简明生物统计方法 第三讲 计量资料的统计推断方法(上)

一、用样本平均数估计总体平均数用样本平均数(χ)估计总体平均数(μ),亦常用区间估计法;即根据χ求出μ的95％(或)99％置信区间。 (一) 当样本含量较大(n>30),不拘原变量(χ)的总体分布如何,均可用下式求出置信区间;但如样本较小(n<30),则原变量必须服从正态分布,方可用下式计算:     

简明生物统计方法

第二讲计数资料的统计推断方法(下)(二)三个以上样本百分率差异显著性测验方法三个以上样本百分率的差异显著性测验结果,如P<0.05,差异显著时,只说明这些个样本百分率所代表的总体百分率之间有一定的差异;至于说是哪两个之间有明显差异?尚需分别两两加以测验,然后才能     

简明生物统计方法

第四讲相关与回归相关与回归是分析两个(或多个)变量之间的关系的方法。譬如说某一特定人群的身高与体重,不仅只分析身高或体重的某一方面(或说指标),而是分析身高与体重两个指标之间有无关联,这便是相关与回归所要分析的内容。当然,相关与回归分析也包括根据样本估计总体     

引导程序法(BOOTSTRAP法)简介——小样本相关系数统计准确度的度量

本文介绍引导程序法,或称Bootstrap法(见文献),并结合农业实际问题给出无分布假设下小样本相关系数统计准确度的估计。一、问题的提出为便于对问题的研究与比较,假设把下述42个大豆品种看作一个总体,其数据如表1所示。     

甘草素对去卵巢APP/PS1双转基因小鼠的保护作用初探

研究甘草素对去卵巢APP/PS1双转基因小鼠脑内老年斑及雌激素受体的作用。24只3月龄雌性APP/PS1双转基因小鼠,随机分为假手术组(6只)和去卵巢组(18只)。手术7 d后,再将去卵巢组随机分为去卵巢(ovariectomy,OVX)对照组、去卵巢+甘草素(liquiritigenin,LG)处理组(OVX+LG,30 mg·kg~(-1)·d~(-1),灌胃)、去卵巢+雌二醇(17β-estradiol,E_2)处理组(OVX+E_2,0.1μg/g皮下注射,阳性对照),各6只,假手术组为试剂对照组(Sham)。3个月后小鼠心脏灌注取脑组织样本。免疫组化法检测老年斑(senile plaques,SP)的表达变化,ELISA检测脑内Amyloidβpeptide 40(Aβ40)、Amyloidβpeptide 42(Aβ42)含量,Western blotting检测雌激素受体α(estrogen receptorα,ERα)、雌激素受体β(estrogen receptorβ,ERβ)蛋白水平变化。结果显示:去卵巢组的老年斑数量(p=0.001)和面积(p0.000 1)均多于假手术组,甘草素处理组(p0.000 1,p0.000 1)和雌二醇处理组(p0.000 1,p0.000 1)的老年斑数量、面积均少于去卵巢组。去卵巢组Aβ40、Aβ42含量(p=0.011,p=0.005)均高于假手术组,甘草素处理组(p=0.000,p=0.015)和雌二醇处理组(p=0.003,p=0.016,)均少于去卵巢组。去卵巢组ERα的蛋白水平,与假手术组、甘草素处理组比较,差异无统计学意义(p=0.214,p=0.175),而雌二醇处理组与假手术组、卵巢切除组、甘草素处理组分别比较均明显增高(p0.000 1,p0.000 1,p0.000 1);卵巢切除组ERβ的蛋白水平与假手术组比明显下降(p0.000 1),甘草素处理组(p0.000 1)、雌二醇处理组(p=0.000)与卵巢切除组比较,均能提高ER的表达水平,甘草素处理组比雌二醇处理组提高ERβ蛋白水平更为显著(p=0.006)。甘草素具有雌激素类似的调节作用,可能通过上调ERβ水平、对抗Aβ毒副作用、减少Aβ沉积从而对AD发挥保护作用。     

室内培养蚤状溞的简易方法

1　装置与材料70～ 10 0 L的水族箱 2个 ,4 0 W的日光型水族灯或日光灯 1个 ,金鱼充气泵 1个 ,水族箱恒温加热器 1个。每平方厘米 10 0～ 14 0目的小水网 1个 (自制或到水族商店购买 )。磷酸氢二钾 1瓶 ,馒头或动物肝脏 ,绿藻液数升。2　培养方法水族箱 (5 0～ 10 0 L)置于靠北室内 ,防止阳光直射 ,以免水温昼夜变化过大。注满自来水 ,箱上方安装水族灯或日光灯 ,接上充气泵 ,通电。每个水簇箱投入磷酸氢二钾 10～ 2 0 g,(视自来水的 p H值而定 ,如果自来水的p H值低于 7,用磷酸氢二钾调节水的 p H值 ,如果自来水 p H值是 7,用磷酸氢二钾…     

