甘肃裕固族HLA-DRB1基因多态性及其族源分析

目的:研究甘肃裕固族HLA-DRB1基因的多态性,探讨裕固族的起源、迁徙及其与其他民族的关系.方法:应用PCR-SSP基因分型技术,对54例裕固族个体进行了HLA-DRB1位点的基因分型并进行相应等位基因频率的比较.结果:甘肃裕固族HLA-DRB1位点共检出了14种等位基因,其中高频基因为DR5(0.2115),DR4(0.1346)和DR7(0.1250),低频的等位基因为DR14(0.0096)和DR13(0.0192);裕固族人HLA-DRB1座位等位基因总的分布格局与蒙古族最接近,与云南黎族则相差较远.结论:对裕固族和我国各地人群的HLA-DRB1频率进行了聚类分析,极为相似的HLA-DRB1背景提示裕固族和蒙古族之间密切的遗传关系.     

云南纳西族HLA—DRB1基因多态性研究及其族源分析

首次在国内采用本室改进的高分辨率的基于内含子的PCR－SBT分型方法,检测云南纳西族HLA－DRB1基因多态性。在60例纳西族个体中共检出37种HLA－DRB1等位基因,其显著特点是等位基因的类型检出较多,频率分布比较平均,除12021（17.50%）外其他的等位基因频率均低于8％,其他较常见的等位基因（＞5％）还有1404（7.50%）,1504（5.83%0,04051（5.83%0,08032（5.83%）,09012（5％）,03011（5％）。这几种中频等位基因共占可检出等位基因的35％,与12021一起共占52.49%,其中DRB1＊0305、0438、1123、1132、1310、0812为首次在我国人群中检出,并且在世界各地人群中也比较罕见。以纳西族和世界各地人群的HLA－DRB1频率进行了聚类分析。比较分析的结果显示纳西族明显属于中国南方族群,未显示出其族源来自北方的痕迹。根据遗传数据,并参照民族学、历史学研究,对其民族起源做了初步的分析。     

HLA—DRB1等位基因的多态性及其应用

HLA系统参与和调节机体免疫功能,是人类重要叫遗传标志,具有种族、地域差异。HLA—Ⅱ类系统中DRB1等位基因的多态性最丰富,它的准确分型直接影响器官移植的供体选择、法医学个体认定、HLA与疾病相关性及人类学等研究。本文综述了HLA—DRB1分型检测方法,不同种族人群HLA-DRB1等位基因的多态性,HLA—DRB1多态性研究在探讨人类起源、民族融合方面的价值,HLA—DRB1与肝炎、系统性红斑狼疮等疾病的相关性等。     

HLA—DRB1基因位点多态性的PCR—RFLP分析

设计并建立了一套适合国内应用的改良ＰＣＲ－ＲＦＬＲ方法,分５组特异性扩增ＤＮＡ样品,随后进行酶切定型分析,准确检测了编码ＤＲ抗原特异性ＨＬＡ－ＤＲＢ１基因位点的多态性,该法采用分组扩增,不发生与其它ＤＲＢ位点等位基因的交叉扩增,不仅适合纯合子的区分而且可以清楚准确地检测杂合子样品。     

HLA－DRB1基因位点多态性的PCR－RFLP分析

设计并建立一套适合国内应用的改良ＰＣＲ－ＲＦＬＲ方法,分５组特异性扩增ＤＮＡ样品,随后进行酶切定型分析,准确检测了编码ＤＲ抗原特异性的ＨＬＡ－ＤＲＢ１基因位点的多态性,该法采用分组扩增,不发生与其它ＤＲＢ位点等位基因的交叉扩增,不仅适合纯合子的区分而且可以清楚准确地检测杂合子样品,已报道过的ＤＲＢ１位点编码的特异性组合都可以通过这个方法得到准确分析。所使用的Ⅱ类限制性内切酶均价格便宜、易购。     

