示差扣除杂交法及其在分子生物学中的应用

对示差扣除杂交方法对中人们比较熟悉的示差筛选,扣除杂交和ＤＤＲＴ－ＰＣＲ法,以及近几年新提出的ＲＤＡ、ＳＳＨ和ＲＳＤＤ法等六种主要的差异基因筛选法,从其原理,在分子生物学中的应用,优缺点及其改进进行了简要概述。     

国内信息

ＤＥＧＣＭ技术中的ＲＤＡ、ＳＳＨ和ＲＳＤＤ差异表达基因分离技术 (ＤＥＧＣＭ )发展很快 ,主要是ＰＣＲ技术的发展和相应新技术的出现为ＤＥＧＣＭ注入了新的活力。ＰＣＲ引入差式筛选之中 ,可提高效力和降低假阳性率。若引入扣除杂交 ,可发展扣除扩增方案 ,并用特异引物结合于ＰＣＲ中选择扩增差异ｃＤＮＡ而形成代表性差式分析法 (ＲＤＡ)。采用抑制性ＰＣＲ选择性扩增差异基因片段 ,用ＤＮＡ链内“退火”优先于链间退火 ,使非目的序列产生“发夹”式互补结构 ,不能与引物配对 ,从而选择性抑制非目的基因片段的扩增 ,以此形成抑制性差…     

用DD—PCR法克隆AVP4—8诱导的鼠脑差异表达基因

精氨酸加压素（ＡＶＰ）Ｃ端片段ＡＶＰ４－８,具有增强记忆的功能,它在大鼠脑内引发一系列的生理和生化变化。采用差示ＰＣＲ（ＤＤ－ＰＣＲ）技术,寻找注射ＡＶＰ４－８前后在大鼠海马中差异表达的基因。抽提总ＲＮＡ,以反转录产生的ｃＤＮＡ为模板进行ＰＣＲ,经过９组引物组合,获得了十几个差异片段,挑选其中差异最大的片段ｄｄｌ进行克隆,测序,并与Ｇｅｎｅｄａｎｋ等数据进行同源比较 有找到同源基因,可能是个新基因     

基因差异表达研究方法的探讨--从DD-PCR到cDNA RDA

ＤＤ－ＰＣＲ和ｃＤＮＡ ＲＤＡ都是近年发展起来的新技术,它们被应用于生物及医学领域,在基因差异表达和筛选差异基因的研究中有着广泛的前景。本文论述了ＤＤ－ＰＣＲ及ｃＤＮＡ ＲＤＡ的基本技术策略,并对两者进行了比较分析。     

一种鉴别差异表达基因的新方法：———cDNA示差分析技术

ｃＤＮＡ示差分析技术是继ｍＲＮＡ差异显示技术之后又一种鉴别差异表达基因的方法。该技术利用双链ＤＮＡ模板在ＰＣＲ时呈指数扩增,而单链ＤＮＡ模板为线性扩增原原理,先用常见的限制性内切酶将实验组与对照组消化成平均长度为２５６ｂｐ的ｃＤＮＡ片段,再用ＰＣＲ技术使用组的ｃＤＮＡ片段富集,随后进行３次差减杂交去除共有基因,最后扩增实验组中的特异表达的基因。本概述了该技术的原理、基本方法及其应用前景。     

发展中的mRNA差别显示技术

随着ＰＣＲ技术的出现（１９８５）,在分子生物学界又相继出现了两个很有影响的新技术──ＲＡＰＤ技术（１９９０）和ｍＲＮＡ差示法（１９９２）,前者用于分子标记,后者用于基因分离。ｍＲＮＡ差示法的生物学基础是基因的差别表达,既：单个细胞中表达的基因仅占基因总数的１５％。这种基因的差别表达决定了生命的所有过程,如：发育和分化、对逆境的反应、细胞分裂、老化等,图一给出了该方法最初的技术路线。提取要比较的两种或两种以上样品的ｍＲＮＡｓ,分别逆转录成ｃＤＮＡｓ,经过ＰＣＲ扩增后,直接进行测序胶电泳即可识别有差别的ｍＲＮＡ。其中、关键的是ＰＣＲ扩增时两个引物的设计．３＇端引物Ｏｌｉｇｏ（ｄＴ）ＭＮ很容易与具有Ｎ＇Ｍ＇－ｐｏｌｙ（Ａ）－３＇末端的大多数ｍＲＮＡ结合,进行ｃＤＮＡ的逆转录合成。Ｍ、Ｎ提供锚定位点,防止３＇端引物在ｐｏｌｙ（Ａ）序列不同位置上的随机结合。５＇端为１０个碱基的随机引物。这个经验上的碱基数值较理论的６－７个碱基（表一）更能满足测序胶电泳要求的条件：分子大小在５００ｂｐ左右,每条泳道上条带数在１００条左右。该方法近年来又有如下改进：一、ＰＣＲ退火温度由４２℃改为４０℃,可在保证特异性的同时,增加泳道上的     

