生物科学类专业期刊网络化现状调查与分析

通过网上实际检索的方法,对108种生物学专业期刊的网络化状况进行了调查研究,并针对其存在问题提出了一些改进对策。     

蛋白质折叠速率数据集的构建及分析

近年来,随着高精度的蛋白质折叠速率实验数据的不断积累,使得从蛋白质折叠速率角度研究蛋白质折叠机制的理论工作者,迎来了前所未有的机遇和挑战。然而,却有约100多个蛋白质的折叠速率实验数据散落在2个数据库和若干文献中。为了方便今后的理论工作分析,作者将这些散落数据汇集整理出来,构建了一个包含109个非冗余单体野生型蛋白质的折叠速率数据集,称为PFRD109(protein folding rate dataset 109)。PFRD109所包含的109个蛋白质中,有69个二态蛋白和40个多态蛋白,折叠速率从10-4到106s-1,跨度为10个数量级。链长最短的为16 aa,最长为390 aa,二态蛋白平均长度为78 aa,多态蛋白平均长度为137 aa。当前,生物信息学对蛋白质折叠速率的研究,主要集中于寻找与折叠速率和折叠动力学相关的各种生化参数或拓扑参数,进而实现对蛋白质折叠速率和蛋白质折叠动力学类型的预测。因此,本文还针对PFRD109数据集,就这两个方面进行了一些参数的统计分析。     

中国陆生脊椎动物野外调查的发展现状与文献分析

新中国成立以来,我国已开展了大量陆生脊椎动物的本底调查和多样性研究项目,取得了一系列成果,并有学者针对兽类、鸟类和两栖爬行类的野外调查监测进行了总结和展望,但尚缺乏对所有陆生脊椎动物类群的调查历史和现状的分析及基于文献收集的研究,特别是对调查方法和技术手段的对比与总结。因此,本文通过文献收集的方法,基于中国知网、Web of Science核心合集和以图书检索为主的读秀学术搜索,以“兽类”“鸟类”“爬行类”“两栖类”“动物资源”“调查”“监测”“新种”“新记录”和“物种多样性”作为检索词,检索并筛选了与兽类、鸟类、爬行类及两栖类陆生脊椎动物调查相关的文献资料共3,504篇,对陆生脊椎动物调查的研究文献在全国各省级行政区、生物多样性热点地区的分布,及其运用的调查方法和技术手段进行了系统的分析和比较。结果表明:相较兽类和两栖爬行类的调查,我国鸟类多样性的调查最多,发表文献占所有文献的70.26%。四川、云南的陆生脊椎动物调查最多,分别发表285篇、260篇文献。分布于我国的4个全球生物多样性热点地区的调查强度存在显著差异,印缅生物多样性热点地区和中国西南山地的研究文献较多,分别为348篇、...     

福建省食品安全监管体系现状分析

分析福建省食品安全监管体系发展现状及特点,总结成功经验,分析其存在的问题,并提出相关对策建议。     

公立医院薪酬分配体系现状调查与分析

目的 了解公立医院薪酬体系的现状与存在的主要问题,为构建以战略为导向的薪酬体系提供依据。方法 采用问卷调查法获得公立医院薪酬管理的基本数据,运用统计描述法对问卷进行分析。结果 现行公立医院的薪酬体系未与医院战略有效结合,与外部环境相脱节,现行薪酬体系缺乏公平性与科学性,不同岗位层级薪酬差距不大,无法形成具有竞争力的薪酬体系。结论 现行薪酬体系同医院的战略相脱节,未能有效体现医院战略。     

