云南黄牛和大额牛的mtDNA多态性研究

本文以mtDNA限制性内切酶片段长度多态技术分析云南牛的mtDNA多态性。结果表明云南黄牛有两种类型的mtDNA分子,一种是普通黄牛类型,另一种是瘤牛类型,两者的频率分别为33%和67%。没有发现过渡型和重组型。昆明黑白花奶牛的mtDNA与云南黄牛的相类似。云南黄牛可能具有两种起源,即普通黄牛起源和瘤牛起源。今天的云南黄牛群体是这两种类型的混合。大额牛的限制性类型与瘤牛相同,表明大额牛的起源与瘤牛有密切关系。     

褐马鸡圈养种群的mtDNA控制区多态性

褐马鸡(Crossoptilon mantchuricum)是我国特有的濒危鸟类,国家一级保护动物。为了保护褐马鸡的种质资源,从分子水平上评价褐马鸡的遗传多样性,对山西省庞泉沟自然保护区、太原市动物园的褐马鸡种群20个个体,线粒体DNA D-loop区全序列进行了克隆和测定,使用Clustal X、DnaSP4.0、Mega3.1等生物信息学软件,对全部20条序列开展了比对分析,确定了多态位点与单倍型数目,计算了核苷酸多样性和单倍型多样性;比较了两个种群的遗传变异,初步探讨了褐马鸡种群的遗传多样性和遗传结构。结果表明:20条褐马鸡线粒体DNA D-loop区全序列长度在1236 1237bp之间,其中A、T、G和C 4种核苷酸的平均含量分别为31.0%、26.8%、27.5%和14.8%,A+T含量(57.8%)高于G+C含量(42.3%)。排除1处核苷酸的插入或缺失后,共检测出26个突变位点,占分析序列总长度的2.1%,其中包括25处单一多态位点和1处简约信息位点。20个个体检测出13个单倍型,其中11个个体具有独特的单倍型,2个共享单倍型。褐马鸡两个种群的单倍型多样性(h)为0.911 0.933,核苷酸多样性(π)为0.002 0.003,单倍型间的遗传距离为0.003 0.002。根据单倍型构建了褐马鸡两个种群的NJ分子系统树。聚类表明,2个种群的个体并没有按相应的地理位置进行聚类。揭示褐马鸡具有较高的单倍型多样性和较低的核苷酸多样性,种群的遗传变异较低;两个种群单倍型间的遗传距离较近,遗传多样性参数接近,统计分析无显著差异,两个种群尚未表现出明显的遗传分化,且两个种群间有基因流存在。     

中国4个民族mtDNA D环多态性研究

本文利用聚合酶链反应限制性片长度多态性（ＰＣＲ－ＲＦＬＰ）方法,检测了３６名汉族,３０名达斡尔族,３２名鄂伦春族,３０名鄂温克族随机选择正常个体ｍｔＤｎＡ Ｄ环４６５ｂｐＤＮＡ片多性并加以比较。结果表明,ｍｔＤＮＡ Ｄ环该片段的ＲＦＬＰ分析共产生２７种限制性类型,计算出４个民族的ｍｔＤＮＡ Ｄ环平均核苷酸歧异频率,并对４个民族的亲缘关系进行了聚类分析。     

婆罗门牛mtDNA D-loop变异及其遗传背景

对10头原种婆罗门牛mtDNAD-loop全序列912 bp测序,婆罗门牛遗传多样性丰富,检测到的9种单倍型兼有瘤牛(B.indicus)与普通牛(B.taurus)的遗传背景,核苷酸变异率为6.25 %,单倍型多态度为0.978±0.054 ,核苷酸多态度为0.014 30±0.008 68。所有单倍型聚为明显的两大分支,婆罗门牛的大部分单倍型为普通牛单倍型类群,并占绝对优势(90 %) ,仅Brah-6与亚洲瘤牛聚在一起,属于亚洲瘤牛线粒体单倍型,表明婆罗门牛的确是集亚洲瘤牛、欧洲普通牛等优良特性于一身(易产犊、产肉性能好、耐热与体表寄生虫等)的瘤牛品种之一。育种学家引种瘤牛的目的是改善当地牛的生产力与适应性,现代普通牛表现出明显又普遍的瘤牛渐渗现象。对现代的瘤牛品种而言,除亚洲瘤牛品种外,普通牛对其他瘤牛品种育成的贡献同样高。支持瘤牛(B.indicus)为独立驯化、起源于印度次大陆的假说。     

