完成果蝇染色体碱基序列测定并着手人染色体的分析

<日经生物技术>1999年9月13日号第5页报道:美国Celera Genomics公司 9月9日宣布,完成了果蝇染色体的DNA碱基序列的测定,并着手分析人染色体的碱基序列.     

国际基因组科学家完成人类第22号染色体DNA序列测定

1999年 1 2月 2日 ,《自然》杂志刊载一则举世瞩目的消息 :英国 Sanger中心的 Ian Dunham研究室联合日本、美国、加拿大和瑞典等国其他 8个研究室完成了人类第 2 2号染色体 DNA序列测定 (Nature,1 999,40 2 :489～ 495) .这一成就堪称人类基因组计划的里程碑 ,因为这是自该计划实施以来首次完成的人类常染色体的几乎全部 (占 2 2号染色体的 97% ) DNA序列 .2 2号染色体在人类各染色体中 DNA含量列倒数第二 ,仅占整个基因组 DNA的 1 .6%～ 1 .8% .2 2号染色体也是 5个近端着丝的染色体之一 ,其短臂 (2 2 q)主要为串联重复的核糖体 RN…     

中国人类基因组研究的现在与未来

人类基因组计划 (ＨｕｍａｎＧｅｎｏｍｅＰｒｏｊｅｃｔ,ＨＧＰ)正式启动于 1990年 ,它的初衷是用 15年时间 ,即到 2 0 0 5年完成人类基因组全长约 30亿个核苷酸的全部序列测定 . 10年来 ,工作已取得了令人振奋的突破性进展 ,人的 2 2号[1] 与 2 1号[2 ] 染色体的全序列测定已经相继完成 ;2 0 0 0年 6月 2 6日参加人类基因组国际合作项目的各国于同一个时间正式宣布人类基因组序列工作框架图的完成 ,测序工作进入绘制完整序列图阶段 ,其测序的精确度要求达到 99 99% .人们预计 ,在 2 0 0 1年 6月将基本完成全序列的测定 .　　当初 ,ＨＧＰ…     

国际基因组完成人类21号染色体DNA序列测定

21号染色体占人类基因组的 1 %～ 1 .5% ,是人类染色体组中最小的常染色体 ,也是自人类基因组计划实施以来第一个被绘制出致密连锁图、酵母人工染色体 (YAC)物理图谱和限制性内切酶 Not 图谱的常染色体 .今年 5月《自然》杂志刊登了日、德、法、美、英和瑞士等国 1 3个研究单位署名文章“人类 2 1号染色体DNA序列”,测定序列覆盖了 2 1号染色体的 99.7% ,序列测定的准确度达 99.995% .根据他们公布的结果 ,2 1号染色体长臂 (2 1 q) DNA由 33546361 bp组成 ,其中只剩下 3个小的克隆裂隙和 7个序列裂隙 (约 1 0 0kb)尚未确定其序列 .2 1号…     

人类第14号染色体基因破译完毕

继人类第 2 2、2 1和 2 0号染色体上的基因被破译之后 ,人体第 14号染色体上的基因又被破译 ,人类对自身的了解更进一步。此前 ,参与“人类基因组测序计划”的各国科学家已公布了人类基因组草图和完成图 ,完成了对 30多亿个碱基对排列顺序的测定。此次研究可以算是人类基因组的后续工作。据悉 ,科学家们对第 14号染色体上的 80 0 0多万个碱基对完成了测序 ,对上面的所有基因进行了破译 ,共发现大约 10 0 0个基因 ,准确率达到 99.99%。此次确定的 10 0 0多个基因中有多个基因与一些遗传疾病密切相关 ,并有大量基因对人体免疫系统有重要意义。…     

96年确定酵母全碱基序列并进行机能分析

进行国际性酵母染色体序列测定项目的比利时Louvain大学的Andre Goffeau估计1996年能确定酵母染色体1270万碱基序列,并于3月15日在生物技术产业协会主持召开的酵母染色体分析研讨会上发表了该项预测。还宣布与测序同时从95年开始(3年计划)着手酵母染色体的机能分析研究。酵母染色体分析已进入从定序到机能分析和产业应用的新阶段。     

福建橄榄18S-26S rRNA及其ITS片段的克隆与序列分析

利用18S-26S rRNA基因及其ITS片段的PCR扩增、克隆及测序分析,对福建14个橄榄品种进行分子标记及遗传分类。序列分析结果表明:14个品种可分为4个类别,以1号品种为参照,3、4、6、7、8、9、11号品种的ITS1、ITS2和5.8S共634个碱基序列完全一致,与1号仅ITS2上有1个碱基差异,2号和1号品种的ITS1和5.8S序列完全一致,仅ITS2上有2个碱基差异,归为第一类;5号和14号的序列完全一致,与1号在ITS1和ITS2上各有1个碱基差异,归为第二类;10号和12号序列完全一致,与1号在ITS1上有2个碱基差异,归为第三类;13号品种5.8S的序列与1号相同,但在ITS1上有1个碱基差异,在ITS2上有24个碱基差异,归为第四类。使用DNAMAN软件建立的同源关系树说明了不同橄榄品种的变异程度。将橄榄18S-26S rRNA基因及其ITS序列登陆GenBank,登陆号:DQ517524。     

