利用DH或RIL群体检测QTL体系并估计其遗传效应

利用ＤＨ和ＲＩＫＬ群体并结合重复内分组随机区组设计对和物产量等遗传率较低的数量性状进行分离分析可提高遗传分析的精度。根据混合分布理论菜了利用ＤＨ或ＲＩＬ群体重复实验数据鉴定数量性状混合遗传模型的分离分析法,特别是２对链锁主基因＋多基因模型。该方法可鉴定数量性状的遗传模型和主基因的作用方式,估计主基因、多基因的遗传疚和遗传方差,在两主基因存在连锁可可估计其重组率。下面通过应用举例说明该方法。     

在DH或RIL群体中两对重叠基因控制性状的定位

在DH或RIL群体中,若只找到与两对重叠基因控制性状连锁的1个分子标记,可采用极大似然法估计控制性状的一对基因与分子标记间的重组率,并推导出重组率估计值的标准误公式。Monte Carlo模拟显示,重组率估计值的无偏性较好,其变异随时样本容量或重组率的增加而减少。     

利用P1、F1、P2、F2和F2:3家系五世代联合分离分析的拓展

在王建康等[3]的基础上拓展了利用P1、F1、P2、F2和F2：3家系5群体的2对主基因（B）和2对主基因 多基因（E）2类模型,为使拓展模型成为可能并提高分布参数估计值的精度,用IECM算法估计样本似然函数分布参数,通过重新分析3个大豆杂交组合抗豆秆黑潜蝇主茎虫量遗传资料证实了通过孟德尔氏遗传分析法所获得的结果,并得到存在多基因的统计学依据。     

植物数量性状遗传体系检测中回交或自交家系重复试验数据的分析方法

为提高主基因+多基因混合遗传分析的精度,降低试验误差,采用重复内分组随机区组设计,对低遗传力性状的B1:2和B2:2或F2:3家系平均数资料进行遗传分析.通过AIC准则和适合性检验比较无主基因(A-0)、1对主基因(A)、2对主基因(B)、多基因(C)、1对主基因+多基因(D)和2对主基因+多基因(E)模型以鉴定其遗传模式.采用IECM算法估计混合模型参数.通过油菜HSTC14×宁油7号初花期F2:3家系平均数资料阐明该方法。 abstract:To improve the precision in the genetic analysis of quantitative traits,the B1:2 and 132:2,or F2:3 families in a randomized blocks design were used to identify the mixed major gene plus polygene inheritance model while error variance was estimated from the analysis of variance.Five kinds of genetic models were established,including:one-major-gene model,two-major-gene model,polygene model,mixed one-major-gene plus polygene model,and mixed two-major-gene plus polygene model.The AIC value and a set of tests of goodness-of-fit were used to identify the most fitted model among the possible ones.The iterated ECM (IECM) algorithm was used to obtain maximum likelihood estimates of the parameters in sample likelihood function.An example of the genetic analysis of days from planting to flowering of a rape cross was used to illuminate the above procedure.     

利用家系群体鉴定数量性状多基因的存在

通过重复试验方差分析获得误差方差以探索只利用B、：2和B2：2或F2：3家系世代鉴定多基因存在的方法,混合分布参数的估计采用IECM算法,以油菜株高B1：2和B2：2家系平均数资料和千粒重F2：3家系平均数资料为例阐明该方法。     

利用回交B1和B2及F2群体鉴定数量性状两对主基因+多基因混合遗传模型

ＱＴＬ作图和主基因＋多基因混合遗传分析表明：拓展两对基基因＋多基因混合遗传模型十分必要。本文利用混合分布理论,ＡＩＣ准则在回交Ｂ１和Ｂ２群体或Ｆ２群体中鉴定两对主基因的存在,当主基因存在时估计其遗传参数;同时还改进了利用亲本,Ｆ１和回交Ｂ１和Ｂ２群体,或亲本,Ｆ１和Ｆ２群体鉴定多基因存在的方法,分布参数的估计采用ＩＥＣＭ算法,以水稻株高性状为例说明该方法的应用。     

利用杂种F_2世代鉴定数量性状主基因-多基因混合遗传模型并估计其遗传效应

大量实验数据和OTL作图结果表明:控制数量性状的基因中既有遗传效应较大的主基因,又有遗传效应较小的多基因,其分离世代表现出多峰性,即出现多个分布混合的特征。本文利用混合模型理论的AIC信息准则在F_2世代中鉴定影响数量性状的主基因的存在,当主基因存在时通过分离分析估计主基因的遗传效应以及主基因的遗传变异占总变异的分量;同时还提出利用P_1、P_2、F_2和F_2 4个世代鉴定多基因存在的方法。以大豆开花期性状为例说明了该方法的应用,在所分析的骨绿豆×上海红芒早杂交组合的F_2世代数据中发现有主基因的存在,主基因表现出完全显性(晚开花),并且有多基因存在。     