机场鸟击特点及防范体系构建

鸟击是威胁机场飞行安全的主要因素之一,根据机场鸟击特点有针对性地制定鸟击防范体系对提升飞行安全、减少经济损失具有重要意义。本文收集了重庆市江北机场2009—2016年的鸟击事件信息并送检鸟击残留物,在2010年3月—2011年2月调查了江北机场及周边区域的鸟类群落,将江北机场鸟击物种信息与鸟类群落的物种信息进行相似性分析,同时将江北机场的鸟击信息数据与中国民航2007—2015年的鸟击信息数据进行对比研究。结果显示:(1)江北机场鸟击物种与飞行区鸟类群落的相似性显著高于农耕区(t=2.507,P=0.041)和城镇园林(t=2.562,P=0.037),其中,夏季白天的鸟击物种与飞行区鸟类群落相似性最高(S=0.413 8),表明飞行区鸟类鸟击率更高,是鸟击防范工作的重点区域,夏季更应关注飞行区的鸟类控制;(2)江北机场与中国民航鸟击在季节、时间等方面基本一致,均呈现秋、夏、春季以及夜间鸟击高发的特点;(3)迁徙鸟和家鸽Columba livia domestica、燕子、树麻雀Passer montanus、小云雀Alauda gulgula等部分机场当地常见鸟是鸟击高发的物种。根据分析结果,结合江北机场及各机场鸟击防范工作经验,本文建议从组织机构、制度管理、监控、信息分析、设备防范、环境管理、航班动态调整、应急处置等方面构建鸟击防范体系,以期为江北机场及其他机场提供参考。     

本体OAE对我国上市疫苗相关不良反应表征研究的可行性分析

从广义上来说,疫苗也是一种药物。由于疫苗是接种到成千上万的健康人群用来预防各类传染性疾病,因此对其安全性的要求要比传统药物更高。保证上市疫苗的安全性可以增强广大民众对疫苗的信心,提高疫苗接种的接受度和普及度,进而实现巨大的社会医疗经济效益。当前,我国疫苗年使用量超过世界任何一个国家或地区,但是受制于数据来源匮乏、研究方法缺失等客观因素,我国关于上市疫苗安全性及其相关不良反应的分析研究明显滞后与不足。本文,我们系统地介绍了时下不良反应研究领域热门的数据标准化与整合工具不良反应本体OAE及其在疫苗不良反应研究中的进展情况,并探讨将其引入到我国疫苗相关不良反应报告体系中的可行性,这将为未来我国上市疫苗安全监督体制的完善及后续科研分析带来极大的促进作用。     

冠心病介入术后临床随访体系的构建及应用

??????? 目的 构建冠心病介入术后临床随访体系。方法 通过组建结构合理的随访队伍、构建随访中心信息数字化平台等收集整理、建立健全经皮冠状动脉介入术后患者的随访档案,并进行术后随访。结果 成功建立了运用中心医疗数字化平台、影像数据收集与分析系统和介入治疗管理系统相结合的冠心病介入术后临床随访体系。结论 构建信息数字化平台与患者临床随访管理相结合的随访体系对于提高临床诊治水平和临床医学研究的内涵建设具有十分重要的意义。     

检验全流程数字化管理及质量控制体系的构建

通过对检验工作各环节流程、质控情况的分析,制定了新的检验业务管理及质量控制流程,并利用数字化技术对流程各环节进行系统实现。检验全流程数字化管理及质量控制体系的构建,有效提高了检验工作的效率与质量安全,进一步促进了医院医疗质量管理水平的提高。     

植物多基因干扰载体体系构建与效用分析

多数重要的功能基因属于多基因家族,这些家族成员间存在功能冗余,高效的多基因干扰体系对研究多基因家族成员的生物学功能及其分子调控机制具有重要意义。对pCAMBIA1301载体改造,构建了适用于植物的多基因干扰体系pCAMBIA1301m和pCAMBIA1301s。使用该多基因干扰体系构建了四基因的干扰载体pCAMBIA1301m：35S∷SlPP2C1-2-3-4,4个目标基因为来源于番茄PP2C家族A组的PP2C1、PP2C2、PP2C3和PP2C4,并通过遗传转化导入番茄,用GUS染色和PCR检测转基因阳性植株,再利用RT-qPCR技术检测T₁和T₂代转基因植株中目标基因的干扰效率,用T₂代种子分析转基因番茄对ABA敏感性。结果表明,应用该干扰体系成功获得了四基因干扰的转基因植株35S∷SlPP2C1-2-3-4。在转基因番茄中4个目标基因的表达量显著低于野生型,其干扰效率均高于70%,转基因番茄种子萌发具有强烈的ABA不敏感性。多基因干扰体系能高效地同时沉默多个目标基因。     

imzML--a common data format for the flexible exchange and processing of mass spectrometry imaging data

