濒危植物七子花RAPD条件的优化

以改进SDS法抽提濒危植物七子花嫩叶总DNA ,进行随机扩增多态DNA(RAPD)分析 ,分别测试了镁离子 ,dNTP ,模板DNA含量 ,引物和DNA聚合酶量对反应结果的影响 ,通过各因子的组合研究 ,可知七子花RAPD分析较适宜的扩增条件是 :1 5μLPCR反应体积 ,1×Taq酶配套缓冲液 (1 0mmol/LTris·HClpH 9.0 ,50mmol/LKCl,0 .1 %TritonX_1 0 0 ) ,2 .5mmol/LMgCl2 ,2UTaq酶 (上海华美公司 ) ,1 0ng模板DNA ,2 0pmol引物 (上海Sangon公司 ) ;dATP、dCTP、dGTP、dTTP各 0 .1mmol/L。     

濒危植物七子花RAPD条件的优化

以改进SDS法抽提濒危植物七子花嫩叶总DNA,进行随机扩增多态DNA（RAPD）分析,分别测试了镁离子, dNTP,模板DNA含量,引物和DNA聚合酶量对反应结果的影响,通过各因子的组合研究,可知七子花RAPD分析较适宜的扩增条件是：15 μL PCR反应体积,1×Taq酶配套缓冲液（10 mmol/L Tris·HCl pH 9.0, 50 mmol/L KCl, 0.1% Triton X_100）,2.5 mmol/L MgCl2,2U Taq酶（上海华美公司）,10 ng模板DNA,20 pmol引物（上海Sangon公司）;dATP、dCTP 、dGTP 、dTTP 各0.1 mmol/L。     

DIFFERENT RESULTS BY DIFFERENT COMMERCIAL TAQ DNA POLYMERASE IN RAPD

RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) technique has been widely used in animal, plant, human and microorganism research since it was first established by Williams in 1990[1-3]. But, because of low annealed temperature and short 10-nt primers, the resolution and repetition is low in RAPD. The stability of RAPD is influenced by many factors such as the concentration of template, primers, dNTP, Mg++,and Taq DNA polymerase[4-6]. The influence on amplified products of different commercial Taq DNA polymerase in RAPD was studied in this paper.     

宽叶缬草DNA的提取及正交优化RAPD反应体系

[目的]确定适合宽叶缬草RAPD分析的DNA提取方法以及建立最佳RAPD反应体系。[方法]比较宽叶缬草基因组DNA的两种提取方法(经典CTAB法、试剂盒法);采用正交设计L16(45),针对Taq DNA聚合酶浓度,d NTP浓度,Mg2+浓度,引物浓度,DNA模板浓度进行RAPD扩增,确立最佳RAPD反应体系。[结果]综合比较,试剂盒法较适合宽叶缬草基因组DNA提取;25μl最适宽叶缬草RAPD反应体系为:2.0 U Taq DNA聚合酶、0.4 mmol/L d NTP、4.0 mmol/L Mg2+、4.0μmol/L随机引物、60 ng模板DNA、2.5μl 10×buffer。[结论]试剂盒DNA提取法和正交优化的反应体系适用于宽叶缬草的RAPD分析,为进一步研究黔产宽叶缬草药材遗传多样性奠定了基础。     

红曲霉DNA提取及其RAPD-PCR反应体系的建立

采用改进的氯化苄法对红曲霉DNA进行提取纯化,探讨了提取液中EDTA的浓度以及其他因素对提取结果的影响。同时,以该法提取的DNA为模板,采用正交实验优化RAPD分析最佳反应条件。结果表明,当提取液中EDTA浓度为125mmol/l时,所得的红曲霉DNA的质量和数量均较理想,每克红曲霉菌丝体（湿重）能提取到50μg的DNA,分子量约为25kb,以此DNA为模板进行PCR扩增,其最佳反应体系为：Mg^2 2.0mmol/l,dNTPs 0.15mmol/l,Taq 0.05U/μl,模板DNA 1.2ng/μl,随机引物0.36μmol/l,Tris-HCl 10mmol/l pH9.0,KCl 50mmol/l,Nonidet P40 0.1%。另外,通过对比RAN酶消化前后的模板扩增结果证明了本实验酶的消化的必要性,对比了不同预变性时间处理模板对RAPD－PCR扩增的影响,发现不经过预变性的模板扩增结果最理想。     

