美国家人类基因组研究所将18种生物列为测序对象

Science News2004年166卷7期109页报道：美国马里兰州贝塞斯达市美国国家人类基因组研究所（NHGRI）的生物学家Adam Felsenfeld最近宣称NHGRI已从整个“生命树”的各个支干的种系中精选出了18种有代表性的生物,作为今后基因组测序的重点对象。     

科学家完成12种果蝇基因组对比研究“壮举”其中10种是首次测序；研究发现新基因和进化痕迹

要详尽刻画一种生物模型的特征,需要多少个基因组序列?对果蝇而言,一打可能是不错的开始。由美国国立人类基因组研究所(NHGRI)资助的一个国际科研组织11月8日宣布,他们完成了12种“近亲”果蝇的基因组对比研究工作,其中有10种果蝇的基因组是首次测序。对比分析确定出了数千个新     

DNA 测序技术领域的相关政府投入分析

DNA测序技术是遗传工程的核心技术之一,发展快速和低成本的基因测序技术成为研究焦点。美国、欧盟等发达国家和地区大力支持DNA测序技术的创新研究,并投入了大量的科研经费。在美国,国家卫生研究院(NIH)下属的国家人类基因组研究院(NHGRI)、美国能源部(DOE)以及美国科学基金委(NSF)等机构是进行DNA测序技术相关项目经费分配的主要政府部门。DNA测序作为生命科学研究的关键技术也是欧盟框架计划资助的重要内容之一,其以多个欧洲国家间合作以及产学研合作的形式开展。中国在DNA测序技术领域也开展了一些研究。     

美国启动大规模探索癌细胞基因组变化的研究

美国国立卫生研究院（NIH）旗下的国立癌症研究所（NCI）和国立人类基因组研究所（NHGRI）于2005年12月宣布，他们启动了一项应用基因组分析技术、特别是大规模基因组测序技术、旨在加速对癌细胞在分子水平上理解的综合性的研究计划。     

美国绘出玉米基因组草图

美国圣路易斯华盛顿大学基因组测序中心近日宣布,他们成功测序得出了玉米基因组草图,这是人类成功测序的第二种农作物基因组,第一种被测序的农作物是水稻。测序项目负责人理查德·威尔逊在“玉米遗传学会议”第50次年会上公布了玉米基因组草图。     

美国能源部资助的微生物基因组研究概况

自 1 995年 1 2月完成第一个微生物 (流感嗜血杆菌 )全基因组测序以来[1] ,微生物基因组学策略和技术提高很快 ,促进了其他生命形式 (包括人类 )的基因组学发展 ,开创了生物基因组计划新时代[2 ] 。短短几年内 ,互联网数据库中各种生物基因组数据迅速增长。 1 998年 2月 2 0日美国Ｓｃｉｅｎｃｅ杂志评选的当年世界十大科技进展 ,将微生物基因组图谱的构建列为其中第六项 ,同年 3月 2 7日Ｓｃｉｅｎｃｅ杂志编者指出 :生物基因组革命可以同工业革命和计算机革命所带来的变化相比 ,是“第三次技术革命”[3 ] 。微生物全基因组测序 ,不仅是人…     

欧洲人类基因组研究项目介绍

欧洲的科学家对美国在人类基因组研究领域持领先地位既羡慕又不甘落后。1991年春天,欧洲科学院(Academia Europaea,于1988年正式成立)应欧洲科学部长会议(European Science Ministers Conference)要求,向欧洲共同体提交了一份“欧洲人类基因组研究计划”的报告。1991年9月18日～21日,欧洲科学院在德国海德堡召开第三届年会,欧洲人类基因组研究计划成为会议重点议题之一。     

美国生物技术产生的崛起

作为现代生物技术的发源地,美国现代生物产业位于世界领先地位。全球上市的生物技术公司有55％来自美国,他们在全球该产业的税收总额中占72％,同时拥有70％的研究费用。由于美国对生物技术研发投入大,在多个领域取得重要进展:人类全基因组测序提前两年完成;找到了干细胞的许多新来源,成人干细胞呈现了更大潜力;生物信息技术促进了生物和信     

