生赤壳科和丛赤壳科的中国新记录种*

本文报道了生赤壳科和丛赤壳科的中国新记录16个种,它们隶属于生赤壳属 (Bionectria)、丽赤壳属 (Calonectria)、赤壳属 (Cosmospora)、血赤壳属 (Haematonectria)、丛赤壳属 (Nectria)和拟赤壳属 (Nectriopsis),变更了一个种的名称。     

丛赤壳科4个中国新记录种

报道了采集于山东、河南、四川和云南的丛赤壳科4个中国新记录种：乌列沃光赤壳、假赤壳、瘤顶乳突赤壳和悬钩子乳突赤壳。对我国材料的宏观和微观特征进行了详细描述和图示,并与上述种的原始描述以及ITS和28S rDNA序列进行了比较。     

丛赤壳科5个中国新记录种

对采自安徽、河南、湖北、云南和西藏等地的丛赤壳科标本进行系统分类研究,综合形态解剖、培养性状、DNA序列和无性阶段特征,报道5个中国新记录种：肯达拉赤壳Cosmospora khandalensis,翠绿赤壳C. viridescens,剑孢新赤壳Neocosmospora protoensiformis,罗杰森假赤壳Pseudocosmospora rogersonii和瘤顶赤壳Tumenectria laetidisca,对它们的宏微观特征和菌落形态进行了描述及图示。     

丛赤壳科3个中国新记录种（英文）

对来自黑龙江、安徽和湖北的部分丛赤壳科真菌进行单孢分离和系统分类研究,将形态解剖、培养性状和DNA序列分析等相结合进行研究,发现3个中国新记录种:新大孢新丛赤壳Neonectria neomacrospora、平截乳突赤壳Thelonectria truncata和周刺座霉Volutella ciliata,对它们的宏观和微观特征进行了详细描述及图示。     

子囊具四个孢子的皱赤壳属一新种

描述了分布于中国热带、亚热带地区的丛赤壳科皱赤壳属Rugonectria一新种。对中国材料进行形态学和DNA序列分析相结合的研究表明,它们与日本报道的栗生皱赤壳R. castaneicola较为接近,但存在形态学和DNA序列上的明显差异,代表该属一个新种。     

丛赤壳类真菌8个新组合（英文）

按现行的国际命名法规和肉座菌目名称提案委员会对属名的处理建议,对生赤壳科和丛赤壳科4个属中8个种的名称进行了命名上的订正,建立8个新组合:蜜黄枝穗霉Clonostachys mellea、平截枝穗霉C.truncata、囊胞枝穗霉C.vesiculosa、竹镰孢菌Fusarium bambusae、庐山新赤壳Neocosmospora lushanensis、平铺假赤壳Pseudocosmospora effusa、河南假赤壳P.henanensis和炭团假赤壳P.nummulariae。     

杆孢赤壳属一新组合(英文)

长期以来,杆孢赤壳属被视为丛赤壳属的异名,最近才恢复其属级分类地位。臧氏丛赤壳在形态特征上与杆孢赤壳属的模式种Allantonectria miltina很相似,在子囊壳解剖结构、近圆柱形至柱棒状子囊、腊肠形子囊孢子等方面均表现出共性。二者间形态相似性得到了6个基因序列分析的支持,因而将臧氏丛赤壳转入杆孢赤壳属,建立新组合臧氏杆孢赤壳。     

COI基因作为丛赤壳科真菌DNA条形码的测试

以丛赤壳科33种76个菌株为材料,探讨COI基因作为该科DNA条形码的可能性。结果表明,该DNA片段存在较多内含子,为了获取某些种的短片段,需设计许多引物,PCR扩增与测序成功率低,难以达到便捷、快速的物种鉴定的目的。因此,COI不宜作为丛赤壳科的DNA条形码。对已获得的少数片段进行分析表明,该基因对丛赤壳科部分种具有较强的物种鉴别力。     

丛赤壳科部分属之间的系统学关系

对nrDNA大亚基部分序列进行序列分析,探讨丛赤壳科11个属的属间关系。研究结果表明,Cosmospora不是单起源,它的成员分别与Nectria,Haematonectria以及Neocosmospora3个不同的属聚类在一起;Haematonectria和Neocosmospora的亲缘关系最接近;Lanatonectria为一个独立的属;以Neonectriadiscophoravar.discophora为代表的Neonectria是一个可靠的属。     