西南地区家猪和野猪mtDNA遗传多样性研究

本实验用ＡｐａＩ、ＡｖａＩ、ＢａｍＨＩ、ＢｃｌＩ、ＢｇｌＩＩ、ＢｇｌＩＩ、ＣｌａＩ、ＥｃｏＲＩ、ＥｃｏＲＶ、ＨｉｎｄＩＩＩ、Ｈｐａｌ、ＫｐｎＩ、ＰｓｔＩ、ＰｖｕＩＩ、ＳａｃＩ、ＳａｌＩ、ＳｃａＩ、ＳｍａＩ、ＸｂａＩ和ＸｈｏＩ等２０种限制性内切酶分析来自中国西南地区的家猪和野猪的ｍｔＤＮＡ群体遗传多样性。结果表明：在全部２８只个体中,共检出２６种限制性态型（ｍｏｒｐｈ）,归结为６种不同的限制性类型,限制性类型的差异主要来源于少数几个限制性位点的偶然突变。利用现代分子群体遗传学方法,对这些猪的遗传多样性进行评估,结果表明中国西南地区猪的ｍｔＤＮＡ变异度很低,遗传多样性贫乏,提示西南地区的猪起源于一个共同的祖先,在品种形成的早期可能受到创立者效应的制约。     

20例藏族人mtDNA多态性的研究

本文通过对20例藏族产妇胎盘线粒体DNA (mtDNA）限制性类型的分析,发现藏族mtDNA是高度多态的,其每个核昔酸位点的平均替换率为0.035,比世界上迄今所报道的值都大。     

林氏果蝇种群间mtDNA的比较研究

运用１０种限制性内切酶分析了林氏果蝇来自不同地区的２２个单雌系的线粒体ＤＮＡ限制性片段长度多态性。采自台湾省的ＴＡＷ３１４６．１与大多数采自广东的品系相同,而广东省品中则存在一定度的分化,ＤＨＳ３０７、３１５和ＮＫＳ９２３４仅在ＨｉｎｄⅢ的酶切位点上与其余单雌系不同;ＴＡＷ３１４６．１与来自缅甸中部的ＭＭＹ３０７,ＭＤＭＹ３２６之间的遗传距离为０．００２７４;ＭＭＹ３０７与ＭＭＹ３２６之间无差异。     

婆罗门牛mtDNA D-loop变异及其遗传背景

对10头原种婆罗门牛mtDNA D-loop全序列912 bp测序，婆罗门牛遗传多样性丰富，检测到的9种单倍型兼有瘤牛(B. indicus)与普通牛(B. taurus)的遗传背景，核苷酸变异率为6.25%，单倍型多态度为0.978±0.054，核苷酸多态度为0.014 30±0.008 68。所有单倍型聚为明显的两大分支，婆罗门牛的大部分单倍型为普通牛单倍型类群， 并占绝对优势(90%)，仅Brah-6与亚洲瘤牛聚在一起，属于亚洲瘤牛线粒体单倍型，表明婆罗门牛的确是集亚洲瘤牛、欧洲普通牛等优良特性于一身(易产犊、产肉性能好、耐热与体表寄生虫等)的瘤牛品种之一。育种学家引种瘤牛的目的是改善当地牛的生产力与适应性，现代普通牛表现出明显又普遍的瘤牛渐渗现象。对现代的瘤牛品种而言，除亚洲瘤牛品种外，普通牛对其他瘤牛品种育成的贡献同样高。 支持瘤牛(B. indicus)为独立驯化、起源于印度次大陆的假说。     

