提高DNA序列测定的准确性方案

目前 ,ＤＮＡ测序的核心仪器是使用荧光染料标记的、具有ＣＣＤ光学系统的ＤＮＡ测序仪 ,其工作原理主要包括 :用不同的荧光染料确定Ａ、Ｇ、Ｃ和Ｔ这 4种碱基的延伸反应 ,通过激光的激发 ,每种染料可以发射出不同的电信号 ,测序仪收集这些光波信号后 ,通过计算机数据分析 ,可得到相应的碱基序列。利用这种方法 ,所有 4种染料可在同一凝胶泳道中检测和辨别 ,消除了因泳道之间迁移率的差异所引起的误差 ,增加了测序的精确度 ;同时 ,可以增加在同一块凝胶上所能分析的模板ＤＮＡ数量。毛细管电泳技术的应用可使测序样品的加样自动化 ,且无须用…     

焦测序技术的研究进展

焦测序技术是一种实时DNA测序技术。它在DNA聚合酶、三磷酸腺苷硫酸化酶、荧光素酶和三磷酸腺苷双磷酸酶4种酶的协同作用下,将焦磷酸转化为等量的荧光信号,通过荧光信号的高低实时检测待测序列,操作简便,可实现高通量、自动化测定,检测不需要电泳,不需要对样品标记和染色,结果准确可靠重复性好。本文综述了焦测序技术的基本原理、历史及其在测序模板制备技术、反应体系和检测仪器三个方面的最新进展,并重点介绍制备单链的Late-PCR技术、高灵敏度反应体系的获得以及454公司超高通量测序技术,并对焦测序技术的发展做了展望。     

焦测序技术的研究进展

焦测序技术是一种实时DNA测序技术.它在DNA聚合酶、三磷酸腺苷硫酸化酶、荧光素酶和三磷酸腺苷双磷酸酶4种酶的协同作用下,将焦磷酸转化为等量的荧光信号,通过荧光信号的高低实时检测待测序列,操作简便,可实现高通量、自动化测定,检测不需要电泳,不需要对样品标记和染色,结果准确可靠重复性好.本文综述了焦测序技术的基本原理、历史及其在测序模板制备技术、反应体系和检测仪器三个方面的最新进展,并重点介绍制备单链的Late-PCR技术、高灵敏度反应体系的获得以及454公司超高通量测序技术,并对焦测序技术的发展做了展望.     

MedLab硬软件全面升级为6.0

南京美易科技有限公司属南京江宁国家级高新技术开发区内的高新技术企业，企业拥有企业标准并已通过ISO9001：2000国际质量管理体系认证。13年来，我们一直致力于生理科学实验仪器的研制与开发。公司成员大多是高校教师，技术力量雄厚，多学科的交叉和结合，     

贝克曼激光研究所及临床医院历史、机构与目的

贝克曼激光研究所及临床医院历史、机构与目的贝克曼激光研究所及临床医院是由Ａ．Ｄ．贝克曼（哲学博士）和Ｍ．ｗ．伯思斯（哲学博士）基于对激光在生物医学的重要性的认知而于１９８２年共同创立的。贝克曼博士是贝克曼仪器公司和贝克曼激光研究所的创始人和名誉主席。...     

圈养小熊猫几种病毒的PCR检测

本文采用巢式PCR/ RT-PCR 方法,对我国10 个动物园中无临床症状的圈养小熊猫的71 个肛拭子和61 个唾液拭子样品,进行犬瘟热病毒(CDV)、犬细小病毒(CPV)、犬冠状病毒(CCV)、犬腺病毒(CAV)和犬疱疹病毒(CHV)的检测,以评估我国圈养小熊猫是否面临这几种病毒的威胁。对阳性PCR 结果进行测序分析,并与GenBank 上的序列进行比较。结果,在肛拭子样品中检测到3 个CPV 和6 个CCV 阳性结果,经测序后,与GenBank 上序列的同源性分别达99% 和100% 。而在唾液拭子样品中没有检测到任何阳性结果,且CDV、CAV和CCV 的检测结果均为阴性。从阳性CPV 的肛拭子样品中分离到一株细小病毒毒株,表明圈养小熊猫已受到细小病毒和犬冠状病毒的感染,今后应加强这两种病毒的预防工作。本文所采用的PCR 方法检测病毒性疾病,能检测到微量的病毒模板,可对小熊猫病毒性感染进行早期诊断。     

多项目连续流动式生化自动分析仪通过鉴定

由上海医疗器械研究所研制成功的多项目连续流动式生化自动分析仪,于1986年12月在上海通过鉴定。该仪器采用连续流动式原理,被测样品和添加试剂在管道中流动,试剂添加、混合、恒温培养、化学反应显色、检测等步骤均在仪器的管道系统中完成。结构简单,操作方便,化验速度快、精度高,且仪器成本低廉,不易发生故障,因而受到欢迎。该仪器有二种工作方式:一是计算机联机工作,此时采样、稀释控制、数据处理、基线校正、打印报告及CRT显示均由该系统完成。二是计算机脱机工作,此时不用计算机系统     

