藏鸡主要组织相容性复合体B-LBⅡ基因第二外显子序列遗传变异分析

根据鸡主要组织相容性复合体B-LBⅡ基因序列设计特异性引物,在藏鸡基因组中扩增了一个包括其第二外显子和第二内含子在内长度为374 bp的片段,并通过克隆和PCR直接测序获得了该片段的核苷酸序列。发现了15个B-LBⅡ新等位基因。对18个B-LBⅡ等位基因核苷酸序列和其所编码的MHCB-LBⅡ分子β1结构域的氨基酸序列分析显示,第二外显子核苷酸序列遗传多态性异常丰富,存在着62个多态变异位点(共包括80个突变),其中41个为简约性多态位点;衡量该序列遗传多样性的π值为0.0718;反映其群体内遗传变异度的平均遗传距离为0.056±0.008,低于在5个外来品种所估算的平均遗传距离。该编码区核苷酸相对异义替换率(15.61±2.69%)显著高于其同义替换率(3.25±0.94%),进一步分析表明,基因重组和平衡选择机制可能是引起B-LBⅡ基因序列变异的主要因素。在β1结构域氨基酸序列中,存在11个同义替换和27个异义替换;在24个肽结合位点中有12个变异位点;与其他6个中国地方鸡品种和一个外来品种比较发现,有11个异义氨基酸替换仅出现在藏鸡群体中,并被认为与藏鸡的免疫特异性有关,可为鸡的抗病力研究提供分子依据。     

中国地方鸡种MHC B-LBⅡ新等位基因的遗传多态性研究

为研究鸡MHC B-LBⅡ基因的遗传多态性,首先在8个中国地方鸡种(藏鸡、仙居鸡、北京油鸡、固始鸡、斗鸡、丝羽乌骨鸡、白耳鸡和狼山鸡)B-LBⅡ基因第二外显子扩增了一长度为 175 bp 的 DNA 片段并进行 SSCP 基因型分析;在8 个地方鸡种共 467 个个体中检测到 37 个 PCR-SSCP 基因型;从被检样品中筛选出不同基因型的个体,并在其 B-LBⅡ基因组中扩增了一个包括其第二外显子和第二内含子在内长度为374 bp的片段,通过克隆和测序获得了该片段的核苷酸序列。经序列分析,在前述地方鸡种被筛选出的 30 个无血缘关系的个体中发现了 31 个 B-LBⅡ新等位基因,并参照哺乳动物 MHC II 类 B 等位基因命名规则进行了命名。对这 31 个 B-LBⅡ新等位基因长度为 374 bp 的 DNA 片段进行比对表明,在其第二外显子序列上共有 68 个多态性变异位点,其中简约性信息位点 51 个,单变异位点 17 个,具有丰富的遗传多态性。在这些多态性变异位点中,出现在遗传密码子第一和第二位上的碱基替换率分别为 36.76% 和 35.29%。等位基因序列间的相似性估测为 90.6%-99.5%;B-LBⅡ基因第二外显子的错义替换率和同义替换率分别为 14.64±2.67%和 2.92±0.94%。结果表明,B-LBⅡ基因的丰富遗传多态性主要是由基因重组和平衡选择效应所引起的。对 B-LBⅡ等位基因第二外显子所编码的 B-LBⅡ分子β1 结构域氨基酸序列比对发现,31 个 B-LBⅡ新等位基因属于 26 个等位基因主型;在β1结构域氨基酸序列的 33个变异位点上,存在 6 个同义替换和 27 个错义替换。分析认为,那些发生在多肽结合位点上的氨基酸错义替换与鸡 MHC B-LBⅡ分子的免疫特异性有关。该结果可为鸡的抗病育种研究提供分子生物学依据。     