贵州黄牛品种间mtDNA的限制性片段长度多态性研究

以１５种限制性内切酶,用限制性片段长度多态方法分析了贵州黄牛４个地方品种和１个育成品种－贵州黑白花奶牛的ｍｔＤＮＡ多态性。发现贵州黄牛有两种类型ｍｔＤＮＡ分子,即普通黄牛类型和瘤牛类型,两者的频率分别是４４．０７％和５５．９３％,没有发现重组和中间类型。贵州黑白花奶牛的ｍｔＤＮＡ与贵州黄牛类似。贵州黄牛可能起源于普通牛和瘤牛。此外,根据品种间亲缘关系的推断,对“盘江黄牛”和“巫陵黄牛”两个品种的命     

中国部分黄牛品种mtDNA遗传多态性研究

对我国8个黄牛品种22个个体的mtDNA D-loop区910bp全序列进行了分析。结果表明：8个黄牛品种D-loop区序列中,A T平均含量为61．65％;经比对,共检测到66个核苷酸多态位点,约占核苷酸总数的7．25％;D-loop全序列突变类型有5种,即转换、颠换、插入、缺失及转换与颠换共存,它们分别占核苷酸多态位点的81．82％、6．06％、7．57％、3．03％及1．52％。以欧洲牛mtDNA D-loop全序列为标准,8个黄牛群体D-loop的平均核苷酸变异率分3个层次：西镇牛、蒙古牛、黑白花牛及秦川牛的核苷酸变异率最低,分别为0．37％、0．44％、0．52％和0．66％;南阳牛与郏县红牛的核苷酸变异率居中,分别为1．91％和2．02％;晋南牛与岳阳牛的核苷酸变异率最高,分别为4．47％和4．73％。中国黄牛品种内D-loop区序列歧异度为0．55％～5．39％,品种间序列歧异度为1．21％～6．59％。在所测黄牛个体中,mtDNA D-loop序列由19种单倍型组成,单倍型比例为86．36%,说明中国黄牛mtDNA遗传多态性很丰富。由此构建了中国8个黄牛品种的NJ分子系统树,聚类分析表明：所测黄牛的mtDNA D-loop序列表现为3个单倍型组,从而揭示中国黄牛可能有3个母系起源,以普通牛起源和瘤牛起源为主。     

应用线粒体DNA D—loop区遗传多样性分析云南4个少数民族的遗传关系

对傣,佤,拉祜和藏族4个群体的99名个体mtDNA非编码区(D-loop)高变区I 16048－16569及I－41的563bp片优进行序列分析,计算了核酸多态度,并用Neighbro-Joining法构建系统进化树,在进化树中,99个mtDNA序列分别聚在4个群中,所有在COII／tRAN^Lys基因间序列存在9bp 缺失的个体均聚在C1如中,C2群由1个佤族个体和4个藏族个体组成,C3群中除2个藏族个体外均为其他3个民族个体,4个群体的大部分个体聚在C4群,根据核酸多态度计算的净遗传距离重建的进化树显示,傣族,佤族和拉祜族的亲缘关系较接近,与藏族距离较远,结果表明遗传距离与他们的地理分布是非常一致的,而拉枯族与相传同为氐羌后裔并有相近语言的藏族遗传距离却较远,这一结果提示这两个民族可能具有不同的起源。     

青海湖裸鲤mtDNA遗传多样性的初步研究

本用Bcl、AvaⅠ,BamHⅠ,PstⅠ,KpnⅠ,PvuⅡ共6种限制性内切核酶,分析了15尾青海湖裸鲤mtDNA的限制片段长度多态性,共检测出20个酶切位点,发现BclⅠ,BamHⅠ和PvuⅡ三种酶切类型具有多态性。根据不同个体mtDNA的酶切类,青海湖裸鲤存在4种mtDNA单位型,计算mtDNA多态度π值为0．0043,初步认为青海湖裸鲤在线粒体DNA上存在较丰富的群体内变异。     