中美血气电解质分析技术交流会

应上海医疗器械研究所的邀请,美国NOVA公司一行三名科技人员来沪与该所及有关医院的医生,于1988年6月15日进行了血气电解质分析技术交流。交流会就血气/生化分析及离子选择性电解质分析的各种仪器及临床应用等方面广泛地进行了技术交流。美方详细介绍了NOVA公司上述两个系统的仪器结构、性能和实际操作示范。NOVA公司的生化仪器是世界上比较著名的厂家之一。如STAT Profile系列血气/生化分析仪,尤是一个小型实验室,每小时能分析38个样品,每份样品仅需250μl,一次     

MedLab硬软件全面升级为6．0（生物信号采集处理系统等）

南京美易科技有限公司属南京江宁国家级高新技术开发区内的高新技术企业，企业拥有企业标准并已通过ISO9001：2000国际质量管理体系认证。13年来，我们一直致力于生理科学实验仪器的研制与开发。公司成员大多是高校教师，技术力量雄厚，多学科的交叉和结合，使拥有自主知识产权的MedLab（登记号：3128284）系列产品在生物信号采集处理领域处于领先地位，多项功能超过国际同类产品，并不断开发出各类实验新产品。MedLab生物信号采集处理系统已获得国家专利（专利号ZL02220911．5）并获得香港专利博览会金奖。MedLab能替代传统的多道生理记录仪、示波器、X—Y记录仪和刺激器等仪器，一机多用，功能强大，可应用于医学院、药学院、生命学院、体育学院、师范学院、农学院等生命学科的生理学、药理学、病理生理学、运动生理学和心理学等实验。     

MedLab硬软件全面升级为6．0

南京美易科技有限公司属南京江宁国家级高新技术开发区内的高新技术企业,企业拥有企业标准并已通过ISO9001：2000国际质量管理体系认证。13年来,我们一直致力于生理科学实验仪器的研制与开发。     

MedLab硬软件全面升级为6．0（生物信号采集处理系统等）

南京美易科技有限公司属南京江宁国家级高新技术开发区内的高新技术企业，企业拥有企业标准并已通过ISO9001：2000国际质量管理体系认证。13年来，我们一直致力于生理科学实验仪器的研制与开发。公司成员大多是高校教师，技术力量雄厚，多学科的交叉和结合，使拥有自主知识产权的MedLab（登记号：3128284）系列产品在生物信号采集处理领域处于领先地位，多项功能超过国际同类产品，并不断开发出各类实验新产品。MedLab生物信号采集处理系统已获得国家专利（专利号ZL02220911．5）并获得香港专利博览会金奖。MedLab能替代传统的多道生理记录仪、示波器、X—Y记录仪和刺激器等仪器，一机多用，功能强大，可应用于医学院、药学院、生命学院、体育学院、师范学院、农学院等生命学科的生理学、药理学、病理生理学、运动生理学和心理学等实验。     

MedLab硬软件全面升级为6．0（生物信号采集处理系统等）

南京美易科技有限公司属南京江宁国家级高新技术开发区内的高新技术企业,企业拥有企业标准并已通过ISO9001：2009国际质量管理体系认证。13年来,我们一直致力于生理科学实验仪器的研制与开发。     

日本计划用白杨树基因培育新树种

日本森林综合研究所和物理化学研究所近日决定 ,今后两三年内在搜集所有白杨树基因的基础上 ,选取有用基因加以解析 ,以用于培育吸纳、贮存二氧化碳能力强的树木。白杨树大约有 5 .5万个碱基对 ,比已经完成基因测序工程的水稻碱基对稍多一点 ,是最有可能成为率先完成基因测序的树木 ,从而作为树木研究标本在国际上引人注目。据悉 ,现在美国已经开始了白杨树基因测序工作 ,研究白杨染色体的国际组织最近也已正式成立。然而 ,如果待白杨树基因测序完成之后再来培育新品种速度太慢 ,因此日本森林综合研究所决定将目标集中于有用基因 ,而且解析…     

纪念巴斯德研究所成立100周年

今年是巴斯德研究所创办100周年纪念。100年前,巴斯德在该所奠基仪式上说:“我们的研究所将同时是狂犬病治疗所、传染病研究中心以及为提高微生物学知识的教学中心”。如今,这个研究所已拥有各类人员2000名,内设9个研究部,80个研究组。该所的生产部有职工800人,为社会提供疫苗、抗生素等医药制品。该所培训中心每年培养300名大学生和600名博士后研究生。     

