扩增大片段核酸的聚合酶链反应及其应用

本综述了扩增１０－４０ｋｂ大片段核酸的聚合酶链反应方法的原理,影响因素条件优化,以及ＬＡ－ＰＣＲ在扩增与克隆目的的基因、研究基因组的多态性和分别等方面的应用。     

聚合酶链反应（PCR）对未知序列DNA的扩增技术

聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction, PCR)是由引物介导,在体外将特异性DNA序列利用酶促作用进行扩增的方法。双链DNA热变性,然后在低温下与引物退火,再在中等温度下进行延伸,三步为一循环。一般经30～35次循环,很容易将目的基因或DNA片段特异地扩增至少10~6～10~7倍。它已是分子生物学研究中常用的、不可缺少的一项基本技术。但常规PCR需在待扩增的已知序列两端分别设计两个寡核苷酸引物,也就     

PCR-微孔板杂交法检测不同人群TTV DNA

根据报道的TTV全序列设计引物和探针,建立PCR-微孔板杂交法,检测81例正常人群、92例职业献血员123例甲～庚型肝炎、32例非甲～庚型肝炎、48例原发性肝癌患者的TTVDNA.结果表明TTV在以上五种人群中的阳性率分别为3.7%、4.3%、21.1%、28.1%、52.0%,前者与后三者比较有显著性差异(P＜0.05),TTV合并HBV二重感染占重叠感染的54.0%.这揭示不同人群均存在TTV感染,正常人群和职业献血员存在健康携带状态,甲～庚型肝炎和非甲～庚肝炎病人为高危人群,TTV可与各型肝炎存在重叠感染,TTV除经血传播外,存在其它传播途径,TTV感染与ALT及TBIL的升高密切相关.     

一种快速序列比较方法及其在PCR扩增产物判定中的应用

根据影响对序列比较速度的二个重要因素：１．启动硬盘读写时间。２．对盘检索定位和数据译码时间。提出相应的改进措施。达到提高比较速度的目的,并对ＰＣＲ扩增产物的判定为例,说明方法成功地应用于未知序列判定。     

用DNA扩增法检测镰状细胞基因

本文报道应用DNA扩增技术对国内首例镰状细胞特征患者(Hb s杂合子)进行基因诊断。方法是从患者干血标本中微量抽提基因组DNA,通过聚合酶链反应(PCR)扩增其β珠蛋白基因,经限制性内切酶MstⅡ消化后作电泳分析直接检测Hb S基因。本文介绍的DNA诊断技术快速、灵敏、简便,它不需要放射性同位素标记的探针,可以采用干血抽提的DNA,因此,对遗传病基因诊断和携带者的筛查具有重要价值。     

PCR—微孔板杂交法检测不同人群TTV DNA

根据报道的TTV全序列设计引物和探针,建立PCR－微孔板杂交法,检测81例正常人群、92例职业献血员123例甲－庚型肝炎、32例非甲－庚型肝炎、48型发性肝癌患者的TTV DNA。结果表明TTV在以上五种人群中的阳性率分别为3．7％、4．3％、21．1％、28．1％、52．0％,前者与后三者比较有显著性差异（P＜0．05）,TTV合并HBV二重感染重叠感染的54．0％,这揭示不同人群均存在TTV感染,正常人群和职业献血员存在健康携带状态,甲－庚型肝炎和非甲－庚肝炎病人为高危人群,TTV可与各型肝炎存在重叠感染,TTV除经血传播外,存在其它传播途径,TTV感染与ALT及TBIL的升高密切相关。     

重组酶聚合酶扩增技术：一种新的核酸扩增策略

重组酶聚合酶扩增 (recombinase polymerase amplification, RPA)是近年来兴起的一种等温核酸扩增技术,它比聚合酶链式反应(polymerase chain reaction, PCR)及其它等温扩增技术更快速、便捷、高效。本文将详细介绍RPA这项新颖的技术,并对其在医疗诊断、农业、食品、生物安全等方面的研究及应用进展进行综述。期望这项技术得到更多的关注,使其发展更加完善,将来在更多的领域充分发挥作用,甚至书写核酸检测历史新篇章。     