中国部分地方鸡种MHC B-G基因第二外显子的遗传多态性

根据鸡主要组织相容性复合体BG基因序列设计特异性引物,在9个中国地方鸡种和1个国外引进鸡种基因组中扩增了包括其第一内含子和第二外显子在内、长度为401bp的DNA片段。经PCRSSCP分型筛选后,对该片段的核苷酸序列进行克隆测序和直接PCR测序及比对分析,发现了31个MHCBG新等位基因;各等位基因主型所含有的亚型数及其在不同品种间的分布极不均衡。第二外显子核苷酸序列和其所编码的MHCBG抗原类IgV结构域氨基酸序列比较表明,在中国地方鸡种BG基因第二外显子的207bp序列中有37个多态性变异位点,其中简约性信息位点29个,单个位点的变异8个;等位基因间的遗传变异范围0.0013-0.1433;各变异位点的核苷酸变异指数0.206-1.462。该编码区核苷酸的异义替换率为9.26%±1.92%,高于同义替换率2.34%±0.90%。所估计的核苷酸转换数和颠换数随着遗传距离的增加而逐渐增加,当核苷酸转换数和颠换数达到平衡后,该片段核苷酸转换数的增加幅度逐渐高于颠换数。在其所编码的类IgV结构域氨基酸序列中,多态变异位点有22个,其中简约性信息位点6个,单变异位点16个;所估测的等电点为8.45,疏水性氨基酸占40.3%,亲水性氨基酸占29.9%;该序列具有明显的疏水性特点。等位基因间的系统发生分析表明,31个BG等位基因分为两个群,相同主型的等位基因首先聚类。本研究为鸡BG基因的免疫功能和遗传进化研究提供了分子依据     

中国大陆野猪SLA DRB基因exon2的序列变异分析

本文基于135头野猪样本中检测到的15种SLA DRB基因exon 2序列的遗传变异分析,探讨DRB基因在不同地理区域中自然选择的变化特征.研究发现DRB基因exon 2抗原结合位点的非同义替换率为同义替换率的2.95倍,表明该位点受到平衡选择的强烈作用.在系统发生分析中,在基于核苷酸序列构建的NJ树中,野猪DRB位点的15种等位基因全部聚为一枝,没有发现跨种多态现象;而在基于氨基酸序列构建的系统发生树中,野猪SLA-DRB*nnu6和人DRB基因exon 2片段聚在一起,这种氨基酸残基的高度相似可能是由于自然选择压力下产生的趋同.野猪DRB基因exon 2的序列多态性分析表明,东北野猪基因多态性低于四川野猪和华南野猪,这可能与不同气候条件和地理环境下的寄生虫等因素对SLA等位基因变异的影响存在差异有关.     

扬子鳄MHCⅡ类B基因第二外元的克隆及序列分析

3头扬子鳄血样取自宣城安徽省扬子鳄繁殖研究中心。利用一对简并引物对MHCⅡ类B基因第二外元的部分片段进行扩增;通过克隆、单链构象多态性分析、测序,并将测得序列与下载的8个物种MHC序列比对,确定序列差异和变异位点;利用MEGA软件构建NJ树,PAUP4．0构建MP树。结果得到10种不同的序列,片段长166bp。核苷酸序列中有38个变异位点,氨基酸序列中有23个变异位点;推定的抗原结合位点非同义替换(dN)明显高于同义替换(dS)。10种序列的NJ树和MP树极为相似,均为A、B两个分支,两个分支明显的特异性位点核苷酸序列中有9个。氨基酸序列中有7个。表明扬子鳄MHCⅡ类B基因第二外元有较高的多态性,有利于扬子鳄饲养种群的遗传保护。     

尼罗鳄MHCⅡ类B基因第二外元的序列变异分析

利用一对简并引物扩增了尼罗鳄MHCⅡ类分子B基因第二外元的部分片段,并对PCR产物进行了克隆和测序,结果得到8种不同的序列,序列长度为166 bp;经分析,序列中有56个变异位点,核苷酸的非同义替换多于同义替换,造成30个位点氨基酸的改变,氨基酸的替换趋于集中在假定的抗原结合位点附近.核苷酸和氨基酸序列与已报道的扬子鳄和密河鳄的MHCⅡ类B基因第二外元序列有较高的同源性,利用PAUP4.0软件构建的NJ树显示,鳄类的MHCⅡ类B基因存在跨种多态性现象.     

