大麦染色体特异IT分子标记的筛选

为了筛选高密度且均匀分布于大麦各染色体的分子标记,该研究利用前期开发的2 267个IT(intron targeting)标记,在‘中国春’、栽培大麦(Golden promise)和普通小麦(中国春)-栽培大麦(Betzes)的6个二体异附加系中进行扩增。结果发现:有534个标记可作为大麦染色体特异的IT分子标记,分别分布在大麦的1H(96个)、2H(84个)、3H(60个)、4H(105个)、5H(59个)、6H(80个)和7H(50个)染色体。进一步利用小麦族多基因组学网站和大麦参考基因组序列进行比对,结果发现,除了标记CINAU800、CINAU1734、CINAU1796、CINAU1736和CINAU1691之外,其余的标记对应的原始基因序列都能比对到大麦对应的同源群的参考基因组中。研究表明,该研究筛选到了534个大麦染色体特异的IT分子标记,多态率为23.56%,略高于其他大麦分子标记;且这些大麦各染色体特异的IT分子标记可用于追踪大麦的特定染色体。     

糖皮质激素受体的光亲和标记

利用[~3H]去炎松缩酮([~3H]TA)进行了糖皮质激素受体(GCR)的光亲和标记。[~3H]TA和GCR共价交联的证据有:(1)光照后,10％的三氯醋酸不能使[~3H]TA和GCR解离;(2)SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳时,有单一的放射活性峰;(3)用地塞米松保护后,GCR不被标记。采用本方法测定的GCR分子量为94000±3000 dalton,该方法可用于GCR分子量的测定、提纯和配基结合区的分析。     

小麦叶片内蛋白质和核酸的标记方法

在植物生长、发育、分化、衰老及其对逆境的适应过程中,核酸与蛋白质代谢(合成与降解)具有极其重要的意义,放射性核素标记前体(标记核苷与标记氨基酸)的掺入是研究这些大分子生物合成的主要手段,而以离体的植物组织或器官进行标记是最简便、最常用的。但国内植生手册及实验指导,均未介     

地高辛标记法检测人源细胞系端粒长度

目的:建立一种灵敏的、非同位素标记的端粒长度检测方法,并用于人源细胞系的肿瘤研究。方法:以地高辛标记寡核苷酸(TTAGGG)3为探针,对基因组DNA进行Southern印迹检测,经CDP-Star显色后与DNA标准分子量比较,利用图像分析系统计算端粒长度。结果:通过严格控制探针的工作浓度(1∶3000稀释)、DNA上样量(1.5～2.5μg)、杂交温度(42±1℃)等主要影响因素,获得了比较好的杂交条带。结论:建立了一种稳定、可靠、低背景的地高辛标记检测端粒长度的方法;对正常细胞、永生化细胞和肿瘤细胞进行了端粒长度的检测和对比分析。     

用碘标记核酸检查鼻咽癌上皮细胞中的EB病毒基因

用同位素碘化钠直接标记核酸。以细胞内原位杂交实验检查鼻咽癌上皮细胞中的EB病毒基因。共检查病理确诊的10例鼻咽癌活检标本的细胞涂片,其中9例直接证实有EB病毒核酸。本文建立并改进了细胞内原位核酸杂交技术,首先使用重组的单链DNA作探针,并将碘标记的核酸用于原位核酸杂交实验。     

同位素标记相对和绝对定量蛋白组技术研究进展

近年来定量蛋白组学技术迅速发展,目前常用的有双向荧光差异凝胶电泳、同位素亲和标记、15N同位素标记、同位素标记相对和绝对定量和细胞培养条件下稳定同位素标记技术等。同位素标记相对和绝对定量技术以其高通量、高灵敏度、高重复性、高动态检测限和能对各种复杂样品进行相对和绝对定量研究等优势而备受研究者青睐,目前已发展到在同一实验中分析8组样品,增加了实验设计的灵活性。我们就同位素标记相对和绝对定量技术在定量蛋白组史中的地位作用、研究策略,以及在病毒致病机制研究和医药临床相关问题中的应用做简要综述。     

