用单细胞凝胶电泳技术检测粉纹夜蛾5BI细胞DNA损伤的研究

为了探测昆虫细胞的DNA损伤,本实验应用单细胞凝胶电泳技术,对不同剂量的过氧化氢和甲醛引起的粉纹夜蛾5BI细胞DNA损伤效应进行了研究,结果表明59μM=10μM、150μM的过氧化氢能引起粉纹夜蛾5BI细胞的DNA断裂,且断裂程度和浓度水平之间成正相关关系;10μM、30μM、50μM的甲醛能引起粉纹夜蛾5BI细胞DNA损伤,其中在10μM时引起DNA断裂,在30μM、50μM时引起DNA交联。     

体外证据不支持5-氮胞苷诱导骨髓基质细胞向心肌细胞分化

目的探讨胞嘧啶类化学物质5-氮胞苷是否可诱导体外培养的骨髓基质细胞 (marrow stromal cells, MSCs)向心肌细胞分化.方法用不同浓度(3, 5, 10 μmol/L)的5-氮胞苷以各种方法(一次处理与反复处理)诱导原代及传代MSCs.采用免疫荧光及Western Blot技术检测心肌特异性肌球蛋白重链 (myosin heavy chain α/β, MHCα/β)及肌钙蛋白I(troponin I, Tn I)的表达;并用心室肌特异性肌球蛋白轻链(ventricular myosin light chain 2, MLC2v)启动子(250 bp)控制的增强型蓝绿色荧光蛋白(enhanced cyan fluorescent protein, ECFP)报告基因表达技术检测被诱导MSCs是否发生MLC2v的转录启动.上述检测技术的特异性和可靠性用培养的心肌细胞进行验证.结果在本试验最长观察时间内(30 d),各种浓度及各种方法5-氮胞苷诱导的MSCs培养物中未见细胞自发搏动、肌管形成、心肌特异性MHC和Tn I表达;亦无MLC2v转录启动阳性细胞出现.结论从转录启动到翻译后水平的证据均不支持体外5-氮胞苷处理可诱导MSCs表达心肌特异性蛋白.     

5- 脱氧杂氮胞苷对人肝癌细胞HepG2 增殖及beclin1 表达的影响

目的:观察5-脱氧杂氮胞苷(5-aza-CdR)对HepG2细胞生长抑制及beclin1表达的影响,以探讨其抗肿瘤发生的潜在机制。方法:采用四甲基偶氮唑盐(MTT)法检测5-aza-CdR对HepG2细胞的生长抑制;用相差显微镜观察不同药物浓度下不同时间段的肝癌细胞形态学改变;采用RT-PCR法和Western blot法检测5-Aza-CdR对抑癌基因beclin1的mRNA和蛋白表达的影响。结果:5-aza-CdR可抑制HepG2细胞生长,呈剂量依赖性,并上调beclin1的mRNA和蛋白的表达。结果:显示102.4umol/L5-aza-C-dR作用72小时细胞增殖抑制率最高,可达(84.3±3.31)%,beclin1的mRNA和蛋白表达上调最明显,与对照组相比差异有统计学意义。结论:5-aza-CdR可抑制HepG2细胞增殖,其机制可能是通过恢复某些抑癌基因的表达,上调beclin1的mRNA和蛋白表达。     

