杭州地区2009‒2014年非结核分枝杆菌流行状况分析

摘要：目的 研究近6年杭州市非结核分枝杆菌（Nontuberculous mycobacteria,NTM）的流行状况。方法 采用基因芯片和16S rRNA测序法鉴定2009年1月至2014年12月本院微生物实验室结核菌培养阳性的分离,并对相关资料进行总结分析。结果 6年间,从789例患者标本中分离798株分枝杆菌（剔除重复菌株）,NTM分离株171株,占21.4%,从2009年的11.9%上升到2014年的25.8%,MTB的构成比例降低和NTM比例升高的趋势有统计学意义（P=0.014）。NTM种群分布达18种,最常见的是胞内分支杆菌、鸟分支杆菌和脓肿分支杆菌,分别占30.4%、26.3%和20.5%。NTM阳性患者中,男性占66.3%,女性占33.7%,45~74岁年龄段合计占65.5%。抗酸杆菌涂片检查阳性的病例中NTM检出率由2009年的8.0%上升到2014年的22.0%,趋势分析P=0.014。结论 杭州地区分枝杆菌中NTM构成比例持续升高,2014年已达25.8%,以胞内分支杆菌、鸟分支杆菌和脓肿分支杆菌为主。开展NTM菌种鉴定,对鉴别诊断和有效治疗有重要意义。     

非结核分枝杆菌肺病临床分离株的菌种鉴定及临床特征分析

为探究非结核分枝杆菌（nontuberculous mycobacterium,NTM）肺病临床分离株的菌种分布及临床特征, 对2017年5月―2018年10月就诊于复旦大学附属中山医院的90例NTM肺病患者的样本进行分析。采用快速全自动分枝杆菌培养和药物敏感检测系统（BACTEC MGIT960 System）或改良罗氏培养法对90例患者的采集样本进行培养,利用基质辅助激光解析/电离飞行时间质谱（matrix assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS）进行菌种鉴定,并对回顾性分析收集的90例患者的临床资料进行分析。结果NTM菌种鉴定为9种,其中慢速生长分枝杆菌65例,以胞内分枝杆菌（54.4%,49/90）占多数;快速生长分枝杆菌25例,以脓肿分枝杆菌（22.2%,20/90）占多数。90例患者中确诊67例、疑似23例。确诊患者中少见菌种所占比例较低（6.0% vs 26.1%,P = 0.016）。确诊与疑似患者在临床表现方面未见显著差异,但确诊患者有抗NTM治疗史的比例显著高于疑似患者（85.1% vs 4.3%,P < 0.001）。确诊患者中,快速生长NTM肺病患者既往抗结核治疗史的比例显著高于慢速生长组（52.9% vs 24.0%,P = 0.036）。本研究结果为NTM肺病的临床诊治提供了数据参考。     

90年代新发现的非结核分枝杆菌

非结核分枝杆菌自发现以来,平均每10年新发现近20余种,且越来越受重视。将90年代新发现的25种非结核分枝杆菌的研究概况作一综述。     

用于结核分枝杆菌与非结核分枝杆菌鉴定的4种方法效能比较

比较硝基苯甲酸/噻吩−2−羧酸肼（PNB/TCH）生长试验、胶体金法、荧光PCR法和基因芯片法用于结核分枝杆菌（MTB）和非结核分枝杆菌（NTM）鉴定的效能,从而为临床选择鉴别MTB和NTM的实验室方法提供参考依据。

收集2021—2022年疑似肺结核患者痰液和肺泡灌洗液样本,选择经BACTEC MGIT 960全自动快速分枝杆菌培养鉴定药敏仪液体培养阳性的440份标本,分别采用PNB/TCH生长试验、胶体金法、荧光PCR法和基因芯片法鉴定MTB和NTM。以16S rRNA基因测序法为金标准,比较4种方法的效能。

440份分枝杆菌阳性标本,16S rRNA基因测序法鉴定出MTB和NTM分别为316株和124株。PNB/TCH生长试验、胶体金法、荧光PCR法和基因芯片法鉴定MTB的敏感度分别为96.5%、97.8%、100.0%和99.7%,差异具有统计学意义（χ² = 17.261,P = 0.012）;特异度分别为90.3%、100.0%、100.0%和98.4%,差异具有统计学意义（χ² = 29.110,P＜0.001）;符合率分别为94.8%、98.4%、100.0%和99.3%,κ值分别为0.87、0.96、1.00和0.98。

PNB/TCH生长试验、胶体金法、荧光PCR法和基因芯片法均可用于MTB和NTM鉴定。胶体金法和荧光PCR法鉴定MTB时效性较好,但胶体金法经济、便捷,更适合于基层临床实验室MTB快速鉴定;基因芯片法对软、硬件均有一定要求、检测成本较高,在一定程度上限制了临床的普及应用。