牙鲆MHC-DAA结构及其等位基因多态性

为了探讨牙鲆MHC-DAA等位基因的多态性, 根据牙鲆 (Paralichthys olivaceus) MHC-DAA的cDNA序列设计特异引物, 扩增内含子序列。牙鲆DAA基因由4个外显子和3个内含子组成, 与大西洋鲑 (Salmo salar) DAA基因结构相同, 在内含子2中存在一个高度多态的微卫星位点(GT)n。根据获得的MHC-DAA基因组序列设计特异性引物, 在45尾牙鲆中扩增了包括完整外显子2和内含子2的长度约670 bp的DNA片段, 克隆测序后共发现30个MHC-DAA等位基因, 各等位基因的频次及其各主型中亚型的数目都不均衡。在249 bp的外显子2序列中共有55个位点发生变异, 核苷酸多样性指数为0.0887, 编码的氨基酸序列中多态变异位点31个, 其中简约信息位点30个, 单变异位点1个。非同义替代与同义替代的比率在PBR(Peptide binding region)和非PBR结合区分别为3.30和2.43, 分析证明平衡选择是牙鲆存在众多DAA等位基因的发生机制。     

兴国红鲤MHCⅡ类基因多态性、表达及其与鱼体抗病力关系的分析

对41尾感病和22尾抗病兴国红鲤的308个有效克隆进行测序,获得171条不同的MHC Ⅱ类基因编码序列,分属26个不同的等位基因,其中Cyca-DXA24Cyca-DXA36为新发现的13个等位基因。MHCⅡ类基因片段的长度为624 bp,包括第14个外显子,分别编码信号肽、1和2结构域及连接肽/跨膜区。1结构域的变异明显大于2结构域,表现在1结构域中核苷酸和氨基酸变异位点比例（55.16%和79.76%）明显高于2结构域的变异位点比例（45.96%和68.42%）。1结构域的PBR区的非同义碱基替换率（dN）与同义碱基替换率（dS）的比值 （=dN/dS）为5.742,远远高于非抗原结合位点（non-PBR）及2结构域的0.755、0.592,揭示兴国红鲤MHC Ⅱ类基因的1结构域在进化过程中受到正向选择作用。等位基因Cyca-DXA24 （P0.01）与兴国红鲤对嗜水气单胞菌的抗性相关,等位基因Cyca-DXA3 （P0.05）、Cyca-DXA4 （P0.01）、Cyca-DXA6 （P0.05）、Cyca-DXA33 （P0.05）与兴国红鲤对嗜水气单胞菌的易感性相关。荧光定量PCR结果表明,MHCⅡ类基因在健康兴国红鲤的肾、肝、鳃等10个组织均能普遍表达。人工感染嗜水气单胞菌后,肾、肝、脾3个组织中的MHCⅡ类基因的表达量均发生了不同程度的变化,表明MHCⅡ类分子在兴国红鲤的免疫反应中起到重要作用。       

白鱀豚MHC基因类DQB1座位第二外元的序列变异分析

测定了 4 5个克隆的白豚 (Lipotesvexillifer)MHCⅡ类基因DQB座位第二外元 172bp的核苷酸序列 ,共获得 15种序列 ,发现了 2 2个变异位点。核苷酸的非同义替换明显多于同义替换 ,并造成了 15个氨基酸的改变。氨基酸的替换趋于集中在假定的与抗原的选择性识别相关的位点附近。白豚DQB基因的核苷酸和氨基酸序列与文献报道的白鲸 (Delphinapterusleucas)和一角鲸 (Monodonmonoceros)DQB1序列具有较高的同源性。氨基酸序列不具备人及其它一些灵长类动物DQB2基因所共有的基序 (Motif) ,而与牛DQB1基因的基序相近 ,说明本研究得到的白豚MHC序列应属于类DQB1基因。同一个体出现了多种序列的情况 ,提示白豚的DQB基因可能存在着座位重复。白豚的类DQB1座位的序列中存在多种基序的不同组合 ,推测是由于基因转换造成的.     

白(既鱼)豚MHC基因类DQB1座位第二外元的序列变异分析

测定了45个克隆的白(既鱼)豚(Lipotes vexillifer)MHC Ⅱ类基因DQB座位第二外元172 bp的核苷酸序列,共获得15种序列,发现了22个变异位点.核苷酸的非同义替换明显多于同义替换,并造成了15个氨基酸的改变.氨基酸的替换趋于集中在假定的与抗原的选择性识别相关的位点附近.白(既鱼)豚DQB基因的核苷酸和氨基酸序列与文献报道的白鲸(Delphinapterus leucas)和一角鲸(Monodon monoceros)DQB1序列具有较高的同源性.氨基酸序列不具备人及其它一些灵长类动物DQB2基因所共有的基序(Motif),而与牛DQB1基因的基序相近,说明本研究得到的白(既鱼)豚MHC序列应属于类DQB1基因.同一个体出现了多种序列的情况,提示白(既鱼)豚的DQB基因可能存在着座位重复.白(既鱼)豚的类DQB1座位的序列中存在多种基序的不同组合,推测是由于基因转换造成的[动物学报 49(4):501～507,2003].     

