尿样在SELDI技术中的优化研究

目的:建立表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF/MS)技术检测尿液样本的方法。方法:采用SELDI技术及弱阳离子交换表面蛋白芯片(CM10)对糖尿病病例组和正常对照组的尿液样本进行分析,从尿液标本的采集、样品保存、上样浓度的控制、实验仪器的内外校准、实验结果重复性验证与分析等方面进行实验条件的优化。结果:反复冻融3次以上的样品经SELDI检测的出峰数量和峰强度情况较差;以1:1或1:2的浓度作倍比稀释后的样本经芯片检测得到的蛋白峰强度和蛋白数量最优;对两组样本重复检测3次,蛋白丰度的平均变异系数(CV值)分别为0.121和0.095;两组样本共检测到202个蛋白峰,其中差异表达蛋白29个,在肝纤维化组中表达上调13个,表达下调16个。结论:初步建立了SELDI技术检测尿液样本的方法,提高了SELDI技术检测尿液样本的质量。     

分枝杆菌特征性蛋白的筛选

目的研究分枝杆菌蛋白表达,筛选分枝杆菌特征性蛋白,为分枝杆菌的快速鉴定奠定基础。方法选取分枝杆菌标准菌株,提取细菌蛋白,干化学法测蛋白浓度,应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术（SELDI-TOF-Ms）检测分枝杆菌蛋白表达,和非分枝杆菌蛋白指纹图谱比较,筛选分枝杆菌特征性蛋白。重复测定20次分枝杆菌蛋白标本,评价SELDI检测分枝杆菌蛋白分子量的重复性。结果耻垢分枝杆菌ATCC 14468有约20个蛋白峰,结核分枝杆菌ATCC 25177、土地分枝杆菌ATCC 15755、胞内分枝杆菌ATCC 13950、耻垢分枝杆菌ATCC 607有近40个蛋白峰。与非分枝杆菌蛋白指纹图谱相比,4个蛋白峰为分枝杆菌所特有。SELDI重复检测20次分枝杆菌蛋白标本显示同一蛋白峰的分子量变异系数≤0．05％。结论分枝杆菌有其特征性蛋白峰,可能有助于分枝杆菌的快速鉴定。     

大肠埃希菌蛋白指纹图谱的建立

目的建立大肠埃希菌（Escherichia coli,E．coli）蛋白指纹图谱,为Ecoli感染快速诊断奠定基础。方法收集临床分离E.coli88株,提取细菌DNA,PCR检测Ecoli 16S rRNA。蛋白提取液提取细菌蛋白,干化学法测蛋白浓度,应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术（SELDI-TOF-MS）检测Ecoli蛋白,采用Ciphergen Pro-teinchip软件自动采集数据。重复测定20次Ecoli混合标本,评价SELDI检测Ecoli蛋白分子量的重复性。结果E．coil标准菌株ATCC 25922和临床分离株均可检出16S rRNA。AU芯片能捕获近30个E．coli蛋白峰,其中19个蛋白峰构成E．coli特征性蛋白指纹图谱,各蛋白峰在临床分离E．coli间分子量变异系数≤0．2％。SELDI重复检测20次E．coli混合标本显示同一蛋白峰的分子量变异系数≤0．05％。结论E．coli在分子量3～20kD范围内具有特征性蛋白指纹图谱,为快速诊断E.coli感染提供了新思路。     

