一个次要成分是通读蛋白 (…     

脊尾白虾血蓝蛋白大亚基基因的克隆及表达分析

应用RACE技术克隆脊尾白虾血蓝蛋白大亚基基因, 并通过攻毒实验揭示脊尾白虾血蓝蛋白基因的先天免疫防御作用, 为脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)的免疫防治研究提供依据和思路。研究成功克隆了脊尾白虾血蓝蛋白大亚基基因全长cDNA序列, 该大亚基cDNA全长 2192 bp, 开放式阅读框长 2034 bp, 5′非编码区长 21 bp, 3′非编码区长 137 bp, 将该基因命名为 EcHcL。EcHcL编码 667 个氨基酸, 前 21 个氨基酸组成信号肽, 推测成熟肽的分子量为 78.5 kD。Blast比对结果显示, 由脊尾白虾血蓝蛋白EcHcL序列推导的氨基酸序列与日本沼虾、凡纳滨对虾血蓝蛋白氨基酸序列的同源性分别达到 87%、73%, 其M结构域氨基酸序列与斑节对虾、日本对虾等物种同源性性高达 90% 左右, 由此推断该cDNA序列属于血蓝蛋白家族。组织表达分析结果显示, EcHcL基因在脊尾白虾鳃、卵巢、肝胰腺、心脏、肠、肌肉、胃、腹神经节、眼柄、血细胞中均有表达, 肝胰腺中相对表达量最高。Real-time PCR分析发现EcHcL基因在金黄色葡萄球菌、副溶血弧菌和对虾白斑综合征病毒(WSSV)感染后脊尾白虾肝胰腺和血细胞中的表达量显著增加, 并具有不同的时空表达模式, 推测脊尾白虾EcHcL基因在免疫防御中具有重要作用。     

视黄醇结合蛋白的分子生物学

视黄醇结合蛋白 (RBP)是维生素A(VitA)的运载蛋白 ,结构上为疏水小分子结合蛋白家族的成员。视黄醇结合蛋白在肝脏中合成并释放入血液后 ,通过与视黄醇 (ROH)、甲状腺素运载蛋白 (TTR)及细胞表面受体相互作用 ,在VitA的储存、代谢、转运到周围靶器官中发挥重要功能。本文从基因结构与表达、构效关系及临床意义等方面介绍了视黄醇结合蛋白的分子生物学。     

赤链蛇不同组织Sox基因表达的RT-PCR分析

采用RT-PCR技术,研究了赤链蛇不同组织Sox基因的表达。通过PCR产物直接克隆法和SSCP技术筛选阳性克隆,分析了雄性睾丸和雌性卵巢组织中的Sox基因序列。结果显示,在赤链蛇雌雄成体组织中,Sox基因在睾丸、卵巢、脑和脾组织中均有不同程度的表达,而在雌雄成体肌肉组织中均无表达,显示该基因表达有一定的组织特异性。序列分析显示睾丸组织中表达的是DRSox3,卵巢组织中表达的是DRSox22。在Sox家族中,Sox3表达于中枢神经系统和尿生殖嵴的发育过程中;Sox22则表达于多种组织和神经系统中,可横跨CNS和PNS的整个过程。此结果表明Sox基因不仅在性别决定中起作用,还可能在胚胎发育过程中担负重要功能。     

Staufen基因在结直肠癌组织中的表达

为研究甲基化差异相关基因Staufen在结直肠癌不同组织中的表达情况,采用RT-PCR和免疫组织化学等方法在结直肠癌病人中检测Staufen基因在腺癌、癌旁粘膜和相应远端切缘正常组织中的表达。研究发现,在mRNA水平上,远端切缘正常组织中Staufen基因的表达水平显著高于癌旁粘膜和腺癌（P<0.05）;从正常组织、癌旁粘膜到腺癌,Staufen基因的表达有降低的趋势;未发现性别、年龄、肿瘤部位（结肠/直肠）、分化程度、淋巴结转移等临床病理因素与Staufen基因的表达有关（P均>0.05）。正常组织与腺癌组织的Staufen蛋白的表达水平显著高于癌旁粘膜（P<0.05）,而正常组织与腺癌组织之间未发现有统计学差别（P>0.05）。结果表明,Staufen基因在癌旁粘膜和肿瘤中有低表达的趋势,该基因可能在结直肠癌的发生、发展中起作用。     