用改良的非同位素凝胶电泳迁移实验鉴定核酸适配体与靶蛋白的结合

目的:在核酸适配体与靶蛋白特异结合的凝胶电泳迁移实验(EMSA)测定方法中,探索使用非同位素标记取代同位素标记。方法:取一定量的生物素标记的核酸适配体与靶蛋白(或无关蛋白)于室温孵育,聚丙烯酰胺非变性凝胶电泳后将核酸适配体湿转至带正电荷的尼龙膜上,紫外交联,经蛋白酶K消化后,用化学发光法检测。结果:与未使用蛋白酶K消化组相比,经蛋白酶K消化后,可明显呈现核酸适配体与靶蛋白特异结合后产生的阻滞条带,其灵敏度不次于同位素标记的检测方法。结论:经蛋白酶K消化步骤优化的生物素标记的EMSA方法,可以替代放射性同位素标记的EMSA方法,用于核酸适配体与靶蛋白结合情况的鉴定。     

定量稳定性同位素探针技术及其在微生物生态学研究中的应用

定量稳定性同位素探针技术(qSIP)是将生态系统中微生物分类性状与代谢功能联系起来的有效工具,能够定量测定特定环境中单个微生物类群暴露于同位素示踪剂后微生物代谢活动或生长速率。qSIP技术采用定量PCR与高通量测序技术并结合稳定同位素探针技术(SIP),通过向环境样品添加标记底物进行培养,提取微生物生物标记物,利用超高速等密度梯度离心将被同位素标记的重链核酸与未被标记的轻链核酸进行分离,并对所有组分微生物类群进行绝对定量和测序分析,基于GC含量和未标记处理DNA密度曲线量化参与吸收转化的DNA同位素丰度。本文重点阐述qSIP的技术原理、数据分析流程及其在微生物生态学研究中的应用进展,并对该技术存在的问题进行了分析和展望。     

核酸分子的化学发光标记和化学发光检测

非同位素标记是核酸分子杂交和检测的关键技术,在已知的各种非同位素标记检测方法中,化学发光标记和检测以其灵敏度高,安全无害和操作简便等优点,愈来愈受到重视,本对核酸分子的化学发光标记和核酸杂交分子的化学发光检测作一简要介绍。     

水稻苯达松敏感致死基因的RAPD标记和SCAR标记

利用RAPD技术对水稻品种农林 8号 (含苯达松抗性基因Ben)和其突变体农林 8号m (含苯达松敏感致死基因ben)进行标记 ,从 36 0个 10bp寡核苷酸随机引物中筛选出 5个引物产生的 7个RAPD标记。经对多态性标记的克隆和序列分析 ,再设计PCR引物 ,将其中 4个RAPD标记OPG18/ 94 3、OPG18/ 972、OPD10 / 12 4 8和OPF0 3/ 1198转化成SCAR标记SCAR/G18/ 883、SCAR/G18/ 890、SCAR/G18/ 919/ 94 8、SCAR/D10 / 12 37、SCAR/F0 3/ 1186。通过对农林 8号×农林 8号mF2 分离群体 32 0个单株的连锁分析及在 1对含ben基因的近等基因系H12 1和Hben12 1中验证 ,标记SCAR/G18/ 883、SCAR/G18/ 890、SCAR/G18/ 919/ 94 8与Ben或ben基因共分离 ,SCAR/D10 / 12 37与Ben基因的遗传距离为 (14 .8± 2 .1)cM。经Southernblotting分析并结合F2 代分离比例表明 ,标记OPG18/ 94 3、OPG18/ 972及其转化的SCAR标记在基因组中为单拷贝序列 ,且OPG18/ 94 3和OPG18/ 972为一对等位STS位点。这是首次报道与ben或Ben基因相连锁的分子标记。本研究为利用分子标记辅助ben基因的转育及利用图位克隆技术分离ben基因提供了有用的分子标记。     

分子标记技术的发展及应用

介绍了几种应用前景较广的分子标记,如基于DNA杂交技术的分子标记:限制性片段长度多态性(RFLP)和DNA可变串联重复数标记(VNRT);基于PCR技术的分子标记:随机扩增多态性 DNA(RAPD)、酶切扩增多态性(CAPS)、扩增片段长度多态性(AFLP)、微卫星DNA(SSR)和DNA单链构象多态性(SSCP);以及新兴的第3代分子标记,即基于DNA芯片技术的分子标记:单核苷酸多态性(SNP)等。分别阐述了它们的原理、方法步骤与优缺点、应用注意事项和适用范围,同时概述了它们在生物学研究中的应用和进展。     

