论分子生物学技术在环境微生物研究中的应用

随着分子生物学技术在新时期的高速发展,越来越多的新方法、新技术被应用于环境微生物研究,本文简要介绍了荧光原位杂交、变性梯度凝胶电泳、末端限制性酶切片段长度多态性分析、基因芯片技术等在环境微生物研究中的应用,不仅可以在环境微生物研究中最大限度的获取微生物遗传信息,并可以对环境中微生物的多样性进行全面分析。     

污染土壤微生物群落结构分子鉴定技术研究进展

土壤微生物群落结构多样性检测是土壤修复、监测、评估时的一个重要参数。由于绝大多数微生物在实验室条件下是不可培养,因而早期依赖于微生物培养的检测结果代表性不强。20世纪90年代以来,不依赖于微生物培养的分子生物学方法是研究微生物群落结构的重要手段。该文对近年来土壤污染微生物群落结构研究所采用的主要分子生物学方法按照其原理进行了比较、分析、总结。根据不同技术的灵敏度、优缺点分析了其适用范围。指出了目前技术中存在的一些共性问题和缺陷并展望了土壤修复领域分子生物学技术的发展趋势。     

新技术在农药微生物降解中的应用

近年来,分子生物学及基因工程的迅猛发展,克服了农药微生物降解传统研究中存在的障碍,为农药微生物降解的研究开辟了新的途径。综述了固定化技术、基因工程、多菌复合体的构建以及细胞表面展示技术在农药微生物降解中的应用,并对新技术在农药微生物降解中的应用前景作出了展望。     

分子生物学方法在环境微生物生态学中的应用研究进展

随着分子生物学方法的不断发展和改进,微生物在生态系统中的作用被更好的挖掘出来。目前快速发展的先进的分子生物学技术,已经开始应用于分析环境微生物的多样性、微生物的生物地理学及微生物对气候变化的响应等。一般环境微生物的研究目标主要有3个,即确定微生物的种类和多样性、微生物的功能或潜在作用及在特定时间点活跃的微生物等。然而,现有微生物的研究方法复杂多样,容易给研究者在方法的选择上带来困惑。将从微生物的多样性和功能研究两个方面介绍和分析相应的分子生物学方法,尤其是近年来快速发展的高通量测序、宏组学和单细胞水平研究方法(如纳米二次离子质谱与荧光原位杂交相结合的方法)等新技术及其应用情况,以期为研究者选择合适的研究方法进行环境微生物的研究提供依据。     

口腔微生物群落结构分析方法的研究进展

牙菌斑是口腔常见感染性疾病——龋病和牙周病的始动因子,主要由微生物构成。在口腔中发现的700余个种属或种系型的细菌中,有50%左右未获得培养。基于分子生物学的方法在口腔微生态和感染性疾病的病因研究中已经成为不可或缺的技术。近年来,以16S rRNA基因为基础建立的分子生物学技术正逐步广泛用于微生物群落的分析,跨越了传统的微生物培养,直接对不同生态系,包括人类口腔的微生物组成进行了研究。本文主要介绍16s rRNA基因的分子分析技术,以及它们在口腔微生物群落结构分析研究中的应用,另外还简要介绍了一些尚未应用于口腔的新技术。     

海洋微生物专题研讨会在厦门举行

2005年8月22日,由中国生物化学与分子生物学会海洋生物化学与分子生物学分会（筹）与中国微生物学会海洋微生物学专业委员会筹备组联合主办的海洋微生物专题研讨会作为第三届海洋生物高技术论坛的卫星会议在福建厦门召开．157名从事海洋微生物研究的工作出席了会议。中国生物化学与分子生物学会海洋生物化学与分子生物学分会（筹）理事长、中国微生物学会常务理事、海洋微生物学专业委员会筹备组负责人焦炳华教授出席并主持了会议。会议共收到论161篇,编辑出版了论集。会议共安排学术报告14个,专家们分别就海洋微生物多样性。深海微生物和海洋动植物共生微生物研究方法与技术、现代陆地生物技术在海洋微生物研究中的应用,海洋微生物天然产物、生物制品和海洋微生物药物的研究与开发等专题进行了热烈的研讨。     