柱状田头菇EST-SSR的开发及应用研究

借鉴香菇EST序列设计的40对引物对柱状田头菇进行了EST-SSR引物通用性研究。结果显示,挑选的28对引物中多态性好且稳定的有13对,通用率达46.4%。PCR扩增产物获得具有多态性条带81条,每对引物扩增条带的数目范围为2–14,平均5.86条,扩增片段大小在100–400bp之间。多态信息含量（PIC）在0.3750–0.8032,平均0.7084。研究结果表明,EST-SSR分子标记在食用菌的遗传多样性和比较基因组学研究中起到重要的作用。     

用重复序列引物PCR分析不同滞育状态麦红吸浆虫DNA多态性

应用 5 个重复序列引物,通过 PCR 扩增试验,研究了不同滞育状态麦红吸浆虫 DNA 的多态性。结果表明:1) 5 个重复序列引物共扩增了 104 条核酸带,分子量介于 202~1 163bp 之间;2) 不同滞育状态的麦红吸浆虫的平均相似性指数范围在 0.573~0.936 之间,在种群 3 和种群 4 之间,最大的平均相似性指数是 0.936,在种群 1、3、4、5 和种群 6、7、8 之间平均相似性指数较高(均超过 0.81);3)不同滞育状态麦红吸浆虫群体的遗传变异大部分来自群体间,产生于群体间的变异为62.41%,来自群体内的变异为37.59%;4) 根据对不同滞育状态间遗传距离的聚类分析,麦红吸浆虫的滞育类型可分为三大类。首次报道了不同滞育状态麦红吸浆虫量化的DNA多态性。     

Transferable EST-SSR markers for the study of polymorphism and genetic diversity in bread wheat

Nearly 900 SSRs (simple sequence repeats) were identified among 15,000 ESTs (expressed sequence tags) belonging to bread wheat ( Triticum aestivum L.). The SSRs were defined by their minimum length, which ranged from 14 to 21 bp. The maximum length ranged from 24 to 87 bp depending upon the length of the repeat unit itself (1–7 bp). The average density of SSRs was one SSR per 9.2 kb of EST sequence screened. The trinucleotide repeats were the most abundant SSRs detected. As a representative sample, 78 primer pairs were designed, which were also used to screen the dbEST entries for Hordeum vulgare and Triticum tauschii (donor of the D-genome of cultivated wheat) using a cut-off E (expectation) value of 0.01. On the basis of in silico analysis, up to 55.12% of the primer pairs exhibited transferability from Triticum to Hordeum, indicating that the sequences flanking the SSRs are not only conserved within a single genus but also between related genera in Poaceae. Primer pairs for the 78 SSRs were synthesized and used successfully for the study of (1) their transferability to 18 related wild species and five cereal species (barley, oat, rye, rice and maize); and (2) polymorphism between the parents of four mapping populations available with us. A subset of 20 EST-SSR primers was also used to assess genetic diversity in a collection of 52 elite exotic wheat genotypes. This was done with a view to compare their utility relative to other molecular markers (gSSRs, AFLPs, and SAMPL) previously used by us for the same purpose with the same set of 52 bread wheat genotypes. Although only a low level of polymorphism was detected, relative to that observed with genomic SSRs, the study suggested that EST-SSRs can be successfully used for a variety of purposes, and may actually prove superior to SSR markers extracted from genomic libraries for diversity estimation and transferability.Communicated by R. Hagemann     

福建东张水库陆封型香鱼的遗传变异

测定了福建东张水库18尾陆封型香鱼的ND4-tRNA^Ser基因533 bp序列,发现2个可变位点和2个简约信息位点,共检测到4种单倍型。基于Kimura 2-parameter模型的遗传距离在0.001 9～0.003 9之间,在NJ系统树上无明显谱系结构;单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.627和0.001 37,平均核苷酸差异数为0.732,远低于两侧洄游型日本香鱼指名亚种(Hd为0.793,Pi为0.002 94),与被列为IUCN濒危物种名录的日本琉球香鱼亚种(Hd=0.519,Pi=0.001 11)相当。东张水库香鱼遗传多样性如此贫乏到底是历史原因还是近期陆封的结果,仍需进一步研究。目前亟待采取有效措施保护东张水库陆封香鱼。     

Structure of genetic diversity in marginal populations of black poplar (Populus nigra L.)