5-氮杂胞苷对T淋巴细胞Jurkat miR-126及IFN-γ、GATA3、ROR-γ、Foxp3表达的影响

目的:探究甲基化酶抑制剂5-氮杂胞苷(5-azacytidin,5-aza)对T淋巴细胞(Jurkat)mi R-126、Th1/Th2、Th17/Treg细胞亚群及因子IFN-γ、GATA3、ROR-γ和Foxp3的调控作用。方法:采用不同浓度5-aza干预T淋巴细胞,24 h、48 h后检测其对细胞增殖抑制作用;实时荧光定量PCR、Western Blot检测5-aza干预后mi R-126表达水平以及IFN-γ、GATA3、ROR-γ和Foxp3的m RNA及蛋白表达水平;流式细胞术检测5-aza干预后Th1/Th2、Th17/Treg细胞亚群分化比例。结果:甲基化酶抑制剂干预T淋巴细胞后,细胞抑制率随5-aza浓度增大及作用时间延长呈递增趋势(P<0.01);细胞抑制率在24 h、48 h,低、中、高浓度下分别为(14.73±0.93)%、(32.67±8.40)%、(60.87±5.78)%以及(18.98±0.73)%、(39.80±8.42)%、(64.11±6.04)%;抑制率在24 h与48 h之间无差异(P>0.05)。甲基化酶抑制剂干预后mi R-126表达降低(P<0.01);IFN-γ蛋白表达降低(P<0.05)、Th1细胞亚群数目降低(P<0.01);GATA3 m RNA和蛋白表达升高(P<0.05)、Th2细胞亚群数目增加(P<0.01);ROR-γ蛋白表达降低(P>0.05)、Th17细胞亚群数目降低(P<0.05);Foxp3 m RNA和蛋白表达升高(P>0.05)、Treg细胞亚群数目增加(P<0.05)。结论:甲基化酶抑制剂可以下调Jurkat细胞mi R-126基因表达;下调Th1、Th17细胞亚群分化,上调Th2、Treg细胞亚群分化;调控细胞因子IFN-γ、GATA3、ROR-γ和Foxp3的表达。     

不同浓度的5-氮杂胞苷对RPMI 8226细胞系的诱导凋亡作用分析

目的:探讨不同浓度的5-氮杂胞苷对RPMI 8226细胞系的诱导凋亡作用.方法:对RPMI 8226细胞系采用5-氮杂胞苷0μmol/L、2μmol/L、5μmol/L、10 μrnol/L、20 μmol/L、50 μmol/L处理24 h、48 h、72 h,并对RPMI 8226细胞系处理后进行刮痕实验,12h后对细胞迁移进行比较.结果:在作用24h、48h时,随着作用浓度的增加,RPMI-8226细胞的抑制率出现明显的增加,但在作用72 h时,我们发现10 μmol/L、20μmol/L、50μnol/L其对RPMI-8226细胞的抑制效果无明显的差异性;刮痕实验后12h后其出现差异性,其中药物浓度越大其对RPMI-8226细胞的运动迁移能力越弱.结论:DNA甲基化转移酶抑制剂5-氮杂胞苷可对RPMI-8226细胞的凋亡具有良好的诱导效果,同时可抑制RPMI-8226细胞的增殖以及迁移.     

莠去津慢性染毒对河蟹血淋巴细胞DNA的影响

利用不同浓度(0.01、0.1、1mg·L-1)的莠去津对河蟹进行慢性染毒处理90d,采用单细胞凝胶电泳技术检测其对河蟹血淋巴细胞DNA损伤的影响。结果表明,不同浓度的莠去津能引起河蟹血淋巴细胞的DNA损伤,且随着浓度的增加,TM值、TailDNA逐渐变大,尤以1mg·L-1浓度组最为显著。证明一定浓度的莠去津可以造成河蟹血淋巴细胞DNA链的断裂,破坏其DNA结构。     

三种小型猪线粒体DNA控制区的比较研究

目的分析五指山小型猪、巴马小型猪和贵州香猪线粒体DNA控制区碱基序列,比较研究不同猪种的遗传标志。方法应用PCR技术分别对这三种小型猪的血液总DNA样品中线粒体DNA D-loop区进行扩增,测序比对。结果猪的线粒体DNA D-loop区分3个区域。Ⅰ区（靠近5′端区域）704 bp,五指山小型猪在此区共有6个变异位点,通过6个变异位点中归纳出3个单倍体,而巴马小型猪在此区有9个变异位点,通过9个变异位点归纳出4个单倍体,贵州香猪在此区共有6个变异位点,通过6个变异位点归纳出3个单倍体。     

三种小型猪线粒体DNA控制区的比较研究

目的分析五指山小型猪、巴马小型猪和贵州香猪线粒体DNA控制区碱基序列,比较研究不同猪种的遗传标志。方法应用PCR技术分别对这三种小型猪的血液总DNA样品中线粒体DNA D-loop区进行扩增,测序比对。结果猪的线粒体DNA D-loop区分三个区域。I区（靠近5’端区域）704bp,五指山小型猪在此区共有6个变异位点,通过6个变异位点中归纳出3个单倍体,而巴马小型猪在此区有9个变异位点,通过9个变异位点归纳出4个单倍体,贵州香猪在此区共有6个变异位点,通过6个变异位点归纳出3个单倍体。Ⅱ区（串联重复序列区）,五指山小型猪、巴马小型猪和贵州香猪序列相同。Ⅲ区（靠近3’端区域）三种小型猪的序列几乎相同。结论五指山小型猪、巴马小型猪和贵州香猪三种小型猪之间线粒体DNA碱基序列变异位点较少,五指山小型猪和巴马小型猪亲缘关系较近。     