The application of mass spectrometry imaging (MS imaging) is rapidly growing with a constantly increasing number of different instrumental systems and software tools. The data format imzML was developed to allow the flexible and efficient exchange of MS imaging data between different instruments and data analysis software. imzML data is divided in two files which are linked by a universally unique identifier (UUID). Experimental details are stored in an XML file which is based on the HUPO-PSI format mzML. Information is provided in the form of a 'controlled vocabulary' (CV) in order to unequivocally describe the parameters and to avoid redundancy in nomenclature. Mass spectral data are stored in a binary file in order to allow efficient storage. imzML is supported by a growing number of software tools. Users will be no longer limited to proprietary software, but are able to use the processing software best suited for a specific question or application. MS imaging data from different instruments can be converted to imzML and displayed with identical parameters in one software package for easier comparison. All technical details necessary to implement imzML and additional background information is available at www.imzml.org.     

Integration of data from remote monitoring systems and programmers into the hospital electronic health record system based on international standards

Remote follow-up of implanted ICDs may offer a solution to the problem of overcrowded outpatient clinics. All major device companies have developed a remote follow-up solution. Data obtained from the remote follow-up systems are stored in a central database system, operated and owned by the device company and accessible for the physician or technician. However, the problem now arises that part of the patient's clinical information is stored in the local electronic health record (EHR) system in the hospital, while another part is only available in the remote monitoring database. This may potentially result in patient safety issues. Ideally all information should become available in the EHR system. IHE (Integrating the Healthcare Enterprise) is an initiative to improve the way computer systems in healthcare share information. To address the requirement of integrating remote monitoring data in the local EHR, the IHE Implantable Device Cardiac Observation (IDCO) profile has been developed. In our hospital, we have implemented the IHE IDCO profile to import data from the remote databases from two device vendors into the departmental Cardiology Information System. Data are exchanged via an HL7/XML communication protocol, as defined in the IHE IDCO profile.     

基于本体论的植物遗传资源数据整合研究

随着现代生物学的发展,全球范围内建立了大量的生物学数据共享中心,同时,在生物学发展的带动下,植物遗传资源数据变得更为复杂、异构化和海量。本文在分析国内外几大著名的数据整合共享中心的基础上,简要介绍了本体论的概念及其在生物学领域中的研究现状,提出了基于生物本体论将植物遗传数据、数据挖掘工具、科技文献和科技交流进行整合的设想,并对数据整合需要考虑的几个问题进行了讨论。     

建立住院医师规范化培训管理体系的探索

住院医师规范化培训是医学生向医生转变的必修科目,也是住院医师向高层次医师迈进的必由之路,对于提高住院医师临床技能及完善医疗水平极为重要。目前,我国住院医师规范化培训存在很多弊端,相关管理体系缺乏统一、完善的评价标准。因此,建立一个完善的住院医师规范化培训管理体系是我们应该重视的问题。本文结合医院临床教学实习所积累的经验,并学习借鉴发达国家及地区对住院医师规范化培训管理制度的优点与长处,探索建立住院医师规范化培训管理体系的新方法,旨在促进住院医师规范化培训工作的持续发展。     