     

结核分枝杆菌耐药性的分子生物学研究进展

结核病一直是世界性问题,我国其发病情况尤为严重,是亚洲的第二大结核病发病国家。结核病治疗方面常使用抗生素作为首选药物,随着抗菌药的滥用,结核杆菌对多种抗菌药产生耐药性,结核病耐药患者增多,治疗难度增加。因此,结核杆菌耐药分子机制的研究更加重要,新型抗结核药物研制更加迫切。结核分枝杆菌的基因突变是引起耐药的主要分子学依据,因此基于结核分枝杆菌耐药性相关基因的深入探索,对于预防结核病的传播及治疗皆具有深远影响。本文从分子生物学角度分析了近年来结核分枝杆菌耐药性产生的原因及相关研究进展。     

结核分枝杆菌耐药机制研究进展

结核分枝杆菌为结核病的病原体.最近几年,由于基因突变导致多耐药及广泛耐药结核菌株的出现,以及抗结核病药近几十年来没有换代,使之前基本得到控制的结核痛死灰复燃,成为世界上病死率最高的传染病.为了遏制其进一步的恶化,必须从根本上透彻了解其耐药分子机制.近年来,各国学者采用先进分子生物学技术对结核杆菌耐药机制进行深入研究,定位了结核分枝杆菌耐药基因的位置和基因突变位点,比如耐异烟肼、利福平、乙胺丁醇、链霉素、吡嗪酰胺、喹诺酮类、外排泵等菌株新的基因突变位点引起新的功能改变有新的发现,特别是gidB基因、外排泵基因等有突破性的发现,对研制新一代抗结核病药提供了理论支持及新的方向,但仍有很多耐药机制未阐明,为后续研究者提供些许查考,故笔者就近几年来从分子水平对耐药机制的研究进展做一概述.     

三磷酸腺苷发光法快速检测结核分枝杆菌药敏技术的研究

目的 建立一种利用三磷酸腺苷( ATP) 与荧光素酶反应测定结核分枝杆菌( 简称结核杆菌) 释放的ATP 来判断结核杆菌药敏的技术。方法 ATP 生物发光法( 简称ATP 法) 通过裂解液体培养基中的结核杆菌, 释放活菌中的ATP, 加入荧光素酶使之发光以检测结核杆菌的活性。共采用H37Rv 标准株和10 株临床分离菌株, 用ATP 法与BACTEC 3D 法同步平行进行利福平药敏检测, 连续7 d 检测结核杆菌释放的ATP, 观察其生长曲线, 并以此判断对药物的敏感性。结果 在生长5 ～7 d的培养基中ATP法可以检测到敏感菌释放的ATP, 并且显著高于耐药菌所释放的ATP, 通过与BACTEC 3D 法相比确定其判断药敏的临界值, 检测结果与L-J 法及同步平行的BACTEC 3D 法对照组符合率达100% 。结论 ATP法可用于结核杆菌对抗结核药物敏感性的检测, 且因其价格较低, 无放射性元素的存在, 作为一种新型的结核杆菌药敏检测技术具有巨大的临床应用潜力。     

城市生活饮用水中非结核分枝杆菌调查

目的 调查上海市生活饮用水中非结核分枝杆菌的状况及主要菌种分布。方法 应用过滤法收集细菌, 并在改良罗氏培养基上培养; 通过16S rRNA 测序鉴定菌种。结果 上海市生活饮用水中非结核分枝杆菌的检出率为16. 7% , 其中自来水厂原水、出厂水和居民生活饮用终端水的检出率分别为60% 、25% 和10. 3% 。分离鉴定的非结核分枝杆菌菌种为戈登分枝杆菌及偶发分枝杆菌, 分别占90% 及10% 。结论 在上海市居民生活饮用水系统中存在非结核分枝杆菌, 因此, 应当采取有效的控制方法以保护公众的健康。     

结核分枝杆菌对异烟肼耐药的分子机制

抗结核一线药物异烟肼是应用最广泛的抗结核药物之一,自1952年应用于临床以来,异烟肼就成了治疗结核和潜在感染的基础药物.有报道,我国异烟肼耐药已排在首位.结核分枝杆菌对异烟肼耐药的分子机制十分复杂,涉及katG、inhA、kasA、ndh、axyR等多种基因,本研究仅就此方面的研究作一综述.     