固定化尿苷-胞苷激酶和聚磷酸激酶偶联催化制备5′-胞苷酸

尿苷-胞苷激酶作为生物体核苷酸代谢补偿途径中的重要催化剂,可以催化胞苷的磷酸化反应合成5′-胞苷酸(简称胞苷酸),但需要NTP作为磷酸供体。为了提高胞苷酸的生产效率,文中首先使用大肠杆菌分别异源表达来源于嗜热栖热菌Thermus thermophiles HB8的尿苷-胞苷激酶和来源于类球红细菌Rhodobacter sphaeroides的聚磷酸激酶,其中尿苷-胞苷激酶用于催化胞苷和ATP形成胞苷酸,聚磷酸激酶则用于ATP的循环再生。然后,使用D403金属螯合树脂吸附Ni²⁺形成固定化载体,再利用固定化载体特异性吸附重组酶形成固定化酶。最后,单因素优化实验确定固定化酶的催化反应条件,在30℃、pH 8.0的条件下,以60 mmol/L胞苷和0.5 mmol/L ATP为底物,可实现5批次的高效连续催化反应,胞苷酸平均摩尔得率达到91.2%。上述制备方法反应成本低,产物得率高,酶利用率高,在工业生产中具有较好的应用潜力。     

5-氮胞苷对转化后间充质干细胞增殖、衰老及p16~(INK4a)表达的影响

目的观察5-氮胞苷对体外自发转化的间充质干细胞增殖、衰老及p16INK4a基因表达的影响。方法采用细胞计数、SA-β-gal染色、Western Blot和重硫酸盐修饰后测序(BSP)检测体外自发转化的大鼠间充质干细胞在不同浓度5-氮胞苷处理后增殖、衰老、p16INK4a表达及p16INK4a基因启动子区CpG岛甲基化水平的变化。结果细胞计数显示5-氮胞苷可剂量依赖性地抑制转化后间充质干细胞的增殖,但增殖受抑的细胞SA-β-gal染色仍呈阴性。BSP及Western Blot分析显示:转化后间充质干细胞p16INK4a基因启动子区CpG岛呈现高水平甲基化(87.30±2.39%)。5-氮胞苷可在一定程度上降低该基因的甲基化,使p16INK4a表达得以部分恢复;但即使是高浓度高达100μmol/L,5-氮胞苷也只能使p16INK4a基因甲基化降低到46.20±1.65%。结论 5-氮胞苷可显著抑制转化后间充质干细胞的增殖,但并不能促使这些细胞重新恢复衰老状态;其原因是5-氮胞苷单独作用不足以完全解除p16INK4a基因启动子区DNA的高甲基化。     

西双版纳小耳猪DNA指纹分析

采用ECL核酸直接标记和检测试剂盒,以HRP标记JL-02多位点探针,对云南版纳小耳猪的HinfI或HaeⅢ酶切图谱进行Southern杂交,以化学发光法进行检测,获得了清晰可辨的、具有高度多态性的DNA指纹图谱.大于2kb的谱带数在13～17条之间,JB亚系内805、807家系和JS亚系内111、121、133、151家系不同个体间的相似系数分别为0.92±0.04、0.85±0.13、0.86±0.02、0.80±0.05、0.84±0.09、0.88士0.08,显著高于家系间的相似系数.JB亚系内的805家系和JS亚系内的151家系不同个体间的相似系数最大,分别为0.92和0.88,说明其近交程度较高,个体间差异较小,均一性较强.另外,JB亚系内的805与807两个家系不同个体猪在11.5kb处,均有一条区别于其他家系的特有图带,其是否是导致JB亚系体型较大的特异性基因座,有待进一步研究。 Abstract:Clearly and highly polymorphic DNA fingerprints from Banna miniature pig were obtained by Southern hybridization with a nonisotopieally HRP(Horseradish peroxidase)labelled multiloci minisatellite probe JL-02,the fragment number of which were ranged from 13 to 17.The similarity coefficient of various individuals from family “805”,“807” in substrain JB and family “111”,“121”,“133”,“151” in substrain JS was 0.92 + 0.04,0.85 + 0.13,0.86 +- 0.02,0.80 +0.05,0.84 + 0.09,0.88 + 0.08,which is higher than that bet ween families(0.46~0.65).Furtherly,similarity coefficients of family “805” in substrain JB and family “151” in substrain JS were 0.92 and 0.88 respectively.This showed that the two families have the higher inbreeding degree,smaller genetic difference,among individuals and the better homogeneity.In addition,all individuals from family 805,807 in substrain JB have a unique fragment different from other individuals from other families,which is abount 11.5kb long.This suggested that this may be the gene resulted in large bodyweight of substrain JB,further research is necessary to be conducted.     

