重症监护病房真菌谱及耐药性6年变化趋势

目的 调查我院重症监护室（ICU）近6 a临床分离真菌株的菌种结构及耐药性变化.方法 2007 ～2012年从我院1435例ICU患者中分离出的1 435株真菌均为首次分离的菌株.采用Cox-Stuart趋势检验回顾性分析了分离真菌株的菌种结构和主要真菌对常用抗真菌药物耐药率的变化趋势.结果 2007 ～2012年间,我院tCU真菌检出阳性标本总数从159株/a逐年增加至396株/a.其中,白念珠菌、近平滑念珠菌、曲霉的构成比波动范围分别为34.6％ ～ 50.3％、6.3％～9.6％、1.3％～3.2％,2010 ～2012年较2007 ～2009年构成比总体均有上升趋势,P=0.02.热带念珠菌、光滑念珠菌、克柔念珠菌构成比波动范围分别为13.6％ ～ 17.3％、9.4％ ～ 22.6％、1.4％ ～5.2％,P=0.18,构成比均无明显上升或下降趋势.2010 ～2012年较2007 ～2009年,白念珠菌对氟康唑和伊曲康唑耐药率的变化均呈降低趋势,P=0.02.热带念珠菌对氟康唑和伊曲康唑耐药率的变化均呈降低趋势,P =0.02;光滑念珠菌对伊曲康唑耐药率的变化总体呈上升趋势,P =0.02.结论 我院ICU近6 a来白念珠菌仍然为临床最常见的真菌分离株,白念珠菌、近平滑念珠菌及曲霉占总真菌分离株的百分比有上升趋势.白念珠菌及热带念珠菌对氟康唑和伊曲康唑耐药率均呈降低趋势,光滑念珠菌对伊曲康唑耐药率呈上升趋势.     

连续5年无菌体液标本中分离真菌的鉴定及药敏分析

目的回顾性调查2002-2006年华西医院住院患者无菌体液标本真菌培养的情况,分析真菌菌种及其耐药特点,为临床诊断、治疗提供参考。方法标本接种沙堡弱培养基进行分离培养,采用科马嘉念珠菌显色培养基（CHRO-Ma-gar）和API-20CAUX鉴定系统结合形态学进行菌种鉴定,使用念珠菌药敏试条（ATB-Fungus 2）对2006年来自血液标本中的真菌进行药敏试验。结果2002-2006年间检出的阳性样本数依次为7株、22株、39株、32株及57株;血液来源73株,清洁中段尿来源59株,是主要样本来源;分离真菌以白念珠菌和热带念珠菌为主,占70%以上;2006年血培养中共分离出16株念珠菌,体外药敏情况详见文中。结论临床无菌体液标本中真菌的检出率有逐年上升的趋势;菌株以白念珠菌和热带念珠菌为主,同时近平滑念珠菌、克柔念珠菌、光滑念珠菌、马尔尼菲青霉菌等菌株也有出现;样本来源以血液、清洁中段尿为主;体外药敏总体耐药率低,但是逐渐出现了对氟康唑耐药的白念珠菌和热带念珠菌,应引起高度重视。     

外科深部真菌感染的病原学分析

目的分析外科住院患者合并真菌感染状况。方法分离的真菌用API 20C AUX真菌鉴定条,用ATB FUNGUS-2进行药敏试验。结果真菌的种类分布中第1位是白色念珠菌占53%,第2位是热带念珠菌占20%,第3位是光滑念珠菌占14%,第4位是近平滑念珠菌占4%,第5位是其余念珠菌占2%;真菌在外科各区分布中,外科ICU占42%,移植外科占25%;真菌在各类标本分布中,痰占43%,尿液占13%,粪便占10%,引流液占9%,血液占7%;真菌对药物5-氟胞嘧啶、两性霉素B、氟康唑、伊曲康唑的药物敏感性分别是93%、98.9%、90.8%、59.8%。结论外科真菌感染集中在重症病区(ICU),分离的致病真菌主要是白色念珠菌、热带念珠菌、光滑念珠菌,真菌对两性霉素B敏感性最高。     

