苦荞黄烷酮3-羟化酶基因F3H的克隆及序列分析

为提高黄酮代谢途径中的关键酶活性,增加苦荞黄酮类化合物的合成量,根据已知植物的F3H基因同源序列,采用RT-PCR和RACE结合的方法,克隆了苦荞黄酮代谢途径中关键酶基因F3H,命名为FtF3H(GenBank登录号:FJ456858)。序列分析结果表明,FtF3H基因长1369bp,编码367个氨基酸,该氨基酸序列及其cDNA序列与葡萄、牵牛F3H等的同源性约80%。二级结构预测表明,随机卷曲是FtF3H蛋白最大量的结构元件,而α-螺旋和β-片层则散布于整个蛋白质中;三维结构建模预测FtF3H蛋白具有铁离子结合位点及2-O-酮戊二酸结合位点等F3H蛋白典型结构。     

草莓G6PDH基因片段的克隆与序列分析

根据不同植物G6PDH同源基因的保守区设计合成简并引物,采用PCR技术从草莓基因组中分离出一个DNA片段并克隆到pMD18-T载体中。序列测定和分析表明,该片段长717 bp,与拟南芥等植物的G6PDH基因的核酸序列具有83%-87%的同源性。结果表明,克隆的片段为草莓G6PDH基因片段。     

南方红豆杉紫杉烷13α-羟化酶基因的克隆及序列分析

目的:紫杉烷13α-羟化酶是紫杉醇下游合成途径关键酶之一,负责催化紫杉二烯-5α-醇的C13侧链发生羟基化反应生成紫杉二烯-5α、13α-二醇.该研究从南方红豆杉中克隆出紫杉烷13α-羟化酶基因并对其序列进行生物信息学分析.方法:利用南方红豆杉的总DNA和总RNA为模板,采用PCR和RT-PCR技术克隆出紫杉烷13α-羟化酶基因的DNA序列和cDNA序列,利用swiss-prot、DNAMAN等生物信息学工具对其核酸序列和蛋白序列进行分析.结果:测序结果显示其cDNA序列长度为1 651bp,含有一个1 458bp的开放阅读框,同源性比较分析结果表明,其氨基酸序列与已经报道的蔓地亚红豆杉的紫杉烷13α-羟化酶氨基酸序列的一致性为96%.结论:成功克隆出南方红豆杉紫杉烷13α-羟化酶基因,为利用合成生物学工程技术生产紫杉醇或其前体物质提供了分子基础.     

高山植物黄管秦艽cDNA文库构建与表达序列标签（EST）分析

黄管秦艽（Gentiana officinalis）是一种重要的藏药高山植物,本研究构建了该物种开花期的eDNA文库。经检测达到中等cDNA文库水平,文库滴度为1．2×10^7pfu／ml,重组率95．9％,插入片段平均长度大于500bp。对343个随机挑选的重组克隆进行部分测序,获得的ESTs经编辑后共有181条有效序列。经生物信息学方法分析181条表达序列标签（EST）代表144个单克隆序列,其中55个与已鉴定的基因同源,35个序列与未鉴定的EST匹配,54个未找到同源序列;后两者共有89个EST序列未发现功能相似的蛋白。对已鉴定的EST进行功能分析发现,相关基因主要编码以下蛋白：与蛋白表达相关的占35％;光合作用相关的占笠％;新陈代谢相关的占18％;抗性相关的占11％;质膜运输和细胞分裂相关的分别占5％;染色体变化和细胞信号转导的分别占2％。根据有效EST序列设计引物,通过RT-PCR进一验证了所得EST的准确性。这些研究结果为将来研究黄管秦艽的功能基因以及该物种与相关物种的群体遗传学、进化生物学等方面提供了基础。     

草莓果实膜联蛋白基因（annfaf）全长cDNA克隆及序列分析

采用RACE技术从草莓（Franaria ananassa Duch)成熟果实中分离克隆了膜联蛋白（annexin)基因的cDNA5'-端未知序列,并通过测序确定了翻译的起始密码位点,终止密码位点及完整的读码框,从而首次获得了草莓果实膜联蛋白基因的cDNA全序列,命名为annfaf9annexin of Fragaria anananssa fruit)基因。     

木瓜凝乳酶基因的克隆及序列分析

通过设计一对特异性的引物,采用RT－PCR方法从未成熟的木瓜组织中扩增得到木瓜凝乳酶基因,并将其重组到pPIC9K载体中,转化大肠杆菌并筛选阳性克隆,序列测定并利用BLAST软件进行核酸及氨基酸序列相似性分析,结果表明：通过序列组成及特征结构分析,扩增得到的基因为木瓜凝乳酶基因。     

