共查询到20条相似文献,搜索用时 31 毫秒
1.
采用RAPD和ISSR标记探讨中国疣粒野生稻的遗传多样性 总被引:123,自引:1,他引:123
用随机扩增多态DNA(RAPD)和inter-简单重复序列(ISSR0标记对分别来自中国海南和云南20个居群的疣料野生稻(Oryaz granulata (Nees et Arn. ex Watt.))混合样品,以及海南(M5)和云南(M27)2个居群各20个植株的遗传多生进行了检测。在混合取样的居群中,20个RAPD引物和12个ISSR引物分别扩增出209个122条带,多态条带比率9PPB)分别 相似文献
2.
莲品种资源的SRAP遗传多样性分析 总被引:10,自引:0,他引:10
利用分子标记SRAP技术对国内广泛栽培以及新近育成的39个莲品种进行了DNA多态性分析。选取5对引物扩增基因组DNA,共获得101条带,其中88条为多态性条带,每对引物平均提供20个标记信息。由UPMGA方法得到的聚类分析结果表明了39个品种间的遗传关系,结果表明:花莲、籽莲和藕莲三大类群有明显的界限,花莲和籽莲的遗传距离较近,藕莲与它们的遗传距离较远。分子方差分析结果表明:莲品种间和品种内均存在遗传变异,藕莲品种内的遗传变异略低于品种间的遗传变异,而诱变籽莲、诱变花莲和常规籽莲品种内遗传变异均大于品种间的遗传变异,尤其是诱变籽莲、诱变花莲品种内遗传变异占总变异的分量分别超过了70%和60%,这种品种内的遗传变异,一方面对于莲的高产稳产具有重要的意义,另一方面也说明了从这些国内广泛栽培的品种以及新近育成的莲品种中可以直接进一步选育出更优良的新品种。 相似文献
3.
苍术DNA分离及RAPD遗传多样性分析 总被引:10,自引:1,他引:9
用新鲜的或-75℃保存的苍术〔Atractylodeslancea(Thunb.)DC.〕叶片提取DNA,产量分别为40ng/mg鲜重和10ng/mg鲜重左右,分离出的DNA的OD260/OD280值均大于19,可用于RAPD试验。用8种引物对苍术4个居群的DNA进行扩增,单个10碱基的引物扩增出的RAPD标记在1~15之间,多态位点百分率南苍术为4750%,北苍术为4540%,遗传相似度值南苍术为085,北苍术为087。结果表明,南苍术的遗传多样性略高于北苍术。 相似文献
4.
鹅膏菌属真菌RAPD分析及亲缘关系的研究 总被引:14,自引:0,他引:14
本文对采自湖南莽山的26种鹅膏菌属(Amanita)真菌进行了随机扩增多态性DNA(RAPD)分析,40个随机引物中筛选出扩增效果较好的6个引物,每个引物能产生1~10条DNA条带,获得的RAPD谱带清晰并呈现多态性OPG15、OPH04两个引物扩增的RAPD谱带能将26种鹅膏菌完全区分开来,通过6个引物的RAPD分析获得的平均相似性系数表明种与种之间的相关系数在20-60%之间,平均链锁聚类分析 相似文献
5.
利用RAPD技术对不同基因组合的鱼类进行了基因组指纹图谱构建,在DNA水平上对基因组成分进行了分析,探讨了其遗传多态性。RAPD结果发现,在26个随机引物扩增的产物中,平均每个个体观察到约142个RAPD标记,单个引物获得的标记平均为5.4。其中4个引物扩增的图谱可将不同的生物型区分开:S-26引物的扩增图谱(Fig.1)可将红鲫(RA)与其它组合区分开,还可将鲤鲫杂种一倍体(CA)与鲫鲤杂种三倍体(CAA)和人工复合三倍体鲤(CCA)区分开;S-8引物(Fig.2)可区分开红鲤(RC)和镜鲤(MC);S-45引物(Fig.3)可区分开RC和CA;S-22引物则可区分开CAA和CCA。六种生物型均存在基因组特异性的图谱即各自独特的“诊断性”图谱,作者由此建立了详细的分子标记检索表(Table1)。通过对RAPD图谱的量化分析,利用UPGMA构建了不同生物型的遗传关系树图;反映了鲤鲫及各种组合生物型之间的遗传相似关系:RC和MC属同一种系,聚为一族;CAA和CA基因组类型相同,聚为一族;CCA虽自成一体,但可与CAA和CA聚为一族;而RA与其它组合遗传距离较远,自成一族。RAPD的结果也表明各种生物型内个体间 相似文献
6.