中国单囊壳属分类的研究III．锦葵科和虎耳草科上的新种和新变种

本文报告了寄生在锦葵科和虎耳草科植物上的中国单囊壳属的一个新种和一个新变种：即锦葵科木芙蓉上的木槿生单囊壳Sphaertheca hibisricola Z. Y. Zhao, 虎耳草科落新妇上的落新妇生单囊壳 Sphamtheca mors-uvae (Schw.) Berk. Var astdbccola Z. Y. Zhao. 上述新的分类单位均有汉文和拉丁支描述,新种、新变种与近似种间的区别有讨论。     

世界今生砂壳纤毛虫名录

砂壳纤毛虫隶属于纤毛门、旋毛纲、环毛亚纲、砂壳目.本文总结了自Kofoid和Campbell(1929)以来的分类学资料,参照Lynn(2008)的分类系统,整理成世界砂壳纤毛虫新名录.厘清砂壳纤毛虫共有15科69属954种,其中海洋种为15科69属925种,淡水种为3科5属29种.在所有属中,以拟铃虫属(Tintinnopsis包含物种最多,为137种,其中海洋种为118种.我国水体共记录有13科36属164种,海洋种13科36属144种,淡水种2科3属20种.除杯形铃壳虫(Codonella cratera)、湖泊领细壳虫(Stenosemella lacustris)、蜉蝣筒壳虫(Tintinnidium ephemeridum)、蝌蚪筒壳虫(Tintinnidium ranunculi)、半缘筒壳虫(Tintinnidium semiciliatum)、纺锤拟铃虫(Tintinnopsis fusiformis)、伊利诺拟铃虫(Tintinnopsis illinoisensis)、卵圆拟铃虫(Tintinnopsis ovalis)、圆柱拟铃虫(Tintinnopsis cylindrata)、这9个种外,其他淡水种在我国都有记录.该名录中,除了已有中文名的159种外,其余的种我们给出了中文译名,并将部分译为似铃虫属(Tintinnopsis)的中文名统一为拟铃虫属,部分译为麻铃虫属(Leprotintinnus)的中文名统一为薄铃虫属,将截短角口虫(Salpingella decurtata)改为截短号角虫,将冰生拟铃壳虫(Codonellopsis glacialis)改为冰生类铃虫.     

从真菌全基因组中筛选丛赤壳科的DNA条形码

将粗糙脉孢菌(Neurospora crassa)的注释基因分别与30 种丝状子囊菌基因组比较, 根据E值大小预测同源序列, 从中选择Hsp90, AAC, CDC48和EF3作为候选基因, 以丛赤壳科(Nectriaceae)13 个属34 个概念清晰的种为材料, 对215个序列片段采用不同方法进行分析, 筛选适合于该科的DNA 条形码. 将种内与种间序列差异以及序列获得的难易程度作为评价指标. 结果表明,Hsp90 和AAC基因虽然具有较高的 PCR 扩增与测序成功率, 但种内、种间距离频率分布存在重叠, 可能导致部分种的鉴定错误;CDC48基因可以恰当地区分种内与种间差异, 但扩增与测序成功率相对较低; EF3基因不存在种内、种间遗传距离重叠, 序列容易获得, 适合作为该科真菌的DNA 条形码.     

新疆小圆孔壳属，锥毛壳属及座坚壳属的分类研究

本文报道了新疆子囊菌小圆孔壳属(Amphisphaerella),锥毛壳属(Coniochaeta)和座坚壳属(Rosellinia)的7个种及1个变种,即:忍冬小圆孔壳(A.xylostei),梭梭锥毛壳(C.haloxylonis),木生锥毛壳(C.ligniaria),粉被锥毛壳(C.pulveracea),毛锥毛壳(C.sordaria),附孢座坚壳(R.aquila),乳头座坚壳(R.thelena)及尖孢座坚壳大孢变种(R.apiculata var.macrospora)。其中,梭梭锥毛壳为新组合种。忍冬小圆孔壳,木生锥毛壳,乳头座坚壳及尖孢座坚壳大孢变种为我国新记录(属)种。这3个属的真菌新疆过去均未报道过,为新疆新记录属。     

肉座菌目一新科（英文）

在吉林、河南和湖北等地大蚕蛾科昆虫的虫茧上发现一种肉座菌目真菌,其子实体非子座型,子囊壳表生、肉质、梨形、淡橙色,子囊长柱形、具帽状加厚的顶端和细长的顶孔,子囊孢子线形、多分隔、易断裂。ITS、LSU、SSU多基因序列分析的结果表明,它属于肉座菌目,并与Flammocladiaceae和线虫草科Ophiocordycipitaceae系统发育关系略近。形态学与序列分析的结果支持将其处理为一新属(茧壳菌属Cocoonihabitus)中的一个新种(茧壳菌Cocoonihabitus sinensis),并代表了该目的一个新科(茧壳菌科Cocoonihabitaceae)。     