肝素酶超表达对HEK293细胞中Arc基因的调节

目的:利用RT-PCR验证基于肝素酶转基因小鼠的大脑皮层组织表达芯片发现的表达上调基因Arc,研究肝素酶基因Hpse对Arc基因表达的影响。方法:在稳定转染小鼠肝素酶基因Hpse的HEK293细胞体系中,采用半定量PCR的方法分析Arc的mRNA表达情况。结果:与前期的小鼠大脑皮层表达芯片结果相反,Hpse下调Arc基因的表达。结论:推断肝素酶可能通过影响Arc基因的表达,从而影响细胞功能。     

Down-regulation of RBP4 indicates a poor prognosis and correlates with immune cell infiltration in hepatocellular carcinoma

Recent research has indicated that metabolically related genes play crucial roles in the pathogenesis of hepatocellular carcinoma (HCC). We evaluated the associations between novel biomarkers and retinol-binding protein 4 (RBP4) for predicting clinical HCC outcomes, hub-related genes, pathway regulation, and immune cells infiltration. Bioinformatic analyses based on data from The Cancer Genome Atlas were performed using online analysis tools. RBP4 expression was low in HCC and was also down-regulated in pan-cancers compared with normal tissues. RBP4 expression was also significantly different based on age (41–60 years old versus 61–80 years old), and low RBP4 expression levels were associated with advanced tumor stages and grades. Higher RBP4 expression was associated with better overall survival time in HCC patients, and we identified a deletion-mutation rate of 1.4% in RBP4. We also identified ten co-expressed genes most related to RBP4 and explored the relationships between six hub genes (APOB, FGA, FGG, SERPINC1, APOA1, and F2) involved in RBP4 regulation. A pathway enrichment analysis for RBP4 indicated complement and coagulation cascades, metabolic pathways, antibiotic biosynthesis pathways, peroxisome proliferator-activated receptor signaling pathways, and pyruvate metabolism pathways. These results suggest that RBP4 may be a novel biomarker for HCC prognosis, and an indicator of low immune response to the disease.     

草莓钙依赖蛋白激酶基因的克隆与表达分析

以EST测序结合RACE技术,从久香草莓的茎尖中分离得到一个新基因,BLASTX分析显示这是一个钙依赖蛋白激酶编码基因,与GenBank中的FaCDPK1同源,命名为FaCDPK2,GenBank登录号为HQ829293.采用半定量RT-PCR对FaCDPK2基因在不同组织中的表达分析表明,FaCDPK2全长3 775 bp,读码框1 659bp,由12个外显子组成,编码552个氨基酸残基,在第89~349位是保守的蛋白激酶结构域,C端含4个EFhand钙结合域.该基因编码蛋白与拟南芥CPK28序列一致性为86.25%,与草莓FaCDPK1序列一致性为43.99%.表达分析显示该基因表达范围较广,在所分析的七种草莓组织材料中,以花中表达水平最高,在果实中的表达可能受成熟的诱导.     

水稻赤霉素代谢关键酶基因表达的检测分析

赤霉素(GA)与水稻矮化突变体的产生有密切的关系.根据GenBank数据库中水稻赤霉素代谢关键酶基因的cDNA序列,在保守序列区域设计引物,经过反应条件优化,建立了相对定量RT-PCR双标准曲线检测方法,并对中9B及其体细胞无性系矮化突变体SV9B的相关基因表达情况进行了检测.结果表明,该方法设计的引物特异性强,所构建的标准曲线相关性好,实验具有很高的可信度,可以应用于水稻赤霉素相关突变体的研究.     