聚合酶链反应技术检测沙门菌的研究进展

聚合酶链反应（ＰＣＲ）技术用于沙门菌检测发展迅速,本文就：①沙门菌检测中的引物设计;②沙门菌ＤＮＡ提取方法;③检测沙门菌的ＰＣＲ方法;④ＰＣＲ扩增产物的检测;⑤各种ＰＣＲ方法检测沙门菌的特异性、敏感性及注意事项等方面简述该技术在沙门菌检测中的应用进展。     

基于杂交链反应的新一代RNA-FISH技术检测EV-A71RNA及其与病毒3D聚合酶的相互作用

RNA荧光原位杂交(RNA-fluorescence in situ hybridization, RNA-FISH)技术利用荧光标记的核苷酸探针,通过互补链杂交,对细胞或组织中特定的RNA序列进行检测和定位。由于RNA-FISH产生的阳性信号较弱,需要结合特异性信号放大,提高信噪比。但传统信号放大技术的背景难以消除,无法定量且分辨率低,是RNA-FISH技术应用的巨大障碍。本文基于第3代杂交链反应(hybridization chain reaction version 3.0,HCR v3.0),利用一对分裂式探针消除非特异杂交背景,并引发荧光信号放大反应,建立了针对肠道病毒A71 (enterovirus-A71, EV-A71) RNA的敏感、特异的FISH检测方法,并将该技术与蛋白免疫荧光(immunofluorescence, IF)检测结合,通过高分辨率激光共聚焦成像,成功地在单个细胞水平上检测了EV-A71感染细胞后病毒RNA与其聚合酶3D蛋白的分布变化和相互作用情况,并对细胞中病毒RNA和3D蛋白进行定量。发现相较于传统定量方法,如逆转录定量聚合酶链反应和免疫印迹,新...     

逆转录聚合酶链反应检测Ⅱ型登革病毒基因

本文应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测Ⅱ型登革病毒基因。所设计引物在E基因区,引物1位于碱基序列的1566—1586,引物2位于1437—1458。引物在黄病毒属中为Ⅱ型登革病毒特有,它是Ⅱ型各株保守区。反应产物为150bp,内含一个HindⅢ酶位点,酶切后有111bP和39bp两个片段。使用本法对一系列稀释的培养液进行检测,可检出少至5TCID_(50)的病毒RNA。此外还检测了10份经病毒分离与免疫萤光分型证实为Ⅱ型登革热病人的血清和14份疑似Ⅱ型登革热病人但病毒分离阴性的急性期血清。证明本法敏感性明显高于病毒分离。     

精子介导鱼类基因转移和聚合酶链反应检测技术

金鱼精子与美洲大绵ｗｅｉ的抗冻蛋白基因一起保温３０分钟后,再与卵子受精,共获得１４５尾成鱼和若干胚胎。从胚胎和成鱼中提取ＤＮＡ经聚合酶链反应（ＰＣＲ法）扩增和Ｓｏｕｔｈｅｒｎ ｂｌｏｔ分子杂交表明,外源的抗冻蛋白基因进入了部分受体鱼的染色体组内。测定了４５尾一年龄实验鱼中,有１２尾显示出明确的杂交带,阳性率为２６％。     

PCR-微孔板杂交-ELISA法检测巨细胞病毒感染

建立PCR-微孔板杂交-ELISA法检测人血清标本中巨细胞病毒DNA。将5’端标记生物素的PCR扩增产物与5’端标记地高辛的探针呈液相混合,90℃ 2min,55℃,1min杂交。杂交后产物被链霉亲和素酶标板固定,经酶标记抗地高辛标记抗体结合显色。本试剂检测灵敏度为2.5×104 copies/mL,比传统PCR和ELISA敏度性高,特异性强,与单纯疱疹病毒Ⅰ型和Ⅱ型,风疹病毒、EB病毒、腺病毒核酸无交叉反应,批内CV为8.9%,批间CV为10.5%。该法可用于定性和定量检测HCMV DNA。     

PCR-微孔板杂交-ELISA法检测巨细胞病毒感染

建立PCR-微孔板杂交-ELISA法检测人血清标本中巨细胞病毒DNA.将5'端标记生物素的PCR扩增产物与5'端标记地高辛的探针呈液相混合,90℃ 2min,55℃,1min杂交.杂交后产物被链霉亲和素酶标板固定,经酶标记抗地高辛标记抗体结合显色.本试剂检测灵敏度为2.5×104 copies/mL,比传统PCR和ELISA敏度性高,特异性强,与单纯疱疹病毒Ⅰ型和Ⅱ型,风疹病毒、EB病毒、腺病毒核酸无交叉反应,批内CV为8.9%,批间CV为10.5%.该法可用于定性和定量检测HCMV DNA.     