中国人类基因组研究走向"主战场"

新华网报道 :从基因测序到疾病相关基因 ,从基因工程药物到基因治疗…… ,随着经济实力的不断增长和科研水平的逐渐提高 ,近年来 ,在测序领域跻身国际一流的中国人类基因组研究正逐渐走向经济建设主战场 ,积极推动基因工程产业化。著名生物学家、国家“86 3”计划生物领域专家委员会委员强伯勤院士说 ,我国近年基因组研究引人瞩目 ,继与国际同步完成人类基因组“工作框架图”后 ,我国日前绘制出了完成图 ;参加国际合作的水稻基因组的测序工作进展顺利 ,痢疾杆菌、钩端螺旋体、嗜热菌等微生物基因组研究取得突破 ,形成了包括国家人类基因组南…     

美科学家绘出玉米基因组草图

美国科学家2月28日在华盛顿宣布．他们成功测序得出了玉米基因组的草图,这是人类成功测序的第2种农作物基因组,第1种被测序的农作物是水稻。     

序言

正20世纪90年代以来,人类基因组测序推动了世界基因组研究的大潮。过去20年中,大量生物完成了基因组测序。1997年国际水稻基因组测序计划(IRGSP)启动,2005年粳稻品种"日本晴"全基因组序列在Nature杂志上发表。多种生物全基因组序列的获得在给研究工作提供极大方便的同时,也给生命科学研究提出了巨大的挑战。其中一个最主要的挑战是如何确定DNA序列的功能。"功能基因     

利用de novo组装策略解析猪的基因组变异

正猪(Sus scrofa)是人类最早驯化的动物之一,在农业生产和生物医学研究中具有重要价值。据统计,目前全球约有730多个品种,其中约2/3分布在中国和欧洲。国际家猪基因组测序协作组于2012年完成了欧洲家猪——杜洛克猪(Duroc)的全基因组序列,为后续的遗传变异检测、种群进化与选择性分析等相关研究提供了宝贵的基础资源。目前,大量非模式生物的参考基因组序列往往是不完整的,不能准确涵盖该物种的全部遗传信息,     

第七届国际人类基因组大会在沪召开

国际人类基因组组织是一家独立的非赢利机构 ,迄今已有逾十年的历史了 ,国际人类基因组大会是该组织举办的全球性重要会议。 2 0 0 2年 4月 14～ 17日 ,第七届国际人类基因组大会 (ＨＧＭ 2 0 0 2 )在上海国际会议中心隆重举行。来自国内的代表 45 0人和来自国外的代表 75 0人参加了盛会。国际人类基因组组织主席Ｌａｐ -ＣｈｅｅＴｓｕｉ和本地大会主席陈竺、强伯勤等主持了会议。大会就人类基因组研究问题举行了几十场专题演讲 ,其中包括 :单核苷酸多态性图谱的医疗应用 (美国Ｐｕｉ-ＹａｎＫｗｏｋ) ;国际人类基因组测序项目和比较基因组…     

白花刺续断野生居群的叶绿体全基因组特征解析

白花刺续断在中国西藏是一种常用的药用植物,但其叶绿体全基因组的相关研究较少。为揭示该物种叶绿体全基因组的基本特征并探讨其谱系遗传结构,该研究利用Illumina测序平台对来自5个野生居群的10个白花刺续断个体进行二代测序,经组装、注释,得到10条完整的叶绿体全基因组序列,并对它们的基因组特征和居群间的谱系进化关系进行了初步研究。结果表明：(1)白花刺续断的叶绿体全基因组大小为155 335～156 266 bp,共注释113个基因,包括72个蛋白编码基因、30个tRNA基因和4个rRNA基因,其叶绿体基因组的大小、结构、GC含量及基因组成等方面在种内高度保守。(2)基因组比较分析表明,白花刺续断变异较大的片段均位于单拷贝区,且IR边界未出现明显的扩张和收缩。(3)群体遗传分析发现,白花刺续断的野生居群具有明显的地理遗传结构,不同居群间在遗传距离与地理距离上具有一定的相关性。研究认为,白花刺续断叶绿体基因组在种内居群水平上比较保守,且叶绿体基因组可在居群水平上揭示物种的地理遗传结构。这为后续开展刺续断属物种群体遗传学和系统发育基因组学研究奠定了基础。     