土壤微生物群落磷脂脂肪酸PLFA生物标记多样性

磷脂脂肪酸(PLFA)生物标记法是一种可定性和定量分析土壤中微生物群落多样性的方法.研究以烟田土壤为例,应用生态学评价方法,即丰富度 (S)、均匀度(J)、Simpson优势度(D)、Shannon-Wiener(H1)、Brillouin(H2)和McIntosh(H3)多样性指数等测度方法,分析土壤中微生物群落PLFAs生物标记的多样性.研究结果表明,供试土壤微生物群落中,先后出现了43种PLFAs,将其聚类分析,可以将所获得的PLFAs分成五大类:第Ⅰ类为高含量、高频次和多样性,PLFA为18:1ω9c的真菌生物标记;第Ⅱ类为高含量、高频次和多样性,PLFA为16:0的假单胞菌生物标记;第Ⅲ类为高含量、高频次,多样性中等,PLFA为16:1ω5c的甲烷氧化菌生物标记;第Ⅳ类为中等含量,频次较高,多样性中等,含有表征好氧菌的i15:0、a15:0、i16:0和a17:0的PLFA,还有表征厌氧菌的18:1ω7c以及硫酸盐还原菌的16:0 10Me;第Ⅴ类为低含量,低频次和多样性,其特征生物标记有表征好氧菌的I 15:0 3OH、15:1 I G、a16:0、i16:1 G、i16:1 H、17:0、i17:0、15:0 2OH、15:0 3OH、17:0和17:0 2OH的PLFAs,存在有表征真菌的18:3ω6c (6,9,12)、放线菌的17:0 10Me和18:0 10Me以及表征原生动物的20:4ω6,9,12,15c.说明供试土壤中能够起主导作用的功能菌依次是真菌、假单胞菌、甲烷氧化菌和部分的好氧菌、厌氧菌及硫酸盐还原菌,将为合理调节土壤微生态系统提供指导,是一种可行的评价土壤微生物群落多样性的新方法.     

同位素双标记水技术及其在动物生态研究中的应用

氢和氧元素均有三种同位素,氘(H~2)、O~(17)、O~(18)为稳定性同位素,不具有放射性,特别适用于那些特殊实验对象,如人。但样品制备复杂,测量比较困难,费用昂贵。氚(H~3)是半衰期为12.3年的放射性同位素,释放射线为软β,软β穿透能力较弱,空气中最大射程不足1 mm,故 H~3为一种较安全的放射性同位素。其优点较多,分析测量和样品制备简便、精确、测量费用和同位素费用均很少。故常用的为 HH~3O~(18)双标法。所谓双标记水,就是将一定浓度的 HTO和 H_2O~(18)混合,然后注射到动物体内,通过扩散与体内总体水达到平衡,参与动物体的     

肾病综合征出血热病毒(HFRSV)的细胞内放射性标记

Lee于1978年在南朝鲜分离到肾病综合征出血热病毒——Hantaan病毒后,我国病毒学者对HFRSV的分离、流行病学、血清学以及病毒形态学做了大量工作。近几年来国外用Hantaan病毒研究生化特征。研究病毒生化需要纯的病毒,针对HFRSV在细胞内复制周期较长,病毒产量低,我们用~3H—氨基酸对HFRSV进行细胞内标记,初步探索感染对细胞蛋白质合成的影响、标记的适当条件和标记HFRSV在病毒蛋白研究上的应用,现将结果报告如下:     

分子标记辅助选育抗水稻条纹叶枯病的‘红血糯’种质

为了改良水稻‘红血糯’品种对条纹叶枯病的抗性,将‘秦稻2号’、‘香糯Q33’、‘青香糯’作为抗性的供体亲本配制杂交组合;同时选取了ST10、H21和STS11-43等3对显性分子标记用于亲本和F2群体田间抗病性的分子标记辅助检测。结果显示:(1)不同分子标记在亲本中的多态性不同,标记H21和STS11-43只有在‘红血糯’和‘香糯Q33’之间具有多态性,标记ST10在‘红血糯’与‘秦稻2号’、‘香糯Q33’、‘青香糯’之间都有多态性。(2)各个分子标记在不同杂交组合F2群体的室内分子检测显示,部分F2单株携带抗性基因条带,也有个别单株含有杂合抗病基因条带。(3)田间发病抗性检测显示,含有抗性基因的植株基本不发病,携带抗性基因的单株与田间发病情况调查结果基本相符,但对含有杂合抗病基因条带的抗病单株,其还需2~3代田间观察,纯化抗病基因。研究表明,分子检测结果与田间抗病性检测结果相符,3种分子标记可以用于‘红血糯’杂交后代的分子标记辅助检测,为改良‘红血糯’的条纹叶枯病抗性育种提供了可行的方法。     