聚合酶链反应-微孔板杂交技术检测人乳头瘤病毒

用HPV通用型引物和型特异性探针以PCR一微孔板杂交检测法（PCR－ELISA）建立了HPV诊断及分型技术,特异性试验表明只与HPV阳性标本显色,A值为0．327士0．029;阴性标本均不显色,A值为0．003士0．001,与性传播性疾病相关的病原微生物、淋球菌、解际支原体、沙眼衣原体、人巨细胞病毒、单纯殖疹病毒均不显色。敏感性试验,显示该法能检出3．6个Hds细胞含HPV－18型144个拷贝,A值0．237－0．206;空白对照A值为0．005－0．ohRllZ－ELISA方法快速、敏感、特异且可用自动化仪器多量标本检测,因此适合临床实验使用。聚合酶链反…     

应用逆转录聚合酶链反应法扩增类胰岛素生长因子Ⅱ基因

利用酸性异硫氰酸胍－酚－氯仿一步法从人胚胎组织中提取总ＲＮＡ,经Ｏｌｉｇｏ（ｄＴ）纤维柱分离纯化出ｍＲＮＡ。用逆转录与聚合酶链反应相结合的ＲＴ－ＰＣＲ法,扩增出人类胰岛素生长因子Ⅱ的ｃＤＮＡ片段,在限制性内切酶ＳｍａＩ存在的连接体系中,将扩增出的ｃＤＮＡ片段克隆进ＰＵＣ１２的ＳｍａＩ位点处。经限制性内切酶ＥｃｏＲＩ,ＳａｌＩ,Ｅｃｏ４７Ⅲ酶切鉴定其方向。以重组质粒的双链ＤＮＡ为模板,用末端终止法测     

聚合酶链反应技术在脑脊液病毒学诊断中的应用

近年来中枢神经系统病毒感染性疾病发病率上升,确诊的主要依据是脑脊液的病原学诊断,但脑认中病毒含量甚低,其病毒培养检测不但费时,费力,而且敏感性和特异性很差,远远不能满足临床要求,建立在聚合酶链反应技术基础上的各种分子生物学诊断技术,逐渐成为生物医学领域最有价值的研究手段和病毒学诊断方法,已经越来越多地应用于中枢神经系统病毒学的基因诊断,本文对近几年聚合酶链反应技术的研究进展进行了综述。     

重组酶聚合酶扩增技术检测结核分枝杆菌

目的 利用重组酶聚合酶扩增（Recombinase Polymerase Amplification,RPA）技术检测结核分支杆菌。方法 采用Axxin T8-ISO扩增仪（TwistDX公司）,反应温度设置为39℃,反应时间20 min。检测分为实验组、阳性对照组和空白对照组。实验组模板DNA从痰液中提取。阳性对照模板DNA为H37Rv标准菌株样本DNA及卡介苗提取的DNA。空白对照为蒸馏水。结果 RPA技术可在20 min内明显区分103~106 copies/mL的阳性质粒与阴性对照。对分离培养的结核杆菌（H37Rv）DNA及卡介苗提取的DNA,阳性克隆质粒进行等温扩增,结果结核杆菌分离株DNA、卡介苗DNA、阳性克隆质粒均有阳性扩增反应,而非结核分枝杆菌分离株和阴性对照无阳性扩增反应。灵敏度为100%,特异性为82%。结论 RPA技术利用了重组酶、单链结合蛋白、DNA聚合酶代替了传统PCR变性、退火、延伸的热循环过程,在常温25℃~42℃、15~30 min内即可实现痕量核酸的快速扩增,可应用于快速检测人结核分枝杆菌,是一种全新的检测方法。