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DNA芯片技术及其在基因表达检测中的应用 总被引:5,自引:0,他引:5
随着人类基因组计划的顺利进行,预计到2003年人类可以完全测出自身的基因组序列。届时,人类将进入后基因组时代。探明人类全部基因的结构及其表达调控将成为后基因组时代的一个重要目标,而进行基因表达的检测则是研究基因功能的一个重要环节。人类如此浩翰的基因,... 相似文献
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DNA芯片技术在微生物学研究中的应用 总被引:4,自引:0,他引:4
DNA芯片技术作为一种高通量的核酸分析方法,已经成为“后基因组时代”中研究海量序列信息的重要分析工具之一。本简述了目前一些常用以及和新出现的DNA芯片的技术原理,并从微生物基因表达谱研究,微生物基因组学研究以及微生物检测鉴定研究等多个方面概述了DNA芯片技术在微生物学中的应用,同时在对DNA芯片技术的不足进行简要分析的基础上,展望了其进一步应用的前景。 相似文献
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DNA甲基化与基因表达调控研究进展 总被引:4,自引:0,他引:4
表观遗传修饰是指不改变DNA序列的、可遗传的对碱基和组蛋白的化学修饰,主要包括DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重塑以及非编码RNA等.表观遗传修饰是更高层次的基因表达调控手段.DNA甲基化是一种重要的表观遗传修饰,参与基因表达调控、基因印记、转座子沉默、X染色体失活以及癌症发生等重要生物学过程.近年来随着研究方法和技术的进步,全基因组DNA甲基化的研究广泛兴起,多个物种全基因组甲基化图谱被破译,全局水平对DNA甲基化的研究不仅利于在宏观层面上了解DNA甲基化的特性与规律,同时也为深入分析DNA甲基化的生物学功能与调控奠定了基础.结合最新研究进展综述DNA甲基化在基因组中的分布模式、规律以及和基因转录的关系等. 相似文献
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目的:研制猪链球菌2型(SS2)全基因组DNA芯片,建立SS2基因表达谱技术平台。方法:利用SS2全基因组序列,挑选出2194条基因,经PCR扩增出2156条基因并将产物纯化,点样制备芯片;将芯片用于表达谱研究,采用实时定量PCR验证表达谱结果,对芯片进行可靠性分析。结果:芯片杂交数据与实时定量PCR验证显示了较高的相关性,二者相关系数r=0.87。结论:研制了一批SS2全基因组DNA芯片,并建立了基于DNA芯片的表达谱技术平台。 相似文献
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DNA芯片技术及其在医学研究中的应用 总被引:3,自引:0,他引:3
DNA芯片因其具有高通量,快速,微型化等特点,已成为基因组学研究中最重要的技术之一,它在医学研究领域也得到越来越广泛应用,本文简述了DNA芯片制作一般过程,以及适应于DNA芯片的检测方法。 相似文献
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伤寒沙门菌基因组DNA芯片的制备与基因表达谱分析应用 总被引:7,自引:0,他引:7
伤寒沙门菌是一种具有鞭毛的革兰阴性人类肠道致病菌,也是一种重要的原核生物研究用模式菌.基因组芯片能够系统、全面且高效地观察生物的基因表达及进行基因组结构比较.利用伤寒沙门菌现有的全基因组序列,以Ty2菌株的基因组为基准,选取CT18菌株和z66阳性菌株的特异性蛋白编码基因,设计特异性引物,经PCR有效扩增出4 201个基因,产物纯化后点样于多聚赖氨酸玻片制备伤寒沙门菌基因组DNA芯片,并验证了芯片样点位次与效果.通过对基因表达谱分析的各种条件进行优化,建立相应的表达谱分析方法,并用于比较伤寒沙门菌野生株在高渗、低渗条件下的基因表达差异,结果与以前的报道基本一致.结果表明,成功建立了伤寒沙门菌基因组DNA芯片及表达谱分析方法,可为有关伤寒沙门菌基因表达调控及致病性机理、进化和基因多样性等方面的深入研究提供有效的技术支持. 相似文献
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目的:21世纪以来,随着合成生物学的高速发展及其所遇到的问题,开发下一代DNA合成技术已经成为了必然趋势。基因芯片技术和DNA大片段组装技术是建立下一代DNA合成平台的关键技术力量。方法:为了开发具有工业化标准的DNA芯片一基因组合成平台,我们首次利用电化学DNA芯片和DNA大片段组装技术合成了72kb的Ostreococcusmud的全叶绿体基因组。结果:首先,我们使用电化学DNA芯片合成仪合成了564条150bp的OligoMix,并成功扩增分离了其中96%的Oligo序列,剩下的基因组序列是通过传统的固相亚磷酰胺三脂合成法合成。在此基础上,我们利用DNA重组技术将564条150bpOligo片段分三步克隆到了一个pGSYN系统。通过高通量测序,我们证实叶绿体基因组被成功地人工合成。整个合成成本大约是目前传统基因合成成本的10%.20%。结论:研究证实基因芯片技术和DNA大片段组装技术的应用是能够明显的降低现阶段基因组合成工艺的成本。新技术的成熟推广和成本的有效控制也会进一步加速科学家对基因组功能的深入研究以及合成生物学的质的飞跃。 相似文献
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基因芯片技术及应用研究进展 总被引:19,自引:0,他引:19
王升启 《中国生物工程杂志》1999,19(4):45-51
采用高速打印或光刻合成技术可在硅片、玻璃或尼龙膜上制造DNA微阵列。样品DNA/RNA通过PCR扩增、体外转录等技术掺入荧光标记分子,与微阵列杂交后通过荧光扫描仪器扫描及计算机分析即可获得样品中大量基因序列及表达的信息。该技术可应用于高通量基因表达平行分析、大规模基因发现及序列分析、基因多态性分析和基因组研究等
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Accumulation of genetic and epigenetic aberrations leads to malignant transformation of normal cells. Functional studies of cancer using genomic and proteomic tools aim to reveal the true complexity of the processes leading to cancer development in humans. Until recently, diagnosis and prognosis of cancer was based on conventional pathologic criteria and epidemiological evidence. Certain tumors were divided only into relatively broad histological and morphological subcategories. Rapidly developing