针对核因子-kB P65基因的短发夹干扰RNA逆转录病毒载体构建与鉴定

目的:构建针对人核因子kB亚基P65基因mRNA的短发夹干扰RNA(shRNA)逆转录病毒表达载体,并探讨小干扰RNA(siRNA)靶向抑制NF-kB P65基因表达的作用.方法:根据shRNA设计原则,在人NF-kB P65全长序列中选取合19个核苷酸靶序列,设计形成siRNA的DNA模板并克隆到shRNA表达载体pSUPER.retro.neo中,构建针对NF-kB P65基因的shRNA表达载体.经293A细胞包装,并感染NIH3T3细胞进行病毒滴度测定后,感染THP-1细胞.分别采用RT-PCR和Western blot从mRNA和蛋白水平检测干扰效果.结果:限制性酶切和基因测序证实针对人NF-kB P65亚基的shRNA表达逆转录病毒载体成功构建;其感染THP-1细胞后,NF-kB P65的mRNA和蛋白表达明显抑制.结论:成功构建了NF-kB P65 shRNA逆转录病毒表达载体,该载体能高效感染THP-1并明显抑制NF-kB P65的表达.     

利用RNA干扰抑制人肝癌细胞中核因子-κB p65基因的表达

目的：用小干扰RNA（siRNA）抑制核因子-κB（NF-κB）p65基因在人肝细胞癌细胞中的表达。方法：从p65的cDNA序列中挑选3个RNA干扰靶位点,用体外转录法制备siRNA,以萤光素酶基因的siRNA为对照,分别转染Hep3B和SMMC-7721细胞,用逆转录半定量PCR和免疫印迹检测siRNA对p65基因表达的抑制效率。结果：3条siRNA对p65基因的表达都有抑制作用,其中2条siRNA的抑制作用更为显著,最高抑制效率约为70%。结论：制备的p65-siRNA可用于研究NF-κB在肝细胞癌发生发展中的作用。     

RNA干扰NF-κB p65对缺血再灌注损伤鼠肺NF-κB和TNF-α的影响

为了研究RNA干扰NF-κBp65对鼠肺缺血再灌注损伤肺组织中NF-κB、TNF-α表达的影响,并探讨减轻鼠肺损伤的保护机制。本研究构建了体外靶向NF-κBp65的短发夹RNA (short hairpin RNA, shRNA)重组表达载体,并采用QPCR检测NF-κBp65的沉默结果。供试的16只SD大鼠随机分为4组:假手术组4只、缺血再灌注+生理盐水组4只,缺血再灌注+NF-κBp65 sh RNA组4只,缺血再灌注+空载组4只,假手术组无缺血再灌注损伤,开胸游离左肺门180 min,缺血再灌注+生理盐水组左肺门阻断前术前24 h给予生理盐水处理,开胸游离左肺门,左肺缺血60 min,再灌注120 min,缺血再灌注+NF-κBp65 shRNA组左肺门阻断前术前24 h滴鼻给予NF-κB shRNA腺病毒(1×1010pfu, 100μL/只),开胸游离左肺门,左肺缺血60 min,再灌注120 min,缺血再灌注+空载组左肺门阻断前术前24 h滴鼻给予空载shRNA腺病毒(1×10~(10)pfu, 100μL/只),开胸游离左肺门,左肺缺血60 min,再灌注120 min。实验结束后每组分别留取左肺组织,留取左肺上叶肺组织测定肺湿/干重比(W/D),部分肺组织光镜下观察病理变化,ELISA法测量NF-κB和TNF-α的表达含量。研究结果表明:成功构建重组NF-κBp65载体,并获得稳定转染的NF-κBp65 shRNA细胞,与转染空载体的阴性对照组(negative control, NC)比较,NF-κBp65 sh RNA能明显使NF-κBp65基因沉默(p0.05),肺组织NF-κB、TNF-α的表达量及W/D值与假手术组比较,缺血再灌注+生理盐水组和缺血再灌注+空载组有明显升高(p0.05);而与缺血再和灌注+生理盐水组和缺血再灌注+空载组比较,缺血再灌注+NF-κBp65 shRNA组明显降低(p0.05),病理学检查表明:假手术组肺组织无明显的炎症损伤;缺血再灌注+NF-κBp65 shRNA组肺炎性损伤较缺血再灌注+生理盐水组和缺血再灌注+空载组明显减轻。本研究结果初步说明,RNA干扰NF-κBp65能明显减轻早期肺移植损伤,其机制可能与抑制NF-κB和TNF-α的表达从而减轻肺组织炎症损伤有关。     