R法遗传参数估值置信区间的计算方法和重复估计次数的研究

探讨R法遗传参数估值置信区间的计算方法和重复估计次数(NORE)对参数估值的影响,利用4种模型通过模拟产生数据集。基础群中公、母畜数分别为200和2000头,BLUP育种值选择5个世代。利用多变量乘法迭代(MMI)法,结合先决条件的共扼梯度(PCG)法求解混合模型方程组估计方差组分。用经典方法、Box-Cox变换后的经典方法和自助法计算参数估值的均数、标准误和置信区间。结果表明,重复估计次数较多时,3种方法均可;重复估计次数较少时,建议使用自助法。简单模型下需要较少的重复估计,但对于复杂模型则需要较多的重复估计。随模型中随机效应数的增加,直接遗传力高估。随着PCG和MMI轮次的增大,参数估值表现出低估的趋势。     

用巢式RT-PCR检测精神分裂症患者血液标本中博尔纳病病毒p24基因

目的：检测精神分裂症患者外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs)标本中博尔纳病病毒(Borna Disease Virus,BDV)p24基因,探讨BDV感染与精神分裂症的关系。方法：用巢式RT—PCR方法检测黑龙江省精神分裂症患者及正常人PBMCs中BDV—p24基因片段,同时扩增β—肌动蛋白(β-actin)作为内参照。结果：66例精神分裂症患者中,BDV—p24基因的阳性检出率为28．8％(19／66);47例正常人中,BDV—p24基因的阳性检出率为6．3％(3／47),经比较两者间阳性率差异有显著性(P＜0．05)结论：证实中国存在BDV感染,黑龙江省精神分裂症的发生可能与BDV感染有关。     

农田环境空间异质性及农作物生产安全风险评价方法研究—以蔬菜生产为例

对贵州省遵义县有代表性的蔬菜地土壤重金属进行了研究和示范性评价.采用Kriging方法估计了目标地块中Cd和Pb的分布,结果显示它们存在较大的空间异质性.土壤重金属危害人体健康主要是通过食用富集重金属的农产品而产生的.为了正确地估计这种土壤重金属危害人体健康的方式,需要将蔬菜对重金属的富集规律和食品安全标准相结合建立评价模型.据此,构建了单因子和多因子评价模型和风险模型.根据实验数据(徐明飞等,2008)建立了9个蔬菜品种对Cd、Pb富集的模型,用该模型与无公害蔬菜产品标准相结合对目标地进行了评价.评价结果表明:在目标地块上生产的黄瓜、长瓜、丝瓜、番茄、萝卜和莴笋产品是安全的,即无风险(p=0);Cd对辣椒产品风险很小(p=0.0023);Cd对茄子产品有一定风险(p=0.4145),而Pb对两者均无风险(p=0);Cd和Pb对青菜产品有巨大风险(p=0.9821或p=0.96961).     

脂质体介导基因编辑载体质粒转染条件的优化

[目的]探讨脂质体介导基因编辑载体质粒转染人食管癌Eca-109细胞的最佳条件。[方法]以基于Cre/Lox P系统的p GT-A1B1和基于CRISPR/Cas9系统的p X458-sgRNA8两种基因编辑载体质粒为实验材料,将环状和线性质粒以不同DNA用量(0. 2、0. 4、0. 6和0. 8μg)和不同DNA与脂质体比例(1∶1、1∶1. 5、1∶2、1∶2. 5和1∶3)转染Eca-109细胞,计算转染效率。[结果]不同DNA用量条件下,p GT-A1B1在0. 4μg和0. 6μg时转染效率较高,p X458-sgRNA8在0. 6μg时转染效率较高,与其它DNA用量比较均有显著性差异(P 0. 05)。不同DNA与脂质体比例条件下,p GT-A1B1在比例为1∶1. 5和1∶2时转染效率较高,p X458-sgRNA8在比例为1∶2. 5时转染效率较高,与其它比例比较均有显著性差异(P 0. 05)。同一种质粒的环状和线性结构形态,在DNA用量或DNA与脂质体比例相同时,转染效率差异不显著(P 0. 05)。[结论]建立了脂质体介导基因编辑载体质粒转染Eca-109细胞的最佳转染条件,质粒p GT-A1B1和p X458-sgRNA8的DNA用量分别为0. 4～0. 6μg和0. 6μg,DNA与脂质体比例分别为1∶1. 5～1∶2和1∶2. 5。     