黄瓜RIL群体瓜长和把长的QTL定位分析

以黄瓜野生变种‘PI183967’(Cucumis sativus L.hardwickii)和新泰密刺选系‘931’为亲本,通过单粒传法获得包含160个株系的F9代重组自交系群体(RIL)。结合分子遗传图谱和不同年份(2012年春、秋季和2013年春、秋季)的表型调查数据,利用MapQTL4.0软件进行黄瓜瓜长和把长的QTL定位。结果显示:(1)共检测到8个与瓜长和把长相关的QTLs,分布在染色体3、4、5、6、7上,LOD值在2.78~10.24之间,可解释7.4%~32.7%的表型变异率,贡献率≥10.0%的QTL位点4个,占QTLs总数的1/2,在春秋两季重复检测出的QTL位点有4个。(2)检测到4个与瓜长相关的QTLs位点Fl3.1、Fl4.1、Fl5.1、Fl6.1,4个与把长相关的QTLs位点Fsl3.1、Fsl3.2、Fsl5.1、Fsl6.1。(3)Fl6.1和Fsl6.1在2012、2013年春秋季中均可检测到,位于第6号染色体的109.2cM处,标记SSR17591~C80之间;Fl6.1在4次中的贡献率在13.8%~32.7%之间,Fsl6.1在4次中贡献率为12.1%~24.1%;(4)Fl3.1和Fsl3.2位于第6号染色体标记SSR16152~SSR07706之间,其中Fl3.1在2012年秋季和2013年春秋两季中均可检测到,贡献率总共为25.1%,Fsl3.2仅在2012年秋季中检测到,解释8.8%的表型变异率。研究表明,第6号染色体上标记SSR17591~C80和第3号染色体上的SSR16152~SSR07706等2个区域聚集了控制瓜长和把长的主效QTL位点,这2个区域应作为今后研究的重点。     

绒毛细胞与新生儿脐带血和成人外周血染色体断裂和裂隙的比较

绒毛用直接法制片,新生儿脐带血和成人外周血用半微量全血法制片。对绒毛、脐带血和外周血染色体的断裂和裂隙进行比较。结果表明,绒毛细胞的染色体断裂和裂隙比新生儿脐带血和成人外周血的显著增高,而新生儿脐带血和成人外周血之间则无明显差异。 Abstract:Chromosome breaks and gaps in chorionic villus cells and lymphocytes from newborn and abult were compared.The number of chromosome breaks and gaps in chorionic villus cells was higher than that in newborn and adult lymphocytes,This might be one of the reasons for higher chromosome aberration rate in chorionic villus.     

水稻耐贮藏基因（lox-3）DH作图群体构建方法的比较研究

以与水稻耐贮藏材料（Daw Dam）有丰富分子标记多态性的常规材料2070、明恢63、Dulur/协青早B为亲本,分别与之杂交,采用改良一步成苗花药培养法对其F1代进行花药培养,以一步成苗法为对照,评价新方法在构建耐贮藏基因DH作图群体中的应用潜力。研究结果表明,改良一步成苗法显著地提高了愈伤组织分化率、植株再生率、绿苗率、绿苗素质,而且得到的加倍单倍体系田间表现良好,是构建耐贮藏基因DH作图群体的理想方法,但在不同基因型间表现有一定的差异性,其中Daw Dam/2070、Daw Dam/明恢63组合的培养效率有较大增幅。利用改良一步成苗法已获得一定数量的DH群体,为开展进一步研究奠定了基础。 Abstract:Crosses were produced by using a storable rice variety (Daw Dam) and 2070,Ming Hui 63,as well as Dulur/Xie Qing Zao B as parents,among these materials there are abundant polymorphisms of DNA molecular markers.Their F1's were applied to generate DH lines by an improved method of direct induction of pollen plant.The method of the direct induction of pollen plant was used as check treatment to evaluate the improved method.The results showed that the improved method increased the re-differentiation percentage of pollen callus,the percentage of regeneration plantlets,and the percentage of green regeneration plantlets and produced more vigorous seedlings.The improved method was a competent method of establishing DH population for mapping lox-3 gene.It was also showed that the efficiency of the new method was different among genotypes and out of three experimental crosses Daw Dam/2070 and Daw Dam/Minghui 63 showed more efficient.More than 60 DH lines have been obtained in this experiment.     