Metabarcoding技术在植物鉴定和多样性研究中的应用

目前植物学研究已进入后植物志时代,iFlora的实现需要以传统植物分类学及相关研究为基础,整合基于高通量测序的DNA条形码（DNAbareoding）技术并开发便携式快速鉴定仪器及构建信息平台。传统植物鉴定多基于形态学分类,而近年来快速发展的DNA条形码快速鉴定技术被各界分类学家认可,在植物鉴定中也被广泛应用。但DNA条形码技术仍存在一些问题亟待解决,如种的鉴定需要多个条形码的解析、Sanger测序平台无法处理混合样品。本文介绍了传统植物分类技术和DNA条形码技术在植物研究中的应用和遇到的瓶颈;并重点介绍了基于高通量测序的metabarcoding技术在植物鉴定及多样性研究中的应用及前景,及其与iFlora的关系。     

开展红外光谱测试服务工作

为了贯彻科学技术工作要面向经济建设的方针,推动科研工作,充分发挥贵重仪器的作用,生物物理研究所五室开展了红外光谱测试服务工作。该室所用测试仪器为580B型红外光谱仪扫描范围4000cm~-1—180cm~-1(2.5μ—50μ),其特点是附件添置齐全,可进行各种样品的测试。和带有微量样品池,可测试微量液体;有聚光器,可测微量固体;有可变光路池,可测不同厚度液体样品;备有变温池,测量温度变化范围可由     

Tm-shift基因分型方法在遗传学中的应用

Melting Temperature shift(Tm-shift)是一种新的基因分型方法,主要通过在两条特异性引物5′端加入不同长度的GC序列,PCR扩增后根据熔解曲线中产物Tm值的差异来完成分型。文章建立了Tm-shift法对2 048份样品的29个SNP进行分型,通过分型成功率、重复检测一致率、测序验证准确度综合评价分型效果。结果显示,29个SNP中有27个可以采用本方法分型,分型成功率为93.1%。测序验证准确性达到100%。3种基因型阳性标准对照重复检测一致率为100%;100个随机样品重复检测,重复性为97%。因此,Tm-shift基因分型法是一种成本低廉、准确灵敏、稳定可靠、通量灵活、操作简便的基因分型方法,可在遗传学研究中推广应用。     

征订启事

《激光生物学报》的前身是《激光生物学》杂志 ,创刊于 1992年 ,1997年经国家科委、新闻出版署批准改为现刊名 ,是由中国科学技术协会主管、中国遗传学会主办、湖南师范大学承办和华南师范大学激光生命科学研究所、安徽农业大学生命科学学院、上海交通大学激光与光子生物医学研究所、中国海洋大学物理系、福建师范大学激光研究所、扬州大学计算物理研究所、亚盛集团博士后科研工作站北京分站协办 ,由国内外有关专家、学者组成的《激光生物学报》编委会编辑部编辑出版的学术性刊物 ,是目前国际上唯一的一份激光生物学科的专业性学术刊物 ,已…     

中国各地不同枣树品种上枣疯病植原体的PCR检测及分子变异分析

摘要：【目的】检测不同地区枣树品种上的枣疯植原体侵染及保守基因序列的变异。【方法】利用植原体16S rDNA的通用引物R16mF2／R16mR1、16S-23S间区序列(SR)的通用引物SR1/SR及secY基因引物FD9f/r,通过PCR检测采自国内7个地区14个枣树品种上的32个枣疯病和4个酸枣丛枝病样品。将PCR产物进行直接或克隆测序,结合已报导的测序数据,进行序列同源性和系统进化分析。【结果】所有枣疯病样品中均检测到植原体;皆属于榆树黄化16S rV-B亚组,与我国重阳木丛枝和樱桃致死黄化遗传关系     

一种基于新型再测序芯片的不明原因腹泻样品检测方法的建立和初步应用

本研究建立了一种基于新型再测序芯片(Resequencing Pathogen Microarray,RPM)的腹泻症候群多病原检测方法,能同时检测14种轮状病毒,7种杯状病毒,8种星状病毒,28种肠道病毒,16种少见致泻病毒。选取已验证的阳性病毒样本为模板来评估该方法的特异性。用克隆质粒和体外转录的RNA梯度稀释液来检验RPM的灵敏度,在20~2 000拷贝/μL水平时RPM仍能检测和分辨出相近的病毒亚型。通过调整参考品的浓度优化了阳性判定阈值,并改进了肠道病毒的检测流程以完成分型。对10份不明原因腹泻样品进行了筛查,从中检出6份腹泻病毒阳性样本。根据RPM结果对样品进行了单重PCR并且测序,RPM与测序结果一致。本研究建立了一种高通量,高特异性,灵敏度较高的RPM方法,对于不明原因腹泻病例的诊断和突发疫情的处理有巨大的应用价值。