核转录因子TR3小干扰RNA载体的构建及其效果鉴定

目的：构建核孤儿受体TR3的小干扰RNA（siRNA）真核表达载体,并进行沉默效果测定。方法：根据TR3 mRNA序列和载体psiSTRIKE的粘性末端,设计合成TR3的干扰RNA序列,退火后克隆至psiSTRIKE,经测序鉴定后用阳离子脂质体将重组子和TR3高表达载体TR3-pcDNA共转染至HEK293细胞中,以Western blotting检测干扰后HEK293细胞内TR3表达的变化。结果：Western blotting检测结果证实构建的TR3 siRNA表达重组载体可显著抑制HEK293细胞内TR3的高表达。结论：构建了核孤儿受体TR3 siRNA真核表达载体。     

针对小鼠早期生长反应因子-1发夹结构小干扰RNA载体的构建及其干扰效率鉴定

目的:构建及筛选高效率针对早期生长反应基因-1(Egr-1)进行RNA干扰(RNAi)的质粒.方法:根据Egr-1基因mRNA序列,设计有小发夹结构的3条寡核苷酸序列,克隆到空栽体pGCSIL-GFP中,构建重组质粒,同时设计构建不针对任何特异基因的质粒作为阴性时照.将shRNA袁达质粒转粢HEK293细胞.通过对GFP表达量的观察,荧光定量PCR及western blotting定量检测Egr-1基因的表达,鉴定shRNA表达质粒对Egr-1的干扰效率.结果:针对小鼠Egr-1基因进行RNAi的3个序列中,有1个序列的干扰效率大于70%以上.结论:成功构建了1个针对小鼠Egr-1基因的高效RNAi表达质粒.     

Spl基因RNA干扰载体的构建及鉴定

目的:构建干扰载体pSilencer 3.1-spl,并初步研究其对Spl基因的干扰作用.方法:根据Spl cDNA编码序列,设计并合成针对Spl基因的特异性RNA干扰片段,并将其克隆入pSilencer 3.1-Hl neo干扰载体中,构建Spl基因小干扰RNA(siRNA)真核表达载体pSilencer 3.1-Spl;分别将阴性对照载体pSilencer 3.1与重组载体pSilencer 3.1-Spl经脂质体LipofectAMINE2000介导转染HeLa细胞,采用RT-PCR、Western blot方法分别检测Spl基因的转录与表达水平.结果:构建了Spl基因siRNA真核表达载体pSilencer 3.1-Spl,经酶切、测序鉴定证实克隆正确,并在mRNA水平和蛋白水平证实了载体的干扰效果.结论:特异性siRNA能明显抑制Spl基因在HeLa细胞中的表达,为进一步研究Spl的生物学功能和作用机制奠定了实验基础.     

核因子-κB的研究进展

机体对损伤及微生物入侵进行防御反应时,活化的核因子－κＢ（ＮＦ－κΒ）可诱导细胞合成各种生物大分子。细胞处于静息状态时,ＮＦ－κＢ与κＢ抑制蛋白（ＩκＢｓ）结合形成三聚体存在于细胞质内。当细胞受到外界因素刺激时,ＮＦ－κＢ与ＩκＢｓ分离,ＮＦ－κＢ进入细胞核内,其亚基形成环状结构与ＤＮＡ接触,启动基因转录。随后,新合成的ＩκＢｓ又与ＮＦ－κＢ结合返回细胞质。不同的ＩκＢｓ亚型发挥不同的生理功能。同时,对ＮＦ－κＢ的生理功能也作了介绍。     

靶向DENN-SV基因的shRNA真核表达载体的构建

该研究根据DENN-SV序列及shRNA设计原则,设计四个靶点序列,退火后用DNA重组技术与pRNAi-U6.1/Neo空载体连接,转化到感受态E.coli中。扩增菌株,抽提质粒,进行酶切、DNA测序鉴定。将重组的真核表达载体转染人乳腺癌MCF-7细胞并使用RT-PCR及Western blot检测其抑制DENN-SV mRNA表达的效率,以MTT法绘制生长曲线。测序结果与设计序列相同,并已成功转染进入人乳腺癌MCF-7细胞,可见GFP(绿色荧光蛋白)表达,且都具有抑制作用(P<0.01),DS-1组的抑制效果最好;MTT法绘制生长曲线结果表明,实验组经该载体转染后细胞增殖程度显著减少(P<0.05)。该研究应用RNAi技术成功构建了小干扰RNA重组体,为进一步研究乳腺癌基因治疗奠定了基础。     

AKT2 基因短发夹结构RNA 慢病毒载体的构建及鉴定

目的:构建丝/苏氨酸蛋白激酶2(AKT2)基因RNA干扰(RNAi)慢病毒载体。方法:利用公用网站按照RNAi序列设计原则,设计RNAi靶点序列并合成靶序列的Oligo DNA,退火形成双链DNA,与经MluI和ClaI进行酶切后的PLVTHM载体连接产生shRNA慢病毒载体。应用shRNA慢病毒载体转染293T细胞及U87细胞,测定病毒滴度,流式细胞仪测定U87细胞的转染效率,PCR及Western blot鉴定AKT2基因在U87细胞中的下调作用。结果:成功构建了shRNA-AKT2慢病毒载体,经测序与设计合成的靶向链完全一致。荧光显微镜下观察293T细胞感染效率大于90%,病毒滴度为3.59×107TU/ml;流式细胞仪测定对AKT2细胞的转染效率为86.93%。PCR测定shRNA载体感染U87细胞后AKT2的干扰效率为68%。Western Blot结果显示该慢病毒载体对AKT2的表达有较为显著的敲减作用。结论:成功构建了人胶质瘤细胞株AKT2基因RNAi慢病毒载体,为后续的体内外功能学试验创造了条件。     