植物数量性状遗传体系的分离分析方法研究

在传统的数量性状多基因遗传模型基础上提出主基因-多基因遗传模型具普遍性,纯主基因或纯多基因遗传模型只是其特例。由此初步建立了植物数量性状遗传体系分离分析方法。目前该方法可以检验2～3个主基因的个别遗传效应、多基因整体的遗传效应和两者的遗传率。本文介绍这种分离分析方法的研究经过、主要进展及应用效果,并以实例说明其分析步骤、方法和效果。     

Segregation Analysis on Genetic System of Quantitative Traits in Plants

Based on the traditional polygene inheritance model of quantitative traits, the author suggests the major gene and polygene mixed inheritance model. The model was considered as a general one, while the pure major gene and pure polygene inheritance model was a specific case of the general model. Based on the proposed theory, the author established the segregation analysis procedure to study the genetic system of quantitative traits of plants. At present, this procedure can be used to evaluate the genetic effect of individual major genes (up to two to three major genes), the collective genetic effect of polygene, and their heritability value. This paper introduces how to establish the procedure, its main achievements, and its applications. An example is given to illustrate the steps, methods, and effectiveness of the procedure. Translated from Hereditas, 2005, 27(1) (in Chinese)     

Segregation Analysis on Genetic System of Quantitative Traits in Plants

Based on the traditional polygene inheritance model of quantitative traits,the author suggests the major gene and polygene mixed inheritance model.The model was considered as a general one,while the pure major gene and pure polygene inheritance model was a specific case of the general model.Based on the proposed theory,the author established the segregation analysis procedure to study the genetic system of quantitative traits of plants.At present,this procedure can be used to evaluate the genetic effect of individual major genes (up to two to three major genes),the collective genetic effect of polygene,and their heritability value.This paper introduces how to establish the procedure,its main achievements,and its applications.An example is given to illustrate the steps,methods,and effectiveness of the procedure.     

利用RIL和CSSL群体检测水稻种子休眠性QTL

利用由梗稻品种Asominori与籼稻品种IR24的杂交组合衍生的重组自交F10。家系(Recombinant Inbred Lines,RIL)群体及其衍生的染色体片段置换系(Chromosome Segment Substitution Lines,CSSL)群体,进行了种子休眠性QTL的检测和遗传效应分析。其中CSSL群体有2个,即CSSLl(以Asominori为背景,置换片段来自IR24)和CSSL2(以IR24为背景,置换片段来自Asominori)。在RIL群体上共检测到3个种子休眠性QTL,分别位于第3、6和9染色体上;在CSSL1群体中检测到分布在第1、3和7染色体上的3个休眠性QTL;而在CSSl2群体上检测到的3个QTL则分别位于第1、2和7染色体上。同时在两套CSSL群体上,分别检测到位于第1、7染色体上位置相近且效应一致的休眠性QTL,分析表明其所在的Asominori片段含对种子休眠性的增效基因,相应的IB24段含有减效基因。     

植物数量性状遗传体系检测中回交或自交家系重复试验数据的分析方法

为提高主基因 多基因混合遗传分析的精度 ,降低试验误差 ,采用重复内分组随机区组设计 ,对低遗传力性状的B1∶2 和B2∶2 或F2∶3 家系平均数资料进行遗传分析。通过AIC准则和适合性检验比较无主基因 (A - 0 )、1对主基因 (A)、2对主基因 (B)、多基因 (C)、1对主基因 多基因 (D)和 2对主基因 多基因 (E)模型以鉴定其遗传模式。采用IECM算法估计混合模型参数。通过油菜HSTC14×宁油 7号初花期F2∶3 家系平均数资料阐明该方法。     

质量—数量性状遗传参数估计的P1,P2,F1,B1,B2联合分析方法

提出利用亲本Ｐ_１和Ｐ_２、杂种Ｆ_１、回交Ｂ_１和Ｂ_１五个世代联合分析包括两个位点主基因控制的质量－数量性状遗传的统计方法,共建立了可供选择的微基因遗传、一对主基因＋微基因混合遗传、二对主基因＋微基因混合遗传三类五种（套）共 ２８个遗传模型,采用 ＡＩＣ信息准则选择最适模型,并通过适合性检验对所选择的遗传模型做进一步的检验．文章最后还讨论了两种变型设计．