FSH通过SATB1调控上皮性卵巢癌ES-2细胞的增殖和侵袭活性

目的：探讨特异AT序列结合蛋白1（special AT-rich sequence-bindingprotein,SATB1）在卵泡刺激素（Follicle stimulating hor-mone,FSH）诱导的上皮性卵巢癌ES-2细胞增殖和侵袭中的作用。方法：以Real-timePCR检测不同浓度FSH（0、10、20、40、80mlU／ml）处理后sATB1基因mRNA表达水平的变化。实验分4组：①siCon组,转染si-阴性对照（si-Negativecontrol）序列的实验组,对SATBl无干扰作用;②siSATB1组：转染特异性干扰下调SATB1的siSATB1序列;（3）FSH＋siCon组：以FSH处理的siCon组;（4）FSH＋siSATBl组：以FSH处理的sisATB1组。MTT法检测4组细胞的增殖情况,Westernblotting技术检测4组细胞细胞周期蛋白（CyclinDl）,基质金属蛋白酶2（MMP．2）的蛋白表达情况,Transwell侵袭实验检测4组细胞侵袭能力的变化。结果：1．FSH＋siCon组的细胞增殖能力明显高于siCon组的细胞增殖能力,FSH＋siCon组的CyclinD1蛋白相对表达量0．90＋0．08明显高于siCon组的0．37＋0．01（P均〈0．01）,提示FSH具有促进ES．2细胞增殖的作用。2．FSH＋siCon组的穿膜细胞数（30212）个明显高于siCon组（13919）个,FSH＋siCon组的MMP．2蛋白相对表达量0．40＋0．01明显高于siCon组的0．28＋0．02,提示FSH具有促进ES．2细胞侵袭能力的作用。3．随着FsH浓度的增高,SATBlmRNA的表达量逐渐增加,分别为1,1．66±0．04,1．79±0．21,2.31±0．03,以FsH浓度为80mlU／m1时最显著（P〈0．05）。4．FSH＋siSATBl组的细胞增殖能力明显低于FSH＋siCon组的细胞增殖能力,FSH＋siSATBl组的CyclinD1蛋白相对表达量0．22±0．02明显低于FSH＋siCon组的0．90±0．08（P均〈0．01）;FSH＋siSATB1组的穿膜细胞数（5216）个低于FSH＋siCon组的（30212）个,FSH＋siSATB1组的MMP-2蛋白相对表达量0．15±0．00明显低于FSH＋siCon组的0．40±0．01（P均〈0．01）,FSH促进ES-2细胞增殖和侵袭的能力由于SATB1基因表达的下降而被阻断。结论：SATBl是FSH作用的重要靶分子,介导FSH对上皮性卵巢癌ES-2细胞系增殖、侵袭活性的调控。     

子痫前期患者尿液中足细胞裂孔膜蛋白和标记蛋白的检测及意义

目的：检测子痫前期患者尿液中足细胞裂孔膜蛋白和足细胞标记蛋白的浓度并探讨其临床意义。方法：本实验以62例妊娠期妇女为研究对象,分为三组,其中正常妊娠期妇女25例为正常对照组,慢性高血压的妊娠期妇女17例为高血压组,子痫前期患者20例为子痫前期组。ELISA检测各组妊娠期妇女的尿液中足细胞裂孔膜蛋白和足细胞标记蛋白的表达;Bradford法检测各组妊娠期妇女的尿蛋白。结果：足细胞裂孔膜蛋白和足细胞标记蛋白在正常对照组尿液中含量极少,在高血压组中分泌增加,而子痫前期组患者中明显升高（P〈0．01）,且在子痫前期组尿液中足细胞裂孔膜蛋白和标记蛋白的分泌含量均成正相关（r2=0．79,P〈0．05）。子痫前期组患者中足细胞裂孔膜蛋白和足细胞标记蛋白与尿蛋白浓度成正相关（r2=0．58,P〈0．05;r2=0．79,P〈0．05）。结论：足细胞蛋白脱落主要发生于子痫前期患者,且足细胞蛋白脱落量与尿蛋白成正相关,能直接反映妊娠期患者的肾损伤程度,可作为预测罹患妊娠期高血压的指标。     