基于分子生物学和基因组学的植物根际微生物研究

根际微生物是指在植物根系直接影响的土壤范围内生长繁殖的微生物。根际微生物研究对微生物生态学和工业生物技术开发均十分重要, 妨碍其研究进展的主要原因是99%的根际微生物物种在实验室中无法成功培养。近年来, 将基于分子生物学和基因组学的非培养研究技术应用于根际微生物多样性研究取得了很大进展, 本文结合作者对红豆杉根际的研究, 评述近期相关新技术的应用和其未来应用前景。     

简讯

海洋微生物专题研讨会在厦门举行2005年8月22日,由中国生物化学与分子生物学会海洋生物化学与分子生物学分会(筹)与中国微生物学会海洋微生物学专业委员会筹备组联合主办的海洋微生物专题研讨会作为第三届海洋生物高技术论坛的卫星会议在福建厦门召开,157名从事海洋微生物研究的工作者出席了会议。中国生物化学与分子生物学会海洋生物化学与分子生物学分会(筹)理事长、中国微生物学会常务理事、海洋微生物学专业委员会筹备组负责人焦炳华教授出席并主持了会议。会议共收到论文161篇,编辑出版了论文集。会议共安排学术报告14个,专家们分别就…     

分子生物学技术在肠道微生物研究中的应用进展

肠道微生物与宿主的健康状况息息相关,已成为当今的热点研究领域。随着分子生物学技术的快速发展,高通量测序技术、实时荧光定量PCR技术和PCR-DGGE技术等凭借其高灵敏度、高通量、无需体外培养等优势,为研究微生物结构和功能基因组提供了新方法,并在肠道菌群的研究中应用广泛。本文对这三种分子生物学技术在肠道微生物研究中的应用进行了综述,总结了这三种技术在肠道微生物研究中的应用范围和优缺点,并展望了其在肠道微生物研究中的广阔应用前景。     

FISH技术在微生物生态学中的研究及进展

分子生物学技术在微生物生态学研究中具有灵敏、精确和快速的优势,但不能提供微生物的形态学、数量性状、空间分布等信息。荧光原位杂交技术结合了分子生物学的精确性和显微镜的可视性信息,可以在自然生境中监测和鉴定不同的微生物个体,尤其是对难培养和未被培养的微生物进行检测。荧光原位杂交技术被广泛用于微生物群落结构诊断和评价,现已成为微生物分子生态学研究中的热点技术。对荧光原位杂交技术的发展和在微生物分子生态学中的应用进行了综述,探讨了该技术应用中存在的问题和发展前景。     

FISH技术在微生物生态学中的研究及进展*

分子生物学技术在微生物生态学研究中具有灵敏、精确和快速的优势,但不能提供微生物的形态学、数量性状、空间分布等信息。荧光原位杂交技术结合了分子生物学的精确性和显微镜的可视性信息,可以在自然生境中监测和鉴定不同的微生物个体,尤其是对难培养和未被培养的微生物进行检测。荧光原位杂交技术被广泛用于微生物群落结构诊断和评价,现已成为微生物分子生态学研究中的热点技术。对荧光原位杂交技术的发展和在微生物分子生态学中的应用进行了综述,探讨了该技术应用中存在的问题和发展前景。     

植物发育分化分子生物学研讨会在沪举行

由中国科学院生物局委托,上海植物生理研究所筹备召开的植物发育分化分子生物学研究讨论会于二月二十一日至二十三日在沪举行。与会代表四十余人,生物局有关领导出席了会议。植物发育与分化的分子生物学研究,是由中科院上海植生所和中科院植物所共同承担的院重大项目。这次会议主要对该项目一年多来的工作进行交流和总结并制订下一步工作计划。     

酸性矿坑废水及目前研究酸性矿坑废水微生物群落的方法

本文通过对近期文献综述,阐明了酸性矿坑废水（Acid Mine Drainage,AMD）的形成机理以及AMD的微生物多样性。综述了AMD形成过程中的硫化金属矿、黄铁矿以及白铁矿的氧化作用,同时对影响AMD形成的化学、生物学以及物理因素及其过程进行了较为详尽的阐述。对目前使用分子生物学对AMD中微生物群落研究的几种手段进行的总结。最后对研究AMD微生物群落这几种分子生物学方法进行了归纳讨论。阐明了这几种分子生物方法对研究AMD微生物群落的重要意义。     

分子生物学技术在生物修复中的应用研究进展

随着分子生物学技术如分子杂交、PCR、电泳技术等的发展,微生物学研究领域发生了深刻的变革,灵敏的检测和精确的细菌鉴定成为可能.微生物分子生态学作为分子生物学与微生物生态学交叉而形成的学科,在生物修复方面得到广泛应用.从分子生物学实验技术角度综述了各种微生物分子生物学技术在生物修复中的应用研究情况.     