黑琴鸡北方亚种mtDNA D-loop遗传多样性初步研究

黑琴鸡(Tetrao tetrix)为国家Ⅱ级保护动物,但近年来种群数量不断减少。因此,了解不同种群的遗传变异情况,可为制定保护管理策略提供依据,以便恢复野外种群的数量。本文测定加格达奇(42个个体)和呼伦贝尔市扎兰屯(76个个体)两个黑琴鸡种群的共118个个体的mtDNA D-loop 序列,共发现25个变异位点,定义了33个单倍型,整体的平均核苷酸差异数(K)为2.608,核苷酸多样性(π)为0.228%,种群的遗传多样性偏低,两个种群有一定的基因交流,N_m为14.63,群体间无显著的遗传分化。Tajima's D和Fu&Li's D的估算结果表明,这两个黑琴鸡种群相对于中性的歧异度并没有明显的偏离(P>0.1),两个种群可能未经过大规模的种群扩张过程。     

云南文山黄牛和迪庆黄牛遗传多样性的蛋白电泳研究

采用水平淀粉胶蛋白电泳技术分析了云南文山黄牛和迪庆黄牛的３３种血液蛋白及同工酶,共计３７个遗传座位,其中６个座位检测到多态性。文山黄牛的多态座位百分比Ｐ＝０．１３８９,平均杂合度Ｈ＝０．０６１０,迪庆黄牛Ｐ＝０．１６６７,Ｈ＝０．０６９１。通过Ｎｅｉ氏遗传距离计算,运用ＰＨＹＬＩＰ３．５Ｃ软件包中的“ＵＰＧＭＡ”,“ＣＯＮＴＭＬ”和“ＮＥＩＧＨＢＯＲ”法,结合前人报道的数据对１０个黄牛品种进行聚类分析。结果得出：文山黄牛可能主要起源于瘤牛（Ｂｏｓｉｎｄｉｃｕｓ）,迪庆黄牛可能主要起源于普通黄牛（Ｂｏｓｔａｕｒｕｓ）。我们的结果提示,云南黄牛可能是由当地人驯化的野生牛群与外来的驯化牛群相结合并适应当地气候和环境逐渐形成的,因而在蛋白水平上具有较为丰富的多样性。     

褐家鼠线粒体DNA遗传多态性的研究

通过碱变性法提取线粒体ＤＮＡ,用地高辛标记的探针Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交限制性酶切多态性（ＲＦＬＰ）分析,研究中国家鼠Ｒａｔｔｕｓｎｏｒｖｅｇｉｃｕｓ遗传多态性。采用ＡｐａⅠ、ＡｖａⅠ、ＢａｎＨＩ、ＢｃｌⅠ、ＢｇｌⅠ、ＣｌａⅠ、ＥｃｏＲⅠ、ＥｃｏＲⅤ、ｈｉｎｄⅢ、ＰｖａⅡ、ＳｃａⅠ和ＸｂａⅠ等１２种限制性内切酶分析来自我国８个地区２６只褐家鼠的线粒体ＤＮＡ,共检出２０种限制性态型和１１种ｍｔＤＮＡ单倍     

云南作物遗传资源研究现状及设想

云南作物遗传资源十分丰富,近年来已开展了大量的研究工作,但也还存在许多不利的影响因素,制约着云南作物遗传资源研究的发展,迫切需要通过改革促进该领域的研究稳步向前发展。本将在分析云南作物遗传资源研究现状的同时阐述深化改革、促进发展的设想,为今后的管理和研究工作提供借鉴。     