以SELDI芯片进行细胞标本蛋白分析的方法学研究

目的:探讨以SELDI芯片技术进行细胞标本蛋白分析的最适方法及条件,筛选细胞标本蛋白表达差异。方法:对细胞标本分别用超声裂解法,U9细胞裂解缓冲液配方和自配细胞裂解液提取蛋白,以BCA法测定蛋白浓度;分别以磁珠活化后点样和生物芯片处理器点样使蛋白样品与芯片结合;并对提取蛋白进行检测,比较不同蛋白浓度梯度点样及WCX2,SAX2,IMAC-Cu,H50芯片捕获蛋白差异,用WCX2芯片筛选蛋白差异表达。结果:相同培养条件细胞以上述三种不同蛋白提取方法获得的蛋白浓度分别为:0.25±0.034μg/μl,0.6±0.06μg/μl,1.02±0.077μg/μl;生物芯片处理器点样法操作简单,要求样本量较少,点样时间短;SELDI芯片蛋白质峰图谱与蛋白浓度呈较好的正相关;WCX2,SAX2,H50,IMAC-Cu芯片捕获的蛋白质种类有较大区别;在分子量1000～300000Da范围内,以WCX2芯片共检测到87个差异蛋白峰,其中17个呈趋势变化。结论:上述三种方法比较,选用自配的细胞裂解液提取蛋白的浓度较高且更适于芯片研究;生物芯片处理器能较好地使蛋白与芯片结合;SELDI芯片能准确定位蛋白,且其蛋白质峰与被测蛋白浓度呈正相关变化;SELDI各芯片捕获蛋白类型不同,选择适宜芯片或联合运用芯片检测更易获得较理想蛋白差异表达结果。     

AKT途径在雌激素调控子宫内膜癌KLE细胞中乙二醛酶Ⅰ表达的作用

目的：探讨雌激素是否通过AKT途径调控子宫内膜癌KLE细胞中乙二醛酶Ⅰ（GlyoxalaseⅠ,GloⅠ）的表达。方法：采用RT—PCR和Western blotting检测雌激素（17-β雌二醇）处理或AKT途径抑制剂（LY294002）处理子宫内膜癌KLE细胞后GloⅠ的mRNA或蛋白的表达情况。实验分4组：Con组（对照组）;LY294002组（LY294002处理组）;E2组（17-β雌二醇处理组）;E2＋LY294002组（LY294002预处理1小时后再17-β雌二醇处理组）。结果：1、经不同浓度的17-β雌二醇（Con、10^-11、10^-10、10-9M）作用于KLE细胞24小时后,GloⅠmRNA的相对表达量分别为1,1．58±0．04,1．82±0．03,1．81±0．04,以10^-10M的浓度时最为显著（P〈0．05）。以10,lOM的17-13雌二醇作用于KLE细胞48小时后,GloⅠ蛋白的相对表达量为1．79±0．02,高于Con组。2、以LY294002抑制AKT途径后,KLE细胞中GloⅠmRNA的相对表达量为0．69±0．03,蛋白的相对表达量为0．16±0．02,均低于Con组.3、E2＋LY294002组GloⅠmRNA和蛋白的相对表达量分别为1．02±0．04、1．01±0．03,均低于E2组中GloⅠmRNA和蛋白的相对表达量,E2组分别为1．34±0．03、1．79±0．02。LY294002组GloⅠmRNA和蛋白的相对表达量分别为0．69±0．03,0．16±0．02,均低于Con组GloⅠmRNA和蛋白的相对表达量。结论：雌激素可上调子宫内膜癌KLE细胞中GloⅠmRNA和蛋白的表达。抑制AKT途径可下调子宫内膜癌KLE细胞中GloⅠmRNA和蛋白的表达。AKT途径在雌激素调控子宫内膜癌KLE细胞中GloⅠ的表达无明显作用．     