8a间院内深部真菌感染的临床分布特点及耐药性分析

了解深部真菌感染的临床分布特点及耐药情况,以指导临床合理应用抗真菌药物。回顾性分析近8a自住院患者送检标本分离的深部感染真菌,利用ATB FUNGUS3真菌药敏卡进行体外药敏试验。2003年至2010年共检出9 854株假丝酵母菌,检出率呈上升趋势,由2003年的19.9%上升至2010年的34.3%。院内深部感染的真菌主要分布于内科（55.9%）;主要感染部位为呼吸道（84.6%）;主要菌种为白色念珠菌（60.9%）;非白色念珠菌比例逐年增高。真菌药敏试验结果表明,深部真菌对两性霉素B、伏立康唑和5-氟胞嘧啶耐药率分别为0.9%、4.0%和4.6%;对伊曲康唑的耐药率有上升趋势,为28%。临床深部真菌感染逐年增加,对唑类药物的耐药情况日趋严重。应重视临床真菌感染的病原学检查和耐药性监测,才能有效地控制深部真菌院内感染。     

慢性阻塞性肺疾病患者继发肺部真菌感染的临床分析

目的探讨慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者继发肺部真菌感染的临床特点。方法回顾性分析2008年1月到2010年12月安徽医科大学第一附属医院收治的COPD继发肺部真菌感染患者病例,并对其耐药情况进行比较。结果本组199例COPD患者检出白色念珠菌137例(68.84%),光滑念珠菌32例(16.08%),热带念珠菌17例(8.54%),克柔念珠菌9例(4.52%),毛霉菌3例(1.51%),清酒假丝酵母菌1例(0.50%);白色念珠菌检出率有下降趋势,热带念珠菌有上升趋势;196例真菌对伏立康唑、氟康唑、两性霉素B、伊曲康唑、氟胞嘧啶的耐药率分别为3.6%、5.1%、1.0%、8.7%和0;2008年至2010年白色念珠菌和光滑念珠菌耐药率变化差异无统计学意义。结论 COPD患者继发肺部真菌感染病原菌仍以白色念珠菌为主,其次为光滑念珠菌和热带念珠菌;白色念珠菌和光滑念珠菌耐药率无明显改变。     

下呼吸道真菌感染的临床特点及耐药性分析

目的探讨住院患者下呼吸道真菌感染的临床特点,对其耐药性进行分析,以指导临床合理用药。方法回顾性调查2008年1月至2009年12月间安徽医科大学第一附属医院发生下呼吸道真菌感染的病例,并进行统计学分析。结果 374例下呼吸道真菌感染患者检出白色念珠菌253例(67.6%),光滑念珠菌74例(19.8%),热带念珠菌28例(7.5%),克柔念珠菌10例(2.7%),其他假丝酵母菌3例(0.8%),毛霉菌4例(1.1%),烟曲霉菌2例(0.5%)。本组资料药敏结果显示各种真菌对多种抗真菌药物敏感率较高,其中两性霉素B、伏立康唑和氟康唑的敏感率较高,而伊曲康唑的耐药率最高,达到12.2%。结论下呼吸道真菌感染仍以白色念珠菌感染为主,光滑念珠菌和热带念珠菌其次,3种念珠菌占总分离真菌的94.9%,5种抗真菌药物的耐药率以伊曲康唑最高,社区获得性感染患者预后明显优于医院感染患者。     