赤霉菌原生质体DNA转化*

Methods for the protoplast preparation and DNA transformation of Gibberella fujikuroi were established. The protoplasts were transformed with plasmid pAN7-1, which carries hygromycin B resistant gene (hPh), and the transformation frequency was about 10. Some transformants grew vigorously on the selectivemedium containing 400μg / ml of hygromycin B, while the minimum inhibitory concentration (MIC) of the antibiotic to the recipient strain was oniy 20μg / ml. Southern hybridization showed that the hph gene ha…     

红曲菌基因组DNA提取及RAPD反应体系优化

为了建立一套适合红曲属真菌RAPD反应的优化体系,用改进的CTAB法提取红曲菌基因组DNA,采用单因素试验探讨RAPD反应体系中模板DNA、随机引物、Taq酶、Mg^2＋、dNTPs对扩增结果的影响。结果在20μL体积中,模板DNA20 ng、随机引物0、2μmol/L、Taq酶、Mg^2＋1.5mmol/L,dNTPs 1mmol/L的反应体系可得到稳定清晰的RAPD扩增图谱,为采用RAPD技术进行红曲菌种质资源遗传多样性研究奠定基础。     

RAPD 技术在药用植物绞股蓝鉴别中的初步研究

运用RAPD技术对绞股蓝(Gynostemma pentaphyllum)及其伪品进行DNA指纹图谱的鉴别研究.采用改进的CTAB法提取七叶绞股蓝、五叶绞股蓝、乌蔹莓(Cayratia japonica)3种植物的总DNA,主要以七叶绞股蓝DNA为模板,采用随机引物WGS001进行PCR扩增,对反应体系包括模板、Mg2 、Taq酶、牛血清白蛋白(BSA)、退火温度进行优化.优化的反应体系总体积25 μL ,含MgCl2 2 mmol/L、dNTP 0.2 mmol/L、引物 0.4 μmol/L、模板60 ng、Taq 酶1 U、BSA 2 μg/μL,退火温度58℃.用10条含20个碱基的随机引物对以上3种植物总DNA作PCR扩增,进行引物筛选.筛选得到的两条随机引物(WGS001、WGS004)可扩增得到识别这些物种基因组DNA的多态性片段.这些片段可以有效地鉴别绞股蓝和乌蔹莓.     

A hot start alternative for high-fidelity DNA polymerase amplification mediated by quantum dots

Quantum dots （QDs） are of great interest due to their unique chemical and physical properties. Recently, a hot start （HS） polymerase chain reaction （PCR） amplification performance based on QDs with a high-fidelity Pfu DNA polymerase has been reported. However, whether QDs can trigger HS effects with other high-fidelity or conventional DNA polymerases is yet to be understood. In the present study, we studied the QD-triggered HS effects with four high-fidelity and three conventional DNA polymerases, and the HS effect comparisons among them were also made. It was found that QDs could trigger a distinct HS PCR amplification performance with all the four tested high,fidelity DNA polymerases, and specific target DNA could be well amplified even if the PCR mixture was preincubated for 2 h at 50℃. On the contrary, the HS effects were not prominent with all the three conventional Taq DNA polymerases. Specifically, the fidelity of Pfu is not sacrificed in the presence of QDs, even after a 1 h pre-incu- bation at 50℃ before PCR. Furthermore, the electrophoresis results preliminarily demonstrated that QDs prefer to adsorb high-fidelity polymerases rather than conventional ones, which might result in the QD-triggered HS effects on PCR performance by using high-fidelity DNA poly- merases.     