It has been hypothesized that populations at the margins of the distributional range of a species show reduced genetic diversity and increased inter-population differentiation compared to central populations. Here, we test this hypothesis by examining the structure of genetic diversity in marginal populations of black poplar, Populus nigra L. (Salicaceae). This species occurs mainly in Europe but its range extends to central Asia. We collected 117 individuals from 10 populations at the edge of the distributional range of the species in central Asia to examine the structure of genetic diversity based on genetic polymorphisms at 20 microsatellite markers. As expected, the genetic diversity within these marginal populations is relatively low, with an average observed heterozygosity H_o of 0.337 and an average expected heterozygosity H_e of 0.466, compared to the genetic diversity of populations from central distributions. However, we recovered very low genetic differentiation between populations, with an average F_st of 0.0745, a value similar to those reported for central populations. AMOVA analyses confirmed this result, showing that only 9.2% of the total variation could be attributed to between-population variance (P < 0.001). Our findings do not fully support hypotheses about the structure of genetic diversity in marginal populations formed from observations on other species. We suggest that a high rate of outcrossing and possible postglacial colonization at the edge of the distributional range of this long-lived poplar may explain the observed structure of the genetic diversity.     

马传染性贫血病毒白细胞弱毒疫苗株及其亲本毒驴强毒株前病毒基因组比较分析

为阐明马传染性贫血白细胞弱毒疫苗株(EIAVDLV)的致弱和免疫保护机理,对EIAVDLV121及其亲本驴强毒株(EIAVDV117)前病毒全基因组序列进行了测定,并结合准种理论,分析了EIAV疫苗致弱过程中基因组进化特点。利用LA-PCR技术对EIAVDV117和EIAVDLV121的前病毒基因组分两段进行扩增,分别获得4个和10个前病毒全基因组序列。EIAVDV117前病毒基因组平均为8236bp,G C含量38.0。EIAVDLV121前病毒基因组平均8249bp,G C含量37.3。两者的前病毒基因组平均差异率为2.8。其中S2、LTR和env基因差异较大,分别为4.1、3.9和3.1。此外,S2、S3和env推导的氨基酸的差异明显,分别为10.4、5.6和4.8(gp90为6.8)。EIAVDLV121各基因的异质性均显著高于EIAVDV117。研究发现体外培养的EIAVDLV121至少有5种类型的LTR混合存在。在gp90推导的氨基酸序列上,EIAVDV117比EIAVDLV121平均多2个N-糖基化位点,总数为19,其中3个为EIAVDV117特有。EIAVDLV121有1个疫苗株特有N-糖基化位点。研究结果为进一步探讨马传染性贫血弱毒疫苗生物学特性提供信息。     

Analysis of the genetic diversity of Bemisia tabaci populations in Shanxi province, China☆

Five different primer combinations were used for the analysis of 152 B biotype Bemisia tabaci (Gennadius) individuals and five Trialeurodes vaporairiorum individuals collected from 19 counties and seven host plants in Shanxi province in China, respectively. The main objective of the present study was to use AFLP markers to determine the genetic diversity of B. tabaci populations collected from Shanxi Province. The use of these primer combinations allowed the identification of 127 polymorphic bands (52.26%) from 60 to 500 bp. The average number of polymorphic bands per primer was 25.4 while the range for the five primers was 20–32. The average degree of heterozygosity was 0.251, while the range for the five primers was 0.204–0.289. The results suggested definite genetic diversity among different B. tabaci populations. Cluster analysis showed that B. tabaci populations were firstly scattered to three genetic groups according to the regions, then every genetic group was scattered to several subgroups according to the host plants, which revealed the genetic variability of B biotype B. tabaci populations has been not only among different regions, but also among different host plants in Shanxi Province.     