外阴阴道念珠菌病的病原检测及体外药敏试验

目的了解STD门诊患者外阴阴道念珠菌病的菌种分布及对常用抗真菌药物的敏感状况,为临床治疗提供参考。方法取STD门诊疑似念珠菌感染患者的阴道分泌物标本,用沙氏琼脂培养基分离纯化菌株,然后用ATB ID 32C酵母菌鉴定系统和ATB Fungus3药敏系统进行菌种鉴定与药物敏感试验。结果950份标本中检出306株念珠菌,占32.21%,其中白色念珠菌226株,阳性率为73.86%;光滑念珠菌37株,阳性率为12.09%;热带念珠菌24株,阳性率为7.84%;近平滑念珠菌13株,占4.25%。药敏结果显示：念珠菌对5-氟胞嘧啶（5-FC）;两性霉素B（AMB）,伏立康唑（VRC）耐药率〈6%;近平滑念珠菌对5种抗真菌药物均敏感;白色念珠菌对氟康唑（FCZ）、伊曲康唑（ICZ）耐药率依次：9.29%、11.06%,光滑念珠菌药耐药率依次为37.84%,67.57%,热带念珠菌药耐药率依次为8.33%、12.5%。结论STD门诊患者阴道念珠菌检出率明显高于普通妇科门诊患者,检出菌种仍以白色念珠菌为主,但光滑念珠菌和热带念珠菌生殖道感染有明显上升趋势;念珠菌对两性霉素B、5-氟胞嘧啶敏感性较高,对唑类药物有耐药菌株。因此,念珠菌鉴定和药敏监测是非常必要的,临床医生应根据药敏结果合理使用抗真菌药物。     

急诊重症监护室患者与社区健康人群肠道假丝酵母构成的比较与分析

本研究旨在分析社区正常人群与急诊重症监护室(intensive care unit,ICU)患者肠道假丝酵母(又称念珠菌)的组成,比较两组人群肠道念珠菌构成的差异。2014年5-7月,收集1 732名上海社区健康人群的粪便标本;2014年2月-2015年1月,收集191名上海交通大学医学院附属瑞金医院急诊ICU患者的粪便或肛周拭子标本。经真菌培养收集单个菌落,通过内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列分析进一步鉴定菌种,分析两组人群肠道定植真菌的组成特点。结果显示,社区健康人群的肠道标本中检测到9种念珠菌,定植率为13.16%;同时有两种和三种念珠菌定植的比例分别为3.81%和0。急诊ICU患者肠道标本只检测到5种念珠菌,但定植率高达37.17%;同时有两种和三种念珠菌定植的比例分别为9.95%和2.09%。社区健康人群和急诊ICU患者肠道中常见念珠菌分别为白念珠菌(5.25% vs. 27.23%)、光滑念珠菌(5.83% vs. 13.61%)、热带念珠菌(0.52% vs. 7.33%)、近平滑念珠菌(4.16% vs. 2.09%)、Candida metapsilosis(1.10% vs. 1.05%)。结果显示,急诊ICU患者的肠道念珠菌定植率显著高于社区人群(P<0.001),同时有两种(P＝0.001)和三种(P<0.001)念珠菌定植的比例也显著高于社区人群。这种肠道念珠菌的高度定植及多重定植可能增加急诊ICU患者发生念珠菌感染的概率。     

院内热带念珠菌分离率与耐药性分析

临床上白念珠菌在分离真菌中居于首位,但近年来非白念珠菌的感染率呈上升趋势[1],热带念珠菌常见条件致病性真菌之一[2],尤以广谱抗生素滥用、长期住院患者中多见,因此,了解热带念珠菌的分布及药敏性,可为临床防治热带念珠菌感染提供参考。     

念珠菌血流感染临床与实验室特点分析

目的根据血培养真菌阳性标本,进行病原学与药敏试验分析,探讨念珠菌在血流感染中的临床和实验室特点。方法收集某院2012年6月至2018年9月的血培养结果为真菌的临床资料,对真菌种类、阳性报警时间(TTP)、标本送检科室、病原菌来源和氟康唑药敏试验结果进行分析。结果血培养分离出真菌共86株,非重复分离株为50株,44株为念珠菌属。排在前3位的念珠菌分别为白念珠菌18株(40.91%),近平滑念珠菌和光滑念珠菌各10株各占(22.73%);近平滑念珠菌TTP[(56.14±7.22)h]最长,热带念珠菌TTP[(19.36±1.24)h]最短,白念珠菌[(34.67±2.98)h]与光滑念珠菌[(38.16±4.12)h]TTP接近居中;念珠菌血症前3位科室为神经外科10株(22.73%)、肿瘤血液科6株(13.64%)、重症监护病房5株(11.36%);泌尿系统为最常见感染来源,其次为腹腔引流感染和导管相关感染;近平滑念珠菌、热带念珠菌对氟康唑敏感率均为100%,白念珠菌和光滑念珠菌分别为88.89%和70%,克柔酵母菌和酿酒酵母菌各1株为耐药和敏感。结论本院念珠菌血流感染最常见为白念珠菌,其次为近平滑念珠菌和光滑念珠菌。如果血培养需氧瓶阳性且TTP大于40 h,发生念珠菌血流感染的可能较大,临床或实验室应高度重视。泌尿系感染、导管相关血流感染、手术部位感染是念珠菌血症的重要感染源。大部分念珠菌对氟康唑仍敏感。     