第三代二化螟(兼性滞育)成虫发生期的预测探讨

<正> 三化螟Tryporyza incertulis(Walker)是水稻主要害虫之一。在我县一年发生3～4代,第三代部分幼虫滞育越冬,形成局部的下一世代。目前对三化螟成虫发生期的中短期预测多采用分龄分级推算法,即根据田间调查幼虫、蛹发育进度(分龄、分级),统计各龄、级虫数占调查总虫数的百分率,然后从最高发育期(蛹壳)向下依次逐级(龄)累加百分率,以调查日期加上累加百分率达16％、50％、84％的蛹级(或虫龄)的相应历期(不足部分从下级蛹或虫龄取出补足),推算出成虫羽化始盛、高峰和盛末期。这种预测方法,是以当代幼虫全部能转化为蛹并羽化为依据的。在本地,用此法预测越冬代及     

miR-30a-3p靶向ANXA1调控EB病毒阳性皮肌炎患者炎症反应的实验研究

皮肌炎(Dermatomyositis,DM)是一种主要影响皮肤和肌肉的自身免疫性疾病,EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)感染可能在皮肌炎的发生扮演着重要的角色。为了探讨miR-30a-3p通过靶向膜联蛋白A1(Annexin A1,ANXA1)调控EBV阳性皮肌炎患者炎症反应的机制,本研究通过qRT-PCR检测外周血样本和外周血单核细胞(Peripheral blood mononuclear cells,PBMCs)中miR-30a-3p和ANXA1 mRNA的表达;通过ELISA分析外周血样本和PBMCs中相关炎症因子(IL-1β、IL-17、TNF-α)的表达;通过生物信息学软件预测miR-30a-3p的靶基因并通过双荧光素酶报告实验确定二者之间的结合作用。结果显示:与对照组相比,在皮肌炎患者外周血样本中miR-30a-3p、IL-1β、IL-17、TNF-α表达显著上调(P0.05);与对照组相比,EBV组中miR-30a-3p、IL-1β、IL-17、TNF-α表达显著上调(P0.05);与对照组相比,miRNA mimics组中miR-30a-3p、IL-1β、IL-17、TNF-α表达显著上调(P0.05);生物信息学分析显示ANXA1是miR-30a-3p的靶标,与对照组相比,miRNA mimics组miR-30a-3p可以与ANXA1 3'UTR区域结合并特异性抑制ANXA1的表达;与oe-NC+miRNA mimics组相比,在oe-ANXA1+miRNA mimics组中ANXA1的表达是可以挽救miR-30a-3p所抑制的ANXA1表达,进而抑制PBMCs中相关炎症因子的表达。从而得出结论:miR-30a-3p通过靶向抑制ANXA1表达,进而促进PBMCs中相关炎症因子的表达以及皮肌炎炎症反应的发生。     

代谢综合征患者血液流变学及多因素相关分析

目的:探讨代谢综合征(MS)患者血液流变学及多因素的相关性。方法:检测49例2型糖尿病(T2DM)和40例MS患者的肥胖指标、血脂、血黏度,并进行比较和相关性分析。结果:(1)MS组的BMI(体重指数),FAT%(体脂百分率),W(腰围),LP(脂蛋白),TG(甘油三酯),TC(总胆固醇),血浆黏度均显著高于T2DM组(p＜0．05);(2)T2DM组的血浆黏度与TC及MS组的W与BMI,FAT%正相关(p＜0．05)。结论:(1)MS较T2DM存在更高的血浆黏度,可能是多因素综合作用的结果。(2)FAT%的测定对中心性肥胖的评估具有一定意义。     