云南绵羊线粒体DNA遗传多态性研究

本研究用12种识别六碱基的限制性内切酶对来自云南省3个地方绵羊品种11个样本的线粒体DNA(mtDNA)进行了限制性片段长度多态性分析(RFLP),结果表明,云南绵羊群体平均核苷歧异度为0.086%,平均遗传距离为0.00 4,说明mtDNA变异度很低,遗传多样性贫乏,提示云南绵羊可能起源于同一个共同祖先;昭通绵羊与德钦绵羊距离较远,大约分歧于30万年前,德钦绵羊与腾冲绵羊大约分歧于11万年前,而腾冲绵羊与昭通绵羊也于18万年前发生分歧。 Abstract:mtDNA from 11 sheeps samples of Deqin,Zhaotong and Tengchong in Yunnan province was analyzed with 12 restriction endonucleases.14 restriction types were observed which could sorted into 3 haplotypes.The estimated number of nucleotide substitutions per site(π)in Yunnan sheep was 0.086% and the mean genetic distance(P) was 0.004.This results might show a pattern of single origin of Yunnan sheep.Divergencetime of the native sheep flocks from three districts of Yunnan were estimated on the mean rate of sequence divergence of 0.01 per million years in mtDNA.     

云南穗花杉的遗传多样性研究

采用随机扩增多态DNA(RAPD)方法对云南穗花杉(Amentotaxus yunnanensis)4个居群和台湾穗花杉似(Amentotaxus for9rmosana)1个居群共104个个体进行了遗传多样性分析。9个随机引物共扩增出清晰谱带143条。云南穗花杉在物种水平上遗传多样性较高(多态位点百分率P为79．0％,基因多样性指数He为0．2718),但云南穗花杉和台湾穗花杉居群内遗传多样性均较低(P为18．0％、6．9％;He为0．0688、0．0198)。云南穗花杉居群间遗传分化强烈(AMOVA,GST和Shannon多样性指数分别为0．7611,0．7503和0．7526)。据推测,第四纪冰川引起的瓶颈效应,小规模居群引起的遗传漂变及幼苗成活率低等因素都加剧了居群间的遗传分化。建议对所研究的云南穗花杉全部居群予以保护,特别是对云南西畴和贵州兴义市七舍两个具有相对较高遗传多样性的居群应该优先建立就地保护点,以达到最大限度保存云南穗花杉遗传多样性的目的。     

青海湖裸鲤mtDNA遗传多样性的初步研究

本文用BclⅠ、AvaⅠ、BamHⅠ、PstⅠ、KpnⅠ、PvuⅡ共6种限制性内切核酸酶,分析了15尾青海湖裸鲤mtDNA的限制性片段长度多态性,共检测出20个酶切位点,发现BclⅠ、BamHⅠ和PvuⅡ三种酶切类型具有多态性.根据不同个体mtDNA的酶切类型,青海湖裸鲤存在4种mtDNA单倍型,计算mtDNA多态度π值为0.0043,初步认为青海湖裸鲤在线粒体DNA上存在较丰富的群体内变异、 Abstract:An analysis of patterns of cleavage of mtDNA by restriction endonucleases was performed for 15 Gymnocypris przewalskii przewalskii.Mitochondrial DNA polymorphisms were detected in the restriction patterns generated by the following 5 enzymes,BclI,AvaI,BamH],PstI,KpnI,PvuII.Only 3 of them (BclI,BantHI,PvuII) were found to be polymorphisms.Our results shorted that there were 4 mtDNA haplotypes in Gyrnnocypris przewalskii przewalskii and the genetic divergenec(π)was 0.0043,which indicated that mtDNA genetic diversity in Gymnocypris przewalskii przewalskii is higher.     

云南5个民族耵聍的遗传学研究

耵聍谷称“耳垢”、“耳屎”等，是由于人的外耳道软骨部皮肤上的耵聍的分泌物所形成，在人类乳儿期已能被观察到，其性质终生不变。人的耵聍有干型和湿型两种，耵聍潮湿、粘稠，且呈暗黄色油状的为湿型，也称为“油耳”。耵聍干燥、毛屑状，一般呈灰白色者，为干型，俗称...