信息管理系统对医院药品管理规范化的作用及意义

目的：评价血清中甲状腺特异性抗体的存在对乳腺癌患病风险的影响,为评估乳腺癌的预后及制定治疗方案提供理论依据。方法：计算机检索Medline（1950~2012）、EMBASE（1949~2012）、Pubmed（1946~2012）、Current Contents Connect（1998~2012）和Google Scholar（1992~2012）等英文数据库。收集关于甲状腺特异性抗体与乳腺癌（Breast Cancer, BC）相关性分析的横断面研究或队列研究。按Cochrane 系统评价方法,评价所纳入研究的文献质量,有效数据采用RevMan5.2 软件进行系统评价。结果：最终纳入6 项研究,共计6945 例患者。系统评价结果显示：乳腺癌的风险会随血清中甲状腺特异性抗体（包括甲状腺过氧化物酶抗体anti-TPO 和甲状腺球蛋白抗体anti-TG）的存在而增加（anti-TPO OR 2.51,95%CI： 1.94-3.25;anti-TG 2.67, 95%CI： 1.65-4.33）。结论：乳腺癌的风险会随血清中甲状腺特异性抗体的存在而增加,甲状腺特异性抗体可能为乳腺癌预后的评估以及治疗原则的制定提供理论基础。     

信息管理系统对医院药品管理规范化的作用及意义

目的:目前医院信息系统在全国多家医院得到普遍使用,它不仅能提高医务工作人员的工作质量和效率,提高医疗水平,还能促进医院药品管理的规范化,在医院管理中发挥着巨大的作用。本文主要探讨医院管理信息系统对药剂管理规范化的作用及意义,为医院药品管理提供可借鉴的方法。方法:利用医院管理信息系统对我院药品的采购、领用、划价、销售及盘点等进行规范。观察并比较该系统实施前后,发药速度、划价标准、药品管理、盘点效率等方面的变化情况。结果:实行信息管理后,药物发放时间和盘点时间明显缩短,药物划价的准确性显著提高,药品浪费及采购不及时的情况明显减少,特殊药品管理和监督的力度显著加强。结论:医院管理信息系统在药剂管理方面起到了规范的作用,缩短了工作流程,提高了工作效率,减少了医患纠纷,能够促进医院的整体现代化建设,是医院药品管理规范化的有效方法。     

生物数据标准化研究进展

随着生物测序技术的快速发展,积累了海量的生物数据。生物数据资源作为生物分析研究及应用的核心和源头,为保证数据的正确性、可用性和安全性,对生物数据资源进行标准化的管理非常重要和迫切。本文综述了目前国内外生物数据标准化研制进展,目前国内外对生物数据缺少一个总体的规划,生物数据语义存在大量的不兼容性,数据格式多种多样,在生物数据收集、处理、存储和共享等方面缺乏统一的标准。国内外生物数据标准化处于起步阶段,但各国生物专家都在努力进行标准研制工作。文章最后从生物数据术语、生物数据资源收集、处理和交换、存储、生物数据库建设和生物数据伦理规范等方面出发,对标准研制工作进行一一探讨,期望能为生物数据标准制定提供一定的参考和依据。     

Towards a global terrestrial species monitoring program

The Convention on Biological Diversity's strategic plan lays out five goals: “(A) address the underlying causes of biodiversity loss by mainstreaming biodiversity across government and society; (B) reduce the direct pressures on biodiversity and promote sustainable use; (C) improve the status of biodiversity by safeguarding ecosystems, species and genetic diversity; (D) enhance the benefits to all from biodiversity and ecosystem services; (E) enhance implementation through participatory planning, knowledge management and capacity building.” To meet and inform on the progress towards these goals, a globally coordinated approach is needed for biodiversity monitoring that is linked to environmental data and covers all biogeographic regions. During a series of workshops and expert discussions, we identified nine requirements that we believe are necessary for developing and implementing such a global terrestrial species monitoring program. The program needs to design and implement an integrated information chain from monitoring to policy reporting, to create and implement minimal data standards and common monitoring protocols to be able to inform Essential Biodiversity Variables (EBVs), and to develop and optimize semantics and ontologies for data interoperability and modelling. In order to achieve this, the program needs to coordinate diverse but complementary local nodes and partnerships. In addition, capacities need to be built for technical tasks, and new monitoring technologies need to be integrated. Finally, a global monitoring program needs to facilitate and secure funding for the collection of long-term data and to detect and fill gaps in under-observed regions and taxa. The accomplishment of these nine requirements is essential in order to ensure data is comprehensive, to develop robust models, and to monitor biodiversity trends over large scales. A global terrestrial species monitoring program will enable researchers and policymakers to better understand the status and trends of biodiversity.