深部真菌感染临床特点分析

目的了解深部真菌感染患者的性别、年龄、感染部位、住院科室、菌种分布及真菌耐药情况,为临床防治真菌感染提供研究依据。方法收集荆州市中心医院2009年1月至2009年12月微生物实验室分离的真菌446株,采用科马嘉显色琼脂及API220C Aux鉴定系统鉴定,并使用ATMTMFUNGUS3真菌药敏卡进行体外药敏试验。结果临床真菌感染男性占72%,以老年患者为主,大于60岁者占54.9%;感染的真菌主要分布于呼吸内科和ICU,分别占35.5%、24.9%;主要感染部位为呼吸道,占91.3%;主要菌种为白假丝酵母菌、热带念株菌、近平滑假丝酵母菌、光滑念株菌和克柔念株菌,分别占64.2%、13.2%、9.6%、7.6%和5.4%;合并细菌感染的感染真菌100株,占22.2%,细菌中以革兰阴杆性菌为主,占96%;药敏试验结果显示真菌对各抗真菌药具有较好的敏感性。结论临床真菌感染已日益突出,以呼吸科及ICU患者老年男性为主,儿童真菌感染亦不容忽视,感染菌种以白假丝酵母菌和热带念株菌为主,临床应加强对这些真菌感染的预防和监测,防止真菌感染。     

住院患者光滑念珠菌检出的回顾性分析

目的调查住院患者光滑念珠菌检出的特征。方法回顾性调查分析白求恩国际和平医院2008年1月～2009年4月住院患者中光滑念珠菌检出阳性者的临床资料,以同期白念珠菌检出患者为对照。结果其间共有52例详细病史资料记录的光滑念珠菌检出患者,以60岁以上老年人为主,占65.4%;主要分离自痰标本,占76.9%。患者患有多种基础疾病,以肺部感染(28例,53.8%)、恶性肿瘤(20例,38.5%)、脑梗死(15例,28.8%)常见。使用抗生素(52例,100%)、留置导尿管(15例,28.8%)是光滑念珠菌检出者的主要实施医疗措施。氟康唑是临床最常用的治疗光滑念珠菌感染药物(23例,44.2%)。光滑念珠菌检出患者死亡率高(14例,26.9%),高于同期白念珠菌检出对照组(6.2%,P=0.004)。结论光滑念珠菌检出患者与白念珠菌检出具有相似的临床流行病学特征。     

复发性外阴阴道念珠菌病的致病菌种鉴定及药敏分析

目的：探究复发性外阴阴道念珠菌病致病菌的菌种分布及耐药情况,指导临床治疗。方法：收集210例念珠菌性外阴阴道炎患者阴道分泌物标本,其中复发性外阴阴道念珠菌病（RVVC）组76例,外阴阴道念珠菌病（VVC）组134例。运用科玛嘉显色培养基法进行菌种鉴定和药物敏感试验。结果：在210例病例中,RVVC组中白色念珠菌54株（71.05%）,光滑念珠菌15株（19.74%）,热带念珠菌4株（5.26%）,克柔念珠菌2株（2.63%）,近平滑念珠菌1株（1.32%）。非白色念珠菌中以光滑念珠菌为主,在RVVC组中的比例明显高于VVC组,有显著性差异（P〈0.05）。药敏试验显示,RVVC的念珠菌株中仅8株对7种药物全部敏感,23株敏感药物〈5种,其中1株仅对制霉菌素敏感;对药物的敏感率为制霉菌素（97.37%）〉克霉唑（60.52%）〉酮康唑（51.32%）〉伊曲康唑（36.84%）〉咪康唑（35.53%）〉氟康唑（23.68%）〉特比奈芬（10.53%）。结论：白色念珠菌仍是RVVC的主要致病菌,非白色念珠菌比例在RVVC组中显著高于VVC组,其中以光滑念珠菌为主。念珠菌对制霉菌素敏感率最高,对唑类药物耐药性有增加趋势。     