蜜蜂全基因组中微卫星的丰度及其分布

查找出蜜蜂基因组中由1～6个碱基重复单元组成的简单序列重复,分析蜜蜂基因组中微卫星的分布频率,并比较其在各染色体中的分布频率。微卫星在蜜蜂基因组中的分布频率为1/0·804kb,其中二碱基重复序列占26·86%,是最丰富的重复单元,而六、一、三、四、五碱基重复单元序列分别占24·74%,22·19%,13·65%,10·98%,2·59%。同时发现富含A和T碱基的微卫星占主导地位,富含G和C碱基的微卫星数量较少。第4,1,3条染色体微卫星分布频率较高,而第11,14,12条染色体微卫星分布频率较低。     

国际人类基因组单体型图计划“中国卷”的最新进展

国际人类基因组单体型图计划是科学家在完成人类基因组序列图谱之后的又一大壮举,加拿大、中国、日本、尼日利亚、英国和美国六国科学家参加了这个项目。中国作为唯一的发展中国家在整个项目中承担百分之十的任务,即构建三号、二十一号染色体和八号染色体短臂的单体型图,同时,还提供一半的亚裔样品。     

中国染色体蛋白质组计划研究进展

人类染色体蛋白质组计划(Chromosome-Centric Human Proteome Project,C-HPP)是由人类蛋白质组组织(Human Proteome Organization,HUPO)于2010年9月在悉尼召开的第九届国际蛋白质组学大会上正式提出的大型国际合作计划。与生理-病理驱动的人类蛋白质组计划(Biology/Disease-driven HPP,B/D-HPP)相同,C-HPP是人类蛋白质组计划(Human Proteome Project,HPP)的主要工作,将由中国、美国、澳大利亚、瑞士、意大利等17个国家的25个研究团队共同合作,旨在10年内(2012.09—2022.09)完成人类24条染色体和线粒体上蛋白质编码基因产物本身及其修饰产物的检测、验证和确认,注销可能过度注释的编码基因,绘制基因图谱并实现人类基因组的重注释。国内军事医学科学院的贺福初院士和徐平教授、复旦大学的杨芃原教授、华大基因的刘斯奇教授和暨南大学的何庆瑜教授,以及台湾地区的陈玉如教授分别领衔承担了人类第1号、8号、20号和第4号染色体上蛋白质编码基因的研究任务。综述了我国承担的C-HPP工作的策略和进展,并提出展望。     

人类第1号染色体基因测序完毕

英美科学家近日公布了人类第1号染色体的基因测序图,这个染色体是人类“生命之书”中最长也是最后被破解的一章。第1号染色体中共有2．23亿个碱基对,占人类基因组中碱基对总量的8％左右。科学家这次测序确定了人类第1号染色体     

“国际人类基因组计划”完成人类基因组 “工作框架图”

20 0 0年 6月 2 6日 ,6国合作、公众支持的国际人类基因组计划协作组今天在全球同一时间宣布已完成人类生命的蓝图———人类基因组的“工作框架图”。这是“人类基因组计划”进展的一个重要的里程碑。　　“工作框架图”的构建包括两大任务 :首先是确定几十万个大片段ＤＮＡ克隆在人类染色体上的位置 ,然后测定这些ＤＮＡ大片段的化学组成单位———核苷酸 (共四种 ,分别以Ａ、Ｔ、Ｃ、Ｇ来表示 )的序列 ,即将每一个位置上的核苷酸一一确定并连接成线 ,最后将测定多次的这些序列依其彼此重叠的相互关系及其在人类染色体上的位置 ,组装成代…     

谈谈植物的性别 ——由一道选择题引起的思考

有这样一道选择题,题目如下：我国科学家在2002年独立完成了“水稻基因组”的测序工作,并且这些数据无偿对外开放,这表明我国在有关基因组测定中走在世界前列。二倍体水稻有24条染色体,我国科学家测定水稻基因组需要测定水稻细胞中多少条染色体DNA的碱基序列(\ )。     

谈谈植物的性别——由一道选择题引起的思考

此题的正确答案是A,许多学生错误选择了B。选错学生的理由是：人体细胞中有46条染色体,人类基因组计划测定的22条常染色体及X、Y染色体（共24条）的DNA碱基序列。那么,同理可以推出,此题中水稻基因组就是要测定11条常染色体及X、Y染色体（共13条）的DNA碱基序列。因此答案应该是B。     