methods of differential gene expression analysis promote the search for clinically relevant genes changing their expression levels during malignant transformation. DNA microarrays offer a unique possibility to rapidly assess the global expression picture of thousands genes in any given time point and compare the results of detailed combinatory analysis of global expression profiles for normal and malignant cells at various functional stages or separate experimental conditions. Acquisition of such genetic portraits allows searching for regularity and difference in expression patterns of certain genes, understanding their function and pathological importance, and ultimately developing the molecular nosology of cancer. This review describes the basis of DNA microarray technology and methodology, and focuses on their application in molecular classification of tumors, drug sensitivity and resistance studies, and identification of biological markers of cancer. 相似文献
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Gene Expression in Tilapia Following Oral Delivery of Chitosan-Encapsulated Plasmid DNA Incorporated into Fish Feeds 总被引:3,自引:0,他引:3
DNA delivery into fish is important for transient gene expression, (e.g., DNA vaccination). Previous studies have generally
focused on intramuscular injection of DNA vaccines into fish. However, this method is obviously impractical and laborious
for injecting large numbers of fishes. This study reports oral delivery of a construct expressing the β-galactosidase reporter
gene into fish by encapsulating the DNA in chitosan and incorporating it into fish feeds. We found that β-galactosidase expression
could be observed in the stomachs, spleens, and gills of fishes fed with flakes containing the chitosan-DNA complex. These
results suggest that DNA vaccines and other constructs can be easily and cheaply delivered into fishes orally by use of carriers
and incorporation into fish feeds. 相似文献
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The genome sequencing project has generated and will continue to generate enormous amounts of sequence data. Since the first
complete genome sequence of bacteriumHacmophilus influenzac was published in 1995, the complete genome sequences of 2 eukaryotic and about 22 prokaryotic organisms have been determined.
Given this ever-increasing amounts of sequence information, new strategies are necessary to efficiently pursue the next phase
of the genome project—the elucidation of gene expression patterns and gene product function on a whole genome scale. In order
to assign functional information to the genome sequence, DNA chip technology was developed to efficiently identify the differential
expression pattern of independent biological samples. DNA chip provides a new tool for genome expression analysis that may
revolutionize many aspects of human life including new drug discovery and human disease diagnostics. 相似文献
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猪瘟病毒E2基因真核表达质粒的构建及基因疫苗的研究 总被引:12,自引:0,他引:12
构建了猪瘟(classical swine fever virus,CSFV)主要保护性抗原E2基因4种不同的真核表达质粒。小鼠免疫试验表明,E2基因上不同的功能区对基因疫苗的免疫应答有很大影响,有信号肽序列的E2基因可诱导产生特异性免疫反应,且无跨膜区序列的E2基因所诱导的免疫应答反应比有跨膜区序列的强,而无信号肽序列的E2基因则不能诱导产生CSFV特异性的免疫反应。攻毒保护试验表明,免疫家兔最 相似文献