血流感染真菌的分布及耐药性分析

目的了解真菌性血液感染常见病原真茵的菌群分布及耐药性状况,为临床真菌感染性疾病提供病原学诊断和合理使用抗真菌药物的依据。方法回顾性分析浙江大学医学院附属第一医院5年（2008-2012年）间导致真菌性血液感染的217株真菌的菌群分布及药物敏感性状况。结果217株真菌标本中以假丝酵母菌属为主,占88. 5%;其中又以白假丝酵母菌比例最高,占35.4%。菌种分布与患者的性别和年龄存在相关性。60-79岁年龄组感染白假丝酵母菌多见,占49% ,这一比例明显高于其他真菌。男性更容易感染白假丝酵母菌（40.1% vs 24.6%,P〈0.05）,女性感染近平滑假丝酵母菌更常见（24.6% vs 11.8%,P〈0.05）.假丝酵母菌和新生隐球菌对两性霉素B、伏立康唑、氟康唑、伊曲康唑、5-氟胞嘧啶的敏感性均较高。光滑假丝酵母菌对伊曲康唑敏感率较低,仅为60.0%。结论真菌血流感染在临床呈上升趋势,抗真菌药物均体现较高抗菌活性,对真菌感染进行地区层面流行病学调查和耐药监测很重要。     

Nucleic acid sequence-based amplification (NASBA) detection of medically important Candida species.

Nucleic Acid Sequence Based Amplification (iNASBA), an isothermal amplification technique for nucleic acids, was evaluated for the identification of medically important Candida species using primers selected from 18S rRNA sequences conserved in fungi. An RNA fragment of 257 nucleotides was amplified for Candida albicans. Nineteen different fungi were tested for rRNA amplification with the NASBA. All were positive when analyzed on agarose gel, whereas human RNA was negative. For the identification of Candida species, NASBA amplification products were analyzed in an enzyme bead-based detection format, using species-specific biotinylated probes and a generic Candida HRPO probe or a membrane-based system using biotinylated probes and avidin-HPRO. Discrimination of the major human pathogenic Candida spp. was based on a panel of biotinylated probes for C. krusei, C. tropicalis, C. albicans, C. glabrata, and C. lusitaniae. Using rRNA dilutions obtained from pure cultures of C. albicans, the combination of NASBA and the enzymatic bead-based detection yielded a sensitivity equivalent to 0.01 CFU. In a model system using 1 ml of artificially contaminated blood as few as 1-10 CFU of C. albicans could be detected. Testing of 68 clinical blood samples from patients suspected of candidemia showed that eight samples were positive for C. albicans and one for C. glabrata. Testing of 13 clinical plasma samples from patients suspected of fungemia identified the presence of C. albicans in two specimens. The whole procedure of sample preparation, amplification and identification by hybridization can be performed in 1 day. This speed and the observed sensitivity of the assay make the NASBA a good alternative to PCR for the detection of candidemia.     

Characterization of Candida Species from Different Populations in Taiwan

The opportunistic Candida species existing as part of commensal microbiota in humans are usually the etiological agents causing infections. We investigated whether isolates collected from different age groups, hospital units, and sources have distinct characteristics. A total of 913 isolates comprising 395 Candida albicans, 230 Candida tropicalis, 202 Candida glabrata, 62 Candida parapsilosis, 13 Candida krusei, and 11 of other six species were analyzed. Urine was the most common source (41.2%), followed by sputum (16.3%), blood (15.2%), and others (27.3%). Candida albicans and C. parapsilosis were more prevalent in the working group [from 19 to 65 years], whereas C. tropicalis and C. glabrata were more prevalent in the elder one (≥ 66 years). We found that the age of patients and the source of isolates affect the distribution of species. On the other hand, the drug susceptibility of isolates was associated with fungal species and whether patients were hospitalized.     