ALA—PDT对正常人角质形成细胞生物效应的实验研究

目的：探讨ALA—PDT抑制角质形成细胞（KC）增殖的可行性和最佳效果。方法：新鲜包皮组织经两次酶消化法进行KC分离与培养,分设对照组、单纯ALA组、单纯照光组及0．1mmol／L、0．6mmol／L、1．2mmol／L、1．8mmol／L、3．6mmol／LALA五个浓度组,经0．5h、1h、3h、5h四个避光孵育时间后PDT。酶标仪检测PDT后KC存活率、FCM检测KC中PpⅨ荧光强度,确定ALA最佳药物浓度和最佳用药时间;吖啶橙染色和Annexin V／PI双染法检测KC凋亡率和生长周期的影响。结果：0．6mmoL／LALA（用药1h）-PDT组为最佳药物浓度和最佳用药孵育时间,显示Pp Ⅸ荧光强度表达与KC凋亡率最高,能明显抑制S期与G2期的细胞增殖,使细胞增殖指数降至最低。结论：0．6mmol／LALA（用药孵育1h）-PDT能明显抑制KC增殖,更有效地促进正常KC凋亡。     

麦冬不同提取物对过氧化氢损伤人血管内皮细胞ICAM-1、VEGF、Bcl-2表达的影响

目的：观察麦冬不同提取物对过氧化氢诱导的人脐静脉内皮细胞（HUVEC）间黏附分子-1（ICAM-1）和VEGF、Bcl-2表达的影响。方法：体外培养HUVEC,用过氧化氢（H2O2）制造HUVEC损伤模型。以四甲基偶氮唑蓝（MTT）比色法检测细胞存活数量,用流式细胞仪检测HUVEC表面ICAM-1的表达量;免疫细胞化学方法检测HUVEC的VEGF、Bcl-2的分布情况。结果：模型组较正常对照组细胞增殖活性明显降低（P〈0．01）。与模型组相比,经麦冬水提物、正丁醇提取物处理组细胞增殖活性明显增加（P〈0．05,P〈0．01）。流式细胞仪检测显示正丁醇提取物可降低过氧化氢增加的ICAM-1基因的表达。Bcl-2的表达,模型组明显低于正常对照组,而正丁醇组表达明显高于模型组（P〈0．01）。VEGF的表达,模型组明显高于正常对照组,麦冬水提物、正丁醇提取物处理组高于模型纽（P〈0．05,P〈0．01）。结论：麦冬提取物具有抗凋亡、促增殖、降低细胞间黏附分子-1表达的作用,尤以正丁醇提取物效果更为显著。     

危重病人预警蛋白质组指纹与肿瘤患者生存关系的报告

目的:探讨危重病人预警蛋白质(lost goodwill target,LGT)多肽谱指纹的峰型和丰度对判断肿瘤患者病情发展及预后的意义.方法:对接受SELDI(Surface enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometer)技术检测的178名患者生存期与死亡时间进行调查,并根据SELDI检测所获得的指纹图中,以LGT指纹存在与否,分成无峰组、单峰组、双峰组、三峰和多峰组.采用多因素方差分析和COX风险回归模型分析的方法,比较四组中哪一种状态下死亡风险最大.结果:恶性肿瘤患者经SELDI技术检测所获取的指纹图中,如果LGT呈阴性表达,死亡风险低于单、双峰组,远低于三峰和多峰组;LGT呈三峰和多峰表达,其死亡风险远高于单、双峰组,差异有统计学意义(P<0.05),死亡率极高.结论:采用SELDI技术检测肿瘤患者的血清,LGT出现三峰和多峰表达,提示肿瘤患者病情即将恶化,该指纹标识为LGT阳性指标;单、双峰者为疑似指标;LGT指纹阴性表达,肿瘤患者近期预后良好,死亡风险极小.     