基因工程固氮研究

法国海外科学技术研究局微生物-生物学家 Claudine Bogusz 女士,在该局设在塞内加尔首都的实验室,与塞内加尔农业研究所合作,对某些作物与生物(细菌)联合共生和吸氮能力进行了研究,试图分离能使细菌具备这种性能的基因,然后将其传递给水稻,使水稻能够进行大气固氮,实现稻田不再施氮肥的目的。最近,该女士因开展分子生物学固氮研究,     

微生物生态学中分子生物学方法及T-RFLP技术研究

根据微生物基因 (DNA)多态性来研究微生物的多样性 ,是建立在多聚酶链式反应 (PCR)基础之上分子生物学的新方法 ,克服了传统微生物培养方法的限制。从理论、实验及应用角度出发 ,介绍了几种在微生物生态学中应用较为广泛的分子生物学技术 ;详细阐述了微生物生态学中分子生物学的一种新研究方法---末端限制性片段长度多态性 (T -RFLP)技术 ,该技术作为一种研究微生物群落特征的理想方法已经越来越受到人们的重视。     

微生物分子生态学技术在湖泊微生物多样性研究中的应用

微生物是湖泊生物圈物质循环和能量流动的主要参与者,在湖泊的生态系统中起着重要的作用。但是,湖泊中存在着大量不可培养的细菌,利用传统的培养技术,无法对湖泊微生物的多样性进行深入而全面的研究,而不依赖培养的分子生物学技术的发展为此方面研究开辟了新的路径。微生物分子生态学作为分子生物学与微生物生态学交叉产生的学科,在研究湖泊微生物多样性方面已经得到了广泛的应用。主要综述了变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术,末端限制性酶切片段长度多态性技术(T-RFLP),16SrDNA克隆文库技术等微生物分子生态学技术在研究湖泊微生物多样性方面的应用情况。     

现代生物化学与分子生物学研究技术在植物微生物生态学中的应用

植物微生物生态学是研究植物微生态系统的一门学科,以植物组织细胞内微生物的组成、功能、演替,以及微生物之间和微生物与宿主之间的相互作用关系为研究对象。现代生物化学与分子生物学技术在植物微生物生态学研究领域的作用日益明显。介绍了上述技术及其在植物微生物生态学研究领域的应用进展,并对其在该领域的利用和发展进行了展望。     

分子生物学在空气微生物气溶胶研究中的应用进展

空气微生物气溶胶的研究方法很多,包括培养计数法、生物发光法、化学发光法、直接镜检法、免疫学方法、分子标志法、生物传感器和分子生物学方法(基因探针和PCR法)。分子生物学方法由于特异性强、操作简便、快速,尤其是最新发展的定量PCR的方法还可以实现对DNA或RNA的绝对定量分析,因此在空气微生物气溶胶的研究中有很好的发展前景。本文对应用PCR和实时定量PCR(QPCR)在空气微生物气溶胶领域的研究进行了综述,指出了传统PCR和QPCR的优缺点,着重对QPCR在空气微生物领域的应用进行了比较全面的分析,指出了应用QPCR检测空气微生物气溶胶还应解决的问题和前景。     

大数据时代土壤微生物地理学研究综述

土壤蕴含极为丰富的微生物多样性,它们在物质分解、元素生物地球化学循环、植物生产力和生物健康中扮演着关键角色。理解土壤微生物的生物地理分布格局、形成机制与群落构建规则,有助于预测在全球变化背景下土壤微生物组的功能演变及其对陆地生态系统的调控影响。自21世纪以来,土壤微生物生物地理学在各种大型国际微生物计划的推动下逐步形成了分子生物学技术耦合大数据分析的模式,实现了多种尺度上的关联研究。阐述了土壤微生物在分布格局和群落构建规则方面的研究进展,重点介绍了分子生物学技术和大数据分析在土壤微生物生物地理研究中的应用,对土壤微生物生物地理学未来在微生物分类分辨率、模型验证与构建和功能基因地理学的发展方向进行了展望。