(1,3)-β-D-葡聚糖在诊断深部真菌感染中的意义

探讨(1,3)-β-D-葡聚糖(BG)检测对于诊断深部真菌感染的临床意义。收集2009年同时进行(1,3)-β-D-葡聚糖检测和真菌培养的住院患者的临床资料。分析不同科室送检真菌抗原情况,重症医学科的(1,3)-β-D-葡聚糖检测阳性者真菌菌种分布情况以及(1,3)-β-D-葡聚糖检测假阳性情况。同时送检(1,3)-β-D-葡聚糖和真菌培养共275例,重症医学科送检最多,共178例:重症医学科(1,3)-β-D-葡聚糖检测阳性36例(阳性率20.22%);重症医学科(1,3)-β-D-葡聚糖检测阳性同时真菌培养阳性者25例,其中白假丝酵母菌10例,热带假丝酵母菌7例,光滑假丝酵母菌4例,阿萨希毛孢子菌2例,克柔假丝酵母菌1例,烟曲霉1例。11例(1,3)-β-D-葡聚糖假阳性,9例存在细菌菌血症。重症医学科等科室应加强真菌感染监测。深部真菌感染中,假丝酵母菌属感染最多见。细菌菌血症可能造成(1,3)-β-D-葡聚糖检测假阳性。     

住院患者粪便标本中念珠菌检测分析

目的分析粪便中检出念珠菌孢子或假菌丝的临床意义。方法检测白求恩国际和平医院2008年4月住院患者送检的粪便标本,用科玛嘉显色培养基鉴定念珠菌菌种,并记录患者粪便常规及临床资料。结果其间共检测1011份粪便,有86份（8．51％）有真菌生长;其中念珠菌阳性76份（7．52％）。60岁以上老年人阳性者33份（占43．42％）。基础疾病以肿瘤,心、脑血管疾病三者为著（占31．58％）。有21例患者（27．63％）粪便性状有异常,以糊状便为主。结论粪便中检出芽生孢子和（或）假菌丝对诊断念珠菌性胃肠道感染有重要价值,尤其要关注抗生素应用患者。     

口腔黏膜真菌鉴定方法的比较

比较常见用于黏膜真菌菌种鉴别的多种方法,探寻最佳的鉴别方法。采集230例普通人群口腔黏膜样本,分别用玉米吐温-80培养观察厚膜孢子法、糖发酵生化反应法、CHROMagar假丝酵母菌显色培养基法、ITS基因的PCR-RFLP(聚合酶链反应-限制性片段长度多态性)法、ITS测序菌种鉴定法,鉴别真菌各菌株。结果显示:有56例菌株至少通过1种方法检出真菌;玉米吐温-80分离培养假丝酵母菌37株;50例菌株ITS基因测序共鉴定出8个菌种,白假丝酵母菌(C.albicans)29株,近平滑假丝酵母菌(C.parapsilosis)10株,热带假丝酵母菌(C.tropicalis)5株,Candida metapsilosis 1株,Lodderomyces elongisporus 1株,克柔假丝酵母菌(Candida krusei)1株,乙醇假丝酵母菌(C.ethanolica)1株,季也蒙毕赤酵母菌(Pichia guilliermondii)2株;CHROMagar假丝酵母菌显色培养基法鉴定出3种菌株,分别是白假丝酵母菌、热带假丝酵母菌、近平滑假丝酵母菌;PCR-RFLP法检出5种菌株,分别是白假丝酵母菌、热带假丝酵母菌、近平滑假丝酵母菌、季也蒙毕赤酵母菌、克柔假丝酵母菌,与基因的测序鉴定一致率为91%;糖发酵生化反应法阳性标本占被检出真菌例数的46.4%(26/56)。结果表明:ITS基因的测序法可以准确鉴定真菌各个菌种;PCR-RFLP法能鉴定常见的菌种,但操作繁琐;CHROMagar假丝酵母菌显色培养基法能快速准确鉴别3种常见假丝酵母菌菌种;玉米吐温-80可以准确培养鉴别白假丝酵母菌;糖发酵生化反应法,缺乏足够的敏感度和特异性,难以准确鉴别各个菌种。