乙肝病毒核衣壳启动子内三链DNA的形成

用电泳迁移分析方法研究了２１ｎｔ脱氧寡核苷酸Ｇ３ＴＧ２ＴＧＴ２Ｇ５ＴＧ２ＴＧＴ与１２９ｂｐ的乙肝病毒核衣壳启动子片段内一位点结合形成的三链ＤＮＡ的特异性及稳定性。在克隆有ＨＢＶ基因组的质粒ｐＣＲＰ１０的酶切产物中,ＣＰ１仅与含Ｃｐdisplay structure     

三链DNA的形成抑制DNA结合蛋白与启动子的结合

电泳迁移分析方法及DNaseⅠ足迹实验表明21nt脱氧寡核苷酸G3TG2T GT2G5TG2TGT(CP1)与乙肝病毒(HBV)核心启动子(Cp)片段之间三链DNA的形成有较高的特异性及稳定性.凝胶滞留实验显示, 在大鼠肝细胞核提取物体外转录系统中, CP1可特异地抑制DNA结合蛋白与Cp片段的结合, 而不能与Cp结合形成三链DNA的脱氧寡核苷酸CP3(TGTG2TG5T2GTG2TG3)对蛋白与Cp的结合并无抑制作用.这些结果表明, 三链DNA的形成有可能抑制HBV DNA的转录.     

三链DNA的形成抑制转录因子与乙肝病毒核衣壳启动子的结合

合成的寡核苷酸可缠绕于DNA双螺旋大沟内并以氢键与其相互作用形成三链DNA结构,这类寡核苷酸常简称为TFO(triplex-form-ing oligonucleotide)。通过TFO与靶基因结合形成局部的三链结构来抑制基因转录的技术被称为反基因策略(antigene strategy)。我们选择乙肝病毒(HBV)核衣壳启动子(Cp)内一近似同聚嘌呤·同聚嘧啶序列(1734～1754,ayw亚型,以EcoR Ⅰ切点为 1)为靶序列,以嘌呤     

三链DNA的分离纯化

λ－ＤＮＡ Ｈｉｎｄ ＩＩＩ热变性可得到单、双、三链ＤＮＡ等混合物,本文利用ＤＮａｓｅＩ选择性地将其中的单、双链酶解后,经ＳｅｐｈａｄｅｘＧ－１５０分离,得到了纯化的三链ＤＮＡ,并对其进行了ＵＶ、荧光光谱、ＣＤ谱及Ｔｍ等性质测定。     

抑制启动子的三链DNA的结构模建及稳定性研究

在IRIS Indigo2(SGI公司)工作站上,利用InsightⅡ/MSI软件包,以TAT三链DNA为模板,采用同源模建的方法,分别建立起两个含21nt的脱氧寡核苷酸CP1(G3TG2TGT2G5TG2TGT)和CP3(TGTG2TG5T2GTG2TG3)的三维结构.采用分子力学方法进行能量优化,将得到的能量最低结构作为分子的优势构象.研究结果显示,CP1的能量低于CP3的能量,即前者的结构较后者稳定.从而证明了CP1与乙肝病毒（HBV）的核心启动子（Cp）片段之间能稳定地形成三链DNA,并能特异性地抑制DNA结合蛋白与Cp片段的结合.这些结果表明,三链DNA的形成有可能抑制DNA的转录.     

分子间三链DNA的应用

自Ｄｅｒｖａｎ等１９８７年首先证实三链ＤＮＡ的形成可介导对靶ＤＮＡ的特异切割以来,有关三链ＤＮＡ的研究进展和奶快。本综述了近几年分子间三链ＤＮＡ在基因表达调控、染色体作图、基因分离及定点诱变等方面的应用,并对三链ＤＮＡ应用中存在的几个问题及相应的解决方法作了简单介绍。     

三链DNA与反基因技术的研究进展

三链ＤＮＡ与反基因技术的研究进展方晔,白春礼（中国科学院化学研究所北京１０００８０）寡聚核苷酸及其衍生物能通过几个战略来实现选择性地调节基因表达［１］,在反义技术中,寡聚核苷酸以信使ＲＮＡ的专一性序列作为靶物,并由此阻止信使ＲＮＡ将信息翻译成蛋白质;...     

乙型肝炎病毒全基因序列的测定

测定７ 例慢性 Ｈ Ｂ Ｖ 携带者 Ｈ Ｂ Ｖ 基因组全序列,经同源性比较,确定基因型。２ 例基因型为 Ｂ 型,余均为 Ｃ 型;血清型ａｄｒ ４ 例,ａｄｗ ３ 例。各序列间 Ｘ 基因差异最大。未见 Ａ１８９６ 、 Ｔ１７６２ Ａ１７６４等重要位点的变异。结合已有的２ 株 Ｈ Ｂ Ｖ 中国流行株全基因序列,初步建立以中国流行株序列为基础的 Ｈ Ｂ Ｖ 标准序列,该标准序列与国外标准序列仅有２２ 个位点的差异     