大豆灰斑病菌生理小种的RAPD标记 总被引:7,自引:1,他引:7
运用随机扩增多态性DNA(RandomamplifiedpolymorphicDNA,RAPD)技术对发生于中国东北的大豆灰斑病菌(Cercosporidiumsojimum)的10个生理小种进行基因组DNA多态性分析,用13个10-核苷酸随机引物获得了111个RAPD标记,其中86.5%具有多态性,通过聚类分析确定了供试小种间的亲缘关系,试验证明,RAPD技术分析大豆灰斑病菌遗传传变异可提供大量 相似文献
7.
芥菜16个变种的RAPD研究 总被引:39,自引:0,他引:39
利用RAPD技术对芥菜(BrasicajunceaCos.)16个变种的遗传变异进行研究。从60个随机引物中筛选出27个有效引物,共扩增出336条DNA带,其中275条为多态性带,占8185%,平均每个引物扩增的DNA带数为1244条。利用19个有效引物扩增的240条DNA带对芥菜16个变种间的亲缘关系进行UPGA聚类分析,计算出16个变种间的平均遗传距离为734,在此基础上建立了中国菜用芥菜16个变种的DNA分子系统树图。该系统将芥菜的16个变种划归A、B、C三个组,其中A组7个变种,B组8个变种,C组只有1个变种,B组又可细分为两个亚组。对芥菜遗传多样性的分子基础进行了探讨。 相似文献
8.
利用RFLP,SSR,AFLP和RAPD标记分析玉米自效系遗传多样性的比较研究 总被引:45,自引:0,他引:45
利用RFLP、SSR、AFLP和RAPD4种分子标记方法研究了15个玉米(Zea mays L.)自交系的遗传多样性,同时对4种标记系统进行比较。在供试材料中筛选到具多态性的RFLP探针酶组合56个,676对SSR引物,20个RAPD引物和9个AFLP引物组合,分别检测到多态性带167、201、87和108条。SSR标记位点的平均多态性检测效率(Ai,32.2)。4种分子标记所得遗传相似自交系划分 相似文献
9.
利用RFLP、SSR、AFLP和RAPD标记分析玉米自交系遗传多样性的比较研究 总被引:115,自引:3,他引:112
利用 RFLP、SSR.AFLP和RAPD 4种分子标记方法研究了 15个玉米(Zea mays L.)自交系的遗传多样性,同时对4种标记系统进行比较。在供试材料中筛选到具多态性的RFLP探针酶组合56个,66对SSR引物,20个RAPD引物和9个AFLP引物组合,分别检测到多态性带167、201、87和108条。SSR标记位点的平均多态性信息量(PIC)最大(0.54),AFLP标记位点最小(0.36),但AFLP标记具有最高的多态性检测效率(Ai,32.2)。4种分子标记所得遗传相似系数相关性显著,比较相关系数表明 RAPD可靠性较低。依据 4种分子标记结果将 15个供试自交系划分为塘四平头、旅大红骨、兰卡斯特、瑞德和PN共5个类群,与系谱分析基本一致。认为SSR和RFLP两种分子标记方法适合进行玉米种质遗传多样性的研究。 相似文献
10.