酸胁迫对干酪乳杆菌H+-ATP酶基因表达的影响

耐酸性是乳酸菌重要的益生菌性状之一。实验采用半定量RT-PCR法分别对在不同酸度条件下培养后的3株不同干酪乳杆菌的H -ATP酶基因mRNA表达水平进行了比较和分析。实验结果显示,随着培养基酸度增加干酪乳杆菌的生长受到抑制,特别在pH4.0条件下干酪乳杆菌的生长受到强烈的抑制;H -ATP酶基因的表达量随着培养基酸度的增加而增加。推测H -ATP酶与干酪乳杆菌耐受酸性条件是有一定的关联的。     

水稻细胞质铜锌超氧化物歧化酶基因的序列和表达分析

以水稻(Oryza sativa)品种Cpslo17幼穗为材料,通过RT-PCR克隆了长度为698bp的编码水稻细胞质铜锌超氧化物歧化酶基因(OsCu/Zn-SOD)。序列分析表明其覆盖基因完整编码框,编码由152个氨基酸组成的蛋白,它与玉米(Zea maize)Cu/Zn-SOD基因序列的相似率为88%。TargetP和ChloroP预测编码蛋白N端无信号肽序列,且此编码区段有8个外显子和7个内含子。利用Swiss-Model站点预测OsCu/Zn-SOD三维结构,并分析其铜锌离子结合位点的结构。RT-PCR结果表明OsCu/Zn-SOD在水稻不同品种均有表达,但表达量存在差异,OsCu/Zn-SOD在Cpslo17的分裂旺盛的幼嫩组织如幼穗、开花期花序和未成熟种子中表达量较高,而在叶片中表达量相对较低,在愈伤组织中表达微弱。     

一种新的抑癌候选基因——NDR2在人类正常组织及相应肿瘤中的表达

为观察NDR2基因在人类正常组织及相应肿瘤组织中的表达分布特点,收集人脑与胶质瘤、肺与肺癌、胃与胃癌、结肠与结肠癌组织标本,分别进行组织石蜡切片和总RNA提取,应用免疫组化方法和RT-PCR技术检测NDR2蛋白质及mRNA表达水平,并通过DNA测序验证PCR产物的正确性.免疫组化结果表明,在上述各组织均有NDR2蛋白不同程度的表达.RT-PCR结果显示,在人脑和胶质瘤组织、肺与肺癌组织、胃与胃癌组织、结肠与结肠癌组织中均有NDR2 mRNA表达,其表达水平以脑组织为最高.NDR2 mRNA在正常脑和肺组织的表达水平分别显著高于胶质瘤与肺癌组织,而结肠与结肠癌组织,胃与胃癌组织NDR2 mRNA表达水平则无显著差别.以上结果表明,NDR2基因可能广泛表达于人体正常组织内,而在胶质瘤与肺癌中的表达较相应正常组织减低,提示该基因可能与神经系统及呼吸系统肿瘤的发生发展有关,为进一步探讨该基因功能提供了线索.     

PRLR、RBP4基因与苏姜猪繁殖性能的相关性分析

采用PCR-RFLP方法对71头苏姜猪的PRLR基因、RBP4基因的多态性进行了检测,分析不同多态性间繁殖性能的差异,探讨将PRLR基因、RBP4基因作为标记辅助选择用于苏姜猪核心群选育的可行性,从DNA水平上为苏姜猪的选育提供技术性支持.结果表明:PRLR、RBP4两个墓因位点在苏姜五世代母猪中均存在多态性.在该试验中,PRLR基因、RBP4基因各自基因型的效应差异均不显著(P>0.05),合并基因型的效应显著(P<0.05),可以联合标记用于苏姜猪核心群的选育.