用PCR—RFLP方法研究藏族HLA0—DQA1和—DQB1基因多态性

应用目前ＨＬＡ研究领域中成熟的、有效的ＰＣＲ－ＲＦＬＰ基因分型技术,从ＤＮＡ水平对藏族健康群体进行了ＨＬＡ－ＤＱＡ１（４９人）和－ＤＱＢ１（４９人）基因分型,这在国内外属首次。所采用的ＰＣＲ－ＲＦＬＰ基因分型技术是在ＨＬＡ－ＤＱＡ１和－ＤＱＢ１各等位基因全部序列已知的情况下,对其第２个外显子碱基序列扩增进而进行ＲＦＬＰ分析的方法。这种方法得到的ＲＦＬＰ的所有片段都是已知序列,因而精确度很高,同时为     

染色体微切割、微克隆技术及其研究进展

本文综述了染色体显微切割与微克隆技术的原理、方法、应用及研究进展,尤其对几种染色体显微切割的方法、染色体的体外扩增技术ＤＯＰ－ＰＣＲ、ＬＡ－ＰＣＲ等进行了比较分析。对染色体微切割、微克隆技术研究中存在的问题和应用前景进行了初步探讨。     

常用实验用近交系小鼠粒体ＤＮＡ遗传变异的分析

应用ＰＣＲ－ＲＦＬＰ和ＰＣＲ－ＳＳＣＰ技术,研究了分析了国内常用的实验用近交系小鼠线粒体ＤＮＡ（mtＤＮＡ）的品种间遗传变异。ＰＣＲ－ＲＦＬＰ分析发现,小鼠mtＤＮＡ的Ｄ－loop、tRNA^Met Glu Ile及ＮＤ３基因核酸序列,在４６个限制性内切酶酶切位点上均无差异;用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ分析方法对这些小鼠mtＤＮＡ的高变异区Ｄ－Loop的５′及3′端作进一步分析,亦未发现品种间遗传变异。结合mtＤＮＡ具有的母系遗传方式的特点,这一结果提示：常用的实验用近交系小鼠形成中可能只有１种雌性血统起了作用。     

几种差别表达基因显示技术及其在植物方面的应用

９０年代以来,先后出现了ＤＤ,ＲＤＡ,ｃＤＮＡ－ＲＤＡ,ＳＡＧＥ,ＧＥＦ,ＲＦＤ,ＳＳＨ以及ＡＴＡＣ－ＰＣＲ等数种未知产物的差别表达基因显示技术,本文对这些技术的异同。各自的优缺点以及它们在植物方面的应用现状和前景作了简单综述。     

r－干扰素对喉癌细胞系HEP－2HLA－DR抗原和增殖细胞核抗原表达的影响

本实验用人重组ｒ－干扰素（ｒｈｕ－ＩＦＮ）作用ＨＥＰ－２细胞后ＨＬＡ－ＤＲ抗原和增殖细胞核抗原（ＰＣＮＡ）表达的检测来探讨ｒ－干扰素对ＨＥＰ－２细胞ＨＬＡ－ＤＲ抗原表达诱导作用及体外抗增殖活性。用单克隆抗体ＣＲ３／４３（抗ＨＬＡ－ＤＲ）和Ｋｉ－６７（抗ＰＣＮＡ）。以链霉素一生物素技术（ＬＳＡＢ）检测ＨＥＰ－２细胞ＨＬＡ－ＤＲ抗原和ＰＣＮＡ表达,结果显示：ｒ－ＩＥＮ诱导ＨＬＡ－ＤＲ抗原和抑制ＰＣＮＡ表达其强弱与ｒ－ＩＦＮ剂量有关。资料提示：ｒ－ＩＦＮ不仅对ＨＥＰ－２细胞有细胞毒作用,同时能调节其细胞膜特性,因而在喉癌的治疗中是有效的。     

随机扩增多态性DNA技术在林业中的应用

１ＲＡＰＤ的原理随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲａｎｄｏｍＡｍｐｌｉｆｉｅｄＰｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃＤＮＡ,ＲＡＰＤ）系１９９０年由美国科学家采用ＰＣＲ技术发展起来的。在发现ＲＡＰＤ多态性的同时,也证明了ＲＡＰＤ标记的分离符合孟德尔独立分配规律,从而确立了ＲＡ...     

RAPD技术及其在动物遗传育种中的应用

ＲＡＰＤ技术是在ＰＣＲ基础上发展起来的一种ＤＮＡ多态性检测技术,已广泛应用于基因组研究的种个领域。本文概述了ＲＡＰＤ反应的原理、特点,总结了其在遗传多样性检测、亲缘关系鉴定、遗传连锁分析和数量性状的辅助标记选择等方面的应用,并肯定了ＲＡＰＤ在动物遗传户种领域的应用前景。     