日本首家植物染色体功能分析风险企业创立

《日经生物技术》2 0 0 0年 1月 31日号报道 :日本首家专门进行植物染色体功能分析的风险企业———植物染色体中心 (股份有限 )于 2月 1日宣布成立。该中心的目标是探索农业上有用的基因和在此基础上开发农药和新品种。在欧美利用遗传信息开发新品种和农药已成为主流 ,在日本也出现了向这种最尖端的农业经营挑战的企业 ,这可能为走进“死胡同”的日本植物生物技术实用化开辟道路。美浓部侑三担任植物染色体中心的代表董事。并于 1999年 4月退出农林水产省生物资源研究所的研究工作 ,在任时曾提出农林水产省水稻染色体计划 ,日本在单子叶植…     

水稻45S rDNA和5S rDNA的染色体定位研究

45SrDNA和5SrDNA是水稻中与核糖体RNA合成有关的2个功能片段,有关这2个序列在水稻染色体上的位置,不同研究者的研究结果不尽相同,在获得水稻染色体清晰制片的基础上,通过FISH确定了45SrDNA序列位于水稻的第9号和第10号染色体的短臂末端,并且第9号染色体上的拷贝数多于第10号染色体,5SrDNA序列位于第11号染色体短臂靠近着丝点处。     

大白×梅山猪资源家系生长性状QTL的检测

以大白猪和梅山猪为父母本建立F2 资源家系 ,在 2 0 0 0年 ,随机选留 6 6头F2 代个体 ,获得出生重、6 0日龄体重、出生至 6 0日龄平均日增重及 6 0日龄至屠宰前平均日增重的表型数据。结合 4 8个微卫星标记构建的猪 1、2、3、4、6和 7号染色体遗传连锁图谱 ,用线性模型最小二乘法对各数量性状进行QTL区间作图 ,利用置换法(permutation)确定显著性阈值。研究发现 ,猪 4号染色体上有一个染色体水平极显著 (P <0 0 1)的QTL影响 6 0日龄至屠宰前平均日增重 ,并达到基因组显著水平 (P <0 0 5 )。在染色体水平 ,出生至 6 0日龄平均日增重QTL位于 2号染色体 ,6 0日龄体重QTL位于 1号染色体。 6号染色体的出生至 6 0日龄平均日增重QTL达到建议显著水平     

枯草杆菌基因组全碱基序列的确定

参加枯草杆菌基因组计划的日美欧研究组确定了枯草杆菌基因组的全碱基序列,并在法国召开的枯草杆菌基因组计划的国际会议“ＩｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌＣｏｎｆｅｒｅｎｃｅｏｎＢａｃｉｌｉ”上发表了其成果。日本枯草杆菌基因组计划研究组代表小笠原直毅参加了这次会议...     

红原鸡全基因组中微卫星分布规律研究

本文对红原鸡Gallus gallus全基因组中微卫星数量及分布规律进行了分析,查找到l～6个碱基重复类型的微卫星序列共282728个,约占全基因组序列(1.1Gb)的0.49%,分布频率为1/3.89kb,微卫星序列的长度主要在12～70个碱基长度范围内。第1、2、3条染色体上微卫星分布频率较高,而32号染色体上无微卫星分布。不同类型微卫星中,单碱基重复类型数目最多,为184192个,占总数的65.1%;其次是四、二、三、五、六碱基重复单元序列,分别占到总数的12.8%、9.7%、7.2%、4.6%、0.8%。T、A、AT、GTTT、AAAC、G、C、ATTT、AC、GT、AAAT、ATT、AAC、AAT、GTT、AG、CT、CTTT、AAAG、GTTTT、AAACA、AAGG、CCTT是红原鸡基因组中最主要的微卫星重复类型。本研究为红原鸡微卫星标记的分离筛选、遗传多样性的研究以及不同物种微卫星的比较分析奠定了基础。     

与新生儿畸形有关的两个基因

有一种新生儿畸形称为ＤｉＧｅｏｒｇｅ综合征 ,经常累及心脏 ,并且引起许多其它症状 ,包括轻度学习困难、严重的迟缓以及面部异常 :诸如下斜眼、球状鼻和裂腭 .该综合征侵袭了每 4 0 0 0个新生儿中的 1个新生儿 ,是引起最常见先天性心脏缺损的第二位病因 .在 2 0 0 1年 3月 1日Ｎａｔｕｒｅ上有 1篇论文以及在 2 0 0 1年 3月Ｎａ ｔｕｒｅＧｅｎｅｔｉｃｓ上有 2篇论文报道了 3个研究组用小鼠实验描述了基因Ｔｂｘ1与Ｃｒｋｏｌ中任何 1个失活便会产生该综合征的许多症状 .1978年研究者确定该综合征的遗传基础是人第 2 2号染色体 ,但难以确…