电针对大鼠胃黏膜损伤修复的血清蛋白质差异表达研究

目的：观察电针胃经穴对大鼠胃黏膜损伤修复的血清蛋白质差异表达,为进一步阐明针刺效应的体液机理提供理论依据。方法：用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱（SELDI—TOF—MS）技术和WCX2（弱阳离子交换芯片）对正常大鼠血清和电针大鼠血清进行蛋白质指纹图谱检测分析,通过Biomarker Wizard和Biomarker Patterns System软件判别分析处理数据并结合生物信息学方法筛选差异表达蛋白质。结果：与正常大鼠血清比较,电针大鼠血清蛋白质在质荷比为2000-50000有25个蛋白质峰差异有显著意义,其中有19个标志蛋白在电针胃经大鼠血清中呈现高表达,6个标志蛋白在电针胃经大鼠血清中呈现低表达。结论：电针可促进胃黏膜损伤大鼠血清蛋白质差异表达,这种差异蛋白质可能与电针促进胃黏膜损伤修复效应密切相关。     

双倍剂量氯沙坦治疗IgA肾病中蛋白尿疗效评价

目的：探讨双倍剂量氯沙坦氯沙坦在IgA肾病（IgA nephropathy,teAN）中降低蛋白尿的临床疗效。方法：选取40例经肾穿刺病理诊断为IgAN的患者,随机分为2组,A组18例采用单剂量（50mg,qd）氯沙坦;B组22例用双倍剂量（100mg,qd）氯沙坦,观察8周后两组的血压、实验室指标：血肌酐、尿素氮、血钾、24h尿蛋白、内生肌酐清除率（creatinine clearancerate,CCr）等以及临床症状,并作安全性评价。结果：B组患者24h蛋白尿下降（0．91±0．33g／24h）,A组患者蛋白尿下降（0．21±0．22g／24h）,B组24h蛋白尿下降率明显高于A组（P〈0．05）。双倍剂量氯沙坦在IgAN治疗中未出现不良反应,包括高血钾、咳嗽、低血压或水肿等。结论：双倍剂量氯沙坦在治疗IgAN中降蛋白尿的疗效较单剂量明显,应用安全,耐受性好,无明显不良反应。     

^1HMRS在定性诊断乙肝后早期肝硬化中的初步研究

目的：研究慢性乙型肝炎后早期肝硬化患者的氢质子磁共振波谱图像特点,旨在探讨^1HMRS成像技术诊断慢乙肝后早期肝硬化的可行性,为早期肝硬化的定性诊断提供新的方法。方法：首先,筛选出15例健康志愿者及15例慢乙肝后早期肝硬化患者。并将15例患者依据肝穿结果分为S2期、S3期和S4期三组;然后,对15例健康志愿者及15例慢乙肝后肝硬化组患者进行常规MRI扫描,包括三平面定位,横断面T1加权像（T1WI）、T2加权像（T2WI）,于T2WI上选取感兴趣区进行单体素氢质子波谱扫描。分别采集各化合物峰,通过GE公司波谱分析软件校正,测量各波峰峰值和峰下面积,分析正常组和病例组各波峰和峰下面积变化特征。结果：正常组均得到谷氨酸和谷氨酰氨复合物（glumatic acid and glutamylamnnia complex,GIX）峰与胆碱／磷酸肌酸（choline／phosphoric creatine acid,Cho／Pcr）峰,病例纽除上述两峰外,还得到乳酸（Lactate,Lac）峰和脂质（Lipid,Lip）峰。经统计学分析正常组与病例组Glx、Cho／Pcr峰值及峰下面积无明显差异（P〉0．05）,而Lac、Lip峰值及峰下面积有差异统计学意义（P〈0.05）。病例组内的S2、S3及S4期三组各自的Glx、Cho／Pcr、Lac、Lip峰值及峰下面积差异无统计学意义（P〉0．05）。结论：1H磁共振波谱成像技术是一种非创伤性定性检测慢乙肝后早期肝硬化的方法。     