抑制性扣除杂交技术(SSH)及其研究进展

一般认为,真核生物基因总数为100,000个左右。但在一定发育阶段,在某一类型的细胞当中,则只有15%左右的基因得以表达[1]。而生物体几乎所有的生命活动过程包括病理的变化,从本质上讲均是基因表达变化的结果。因此,关于真核生物发育过程中基因的表达与调控的研究已引起人们的高度重视。过去,人们对差异表达基因的分离主要依赖于示差筛选和差别杂交技术,但它们又存在着重复性差、敏感度低等缺点。近几年,随着ＰＣＲ技术的出现,涌现了许多基于ＰＣＲ的分离有差别表达基因的新方法。1992年ＬｉａｎｇＰ等[2]提出ｍＲＮＡ差异显示技术(ｍＲＮＡｄ…     

多聚酶链反应技术诊断结核病的进展

多聚酶链反应（ＰＣＲ）技术在结核病诊断上发展迅速。本文就①结核菌ＤＮＡ提取技术;②引物的设计;③用于诊断结核的ＰＣＲ方法;④ＰＣＲ产物的检测方法;⑤ＰＣＲ的敏感性和特异性;⑥ＰＣＲ临床应用和注意事项等方面,简述该技术在结核病诊断中应用的进展和需要进一步研究的问题。     

一种新的免疫—PCR系统的建立和应用研究

把ＰＣＲ技术作为指示系统引入免疫检测中,建立了免疫－ＰＣＲ技术。在本研究中,以ＰＥＩ作交联剂,首次成功地将特异性抗体直接与ＤＮＡ交联,构建了三种Ａｂ－ＤＮＡ基因探针,组成新的免疫－ＰＣＲ检测系统。此三种特异性Ａｂ－ＮＤＡ探针可用于检测三种相应抗原。检测ＨＳＡ抗原的最低含量可达１０＾－１８ｍｇ／ｍｌ,灵敏度比ＥＬＩＳＡ高１０＾６倍。     

一个改进的PCR过程中聚合酶复制精确性测定系统的建立

在大肠杆菌中建立了一套用于测定ＤＮＡ聚合酶在ＰＣＲ过程中复制精确性的系统,并测定了耐热ＦＤＤＮＡ聚合酶在ＰＣＲ扩增过程中的复制精确性。这一系统主要包括以质粒ｐＵＣ１１８和ｐＵＣ１１９为出发质粒所构建的一套共６个突变质粒,分别为ｐＦＤＦＰ１１８和ｐＦＤＦＰ１１９（＋１移码突变）、ｐＦＤＦＭ１１８和ｐＦＤＦＭ１１９（－１移码突变）、ｐＦＤＦＵ１１８和ｐＦＤＦＵ１１９（碱基置换突变）。这些突变质粒均不能进行ｌａｃＺ－α互补反应,因此在含有Ｘ－Ｇａｌ和ＩＰＴＧ的培养基上菌落呈白色。同时还构建了ＰＣＲ产物克隆载体ｐＦＤＦＬ１１８和ｐＦＤＦＬ１１９。以上述突变质粒为模板进行ＰＣＲ反应,取反应产物和ｐＦＤＦＬ１１８或ｐＦＤＦＬ１１９连接后转化到大肠杆菌中。若在ＰＣＲ过程中发生回复突变,则转化子在含有Ｘ－Ｇａｌ和ＩＰＴＧ的培养基上呈蓝色。由转化子中蓝白菌落个数即可计算出ＤＮＡ聚合酶的复制差错率。用这一系统测得ＦＤＤＮＡ耐热聚合酶的复制差错率为１０－５～１０－６。     

用~1H NMR和FT－IR研究hF－GRP及其类似物TF14与DMPC脂质体的相互作用

用＾１ＨＮＭＲ和ＦＴ－ＩＲ技术研究了肽激素ｈＦ－ＧＲＰ及其类似物ＴＦ１４与ＤＭＰＣ脂质体的相互作用及其构象变化,＾１Ｈ－ＮＭＲ实验结果提示这两个肽与ＤＭＰＣ之间存在静电相互作用,这使其可从水相结合到脂相中。     

RAPD在双歧杆菌菌种鉴定及分型研究中的应用

采用近年来兴起的一种新的分子生物学分型技术ＲＡＰＤ即ＡＰ－ＰＣＲ对２０株４种不不双歧杆菌进行了基因指纹图谱的构建,其结果不同双歧杆菌种间存在同源性和多态性。本研究结果表明ＲＡＰＤ技术可用于双歧杆菌菌种鉴定及分型。     

应用反转录—聚合酶链反应检测口蹄疫病毒

建立了一种适用于检测动物（猪、牛、羊）组织（肌肉、淋巴结、脊髓、扁桃体和蹄冠皮）和牛食道－咽部分泌物（Ｏ－Ｐ液）中的口蹄疫（ＦＭＤ）病毒核酸（ＲＮＡ）的反转录－聚合酶链反应（ＲＴ－ＰＣＲ）技术。引物对是人工合成的两条２０ｍｅｒ寡核苷酸片段,它们的序列相应于ＦＭＤ病毒结构蛋白ＶＰ１基因后２／３区段,在４个血清型之间基本一致（保守）。ＰＣＲ产物经琼脂糖凝胶电泳检测。试验结果表明,ＲＴ－ＰＣＲ具有良好的