秦艽1-羟基-2-甲基-2-(E)-丁烯基-4-焦磷酸还原酶基因(GmHDR)的克隆和表达分析

龙胆苦苷(gentiopicroside)等裂环烯醚萜苷类化合物是中药秦艽中主要的有效成分,属于萜类化合物的衍生物,1-羟基-2-甲基-2-(E)-丁烯基-4-焦磷酸还原酶(1-hydroxy-2-methyl-2-(E)-butenyl-4-diphosphate reductase,HDR)是植物萜类物质合成的关键酶之一。该研究在实验室高通量测序的基础上,采用RT-PCR方法克隆了秦艽HDR基因(即Gm HDR基因),利用生物信息学的方法分析了Gm HDR编码氨基酸序列的理化性质、信号肽、转运肽、亚细胞定位、保守结构域和高级结构等特征,并采用实时定量PCR分析了HDR的表达模式。结果表明:秦艽Gm HDR基因包含一个完整的长1 392 bp的ORF框,编码463个氨基酸;Gm HDR与萝芙木、艾菊等植物HDR蛋白具有很高的一致性(≥84%),无跨膜结构域,有叶绿体转运肽等结构,主要定位于叶绿体中。实时定量PCR结果显示,Gm HDR基因在秦艽的花中进行表达量高,在叶、茎和根等部位表达较低。Gm HDR在序列上与其他植物的HDR蛋白序列特征上存在很大的相似性;Gm HDR基因主要在秦艽花中表达,可能主要参与花中萜类物质的合成。该研究结果可为今后研究秦艽环烯醚萜类化合物的生物合成机制提供依据。     

絮凝基因(FLO1G)的序列测定及分析

虽然酵母细胞絮凝的确切机制至今尚无定论 ,但已克隆了多个与絮凝相关的基因 ,如ＦＬＯ1、ＦＬＯ5、ＦＬＯ1 1等[1～3 ] 。这些基因的表达可以赋予非絮凝酵母细胞以絮凝能力。酵母细胞的絮凝特性在酿造工业、固定化酶、精细化工和物生制药等领域具有广泛的应用价值[4 ,5] 。从一株强絮凝酿酒酵母菌株中克隆到一个约 4 3ｋｂ的ＮＤＡ片段 ,酵母转化实验证明该ＤＮＡ片段能够赋予非絮凝酵母菌株以絮凝能力[6] 。本文简要报道对该ＤＮＡ片段进行序列测定和分析的结果。1　材料和方法1 .1　菌株和质粒实验所用菌株和质粒见表 1。表 1　菌株和质…     

大肠杆菌ubiC基因的克隆及序列分析

研究以克隆得到正确序列的大肠杆菌ubiC基因目的,实验通过PCR方法从大肠杆菌基因组中扩增得到了ubiC基因,扩增产物克隆到pUC118载体,转化大肠杆菌JM109,DNA序列分析结果表明克隆得到的大肠杆菌ubiC基因碱基序列正确。     

秦艽与小秦艽光合日变化的研究

运用光合作用测定系统,对野生秦艽(Gentiana macrophylla Pall．)和小秦艽(G．dahurica Fisch．)的开花期的光合特性进行研究。结果表明,2种秦艽的净光合速率、蒸腾速率、气孔导度日变化曲线都呈双峰型,有明显的光合“午休”现象。小秦艽的光合速率、蒸腾速率、气孔导度照著高于秦艽,分别高出2．7 μmolCO2·m-2·s-1、1．5 mmol·m-2·s-1和140．7 mmol．m-2·s-1而叶温则低于秦艽2．8C。相关分析表明,开花期的温度、光照对2种秦艽的光合都有一定影响,蒸腾速率、气孔导度调节光合作用,而引起2种秦艽光合速率降低的主要因素为非气孔因素。     

大叶秦艽的组织培养与植株再生

以秦艽的叶和下胚轴为外植体,成功地诱导出愈伤组织和再生植株.诱导愈伤组织最合适的培养基为附加2 m g·L- 1 2 ,4 - D和0 .5 mg·L- 1 6 - BA的MS培养基,诱导率可达到10 0 % .愈伤组织转移到附加2 mg·L- 12 ,4 - D和0 .5 mg·L- 1 KT和5 0 0 m g·L- 1 L H的MS培养基上进行继代培养,增殖后的愈伤组织转移到附加0 .1mg·L- 1 2 ,4 - D和0 .5 m g·L- 1 6 - BA的MS分化培养基上进行分化,其分化率可达到86 .6 7% ,将分化出的芽转接到不加激素的MS上,结果可生长出大量的分化苗.     

陕西秦艽药源植物及秦艽药材HPLC的比较研究

目的:系统比较研究秦艽药材与其药原植物间主要化学成分的差异。方法:高效液相色谱法,色谱柱:Diamonsil C18(200 mm×4.6 mm,5um);洗脱条件:乙腈-水溶液梯度洗脱;检测波长:240 nm;柱温:30℃;流速:0.5 mL.min-1。结果:陇县、太白秦艽中龙胆苦苷含量明显高于市售秦艽药材;通过确定7个共有峰建立陕西秦艽HPLC指纹图谱,所测定的29批秦艽药材具有很高的相似度,而秦艽伪品相似度较低。采用HPLC各峰面积及其相对之比进行聚类分析结果显示,采自太白的10个样本和陇县的8个样本分别聚为两支,表明秦艽化学成分含量与其地理分布存在密切关系。结论:本实验建立的指纹图谱可用于秦艽及其药材鉴别和质量控制;聚类分析可以鉴别秦艽产地。     