Evaluation of allelic diversity at chloroplast microsatellite loci among common wheat and its ancestral species

Twenty four chloroplast microsatellite loci having more than ten mononucleotide repeats were identified from the entire chloroplast DNA sequence of common wheat, Triticum aestivum cv Chinese Spring. For each microsatellite, a pair of primers were designed to produce specific PCR products in the range of 100– 200 bp. The allelic diversity at the microsatellite loci was evaluated using 43 accessions from 11 Triticum and Aegilops species involved in wheat polyploid evolution. Polymorphic banding patterns were obtained at 21 out of 24 chloroplast microsatellite loci. The three monomorphic microsatellites were found to be located in coding regions. For the polymorphic microsatellites, the number of alleles per microsatellite ranged from 2 to 7 with an average of 4.33, and the diversity values (H) ranged from 0.05 to 0.72 with an average of 0.47. Significant correlations (P<0.01) were observed between the number of repeats and the number of alleles, and between the number of repeats and diversity value, respectively. The genetic diversity explained by chloroplast microsatellites and nuclear RFLP markers were compared using 22 tetraploid accessions. Although the number of alleles for nuclear RFLP markers was found to be higher than that for chloroplast microsatellites, similar diversity values were observed for both types of markers. Among common wheat and its ancestral species, the percentages of common chloroplast microsatellite alleles were calculated to examine their phylogenetic relationships. As a result, Timopheevi wheat species were clearly distinguished from other species, and Emmer and common wheat species were divided into two main groups, each consisting of a series of wild and cultivated species from tetraploid to hexaploid. This indicates that the two types of chloroplast genomes of common wheat might have independently originated from the corresponding types of wild and cultivated Emmer wheat species. Received: 6 October 2000 / Accepted: 13 March 2001     

意大利蜜蜂产浆性状10个微卫星位点的遗传分析

我国培育成功的世界上蜂王浆产量最高的蜂种（Ea）是从20世纪30年代引进我国的意大利蜜蜂（Eb）中选育的。采用10个微卫星位点对蜂王浆高产蜜蜂、原种意大利蜜蜂（Ee）和本地意大利蜜蜂进行研究,以探明由于人工选择和地理隔离造成的其分子进化上的一些特征。结果,10个微卫星位点在3个蜂种中共扩增到96个等位基因,其中有48个等位基因是不同的,表明10个微卫星位点在3个蜂种中的高度多态性,而且由于人工选择和地理隔离已造成3蜂种在遗传基础上的一些分化。3蜂种的多态信息含量（PIC）分别为0．57、0．50、0．57,杂合度分别为0．60、0．57、0．61,二者均无显著差异。遗传距离的分析结果显示,Ee和Eb（0．14）、Eb和Ea（0．16）之间的遗传距离较近,而Ea和Ee（0.25）之间的遗传距离较远。等位基因频率的分析结果表明,6个位点的7个等位基因的频率（A29的159bp、A24的100bp和104bp、A7的110bp、A43的126bp、A14的221bp和A113的221bp）以Ee、Eb、Ea的顺序递增,Ea的这7个等位基因频率分别显著高于Ee和Eb。同时4个位点的4个等位基因的频率（A24的106bp、A43的140bp;A113的215bp和A14的219bp）以Ea、Eb、Ee的Ⅲ页序下降,Ea在这4个位点的频率分别显著低于Eb和Ee。这些位点的等位基因可能与蜂王浆产量有关。     

环境因素对东平湖沉积物细菌群落结构的影响

【目的】探讨环境因素对东平湖沉积物细菌群落结构的影响。【方法】应用T-RFLP(Terminal RestrictionFragment Length Polymorphism)技术分析和比较了6个不同位置的东平湖沉积物在丰水期和枯水期的细菌多样性,并结合不同样品环境因子的差异,采用主成分分析(PCA)和典型对应分析(CCA),探讨了环境因子对细菌多样性的影响。【结果】不同沉积物样品的T-RFLP图谱具有较高的相似性。除2号样品外,所有枯水期样品的细菌群落具有较高的丰富度、多样性、均匀度和较低的优势度。CCA结果表明,558bp T-RF的丰度与总磷、总氮、总有机碳、铵态氮和硝态氮含量呈负相关而与碳氮比和水深呈正相关;64.5、164、509和543bp T-RFs的丰度与总氮、总有机碳、铵态氮、硝态氮、碳氮比和水深呈正相关;而其它14种主要的T-RFs在不同样品间分布较为稳定受环境因子影响不大。90、136.5、138和488bp等T-RFs可能代表了东平湖沉积物中占优势地位的土著菌群。通过Phylogenetic Assignment Tool在线分析结果推测,东平湖沉积物中的优势菌群可能属于Firmicutes和Proteobacteria门。【结论】环境因素对东平湖沉积物的细菌多样性产生显著影响,但对其土著菌群的影响不大。