人乙型肝炎病毒前表面抗原preS基因的克隆与序列分析

从杭州、兰州两地各一例乙型肝炎病毒（HBV）表面抗原阳性血清中提取病毒DNA,采取PCR技术扩增出前表面抗原（preS)基因片段,重组到质粒载体上,对该基因进行了全序列测定[GenBank索取号CpreS-HZ:AF 325674;preS-LZ:325675].克隆的HBVpreS基因杭州分离物（preS－HZ）和兰州分离物（preS－LZ）全长522个核苷酸,编码174个氨基酸。preS－HZ与已发表的HBV adr亚型上海分离物、北京分离物、日本分离物、HBVadw亚型和ayw亚型preS基因的核苷酸序列同源性分别为96．7％、96．2％、97．3％、88．7％和84．1％,氨基酸序列同源性分别为96．0％、94．9％、97．1％、85．1％和85．4％;preS－LZ与相应序列的核苷酸序列同源性分别为96．4％、96．2％、96．9％、88．7％、83．7％,氨基酸序列同源性分别为94．9％、94．9％、96．0％、85．1％、84．1％,分子进化分析（ADNASTAR,1999）表明,相对于以上报道的序列二者含有四个特异的氨基酸突变位点,在免疫保护区内二者具有较好的保守性,可用于表达乙肝重组亚单位疫苗。     

Interference of Hepatitis B Virus with Cellular Signaling

The presence of hepatitis B virus (HBV) proteins leads to changes in the cellular gene expression. As a consequence, the cellular signaling processes are influenced by the actions of HBV proteins. It has been shown that HBV nucleocapsid protein and the amino-terminal part of polymerase termed as terminal protein (TP) could inhibit interferon signaling. Further, the global gene expression profiles differ in hepatoma cells with and without HBV gene expression and replication. The expression of interferon (IFN) stimulated genes (ISGs) was differently regulated in cells with HBV replication and could be modulated by antiviral treatments. The HBV TP has been found to modulate the ISG expression and enhance the HBV replication. The modulation of the cellular signaling processes by HBV may have significant implications for pathogenesis.     

pRNA介导的RNA干扰抑制HBV表达和复制的研究

为了研究由pRNA携带的siRNA(HBVsi18-42)所介导的RNAi过程能有效地抑制HBV的基因表达和病毒复制,我们利用细胞模型和高压注射小鼠模型评价HBVsi18-42对HBV复制和基因表达的抑制作用。通过Western印迹检测细胞内的HBsAg含量,用ELISA检测细胞培养上清和小鼠血清中的HBsAg水平,采用Southern印迹检测HBV的复制中间体,通过免疫组织化学检测肝组织切片中HBcAg的表达情况。试验结果显示,HBVsi18-42能以剂量依赖的方式在293T细胞中抑制HBsAg的表达以及在HepG2细胞中下调病毒HBsAg和HBeAg的表达和病毒复制中间体的水平。在小鼠模型中,注射后的3d内HBVsi18-42使小鼠血清中HBsAg的水平分别下降了98.98%、77.07%和60.73%,免疫组织化学检测显示,在注射后的第3天小鼠肝组织内HBcAg阳性细胞数减少了79.1%。初步结果显示HBVsi18-42无论是在细胞或是在小鼠模型中都能下调HBV的复制和基因的表达。本研究为我们下一步实现由pRNA介导的靶向RNAi及基因治疗提供了理论和技术支持。     

Advances in Research on Hepatitis B Virus DNA Integration

Since HBV DNA integration was discovered for the first time in 1980, various methods have been used to detect and study it, such as Southern Blot, in situ hybridization, polymerase chain reaction and so on. HBV DNA integration is thought to be random on the whole although some hot spots of integration were described by some researchers, one of which might be the repetitive sequences of the genomic DNA. Besides, DNA damage, especially double-strand breaks could promote HBV DNA integration into host genome. HBV DNA integration into cells may damage the stability of the genome, cause DNA rearrangement, promote DNA deletion and induce the formation of HCC.     

基因工程乙肝疫苗研究进展

乙肝病毒(hepatitisBvirus,HBV)为嗜肝病毒,全世界有超过3亿人受到乙肝病毒的感染。综述近年来乙肝疫苗的最新研究进展,并对乙肝疫苗的发展历程,应用中出现的问题,克服不应答及低应答的策略,乙肝疫苗的发展方向以及目前最新的DNA疫苗进行了阐述 。     

乙型肝炎病毒感染Babl/c乳鼠动物模型的研究

目的:目前HBV感染动物模型各有局限,无法全面研究HBV。拟建立人HBV血清感染Babl/c乳鼠的动物模型,以便于研究HBV感染与乳鼠免疫力低下的相关性。方法:将20只Babl/c乳鼠随机分为实验组、对照组、PBS组及空白组,通过高压水动力尾静脉注射法将人HBV血清、正常人血清、PBS注入各组乳鼠体内,记录接种后乳鼠体温及体质量。于接种后第7、15、30 d采集血清标本,应用ELISA检测HBs Ag、HBe Ag的表达情况,实时荧光定量PCR检测HBV DNA浓度。结果:接种后各组小鼠体温及体质量均无明显变化。实验组中共4只乳鼠可检测到HBs Ag为阳性且维持时间长达30 d,但HBe Ag均为阴性,HBV DNA浓度均未达500 IU/ml;余下各组检测HBs Ag、HBe Ag均为阴性。结论:通过高压水动力尾静脉注射法接种人HBV血清,可成功使Babl/c乳鼠感染HBV。本实验证实乳鼠免疫力低下,HBV血清进入体内未能有效清除,对HBV存在易感性,为建立HBV感染动物模型提供实验依据,可用于研究HBV对免疫状态的影响。