广东野百合DNA提取和RAPD条件的优化

以野百合(Lilium brownii)新鲜叶片、硅胶干燥叶片及鳞片为材料,研究了DNA的提取方法,并对影响随机扩增多态DNA(RAPD)反应的各因素进行了优化。建立了野百合RAPD的优化反应体系及程序,即在20μl反应体系中,含20 ng模板DNA,2.0 mmol/L Mg2 、0.2 mmol/L dNTPs、1.5 U Taq DNA聚合酶、0.3μmol/L随机引物S1519;扩增程序为:94℃预变性5 min,然后94℃30 s,38℃50 s,72℃1 min,35个循环,最后72℃延伸10 min,4℃保存。     

一种高效可直接用于PCR分析的土壤总微生物DNA抽提方法

以CTAB-溶菌酶-蛋白酶K-冻融裂解法直接抽提土壤总微生物的基因组DNA,利用G8000沉淀和纯化DNA.结果表明,该方法是一种简便、有效可直接应用于PCR分析的土壤总微生物基因组DNA的抽提方法.采用含聚乙烯吡咯烷酮(PVP)的缓冲液预洗,添加CaCl₂和BSA,可以去除腐殖酸;用PEG8000沉淀DNA,可以提高DNA质量;采用冻融法破碎细胞,CTAB、溶菌酶和蛋白质酶K共同作用以裂解细胞,可以保证获得大片段的DNA,提高DNA产率.用该方法抽提的七子花林下土壤总微生物DNA产率为9.22 μg·g^-1,A260/A280为1.65,可适用于 PCR扩增及扩增rDNA限制酶切分析(ARDRA)技术,适宜的模板DNA浓度为0.67 ng·μl^-1.快速、有效、可直接用于PCR分析的土壤总微生物DNA提取方法的建立,为大规模的土壤微生物分子生态学研究提供了可能.     

濒危植物七子花DNA的提取及分析

用不同的方法抽提濒危植物七子花嫩叶DNA ,利用紫外分光光度法对其质量进行鉴定 ,以紫外分光光度法及琼脂糖凝胶电泳 -溴化乙锭染色法对其含量进行双重测定 ,显示适合七子花DNA抽提的最佳方法是改进的SDS法 ,该法适合RAPD分析。用此法对七子花植株不同器官的DNA进行抽提 ,其含量分别是 :嫩叶 >枝芽 >老叶 >嫩茎 >老茎。     

濒危植物七子花种内与种间竞争的数量关系

七子花为国家2 级重点保护植物, 现野生资源极少。利用Hegyi 单木竞争指数模型对分布在浙江天台山的七子花种群的种内、种间竞争关系进行定量分析。结果表明:七子花种内竞争强度随着林木径级的增大而逐渐减小, 种内竞争较之与其伴生树种间的竞争剧烈。七子花种内、种间竞争强度大小顺序为:种内 > 苦枥木 > 红脉钓樟 > 青钱柳 > 青榨槭 > 暖木 > 细齿绸李 > 柳杉 > 赤杨叶。竞争强度与对象木的胸径大小服从幂函数关系, 利用模型可预测七子花种内、种间的竞争强度, 从预测结果可知当七子花的胸径达到20 cm 后, 竞争强度变得很小, 且变化幅度不大。     

七子花的繁殖生物学研究

对国家2级保护植物七子花（Heptacodium miconioides)的开花、传粉与结实等繁殖特性进行了研究。结果显示：七子花的花无梗,由多轮紧缩呈头状的聚伞花序组成顶生圆锥花序,多数花序开两轮花（基轮和中轮）,少数只开基轮花。自花传粉的比例高,花后4h的柱头花粉多超过60粒,8h的柱头可多达142粒,其中近1／3的花粉萌发,少数能到达子房。每个子房仅1枚胚珠可育,其平均结实率为40．6％,上轮花的开花会影响下轮花的结实率,降低幅度可达34．8％,早开花的结实也会影响迟开花的结实。表明七子花的结实率很低,资源限制是影响结实的主要因素。     