Molecular Cloning and Sequence Analysis of a Gene Encoding Rice 10 kD Prolamin

Using PCR technique, two prolamin genes from Oryza sativa var. indica (cv. Guanglu′ ai) and O. sativa var. japonica (cv. Zhonghua 8) were amplified and cloned. The prolamin gene contained 525 base pairs and encoded 134 amino acid residues. The two genes cloned from two different rice cultivars exhibited 100% homology and were highly homologous with the 10 kD prolamin gene in other rice species amountin an homology ranging from 96.6% to 100%. The deduced amino acid sequence shared 34.2% homology with that of maize 10 kD prolamin. As for dicots, only two types of storage protein shared some homology with rice 10 kD prolamin. One was from Brazil nut and the other from castor bean. Analysis on the signal peptide of rice 10 kD prolamin showed that it shared higher homology with that of storage proteins in some monocots such as maize, sorghum and oat. No similar sequence was found in dicots. The gene sequences of "Guangluai” and "Zhonghua 8” 10 kD prolamin would appear in EMBL data-base under the accession number L36604 and L36605 respectively.     

秦艽及其近缘种植物资源在我国的分布

秦艽是我国大宗中药材之一,在传统中医药理论中有重要的应用价值。近年来伴随秦艽药用价值研究的不断深入,其需求量不断增加,致使秦艽野生资源日趋减少。通过野外考察和资料查阅,系统阐述了秦艽组植物资源在我国的分布概况,并详细介绍了药典规定品种的具体分布,从而为合理利用和保护秦艽资源,开发新资源提供参考。     

柠条锦鸡儿香豆酸-3-羟化酶基因克隆及其功能初步研究

香豆酸-3-羟化酶(Coumarate 3-Hydroxylase,C3H)是木质素生物合成途径中的关键酶之一.以柠条锦鸡儿为材料,利用RACE技术克隆了C3H基因.对柠条锦鸡儿C3H基因的gDNA和cDNA全长分析显示该基因具有3个外显子,2个内含子,编码框长度为1530bp,编码509个氨基酸.预测该基因编码蛋白的等电点位7.67,分子量约57.61 kDa.氨基酸序列分析显示具有一个保守的P450结构域.系统进化分析表明该蛋白与大豆C3H具有最高的同源性,将该基因命名为CkC3H,GeneBank登录号为HQ829858.构建了35S启动子驱动的CkC3H基因植物表达载体,互补拟南芥C3H(CYP98A3)基因突变体ref8,转基因植物表型得以部分恢复.这些结果说明柠条锦鸡儿CkC3H与拟南芥C3H至少具有部分相同的功能.     

Chemical and Genetic Comparative Analysis of Gentiana crassicaulis and Gentiana macrophylla

Gentiana crassicaulis Duthie ex Burk . and Gentiana macrophylla Pall . are two main sources of Radix Gentianae Macrophyllae (Qinjiao) available in markets, which has a wide range of anti‐inflammatory effects and has been extensively used for fighting rheumatoid arthritis. However, they vary in terms of chemical compositions, pharmacological activities, and biomass. In this study, a combined chemical and genetic (HPLC and DNA barcoding) approach was used to compare these two plants. Four predominant bioactive compounds, namely, gentiopicroside, loganic acid, swertiamarin, and sweroside, were used to assess the chemical variations. Based on chemical variations, 15 samples were clustered into two groups through PCA analyses. DNA barcoding utilizing the variable nuclear ITS2 regions were sequenced, aligned, and compared. Together with 61 sequences collected from GenBank, 76 batches of Qinjiao were clustered in two groups according to species origin. The genetic relationships indicated by the ITS2‐based NJ tree were consistent with the chemical variations. Thus, the chemical profiles determined by HPLC and DNA profiles obtained from ITS2 region could be applied for the quality control of Qinjiao.     

秦艽根中柱裂分结构的发生及龙胆苦苷的积累研究

采用植物解剖学、组织化学、分析化学和现代仪器分析技术相结合的方法,系统研究了秦艽根的中柱裂分发生、有效成分积累部位及其结构与有效成分的积累关系。结果表明：（1）秦艽根的中柱裂分发生是由于维管形成层和薄壁细胞的异常活动,使原维管柱裂分为几个相对独立的维管柱,这些独立的维管柱被木栓化细胞包围,主根裂分为支根;（2）秦艽根中的有效成分主要存在于维管组织的韧皮薄壁细胞和木薄壁细胞中;（3）秦艽根中裂分部位的龙胆苦苷含量为未裂分部位的60%。     

庚型肝炎病毒—中国河北分离株部分NS3区基因序列分析

在急慢性输血后肝炎、散发性肝炎及爆发型肝炎中,大约１０～２０％的病人不属于已发现的Ａ～Ｅ型肝炎,提示存在新型肝炎病毒。在美国１９９５年第４６届医学年会上,已有了一些有关庚型肝炎病毒（ＨＧＶ）分子生物学及庚型肝炎血清学方面的摘要报道。１９９６年初Ｌｉｎ...