供水系统非结核分枝杆菌生长因素及控制措施研究进展

近年来,非结核分枝杆菌感染在世界范围内日益普遍,严重威胁公众健康。供水系统是非结核分枝杆菌重要环境来源和主要传播途径,但目前对供水系统非结核分枝杆菌生长因素及控制措施的认识仍有较多不足。本文介绍了供水系统非结核分枝杆菌的生长传播特征,探讨了多个工程环境因素(如消毒剂、有机碳、管材和温度)和生物因子(如生物膜、阿米巴原虫和细菌)对非结核分枝杆菌丰度和物种多样性特征的影响,分析了供水全流程不同阶段控制措施对非结核分枝杆菌的控制效用,提出了深化认识供水系统非结核分枝杆菌的研究需求。     

Shifting paradigms of nontuberculous mycobacteria in cystic fibrosis

Important paradigms of pulmonary disease with nontuberculous mycobacteria (NTM) are currently shifting based on an increasing attention within the field of cystic fibrosis (CF). These shifts are likely to benefit the management of all patients with pulmonary NTM, regardless of underlying pathology. Currently several key areas are being revised: The first outbreak of human NTM transmission has been proven and new evidence of biofilm growth in vivo has been demonstrated. A better understanding of the clinical impact of NTM infection has led to increased diagnostic vigilance and new recommendations for lung transplantation are under way. While recent changes have reinvigorated the interest in NTM disease, the challenge remains, whether such advances can be successfully translated into improved management and care.     

Surrounded by mycobacteria: nontuberculous mycobacteria in the human environment

A majority of the Mycobacterium species, called the nontuberculous mycobacteria (NTM), are natural inhabitants of natural waters, engineered water systems, and soils. As a consequence of their ubiquitous distribution, humans are surrounded by these opportunistic pathogens. A cardinal feature of mycobacterial cells is the presence of a hydrophobic, lipid-rich outer membrane. The hydrophobicity of NTM is a major determinant of aerosolization, surface adherence, biofilm-formation, and disinfectant- and antibiotic resistance. The NTM are oligotrophs, able to grow at low carbon levels [>50 μg assimilable organic carbon (AOC) l⁻¹], making them effective competitors in low nutrient, and disinfected environments (drinking water). Biofilm formation and oligotrophy lead to survival, persistence, and growth in drinking water distribution systems. In addition to their role as human and animal pathogens, the widespread distribution of NTM in the environment, coupled with their ability to degrade and metabolize a variety of complex hydrocarbons including pollutants, suggests that NTM may be agents of nutrient cycling.     

6038例儿科临床标本深部真菌检出率及其药敏分析

目的了解儿童常见深部真菌的种类及耐药状况,指导临床合理用药。方法对785株深部真菌用YBC鉴定卡鉴定到种,用ATB-FUNGS试剂盒进行药物敏感试验。结果785株真菌中自色念珠菌占72．2％,其次是光滑念珠菌、热带念珠菌、克柔念珠菌,分别占17．2％、8．7％、1．3％。呼吸科、心内科、新生儿科、血液科真菌的检出率分别为：30．1％、13．5％、13．1％、12．1％;785株真菌对5-氟胞嘧啶、两性霉素B、制霉菌素、咪康唑、益康唑、酮康唑总的敏感率分别为93．2％、85．2％、87．4％、30．5％、61．8％、45．4％。结论儿童深部真菌以白色念珠菌最多。785株真菌对5-氟胞嘧啶、两性霉素B、制霉菌素的敏感性较高,它们仍然是治疗深部真菌感染的有效药物,而咪康唑、益康唑、酮康唑的敏感性较低,应引起临床医生的重视。     

Contribution of the multidrug efflux pump LfrA to innate mycobacterial drug resistance

Multidrug resistance (MDR) in bacteria has been associated with efflux pumps that export structurally unrelated compounds and decrease cytoplasmic drug accumulation. To investigate MDR in mycobacteria, we studied the Mycobacterium smegmatis mutant mc(2)11, which is resistant to doxorubicin, tetracycline, rhodamine, ethidium bromide and the hydrophilic fluoroquinolones. A genomic library constructed from this mutant was used to select clones conferring resistance to doxorubicin. Surprisingly, the clone selected encodes the efflux pump LfrA, which has been reported to confer resistance to hydrophilic fluoroquinolones, ethidium bromide, rhodamine, and acriflavine. To define the contribution of LfrA to the innate mycobacterial drug resistance and to the MDR phenotype in mc(2)11, the lfrA gene was disrupted in both the mc(2)11 mutant and the mc(2)155 wild-type parent. LfrA disruption of the wild-type strain decreased resistance to ethidium bromide and acriflavine, and increased accumulation of ethidium bromide. However, disruption of lfrA gene results only in a 2-fold decrease in minimal inhibitory concentrations (MICs) for ciprofloxacin, doxorubicin, rhodamine, and accumulation of [(14)C]ciprofloxacin was unchanged. LfrA disruption of the MDR strain mc(2)11 produced a similar phenotype. Thus, LfrA contributes significantly to the intrinsic MICs of M. smegmatis for ethidium bromide and acriflavine, but not for ciprofloxacin, doxorubicin or rhodamine.     