HLA—DRB1基因多态性与溃疡性结肠炎的相关性研究进展

溃疡性结肠炎（Ulcerativecolitis,uc）是一种直肠和结肠的慢性非特异性炎症性疾病,其病因至今仍未完全阐明,普遍认为与遗传因素和自身免疫异常有关。人类白细胞抗原（Humanleukocyteantigen,HLA）是人类主要组织相容性复合体（MHC）基因的编码产物,是调控人类免疫应答的关键因素之一,其中HLAII类基因参与外源性抗原的递呈,是目前研究的最为广泛的与炎症性肠病相关的区域。HLAII类基因中以HLA—DRB1等位基因的多态性最丰富,国内外大量研究均显示HLA—DRB1基因不仅与uc的发病密切相关,而且与UC的临床特点有关联,但研究的结果并不完全一致,而且其导致特定人群UC易感的分子生物学机制也不十分清楚。本文主要综述HLA．DRB1基因多态性与uc相关性的研究进展。     

用PCR—RFLP方法研究藏族HLA0—DQA1和—DQB1基因多态性

应用目前ＨＬＡ研究领域中成熟的、有效的ＰＣＲ－ＲＦＬＰ基因分型技术,从ＤＮＡ水平对藏族健康群体进行了ＨＬＡ－ＤＱＡ１（４９人）和－ＤＱＢ１（４９人）基因分型,这在国内外属首次。所采用的ＰＣＲ－ＲＦＬＰ基因分型技术是在ＨＬＡ－ＤＱＡ１和－ＤＱＢ１各等位基因全部序列已知的情况下,对其第２个外显子碱基序列扩增进而进行ＲＦＬＰ分析的方法。这种方法得到的ＲＦＬＰ的所有片段都是已知序列,因而精确度很高,同时为     

金鱼Vsx1基因结构及其内含子多态性分析

Vsx1是第一个在金鱼中发现的编码含有同源异型框(homeodomain)和CVC结构域蛋白的基因。该基因在胚胎发育的不同阶段在胚胎的不同区域和不同组织中表达,并已经证明它在视网膜视锥双极细胞的分化和正常功能的维持中具有重要作用。为了进一步研究该基因在不同发育阶段组织特异性表达的调节机制,实验用PCR方法分析了金鱼Vsx1的基因组结构和内含子多态性。结果表明:金鱼Vsx1基因由5个外显子和4个内含子组成,与斑马鱼、人、小鼠的Vsx1基因结构相同。4个内含子中,第一内含子有两种序列差异明显的类型,但第二、三、四内含子无明显差异。第一内含子的一种类型比另外一种类型多39个碱基,这39个碱基中包括了真核生物增强子的核心序列。这一观测结果提示金鱼Vsx1第一内含子可能与该基因的发育阶段特异性和组织特异性表达调节有关。同时,第一内含子序列的明显差异也为分析Vsx1不同等位基因或基因拷贝的表达活性,以及组织特异性表达调节方式提供了合适的探针序列。     

四川彝族和新疆维族HLA-B位点基因多态性分析

应用PCR-SSP(Polymerase Chain Reaction-Sequence Specific Primer) 方法对无亲缘关系的106位四川彝族样品和110位新疆维族样品进行HLA-B基因分型。在彝族样品中共检出20个等位基因,其中高频率的等位基因为B*40（0.2028）、B*15（0.1604）、B*51(0.1274),低频率的等位基因为B*47 (0.0189)、B*27(0.0142)、B*44(0.0142)、B*18(0.0094)和B*78(0.0047)。在维族样品中共检出27个等位基因,其中高频率的等位基因为B*35 (0.1136)和B*51（0.1136）,低频率的等位基因为B*41（0.0045）、B*56（0.0045）和B*78（0.0091）。经χ2检验,两个民族群体的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡。经遗传分析,四川彝族群体HLA-B基因座杂合度(H)、个体识别率(DP)和非父排除率(EP)分别为0.8977、0.9661和0.8009;维族群体的H、DP和EP分别为0.9372、0.9857和0.8732。本研究获得了四川彝族和新疆维族HL A-B基因座基因频率数据,为临床器官移植配型、人类学、法医学及疾病关联性研究提供了重要的群体遗传学资料。     