贵州小型猪主要病原微生物与寄生虫的控制

封闭群实验用贵州小型猪Sus scrofa domestica var. mino guizhounensis Yu是目前国内最主要的实验用小型猪种群之一(甘世祥, 1994).开展实验动物微生物与寄生虫的控制与监测,对保证实验动物和动物实验的质量和维护人类健康具有重要意义(孙靖,2005).本研究探索了环境消毒、体内外驱虫、疫苗接种等措施对贵州小型猪病原生物的携带和免疫状况的影响.     

贵州小型猪胃肠道正常菌群的初步检测

目的 检测成年贵州小型猪胃肠内容物和新鲜粪便中正常菌群数量,为相关动物实验提供正常参考值.方法 采用滴注接种法,在选择性培养基上需氧或厌氧培养后,定性定量检测胃肠各段菌群.结果 经检测,获得了成年贵州小型猪胃肠内容物及新鲜粪便中正常菌群的基本数据.结论 贵州小型猪胃肠道正常菌群数量是其相关基础研究和模型应用的重要参考值.     

调控DNA损伤修复基因的微小RNA

随着对DNA损伤修复基因研究的深入,其信号转导路径及调控网络也进一步明了,调控DNA损伤修复基因的微小RNA(miRNA)也越来越多地被认识和发现。简要综述了DNA损伤途径中调控主要的损伤修复基因的miRNA,有助于深入阐明DNA损伤修复机制,为开发抗辐射药物和临床上DNA损伤修复异常相关肿瘤的基因治疗提供新的靶点。     

Sirtuins家族在DNA损伤修复中的作用

Sirtuins家族蛋白是一类依赖NAD的去乙酰化酶,属于第Ш类去乙酰化酶(HDACs),哺乳动物Sirtuins家族成员共有7个(SIRT1-7),其主要具有去乙酰化酶的活性,可以使多种蛋白发生去乙酰化,进而参与DNA的损伤修复、基因的转录调控、细胞凋亡、代谢及衰老等诸多生物进程。本文主要对Sirtuins家族在DNA损伤修复中的作用及其相关机制进行阐述。     

Repair of DNA Damage Induced by Solar UV

Solar UV radiation induces significant levels of DNA damage in living things. This damage, if left unrepaired, is lethal in humans. Recent work has demonstrated that plants possess several repair pathways for UV-induced DNA damage, including pathways for the photoreactivation of both 6-4 products and cyclobutane pyrimidine dimers (CPDs), the two lesions most frequently induced by UV. Plants also possess the more general nucleotide excision repair (NER) pathway as well as bypass polymerases that enable the plant to replicate its DNA in the absence of DNA repair.This revised version was published online in October 2005 with corrections to the Cover Date.     

DNA Damage Checkpoint, Damage Repair, and Genome Stability

Genomic DNA is under constant attack from both endogenous and exogenous sources of DNA damaging agents. Without proper care, the ensuing DNA damages would lead to alteration of genomic structure thus affecting the faithful transmission of genetic information. During the process of evolution, organisms have acquired a series of mechanisms responding to and repairing DNA damage, thus assuring the maintenance of genome stability and faithful transmission of genetic information. DNA damage checkpoint is one such important mechanism by which, in the face of DNA damage, a cell can respond to amplified damage signals, either by actively halting the cell cycle until it ensures that critical processes such as DNA replication or mitosis are complete or by initiating apoptosis as a last resort. Over the last decade, complex hierarchical interactions between the key components like ATM/ATR in the checkpoint pathway and various other mediators, effectors including DNA damage repair proteins have begun to emerge. In the meantime, an intimate relationship between mechanisms of damage checkpoint pathway, DNA damage repair, and genome stability was also uncovered. Reviewed hereinare the recent findings on both the mechanisms of activation of checkpoint pathways and their coordination with DNA damage repair machinery as well as their effect on genomic integrity.     