广西地区艾滋病患者临床标本分枝杆菌培养及耐药性分析

为探讨艾滋病患者临床标本分枝杆菌培养阳性率、菌种类型及耐药状况,本研究对2010年1月—2019年12月在广西某医院就诊的艾滋病患者的临床标本进行分枝杆菌培养,分离鉴定后用8种以上抗结核药物进行药敏试验.结果显示,艾滋病患者临床标本分枝杆菌培养总阳性率为15.68％(2163/13795),脓液、分泌物、组织标本、胸腹...     

女性不孕症患者支原体的检测及耐药性分析

目的了解女性不孕症患者支原体感染及耐药性状况。方法用解脲脲原体(Uu)和人型支原体(Mh)培养、鉴定、药敏一体化试剂盒,对宫颈拭子标本进行检测。结果 2008年1月至2010年6月检测的2 325份患者标本,共检出阳性1 028份,总检出率44.2%,检出支原体共1117株,包括Uu 998株(89.3%),Mh 119株(10.7%),其中单一Uu感染率为87.5%(900/1028),单一Mh感染率为2.0%(21/1028),Uu和Mh同时感染率为9.5%(98/1028);强力霉素、交沙霉素、四环素、克拉霉素、原始霉素对Uu和Mh的敏感率为77.3%~93.3%,阿奇霉素敏感率为58.8%~78.0%;喹诺酮类药物的敏感率仅为21.0%~42.0%。结论 Uu是主要感染菌种,有生殖泌尿道症状或不洁性行为史的女性不孕患者,都有必要检测支原体;混合感染Uu和Mh患者的治疗用药应兼顾2种支原体的效果;四环素类、大环内酯类可作为支原体治疗的首选药物之一,阿奇霉素治疗Mh疗效不佳,喹诺酮类药物因其较高的耐药率而应慎用。     

Detection of gene mutations related with drug resistance in Mycobacterium leprae from leprosy patients using Touch-Down (TD) PCR

The lack of methods to identify Mycobacterium leprae with the resistance against multi-drugs quickly and specifically has hindered effective chemotherapy against M. leprae infection. To screen M. leprae with resistance against multi-drugs, the Touch-Down (TD)-PCR has been used in this study. Sequences of the folP, rpoA, B, and gyrA, B genes were analyzed for isolates of M. leprae from leprosy patients in Korea. We amplified designated region of several genes in M. leprae involved in drug resistance and could obtain the PCR products of each gene. The mutations in the particular region of folP, rpoB, and gyrB gene were certified by TD-PCR single-stranded conformational polymorphism and DNA sequencing, respectively.     

嗜麦芽寡养单胞菌临床分布特征与耐药分析

目的了解湖州市中心医院嗜麦芽寡养单胞菌临床分布特征与耐药性。方法采用常规方法分离,用VITE-COMPACT2全自动微生物分析仪进行菌种鉴定,用K—B法进行药敏试验。结果分离到嗜麦芽寡养单胞菌810株,复方新诺明耐药菌株48株（分离率5．9％）。标本来源主要来自ICU室,其次呼吸科,大部分来自痰液标本（约占89．2％）,年龄段以中老年人比率最高。嗜麦芽寡养单胞菌对亚胺培南、美罗培南、头孢吡肟、哌拉西彬他坐巴坦、庆大霉素、妥布霉素、阿米卡星高度耐药;头孢他啶、替卡西林／克拉维酸、环丙沙星耐药率为33．7％～58．2％;头孢哌酮／舒巴坦、左氧氟沙星、米诺环素、复方新诺明耐药率低于30．0％。复方新诺明耐药菌株对头孢哌酮／舒巴坦、左氧氟沙星和米诺环素耐药率分别为60．4％、91．7％和2．0％,对其余抗菌药物耐药率达100．0％。复方新诺明耐药菌株与复方新诺明敏感菌株相比,耐药情况更严重,其中对三、四代头孢菌素、喹诺酮类耐药率显著高于复方新诺明敏感菌株（P〈0．01）;对碳青霉烯类、青霉素类、氨基糖苷类抗菌药物耐药率与复方新诺明敏感菌株相比,差异无统计学意义（P〉0．05）。结论嗜麦芽寡养单胞菌呈高度耐药,对头孢哌酮／舒巴坦、左氧氟沙星、米诺环素、复方新诺明尚敏感,但对复方新诺明耐药的嗜麦芽寡养单胞菌耐药现象更严重。应重视嗜麦芽寡养单胞菌引起的院内感染,尽量减少不必要的侵人性操作,加强抗菌药物的合理规范使用。