陕北白绒山羊DRB1基因多态性与球虫病的相关性分析

本研究旨在探讨陕北白绒山羊MHC (主要组织相容性复合体)基因与疾病抗性的关系,通过对98只陕北白绒山羊DRB1基因外显子2多态性与球虫病的相关性研究,共获得17条等位基因和29种基因型,其中10条等位基因是首次发现。生物信息学分析表明DRB1位点具有高度多态性,且不同等位基因预测的蛋白质结构存在明显差异,说明这种基因可能通过抗原呈递分子结构的改变影响宿主对病原体的免疫应答。相关性分析发现DRB1*16等位基因频率与球虫感染强度呈显著负相关(p0.05),提示该等位基因可能与相关抗原呈递及抗性的产生有关。本次对陕北白绒山羊DRB1基因多态性及其与球虫病的相关性分析有助于筛选疾病抗性和易感性相关基因,进而可加速绒山羊抗病品系的培育进程。     

云南澜沧拉祜族HLA-DRB1基因多态性研究

采用我们改进的高分辨率基于内含子的PCR-SBT分型方法,首次检测云南拉祜族HLA-DRB1基因多态性。在55例拉祜族个体中共检出16种HLA-DRB1等位基因,最常见的DRB1等位基因是HLA-DRB1*12021、09012、15011,基因频率分别为30.909%、15.455%、13.636%,共占拉祜族可检出等位基因的60%,其中DRB1*0413、11081、1312、1418、1504首次在我国人群中检出,并且在世界各地人群中也比较罕见。对拉祜族和世界各地人群的HLA-DRB1频率进行了比较,分析了HLA-DRB1等位基因在各人种中的分布特点,并用Neighbor-joining法进行了聚类分析。比较分析的结果显示拉祜族明显属于中国南方族群,未显示出其族源来自北方的痕迹。对此遗传数据和民族学、历史学研究的矛盾,做了初步的分析。 Abstract:The HLA-DRB1 gene polymorphism in Lahu ethnic of Yunnan,China was the first time investigated using high resolution PCR-SBT method,which is based on sequences of HLA-DRB1 Intron 1 and Intron 2 and with our improvement.From 55 individuals of Lahu ethnic 16 DRB1 alleles were detected.The three most common alleles were HLA-DRB1*12021(30.909%),09012(15.455%),15011(13.636%),and they covered 60% of the total alleles detected from Lahu ethnic.HLA-DRB1*1413,*11081,*1312,*1418,*1504 were the first time detected in the Chinese,and were very rare in worldwide ethnic groups.With comparison of HLA-DRB1 gene frequencies between various ethnic groups we analysized the characteristics of HLA-DRB1 gene distribution in worldwide populations,and constructed the phylogenetic tree by Neighbor-joining method and Nei measure of genetic distance.The result showed Lahu ethnic obviously belong to the Chinese South ethnic groups and can't trace its origin from northern groups with the HLA-DRB1 genetic data.The preliminary explanations about the contradiction were given in this paper.     