早期肠内营养辅助治疗重症胰腺炎的临床疗效分析

目的：探讨早期肠内营养辅助治疗重症胰腺炎的临床效果。方法：选择2009年4月-2012年2月我院收治的重症胰腺炎患者共46例,随机分为实验组和对照组各23例,实验组在综合治疗的基础采用早期肠内营养治疗（EN）,而对照组在综合治疗的基础上采用全胃肠外营养治疗（TPN）,比较两组患者的血清总蛋白、白蛋白、尿素氮水平及血淋巴细胞百分比变化、血淀粉酶和尿淀粉酶恢复正常时间、住院时间及病死率,并比较两组治疗前及治疗后24、48及72小时的APACHEII评分。结果：治疗后,实验组患者的血清总蛋白、白蛋白、尿素氮水平及血淋巴细胞百分比变化均较对照组明显增高,差异有统计学意义（P〈0．05）,而血淀粉酶、尿淀粉酶恢复时间、病死率及住院时间分别均明显较对照组降低或缩短,差异有统计学意义（P〈0．05）。治疗24、48及72小时后,实验组APACHEII评分均较治疗前显著减低（P〈o．05）,而对照组治疗24、48h后APACHEⅡ评分与治疗前比较差异无统计学意义（P〉0．05）,治疗72h后APACHEII评分较治疗前显著减低（P〈O．05）。结论：采用早期肠内营养辅助治疗重症胰腺炎患者能有效保护肠黏膜屏障功能,改善患者的营养状况,增强患者的免疫力,并改善患者的预后。     

重组人甲状旁腺素（1-34）在大鼠体内的组织分布和排泄

目的：研究重组人甲状旁腺素（1-34）[rhPTH（1—34）]在大鼠体内的组织分布和排泄情况,为进一步的临床实验提供参考。方法：用^125I-同位素示踪法结合TCA酸沉淀法测定各主要器官组织的总放射性浓度和酸沉淀部分放射性浓度,获得rhPTH（1-34）的尿粪排泄和胆汁排泄数据。结果：各主要器官组织的总放射性浓度排序由高到低依次为：尿、肾、膀胱、肠内容物、肌肉、血清、肾上腺、空肠、肝、肺脏、卵巢、肠淋巴结、脾、胸腺、心脏、脂肪、睾丸和脑;大鼠皮下注射。^125I-rhPTH（1-34）后,骨骼组织中放射性分布低于血浆,但消除缓慢,血浆浓度4h较15min降低了78％,而骨骼浓度多数仅降低了50％以下;注射后72h,尿、粪分别排出注入放射性量的73．6％±10．9％和3．2％±1．3％,尿、粪合计排出注入放射性量的76．8％±11,4％;注射后12h,胆汁中累积排出注入放射性的6．64％±1．04％。经分子筛排阻HPLC证实,^125I-rhPTH（1-34）不与大鼠的血浆蛋白发生结合。结论：rhPTH（1-34）在泌尿系统中的分布较高,在脂肪和脑中最低,提示药物不易透过血脑屏障;就全身放射性分布而言,在骨骼中分布较高,提示药物具有一定的靶向性;rhPTH（1-34）主要经尿的形式排泄。     

评估SELDI-TOF-MS技术检测肾移植术后病人尿液的能力

目的:研究表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测肾移植术后病人尿液中蛋白质的能力。方法:根据尿液标本中蛋白质浓度进行稀释处理,采用SELDI-TOF-MS技术,用3种不同芯片(NP20、CM10、IMAC30)与蛋白质浓度的不同组合分别检测肾移植术后病人的尿液。结果:采用NP20/蛋白质未稀释、CM10/蛋白质浓度约0.1g/L、IMAC30/蛋白质浓度约2g/L时,质谱图中蛋白质峰的个数和丰度达到最佳;单一芯片中NP20捕获质荷比为5000～20000的蛋白质能力最佳,而CM10和IMAC30在质荷比为2000～5000时有较大的捕获能力;3种芯片中CM10具有最大的捕获蛋白质的能力。结论:3种芯片检测尿液中蛋白质的能力不同;为了更好地发现疾病特异性标志物,最好多种芯片同时检测,且在各种芯片得到最佳质谱图时的浓度进行检测。     