科学家完成金小蜂基因组测序

<正>近日,美国罗切斯特大学生物学教授John H.Werren和贝勒医学院基因组测序中心的Stephen Richards领导完成了3种寄生性金小蜂(Nasonia vitripennis,N.giraulti和N.longicornis)的基因组测序。这一成果揭示     

人类基因组学的新战略：全基因组随机测序

人类基因组学的新战略：全基因组随机测序吴家睿（中国科学院上海生物化学研究所,上海２０００３１）关键词人类基因组ＤＮＡ测序遗传图谱物理图谱人类基因组计划（ＨＧＰ）的战略构想是,以“作图”（Ｍａｐｐｉｎｇ）为测序的基础。也就是说,首先将人类的整个基因组一...     

ENCODE计划和功能基因组研究

人类基因组计划完成以来,科学家们一直在努力阐释基因组信息所代表的生物学意义。自2003年开始,美国国家人类基因组研究所(National Human Genome Research Institute,NHGRI)投资近3亿美元启动"DNA元件百科全书(Encyclopedia of DNA Elements,ENCODE)"计划,集结了来自美国、中国、英国、日本、西班牙和新加坡等国家的32个实验室的440余名科学家,共同鉴定并分析人类基因组中所有的功能调控元件。高通量测序技术等实验手段的发展和生物信息学技术的不断完善使得ENCODE计划取得了丰硕的成果:确定了甲基化和组蛋白修饰等表观修饰区域及其对染色质结构的作用,进而确定染色质结构的改变影响基因表达;确定了转录因子及其结合位点的信息,并构建了转录因子调控网络;进一步修订更新了假基因和非编码RNA数据库;并确定了调控序列的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)并与疾病相关联。这些发现一方面有助于系统解析基因和基因组信息、调控元件的调控作用以及非编码区转录调控等分子机制;同时也将为转化医学等生命科学研究领域提供丰富的数据来源。文章综述了高通量测序技术等实验手段的发展和生物信息学技术的不断完善对ENCODE计划的贡献、表观遗传学研究与ENCODE计划的关联性、ENCODE计划的主要科学成果等,同时展望了ENCODE计划对基础医学、临床医学和转化医学等生命科学研究领域的巨大推动作用。     

单细胞自由生物基因组全序列的测定和比较基因组研究

近几年来五种单细胞生物的基因组计划得以完成。本文介绍了从五种生物的全基因组序列获得的一些成果,包括全基因组鸟枪法测序、基因组分析和新比较基因组等三个方面,并对生物基因组计划的研究方法作一些探讨。     

单细胞自由生物基因组全序列的测定和比较基因组研究

近几年来五种单细胞生物的基因组计划得以完成。本文介绍了从五种生物的全基因组序列获得的一些成果,包括全基因组鸟枪法测序、基因组分析和新比较基因组等三个方面,并对生物基因组计划的研究方法作一些探讨。     

华大基因六周年

从1%人类基因组测序到水稻、家蚕基因组测序,从10%人类HapMap项目中国部分到家鸡单体型图,华大基因研究中心完成了一系列一流的科研工作,为中国科技界争得了荣誉。一流的技术水平先进的核酸分析平台:拥有ABI3730xl,ABI377,MegaBACE等先进的测序仪共112台,日产可达5千万高质量碱基,单碱基正确率大于99%。拥有SEQUENOM,Illumina等先进的基因分型仪器。强大的生物信息分析平台:拥有IBM,SUN,SGI,曙光等7台超级计算机,近百名经验丰富的专业人才。成熟的实验和分析流程:拥有经过大型项目锤炼的基因组测序,基因表达分析,基因分型,基因…