用Peason Ⅲ型曲线拟合菜蚜种群空间分布型的初步研究

为寻求某些研究r-对策昆虫种群在其生境空间的概率分布的方法,我们用Pesson Ⅲ型曲线(简称P-Ⅲ分布)拟合了菜蚜种群的9批抽样数据,它们是1981年在菜蚜种群发生期的不同日期抽取于北京郊区的秋白菜田间。 我们可以通过MTLK方案将P-Ⅲ分布用于拟含9批样本中经过初步判断具有可拟性的3批数据: M——初值估计采用矩法,即以矩法估计P-Ⅲ分布的三个基本参数:平均数Ex,离势系数Cv和偏差系数Cs,做为下面将要进行的适线法之初始值。 T——P-Ⅲ分布的累积概率值p是由数表给出,具体做法是由给定的Cs值和抽样数据x的标准化变量φ值在数表中查得p值。 L——以适线法实现良好的拟合,该法是在计算机上通过一项最优化技术,即在Cv-Cs直角坐标系中产生一组正三角形(简称GRT法),以自动得到拟合的良好结果。 K——对拟合优度采用柯尔莫哥洛夫检验。 拟合结果,3批样本中有两批可理论地拟合。该P-Ⅲ分布的概率密度函数为f(x)=βα/г(α)(x-b)~(α-1)*exp(-β*(x-b)),(b≤x<∞)其中b=Ex*(1-2*Cv/Cs),α=4/Cs~2,β=2/(Ex*Cv*Cs),经过拟合后,b、α和β的取值便更加适合了。 本文得出的结论是: 1.连续型概率分布可以被用来拟合某些r-对策昆虫种群的田间抽样数据,这是与传统的方法不同的。这里所谓传统的方法是指用于拟合k-对策昆     

Neurexin 1β及其剪切变异体真核表达载体构建

[目的]构建大鼠Neurexin 1β(Nrx 1β)及其剪切变异体Nrx 1β(ΔS4)真核表达载体,并鉴定其在真核细胞中的表达能力。[方法]以提取的大鼠海马总RNA为模板,采用RT-PCR技术获得Nrx 1β及Nrx 1β(ΔS4)目的基因,通过分子生物学方法将目的基因亚克隆至p DsRed2-C1载体。重组体转染HEK293T细胞,免疫印迹检测Nrx 1β及Nrx1β(ΔS4)的蛋白表达。[结果]Nrx 1β及Nrx 1β(ΔS4)目的基因扩增成功,重组体酶切鉴定能观察到目的基因片段(约1500 bp处),Nrx 1β及Nrx 1β(ΔS4)测序结果与Gen Bank中的序列一致。免疫印迹显示,p DsRed2-C1-Myc-Nrx 1β或p DsRed2-C1-Myc-Nrx 1β(ΔS4)在HEK293T细胞中能表达Nrx 1β或Nrx 1β(ΔS4)。[结论]成功构建大鼠Nrx1β及其剪切变异体Nrx 1β(ΔS4)的真核表达载体,重组体在HEK293T细胞中高效表达。     

PI3K/p110β和PTEN在前列腺癌中的表达及意义

[目的]探讨磷脂酰肌醇3-激酶亚单位p110β(PI3K/p110β)和PTEN基因在前列腺癌中的表达.[方法]收集绵阳市中心医院2016年1月～2020年1月经手术切除的前列腺癌标本80例,取新鲜癌组织及癌旁组织作为实验样本.用实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)法检测癌及癌旁组织PI3K/p110β及PTEN基因相对...     

齐墩果酸抑制肿瘤坏死因子-α诱导的成纤维细胞样滑膜细胞炎症因子表达及其机制研究

探讨齐墩果酸(Oleanolic acid,OA)对肿瘤坏死因子-α(TNF-α)诱导成纤维细胞样滑膜细胞的炎症因子表达的影响及其机制。首先复苏培养人成纤维细胞样滑膜细胞(FLS),通过RT-PCR检测细胞IL-6及IL-1βmRNA表达,采用Western blot方法检测p38MAPK及NF-κB蛋白表达变化,通过ELISA法检测细胞上清液中IL-6及IL-1β浓度。与对照组比较,TNF-α明显诱导FLS细胞IL-6及IL-1βmRNA的表达及上清液中IL-6及IL-1β的分泌(P0.05),同时磷酸化p38蛋白和核NF-κB明显增加(P0.05),且p38MAPK阻断剂SB203580能抑制TNF-α诱导的核NF-κB增加。OA呈浓度依赖性抑制TNF-α诱导的FLS细胞p38蛋白磷酸化和核NF-κB增加(P0.05)。且OA、p38MAPK通路抑制剂SB203580或NF-κB阻断剂BAY 11-7082均能抑制TNF-α诱导的IL-6及IL-1β分泌增加(P0.05)。综上所述,OA能抑制TNF-α诱导的FLS细胞炎症因子IL-6及IL-1β的产生,其机制可能与抑制p38MAPK/NF-κB信号通路有关。     