烟草黑胫病菌株亲缘关系的RAPD分析 总被引:15,自引:1,他引:14
从220个RAPD(Random Amplified Polymorphic DNAs)随机引物中所选出的多态扩增性强的21个引物对来源不同的33个烟草黑胫病菌株进行全基因组DNA遗传多样性分析和指纹构建。选用引物对受试菌株进行RAPD-PCR扩增,共产生243条DNA标记图带,其中191条为多态性图带,多态检测率为78.6%。利用UPGMA(Unweigthted Pair-group Meth 相似文献
11.
本文对采自湖南莽山的26种鹅膏菌属(Amanita)真菌进行了随机扩增多态性DNA(RAPD)分析,40个随机引物中筛选出扩增效果较好的6个引物,每个引物能产生1~10条DNA条带,获得的RAPD谱带清晰并呈现多态性OPG15、OPH04两个引物扩增的RAPD谱带能将26种鹅膏菌完全区分开来,通过6个引物的RAPD分析获得的平均相似性系数表明种与种之间的相关系数在20-60%之间,平均链锁聚类分析可将26种鹅膏菌分为二大类,且一些具菌环和苞状菌托的种类聚在一起,与形态分类基本相吻合。 相似文献
12.
本文对少孢节丛孢的10个菌株进行了胡机扩增多态性DNA(RAPD)分析。4个随机引物获得的RAPD谱带并呈多态性,单个引物获得的RAPD片段数在2~13个之间。供试的10个菌株来自不同的地方,形态差异较大,但四个随机引物的扩增结果基本上都体现了少孢节丛孢种的特征“指纹”,基于遗传距离分析和应用UPGMA方法构建的分子系统树显示,少孢节丛孢不同地理群体间不存在遗传分化,提示在少孢节丛孢群体中没有显著 相似文献
13.
从220个RAPD(RandomAmplifiedPolymorphic DNAs)随机引物中所选出的多态扩增性强的21个引物对来源不同的刀个烟草黑胫病菌株进行全基因组DNA遗传多样性分析和指纹构建。选用引物对受试菌株进行RAPD-PCR扩增,共产生243条DNA标记图带,其中191条为多态性图带,多态检测率为78.6%。利用UPGMA(UnweigthtePair-group MethodWithArithmetic Average)软件对受试菌株间的遗传距离进行聚类分析构建系统树状图,受试对个菌株被划分为5个遗传聚类组即(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ)。结果证明供试菌株具有丰富的遗传多样性,虽各自的遗传背景差异显著,但其亲缘关系相近,遗传聚类组的划分与菌株的地理来源未有明显的相关性。 相似文献
14.
北京东灵山辽东栎群落DNA多样性的研究 总被引:11,自引:0,他引:11
在同工酶研究基础上,利用随机扩增多态性DNA(RAPD)及DNA扩增指纹(DAF)方法,从生态学观点分析了北京东灵山区辽东栎(Quercus liaotungensis Koddz.)种群的遗传和多样性。对12个引物扩增产生的205个产物(部分)经,Shannon信息指数分析,结果表明:辽东栎群群内部存在丰富的遗传变异,中央种群的遗传多样性高于边缘种群的遗传多样性。总遗传多样性的95%发生在种群内 相似文献
15.
RAPD标记在紫菜遗传多样性检测和种质鉴定中的应用 总被引:42,自引:0,他引:42
用RAPD技术对4类紫菜(Porphyra yezoensis,P.haitanensis,P.katadni var.hemiphylla和P.oligospermatangia)的15个无性系丝状体进行了遗传多样履分析,从50个OPERON引物中经过初筛,其中6个引物可以扩增出稳定的可重复的图谱。这6个引物共扩增出了60条带,多态性比例达97.1%。根据RAPD结果将这15个无性了紫菜的DNA 相似文献
16.