DNA损伤检验点与损伤修复及基因组稳定性

生物有机体基因组DNA经常会受到内源或外源因素的影响而导致结构发生变化,产生损伤;在长期进化过程中,有机体也相应形成了一系列应对与修复损伤DNA,并维持染色体基因组正常结构功能的机制。其中DNA损伤检验点（DNA damage checkpoint）就是在感应DNA损伤的基础上,对损伤感应信号进行转导,或引起细胞周期的暂停,从而使细胞有足够的时间对损伤DNA进行修复,或最终导致细胞发生凋亡。DNA损伤检验点信号转导途径是一个高度保守的信号感应过程,整个途径大致可以分为损伤感应、信号传递及信号效应3个组成部分。其中3-磷脂酰肌醇激酶家族类成员ATM（ataxia-telangiectasia mutated）和ATR（ataxia-telangiectasia and Rad3-related）活性的增加构成整个途径活化的第一步。它们通过激活下游的效应激酶,Chk2／Chk1,通过协同作用许多其他调控细胞周期、DNA复制、DNA损伤修复及细胞凋亡等过程的蛋白质因子来实现细胞对DNA损伤的高度协调反应。近十几年,随着此领域研究的不断深入,人们逐步揭示了DNA损伤检验点途径发生过程中,各种核心组分通过与不同调节因子、效应因子及DNA损伤修复蛋白间的复杂相互作用,以实现监测感应异常DNA结构并实施相应反应的机制;其中,检验点衔接因子（mediators）及染色质结构,尤其是核小体组蛋白的共价修饰在调控ATM／ATR活性,促进ATM／ATR与底物间的相互作用以及介导DNA损伤位点周围染色质区域上多蛋白复合物在时间与空间上的动态形成发挥着重要的作用。同时,人们也开始发现DNA损伤检验点途径与DNA损伤修复、基因组稳定性以及肿瘤发生等过程之间某些内在的联系。该反应途径在通过协调细胞针对DNA损伤做出各种反应的基础上,直接或间接地参与或调控DNA损伤修复过程,并与DNA损伤修复途径协同作用最终保证染色体基凶组结构的完整性,而检验点途径的改变,则会引起基因组不稳定的发生,包括从突变频率的提高到大范围的染色体重排,以及染色体数量的畸变。如：突变发生在肿瘤形成早期,会大大增加肿瘤发生的几率。文章将对DNA损伤检验点途径机制及其对DNA损伤修复、基因组稳定性影响的最新进展进行综述。     

Sirtuin家族与DNA损伤修复

DNA损伤的发生与积累是造成细胞功能紊乱的根本原因,也是引起衰老与肿瘤等疾病发生的关键事件。为维持机体自身遗传物质的完整性与稳定性,生物体内拥有多种针对不同类型DNA损伤的修复方式。Sirtuin蛋白是一组NAD+依赖的、高度保守的组蛋白去乙酰化酶,可通过去乙酰化作用调节众多底物蛋白质的表达、活性与稳定性。 近来的研究显示,DNA损伤修复途径的多个关键蛋白质是Sirtuin的下游底物。Sirtuin蛋白通过调节同源重组修复、非同源末端修复、核苷酸切除修复等途径中的核心蛋白质参与修复包括双链断裂（double stranded breakes, DSBs）在内的多种DNA损伤类型,从而在维持基因组稳定性、寿命以及细胞能量代谢调节等一系列生物学作用中发挥至关重要的作用。本综述将介绍近年来Sirtuin与DNA损伤修复的研究进展。     

DNA损伤修复过程表观遗传学改变

多种化学、物理及生物因素可诱发细胞DNA损伤,损伤后DNA损伤位点被相关损伤感受器识别,激活相应的修复通路进行DNA修复。越来越多的证据表明DNA甲基化状态、蛋白翻译后修饰、染色质重塑、miRNA等修饰方式参与了DNA的损伤修复。文章通过不同损伤修复通路中这些修饰的特点,阐述表观遗传学改变在DNA损伤修复发展过程中的作用机制。