中国毛壳菌科研究III.毛壳菌属和梭孢壳属的种

报道了毛壳菌属和梭孢壳属5个新记录种,同丝毛壳Chaetomiumhomopilatum,刺毛壳C.spinosum,变绿毛壳C.virescens,小孢梭孢壳Thielaviamicrospora,栖土梭孢壳T.terricola。根据所采集的标本和菌种对这些种进行了描述和照像。干制培养物标本和菌种保藏在西北农林科技大学真菌标本室(HMUABO)。     

赤杆菌科微生物分类研究进展

赤杆菌科微生物隶属于细菌域(Bacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)、鞘脂单胞菌目(Sphingomonadales)。依据16S rRNA基因序列的系统发育分析结果,2005年赤杆菌科被提议建立,成立之初由3个属5个种组成;在过去10年中,该科的物种数量增加迅速;截止2015年10月,赤杆菌科合格发表6个属44个种。赤杆菌科微生物在土壤、热泉、海水和沉积物等环境中广泛分布,其在环境修复、食品工程及生物医药等领域具有重要的应用前景。此外,部分菌株具有细菌叶绿素a,营好氧异养生长兼具光合作用功能,是好养不产氧光合异养菌的一个重要类群,近年来其在全球海洋碳循环和能量代谢过程中的重要作用日益凸显,得到了国内外学者的关注。本文综述了赤杆菌科微生物的分类特征、生态分布和应用基础等方向的研究进展,并对其分类研究趋势做了分析。     

北极、南极和西藏有壳虫区系与分布

有壳虫(Testacea)是一类常见的自由生活的原生动物,在生态系统物质循环和能量流动中发挥重要作用.作者在分析地球三极(北极、南极、西藏)地区有壳虫种类名录(62属315种)基础上,对有壳虫区系特征、地理分布及其影响因素进行了研究.结果显示,北极地区已记录25科51属232种;南极地区20科30属131种;西藏地区22科42属173种.三个地区物种丰富度最高的属均为砂壳虫属(Difflugia)、匣壳虫属(Centropyxis)、梨壳虫属(Nebela)、鳞壳虫属(Euglypha)和表壳虫属(Arcella);5个属的种数分别占北极、南极、西藏总种数的51.3%、63.4%和60.1%.此外,3个地区共有种数是73(23.2%),共有属数是24(38.7%);仅在1个地区记录的种数是167种(53.0%).在三极地区40个亚区域,苔藓鳞盖虫(Assulina muscorum)和旋匣壳虫(Centropyxis aerophila)的分布最广泛,出现频率均高达90%.聚类分析显示,三个地区种水平相似性系数为51.3-56.3%,属于中等相似,北极和西藏相似系数最大.相似性分析表明,虽然有壳虫具有较强的长距离被动扩散能力,但是一些大于100μm的种类不是全球性分布.有壳虫的地理分布格局与个体大小、生境类型、地质历史事件等密切相关,分析结果受物种鉴定标准、样品数量、空间尺度大小等因素影响.     

土赤壳属三个中国新记录种

通过形态特征观察、rDNA-ITS和histone H3序列测定分析,报道分离自西藏药用植物一把伞南星Arisaema erubescens和工布乌头Aconitum kongboense的土赤壳属3个中国新记录种：埃什特雷莫什土赤壳Ilyonectria estremocensis、假毁土赤壳Ilyonectria pseudodestructans和强壮土赤壳Ilyonectria robusta,并对其进行了形态学描述和系统发育分析。研究菌株保存于北京协和医学院药用植物研究所生物技术中心菌种库。     

白粉菌科二新种

本文叙述了采自四川省的白粉菌科二个新分类单位,它们是寄生在马桑科马桑上的新种马桑球针壳(Phyllactinia coriariae Xie)和马桑棒丝壳(Typhulockaeta corlariae Xie)。马桑科是球针壳属和棒丝壳属寄主科的世界新记录。     

中国的小煤炱科Ⅳ.

本文报告27个分类单位,它们分别属于小煤炱属,小光壳炱属,附丝壳属和针壳炱属;联昌小煤炱(Meliola lianchangensis Jiang)、帽柱木生小煤炱水锦树生变种(Meliola mitragynicola Deight.var.wendlandiicola Jiang)和拟石珠小光壳炱假木荷变种(Asteridiella gaylussaciae Hansf.var craibiodendri Jiang)为新种和新变种。*非洲小煤炱,*蒲葵小煤炱,*坦卡小煤炱为我国新记录。