温肾固疏方对PMOP大鼠骨密度及细胞因子表达的影响

通过观察温肾固疏方对去卵巢骨质疏松(PMOP)大鼠的骨密度及对白细胞介素-1β、肿瘤坏死因子-α、白细胞介素-6的血清含量和转化生长因子-β骨组织表达的影响,探讨其治疗骨质疏松的可能作用机制。将48只SPF级雌性SD大鼠分为6组:假手术组、模型组、雌激素组、温肾固疏方高、中、低剂量组。造模4周后开始给药,连续给药12周,酶联免疫法(ELISA)检测外周血清白细胞介素-1β(IL-1β)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞介素-6(IL-6)含量;q RT-PCR法检测骨组织转化生长因子-β(TGF-β)m RNA含量。与假手术组相比较,去势模型组大鼠骨密度(BMD)、TGF-β mRNA显著降低(p0.05),而IL-1β、TNF-α、IL-6均显著升高(p0.01),符合绝经后骨质疏松症改变;干预治疗后,与模型组比较,温肾固疏方高、中剂量组椎骨BMD显著升高(p0.05),IL-1β、TNF-α、IL-6显著减少(p0.05),温肾固疏方高剂量组TGF-β mRNA显著增加(p0.05)。温肾固疏方治疗骨质疏松的作用机制可能与其下调IL-1β、TNF-α、IL-6等促炎细胞因子的表达,抑制骨吸收;同时上调TGF-β等抑炎细胞因子的表达,促进骨形成有关。     

Wistar大白鼠血红蛋白的抽样测试与统计分析

对 6～ 8周龄Wistar大白鼠大样本随机抽样 ,眼底静脉丛取血 ,用氰化高铁血红蛋白光电比色法测血红蛋白 ,经统一分析 ,结果 ,♂ : X±SD =1 2 8 4 0± 1 1 55,μ±S x =1 2 8 4 0± 0 89,μ的可信区间估计为 1 2 6 65～ 1 3 0 1 5(可信度 95% )和 1 2 6 1 0～ 1 3 0 70 (可信度 99% ) ,正常值范围估计为 1 0 6 79～1 52 90 (含 95%总本 )和 1 0 0 3 7～ 1 59 4 8(含 99%总体 ) ;♀ : X±SD =1 2 8 79± 1 1 2 9,μ±S x =1 2 8.79± 0 87;μ的可信区间估计 1 2 7 0 8～ 1 3 0 50 (可信度 95% )和 1 2 6 53～ 1 3 1 0 4 (可信度 99% ) ,正常值范围估计 1 0 8 4 6～ 1 52 1 8(含 95%总体 )和 1 0 1 96～ 1 58 2 5(含 99%总体 ,单位均为 g/L ,性别间无显著性差异。结果可作为科研、教学等的大白鼠血红蛋白正常值的参考。     

中华绒螯蟹一龄幼蟹(Eriocheir sinensis)越冬前后脂肪酸和4种类胡萝卜素含量的变化

实验以越冬前后的中华绒螯蟹一龄幼蟹作为研究对象,利用高效气相色谱法分别检测一龄幼蟹越冬前后肝胰腺及头胸甲中脂肪酸含量变化、利用液相二级质谱法分别测定一龄幼蟹越冬前后肝胰腺、头胸甲和血淋巴中4种类胡萝卜素含量变化。结果表明:肝胰腺中的饱和脂肪酸(SFA) C20:0、单不饱和脂肪酸(MUFA) C18:1n9作为主要能量脂肪酸被动用,其含量越冬后显著下降(p0.05),多不饱和脂肪酸(PUFA)中的C18:3n3、C22:6n3越冬后含量显著升高(p0.05)。头胸甲的饱和脂肪酸(SFA) C16:0、C18:0,单不饱和脂肪酸(MUFA)中的C18:1n7作为主要能量脂肪酸被动用,越冬后含量下降显著(p0.05)。多不饱和脂肪酸(PUFA) C18:2n6、C20:3n6越冬后含量显著升高(p0.05)。越冬后头胸甲中4种类胡萝卜素含量均极显著下降(p0.01)。其中,血淋巴中虾青素、叶黄素含量极显著升高(p0.05),β-胡萝卜素含量极显著下降(p0.05)。肝胰腺中虾青素与叶黄素、β-胡萝卜素变化趋势与血淋巴的一致,角黄素含量显著下降(p0.05)。越冬期间气温、水温的短暂升高可能使一龄幼蟹短暂摄食。越冬前经育肥的扣蟹越冬后能量物质无显著变化,越冬后根据肝胰腺颜色来判断一龄幼蟹质量的方法不科学。