HLA-DRB1 alleles in four Amerindian populations from Argentina and Paraguay

The major histocompatibility complex (MHC) is one of the biological systems of major polymorphisms. The study of HLA class II variability has allowed the identification of several alleles that are characteristic to Amerindian populations, and it is an excellent tool to define the relations and biological affinities among them. In this work, we analyzed the allelic distribution of the HLA-DRB1 class II locus in four Amerindian populations: Mapuche (n = 34) and Tehuelche (n = 23) from the Patagonian region of Argentina, and Wichi SV (n = 24) and Lengua (n = 17) from the Argentinean and Paraguayan Chaco regions, respectively. In all of these groups, relatively high frequencies of Amerindian HLA-DRB1 alleles were observed (DRB1*0403, DRB1*0407, DRB1*0411, DRB1*0417, DRB1*0802, DRB1*0901, DRB1*1402, DRB1*1406 and DRB1*1602). However, we also detected the presence of non-Amerindian variants in Mapuche (35%) and Tehuelche (22%). We compared our data with those obtained in six indigenous groups of the Argentinean Chaco region and in a sample from Buenos Aires City. The genetic distance dendrogram showed a clear-cut division between the Patagonian and Chaco populations, which formed two different clusters. In spite of their linguistic differences, it can be inferred that the biological affinities observed are in concordance with the geographic distributions and interethnic relations established among the groups studied.     

云南汉族HLA-DRB1多态性分析及与9个汉族群体的比较

主要应用聚合酶链反应—微孔板杂交(Polymerase Chain Reaction and Microtitre Plate Hybridization,PCR-MPH)的方法对云南129个无亲缘关系的汉族样品进行了HLA-DRB1的遗传多态性分析,对MPH初分出的DRB1*15组的样品进行了单链构象多态（Single-Strand Conformation Polymorphism, SSCP）检测。共发现36种等位基因,其中等位基因频率大于0.05的有DRB1*1501(0.1240),DRB1*09012(0.0969),DRB1*08032(0.0930),DRB1*1202(0.0891),DRB1*1201(0.0814),DRB1 *1401(0.0775),DRB1 *0701(0.0620)。云南汉族HLA-DRB1等位基因频率与中国其他9个汉族群体进行χ²检验,结果显示与云南汉族比较χ²>10的有西安汉族（DR8,χ²=13.9712）、上海汉族（DR4,χ²=10.1632）、广东汉族（DR9,χ²=12.6121）和南京汉族（DR4,χ²=10.5796）。从遗传距离分析发现,在9个国内汉族群体中云南汉族与辽宁汉族有最近的距离（0.0541）,而与广东汉族最远（0.1851）。云南汉族在构成上可能与辽宁汉族更为接近,尽管地处南方,但已不属典型的南方汉族。这也可能因云南汉族与当地的少数民族存在基因交流,从而形成了一个较为特殊的群体。     

Association of HLA-DRB1 and HLA-DQB1 alleles with red blood cell auto-immunization in the Chinese population

Red blood cell (RBC) auto-immunization poses a clinical dilemma, because the formation of RBC autoantibodies in certain patients is a significant causative factor for autoimmune hemolytic anemia. To clarify whether specific HLA-DRB1 and HLA-DQB1 alleles are associated with the response to RBC auto-immunization, we conducted a case-controlled retrospective study. The case group included 117 patients with autoantibodies potentially harmful to RBC after transfusion at the Beijing Red Cross Blood Center, and the controls were 1.6 million healthy subjects whose data are stored in the China Marrow Donor Program database. In the case group, the frequencies of HLA-DRB1 and HLA-DQB1 allele were determined by PCR-rSSO Luminex high-resolution technology. HLA-DRB1*13 allele expression was not detected in the 75 autoantibody positive patients with anti-C3d production (adjusted P=0.0383), whereas the presence of HLA-DRB1*14 allele showed a positive correlation with the autoantibody positive group with anti-C3d production (odds ratio = 2.22, 95% confidence interval = 1.293.84, adjusted P=0.0383). The HLA-DQB1*02 allele was more frequent in patients with both RBC auto-antibodies and alloantibodies. There was no significant association between a positive antiglobulin test result and the presence of HLA-DRB1 and HLA-DQB1 alleles. In summary, we found that HLA-DRB1*13 may serve as a protective factor, whereas HLA-DRB1*14 appears to be a risk factor for the production of autoantibodies positive with anti-C3d in RBC auto-immunization. To our knowledge, this is the first study to propose HLA-DRB1*13 as a protective factor in auto-immunization.