SELDI-TOF-MS筛选慢性阻塞性肺疾病血清标志蛋白的初步研究

目的:利用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)筛选慢性阻塞性肺疾病(COPD)血清特异标志物。方法:应用SELDI-TOF-MS技术检测30例COPD稳定期患者和30例健康对照者血清蛋白指纹图谱,采用Biomarker pattern软件进行分析,建立COPD的诊断模型。结果:COPD患者血清蛋白图谱与对照组相比,在相对分子质量2000-15 000范围内共检测到75个蛋白峰,发现19个有统计学差异的蛋白峰(P0.05)。通过对COPD组与对照组间的数据作进一步分析,经BPS软件分析,建立质荷比(M/Z)3 167、4 645的差异蛋白组成的诊断模型,其诊断敏感度为96.67%,特异度为96.67%。结论:SELDI-TOF-MS技术是一种快速、简单易行、用量少和高通量的分析方法。能直接筛选出COPD血清中特异表达标志物,用特异表达标志物建立的诊断模型能有效区分COPD患者与健康对照者,有望成为COPD诊断的辅助指标。     

SELDI-TOF-MS分析结直肠腺瘤血清蛋白质谱的变化

目的：分析结直肠腺瘤血清蛋白质谱的变化,寻找结直肠腺瘤的特异性生物标志物。方法：采用SELDI-TOF-MS技术（表面增强激光解析电离飞行时间质谱）对比分析31例结直肠腺瘤患者和11例正常人的血清蛋白质谱,用Biomarker Wizard软件对获得的蛋白质谱进行分析。结果：结直肠腺瘤组与正常对照组有24个蛋白峰有差异,其中有三个蛋白峰（8565.84D、8694.51D和5910.50D）的差异非常显著,8565.84D和8694.51D在结直肠腺瘤中高表达,在正常人中低表达,而5910.50D在两组人群中的表达相反。结论：这三个蛋白峰可能为结直肠腺瘤特异性的生物蛋白标志物。     

SELDI-TOF-MS Proteomic Profiling of Serum,Urine, and Amniotic Fluid in Neural Tube Defects

Neural tube defects (NTDs) are common birth defects, whose specific biomarkers are needed. The purpose of this pilot study is to determine whether protein profiling in NTD-mothers differ from normal controls using SELDI-TOF-MS. ProteinChip Biomarker System was used to evaluate 82 maternal serum samples, 78 urine samples and 76 amniotic fluid samples. The validity of classification tree was then challenged with a blind test set including another 20 NTD-mothers and 18 controls in serum samples, and another 19 NTD-mothers and 17 controls in urine samples, and another 20 NTD-mothers and 17 controls in amniotic fluid samples. Eight proteins detected in serum samples were up-regulated and four proteins were down-regulated in the NTD group. Four proteins detected in urine samples were up-regulated and one protein was down-regulated in the NTD group. Six proteins detected in amniotic fluid samples were up-regulated and one protein was down-regulated in the NTD group. The classification tree for serum samples separated NTDs from healthy individuals, achieving a sensitivity of 91% and a specificity of 97% in the training set, and achieving a sensitivity of 90% and a specificity of 97% and a positive predictive value of 95% in the test set. The classification tree for urine samples separated NTDs from controls, achieving a sensitivity of 95% and a specificity of 94% in the training set, and achieving a sensitivity of 89% and a specificity of 82% and a positive predictive value of 85% in the test set. The classification tree for amniotic fluid samples separated NTDs from controls, achieving a sensitivity of 93% and a specificity of 89% in the training set, and achieving a sensitivity of 90% and a specificity of 88% and a positive predictive value of 90% in the test set. These suggest that SELDI-TOF-MS is an additional method for NTDs pregnancies detection.