水杉栽培居群的遗传多样性研究

利用RAPD技术,对9个水杉(Metasequoiaglyptostroboides)栽培居群的遗传多样性进行了初步研究。用10bp的随机引物16条,共扩增出103个位点,其中37个为多态位点,占35.92%。各居群的多态位点百分率在16.50%~33.01%之间。POPGENEversion1.31软件处理结果如下:居群的Shannon’s信息指数为0.1930。遗传距离在0.0130~0.0650之间,遗传一致度在0.9370~0.9871之间。AMOVA分析结果显示遗传变异主要存在于居群内,占89.05%,居群之间有一定的分化。上述结果表明水杉栽培居群的遗传多样性略低于自然居群,涵盖了自然居群近80%的遗传多样性。由此可以确认栽培水杉的种源是经过混合的,它们在相当程度上代表了自然居群的遗传多样性水平。采自潜江的9株丛枝水杉(Metasequoiaglyptostroboidesvar.caespitosa)没有扩增出特有位点,将其视为一个居群根据遗传一致度作UPGMA聚类分析时,该居群和湖北的3个居群及南京(NJ)、成都(CD)居群聚在一起;单株聚类时丛枝水杉也没有聚成独立的一支,而是比较分散,因此不支持将丛枝水杉作为水杉的一个变种的分类处理。从亲缘关系上看,丛枝水杉应当归属于湖北潜江蚌湖种子园(BH)和湖北潜江广华(GH)居群,这与其分布现状也是吻合的。     

浙江天台山七子花群落研究

七子花为优良的观花树种,此种珍贵、罕见,已临近濒危境地。本文以分布在浙江天台山的七子花林为对象,分析了群落的特征和性质。七子花群落垂直结构较复杂,可分为乔木层、灌木层、草本层,亦有数量较多的层间植物。群落的优势种显著,乔木层的中多样性指数较高,各样地间的植物种类具有一定的相似性。七子花种群年龄处于衰退型阶段,天然更新不佳。种群的分布格局集群分布。     

浙江天台山七子花群落种群分布格局研究

以浙江省天台山七子花群落为研究对象,采用相邻格子样方法取样数据,应用方差／均值比的t检验法、负二项参数、扩散型指数、Cassie指标、丛生指标、平均拥挤指数和聚块性指数等方法,分析了七子花群落各优势种群以及七子花种群在各样地中的分布格局,并分立木级对七子花种群在不同样地内的集群强度进行了测定。结果是：群落中各优势种群均呈集群分布;七子花种群在各样地亦呈集群分布,但集群强度有差异;各样地中七子花种群小树的集群强度均大于中树,种群呈扩散趋势。     

浙江天台山七子花群落优势种群结构及物种多样性研究

七子花 (Ｈｅｐｔａｃｏｄｉｕｍｍｉｃｏｎｉｏｉｄｅｓ)为我国特产的落叶小乔木 ,属忍冬科的单种属植物 ,现资源极少。在浙江省天台山分布着一小片以七子花为优势的群落 ,作者曾对该群落特征和种群结构作了初步的研究[4 ,5] 。本文通过对该群落优势种群的年龄结构和物种多样性进行分析 ,探讨该群落优势种群的年龄动态和物种多样性特征 ,为七子花群落的保护与持续利用提供科学依据。1　研究地和方法1 1　研究地自然概况研究地区位于浙江省天台山主峰华顶山北侧狮子岩坑处 ,地理位置为 2 9°15′Ｎ、12 1°0 6′Ｅ。有关其自然概况报道较多…     

濒危植物七子花繁殖器官的形态及其变异

对国家2级保护植物七子花(Heptacodium miconioides)的繁殖器官的形态及其变异进行了研究.结果显示:种群A的生境恶劣,花枝的开花数少,结实状况不及种群B,但因仅开基轮花的花序比例低和开三轮花的花序比例高,果实和种子的变异较大;而种群B的生境条件好,开花结实有明显的改善,但成熟种子的胚发育也不完全,且种子的最大值(由花序Ⅰ产生)不及种群A.说明七子花更适合于生境恶劣的条件下生长.另外,整枝疏花可以改善其结实状况,但效果不显著,说明七子花自身的营养调节能力差.因此,有性生殖障碍是七子花成为濒危物种的主要原因,要消除这种障碍必须研究种群的生态适应机制和种质的更新.