RAPD用于生物鉴定具有快速、简便、经济等优点。但是,由于该法所用引物通常为9~10个寡聚核苷酸,与PCR使用特异引物相比,其Tm值相对较低,扩增反应易受外界条件影响,重复性较差。SRFA技术采用设计有限制内切酶位点的人工合成接头与引物互补,弥补了RAPD法的上述不足。Fig.1为SRFA的技术路线。为提高连接效率,在同一试管内,用PstI酶解基因组DNA,并与人工接头连结,制备SRFA扩增的模板。合成与接头序列相应的引物。对南方5个野生稻品种和籼、粳稻各一个栽培品种进行SRFA扩增。Fig.2表示:每种材料均能获得约10条以上的扩增条带。条带的大小在4002000bp之间。栽培稻品种中出现多态性片段:用引物1可得一条(1.3kb)片段,用引物2可得2条(1.1kb、0.7kb)片段。与FAPD法相比,SRFA法增加20%的多态性。栽培稻与野生稻之间在多态性上没有差异,说明两者亲缘关系非常接近。五种野生稻的图谱可分为两类:江西、湖南、广西的与籼稻相近,广东、云南的与粳稻相近。当然,这还有待其它方面的研究来验证。接头的设计要求避免自身连结,与目的片段连结后不能再被PstI切开。引物包括不变序列和选择序列两部 相似文献
17.
普通小麦细胞质雄性不育系及其保持系线粒体DNA的RAPD分析 总被引:1,自引:0,他引:1
应用随机扩增多态DNA(RandomamplifiedpolymorphicDNAs,RAPD)技术,对普通小麦细胞质雄性不育系(A)及其保持系(B)线粒体基因组(mitochondrialgenome)的指纹图谱进行了分析。共使用引物41个,其中20个引物得到了扩增产物,部分引物扩增结果表现多态性。说明线粒体DNA(mitochondrialDNA,mtDNA)序列在不育系和保持系之间存在差异,进一步明确了小麦细胞质雄性不育(cytoplasmicmalesterile,CMS)与mtDNA的关系。 相似文献
18.
利用分子标记定位农垦58S的光敏核不育基因 总被引:17,自引:0,他引:17
对农垦58S(Oryzasativasp.japonica)/大黑矮生标记基因系FL2组合组建可育集团和不育集团,并以亲本为对照进行了RFLP、RAPD和双引物RAPD分析,结果第12染色体上的一个单拷贝标记G2140与光敏核不育基因连锁遗传,二者间的遗传图距为14.1cM(centimorgan)。在筛选过的1040个随机单引物和190个双引物中,仅引物OPAU10扩增出与光敏核不育基因连锁的1.5kbDNA片段,回收、克隆该DNA片段并制备探针,将其转换成共显性的RFLP标记并命名为OPAU101500。分离群体连锁分析表明该标记与标记G2140紧密连锁,将农垦58S的一对光敏核不育基因定位于第12染色体上。 相似文献
19.
中国棉花枯萎菌生理小种的RAPD分析 总被引:9,自引:0,他引:9
利用随机扩增多态性DNA(RAPD)分子标记方法对我国棉花枯萎菌3个生理小种(3、7、8号)进行遗传多样性分析,以筛选出的10个随机引物对采自我国11个省(自治区)的26个代表菌株及国外3个不同生理小种对照菌株进行RAPD-PCR扩增,共产生了140个RAPD分子标记,其中87.8%具有多态性。通过聚类分析确定了供试小种间的亲缘关系,并寻找到了我国3、7、8号小种的特异条带,为确立我国棉花枯萎菌生 相似文献
20.
少孢节丛孢DNA随机扩增多态性及变种分析 总被引:1,自引:0,他引:1
本文对少孢节丛孢的10个菌株进行了随机扩增多态性DNA(RAPD)分析。4个随机引物获得的RAPD谱带清晰并呈多态性,单个引物获得的RAPD片段数在2~13个之间。供试的10个菌株来自不同的地方,形态差异较大,但四个随机引物的扩增结果基本上都体现了少孢节丛孢种的特征“指纹”。基于遗传距离分析和应用UPGMA方法构建的分子系统树显示,少孢节丛孢不同地理群体间不存在遗传分化,提示RAPD在少孢节丛孢群体中没有显著的地区特异性。结果表明,根据分生孢子的大小将少孢节丛孢划分为三个变种的观点不能成立,而附属丝在少孢节从抱形态分类上没有意义。 相似文献