AKT2基因短发夹结构RNA慢病毒载体的构建及鉴定

目的：构建丝/苏氨酸蛋白激酶2（AKT2）基因RNA干扰（RNAi）慢病毒载体。方法：利用公用网站按照RNAi序列设计原则,设计RNAi靶点序列并合成靶序列的Oligo DNA,退火形成双链DNA,与经MluI和ClaI进行酶切后的PLVTHM载体连接产生shRNA慢病毒载体。应用shRNA慢病毒载体转染293T细胞及U87细胞,测定病毒滴度,流式细胞仪测定U87细胞的转染效率,PCR及Western blot鉴定AKT2基因在U87细胞中的下调作用。结果：成功构建了shRNA-AKT2慢病毒载体,经测序与设计合成的靶向链完全一致。荧光显微镜下观察293T细胞感染效率大于90%,病毒滴度为3.59×107TU/ml;流式细胞仪测定对AKT2细胞的转染效率为86.93%。PCR测定shRNA载体感染U87细胞后AKT2的干扰效率为68%。Western Blot结果显示该慢病毒载体对AKT2的表达有较为显著的敲减作用。结论：成功构建了人胶质瘤细胞株AKT2基因RNAi慢病毒载体,为后续的体内外功能学试验创造了条件。     

新生隐球菌MIS1基因的siRNA表达载体的构建及鉴定

目的 构建靶向新生隐球菌MIS1基因的siRNA重组表达载体质粒,并进行鉴定.方法 根据GenBank的MIS1基因序列,按照载体要求设计单链引物,克隆到空载体psilencer4.I-CMV neo中,经过LiAc化学法将重组质粒转染到新生隐球菌细胞中并用G418筛选,利用real time PCR鉴定阳性细胞的MIS1基因水平.结果 重组表达质粒Psilencer4,1-CMV-si-MIS1经PCR、双酶切及测序鉴定,结果证明重组表达载体构建成功,其能在mRNA水平显著抑制MIS1的表达.结论 已成功构建新生隐球菌MIS1基因的siRNA表达载体,为深入研究MIsl在隐球菌相关疾病的发生及发展中的作用提供了技术手段.     

P27特异性siRNA重组腺病毒载体的构建及功能鉴定

目的构建针对P27的siRNA腺病毒载体及相应的对照病毒载体,并鉴定重组腺病毒在小鼠胰岛中对内源性皿7基因表达的影响。方法合成针对p27的siRNA的靶DNA序列及相应的阴性对照序列,连接至pShuttle-H1质粒中,然后用NotI和HindHI限制性内切酶将H1-siRNA片段从pShuttle—H1-siRNA质粒上双酶切下来,克隆至空载pAdTrack穿梭质粒上,与腺病毒骨架质粒pAdeasy-1在BJ5183细菌中进行同源重组,转染QBI-293A细胞,包装得到pAd—P27-siRNA和pAd—NC重组腺病毒。用病毒体外感染小鼠胰岛,Western印迹法检测P27蛋白表达水平。结果重组腺病毒载体经测序鉴定正确,制备的病毒感染效率高,能有效抑制小鼠胰岛中P27的表达。结论成功构建了针对P27的siRNA重组腺病毒载体,为进一步研究P27在胰岛β细胞生长中的作用提供了基础。     

A genome-wide expression profile and system-level integration of nuclear factor kappa B regulated genes reveals fundamental metabolic adaptations during cell growth and survival

A murine lung alveolar carcinoma cell line (WT-Line 1) and its equally tumorigenic but non-malignant derivative transduced with a dominant negative inhibitor of NF-kappaB (mI-kappaB-Line 1), were profiled on the Affymetrix 19000 gene array platform. Two differentially expressed gene clusters were identified and integrated into a functional model. The downregulation of anti-oxidant defenses, in mI-kappaB-Line 1 cells, correlates with high levels of reactive oxygen species (ROS) and ROS damage to cellular macromolecules while the upregulation of metabolic nuclear receptors correlates with an adaptive/survival response, which involves a shift in energy metabolism toward beta-oxidative respiration. Accordingly, mI-kappaB-Line 1 cells are markedly sensitized to pharmacologic inhibition of beta-oxidative respiration. These findings are indicative of compensatory changes that could undermine anti-cancer therapies targeting NF-kappaB.