黄麂标记行为初探

2002年3-4月对上海动物园人工饲养的黄麂(Muntiacus reevesi)的标记行为进行了初步研究。结果表明黄麂的标记方式可分为用面腺(包括额腺和眶前腺)、尿液和粪便标记3种。雌雄黄麂用面腺标记的频次差异显著(P＜0,01)。面腺标记是雄麂最主要的标记方式,占总标记次数的74.27%;雌麂最主要的标记方式是排便(48.10%)和排尿(44.30％)。进入发情期后,个体的标记行为变得频繁,雄性个体的这种差异尤为显著(P＜0．05),这说明黄麂的标记行为具有发情信号的作用。     

无尾两栖类的简易标记法

在动物学、动物生理学和生态学等学科的研究中 ,常常需要对所研究的动物个体进行标记 ,以便于对其个体活动的追踪研究观察。在有关研究工作中 ,目前使用多种标记法 ,如烙印法、同位素示踪法等。在对蛙类的研究实践过程中 ,我们找到了针对蛙类研究的一种简单易行的标记法——划蹼法和切趾 (指 )法。由于蛙类个体小 ,较为脆弱。烙印等方法容易对其造成伤害 ,影响其生存 ,同时也不易进行操作。尤其是在蝌蚪变态期不易进行有效的标记 ,给追踪观察造成极大的困难。我们经过对中国林蛙的标记试验探索 ,找到了一种简单易行的标记方法。即采用划去蛙…     

Cytohesins介导EGFR 通路在结直肠癌细胞增殖中的作用

目的:研究Cytohesins介导EGFR通路在结直肠癌细胞增殖中的作用。方法:选择人结直肠癌细胞系HT-29作为研究细胞,采用免疫荧光检测结直肠癌细胞系HT29中EGFR表达情况,Secin H3阻断结直肠癌细胞系HT29细胞内cytohensins观察细胞内EGFR通路激活情况,MTT法检测细胞增殖情况。结果:EGF+Secin H3组细胞内p-EGFR水平显著低于EGF组(P0.05)。第3、5天,各组细胞增殖情况存在显著差异(F=38.072,P0.05),其中EGF组显著高于Secin H3阻断组(P0.05)和对照组(P0.05),对照组吸光度值显著高于Secin H3阻断组(P0.05)。结论:EGF与结直肠癌细胞的增殖密切相关,通过阻断Cytohesins介导EGFR通路能够显著抑制结直肠癌细胞的增殖。     

SRAP分子标记分析西瓜遗传多态性

目的:探讨西瓜遗传多样性和遗传基础。方法:采用SRAP分子标记对西瓜品种D1、D2、D3、H1、H2、H3、M1、M2、M3、m1、m2、m3的多态性进行了分析。结果:每对引物组合产生13~25对比较清晰的扩增带.8对引物组合共产生131条扩增带。平均每对引物组合产生16.375条。8对引物组合共产生多态性带37条,每对引物组合产生3~7条,平均4.625条。每对引物组合产生的多态性带的比例为16.666%~38.464%,平均为28.675%。另外,对银染过程进行了优化。结论:SRAP标记多态性还是较高的,可以适于分析西瓜等遗传差异小的作物。     

用商品群作为参考系构建猪的微卫星连锁图谱

由 19头杂种公猪 [皮特兰× (皮特兰×汉普夏 ) ]、5 2头杂种母猪 [Leicoma× (大约克×长白 ) ]及其 332头后代组成的商品群作为参考系 ,选择 172个微卫星标记和 3个Ⅰ类标记 (RYR1、PIT1、PRKAG3)对参考系的个体进行遗传标记分型 ,应用CRIMAP(2 4 )构建猪的整个基因组微卫星连锁图谱。采用多重PCR方法对微卫星标记进行扩增 ,用ABI 377测序仪进行电泳分离 ,应用Genescan 3 0和Genotyper 2 0软件进行基因型检测。 3个Ⅰ类标记用PCR RFLP技术进行分型。CRIMAP程序分析表明 :所构建的猪常染色体性平均连锁图谱的总长度为 2 36 8 7cM ,X染色体的长度为 14 3 10cM ,遗传标记的平均间距为 16 3cM ,亲本的微卫星标记座位的杂合度平均为 0 70。此连锁图谱的构建将为商品猪群的生长、胴体、肉质以及繁殖性状的QTL扫描打下基础。