与人类和动物感染相关的4个非发酵菌新菌属

近10年来,随着分子生物学的飞速发展,特别是16S rRNA序列检测的应用,阐明了细菌菌属间及菌属内的亲缘关系,在新菌属、新菌种的发现方面起到了重要作用。现将近几年来新发现的、与人类或动物感染相关的4个新菌属的分类和生物学特性简要做一介绍,以促进我国细菌学工作者对这些新菌属的认知。     

海洋放线菌盐孢菌属研究进展

1991年,Jensen等从热带及亚热带海洋样品中分离获得了放线菌目专性海洋放线菌类群MAR1。根据形态学特征、生理生化特征及16S rRNA基因分析,提议该类群为新属——盐孢菌属(Salinospora)。2005年,盐孢菌属被正式报道,并将Salinospora更正为Salinispora。盐孢菌属是放线菌目第一个被报道的专性海洋微生物属,可以产生丰富的活性次级代谢产物,使盐孢菌属成为海洋微生物研究的热点。短短几年内,相继报道了许多研究成果。本文从盐孢菌属的建立过程、属及所含种的分类特征、生理生态学研究、次级代谢产物和分子生物学研究等方面对盐孢菌属的研究进展进行综述。     

油盘孢属和泽田外担菌的研究

寄生于樟、阴香和肉桂等植物上的泽田外担菌和油盘孢属真菌,几十年来分类上存在许多不同看法,或全部归泽田外担菌,或全部归油盘孢属,把此二类不同真菌混淆起来,造成名称混乱。本文通过形态学的研究,表明泽田外担菌与油盘孢属的区别是:泽田外担菌具担子层,担孢子4—8个生担子上,寄主是樟树;而油盘孢属的孢子生菌丝上,形成孢子堆,寄主是阴香和肉桂等植物。     

齿裂菌属的两个新种

本文报道齿裂菌属的两个新种一贵州齿裂菌和油杉齿裂菌。前者发生在贵州织金县华山松的枝条上,后一种见于福建省福州市油杉的落叶上。对这两个种作了汉文、拉丁文描述和图解。     

中国柱隔孢菌属及其近似属的研究I.

本文报道柱隔孢菌属二新种和菌绒孢属一个中国新记录种。新种是天门冬柱隔孢Ramulariaasparagi,寄生在百合科Liliaceae文竹Aspargisplumosus上;香茶菜柱隔孢Ramulariarabdosiae,寄生在唇形科Labiatae香茶菜Rabdosiaamethystoides上。新记录种是甜苦菌绒孢Mycovellosielladulcamarae。文中为新种提供了拉丁文描述和附图。研究标本保存于云南农业大学真菌标本室(MHYAU)。     

云南省可培养丝孢真菌资源的调查研究(Ⅳ)

本文报道裸胞壳属和新萨托菌属的如下8个种：四脊裸胞壳、褶皱裸胞壳、费希新萨托菌、光滑新萨托菌、刺孢新萨托菌、宽脊新萨托菌、浅黄新萨托菌和四绕新萨托菌。其中,后面的3个种是我国的新记录种,并有详细的描述、线条图和子囊孢子的扫描照片。     

假单胞菌属的分类现状

随着ＤＮＡ－ｒＲＮＡ杂交与１６ＳｒＲＮＡ测序等技术的使用,原来假单胞菌属的种除少数外,陆续分别转入重新建立的近１２个新菌属中,因此在分类命名上出现较大变动。本文了近１０年来有关种的这些变化。     

中国白粉菌的四个新记录分类群

报道了中国白粉菌科Erysiphaceae的四个新记录分类群,即:寄生于大刺儿菜上的梅厄白粉菌日本变种Erysiphemayoriivar.japonica,寄生于铺地委陵菜上的瑟门白粉菌Erysiphethuemenii,寄生于美女樱上的马鞭草高氏白粉菌Golovinomycesverbenae以及寄生于牻牛儿苗和老鹳草属上的老鹳草新白粉菌Neoerysiphegeranii。研究标本保存在赤峰学院菌物标本室(CFSZ)。     

中国白粉菌属的分类研究I．忍冬科上的新种和新变种

本文描述了两个寄生在忍冬科上的白粉菌属(Erystphe)的新分类单位：一个是采自四川省的Abelta属植物上的 Erysiphe abeliae sp. Nov., 另一个是采自西藏自治区的 Sambucus属植物上的Errsiphs．Cartwbuci Ahmad var. crassitunicata var．Nov.Erysiphe abcliae sp. Nov. 是一种很有意思的白粉菌。它的附属丝几乎全部典型地为Ery-siphe类型,但在大约500一1000根这样的附属丝中间却可以发现一根典型地为Oncinula类型的附属丝。这种现象说明此二属的关系是非常密切的。我们认为这种菌的发现对于在白粉菌的系统发育方面主张Lrncinula属是从Erysipka属进化而来的观点提供了强有力的证据。新种和新变种有拉丁文和汉文描述,成立新分类单位的理由亦有讨论。     

中国柱隔孢菌属及其近似属的研究I.*

本文报道柱隔孢菌属二新种和菌绒孢属一个中国新记录种。新种是天门冬柱隔孢Ramulariaasparagi,寄生在百合科Liliaceae文竹Aspargisplumosus上;香茶菜柱隔孢Ramulariarabdosiae,寄生在唇形科Labiatae香茶菜Rabdosiaamethystoides上。新记录种是甜苦菌绒孢Mycovellosielladulcamarae。文中为新种提供了拉丁文描述和附图。研究标本保存于云南农业大学真菌标本室(MHYAU)。     

不同附生基质金钗石斛根际微生物的比较研究

对同一栽培环境下不同附生基质金钗石斛根际微生物的多样性和差异性进行了研究，以明确基质对其根际微生物的影响。运用高通量测序技术对石质和木质两类5种附生基质的金钗石斛根际微生物进行16S和ITS测序，结合OTU分析、Alpha多样性分析和主成分分析对金钗石斛根际微生物的多样性和差异性进行比较研究。共鉴定了细菌56个门，112个纲，275个目，377个科，621个属；真菌13个门，47个纲，123个目，273个科，503个属。石质基质金钗石斛真菌优势菌属为unidentified＿Cantharellales＿sp菌属，细菌优势菌属为鞘氨醇单胞菌属、粪杆菌属、unidentified＿Chloroplast菌属；木质基质金钗石斛真菌优势菌属为unidentified＿Cantharellales＿sp菌属、粉褶菌属，细菌优势菌属为粪杆菌属。石质基质较木质基质真菌物种相对丰度差异较大，优势菌属种类不同。功能预测分析表明，附生基质与金钗石斛根际微生物群落功能密切相关。本研究为金钗石斛“基质-根际微生物-菌根真菌”的相关性及其生长发育、次生代谢产物积累规律提供了实验依据，为石斛“生石上者胜”、金钗...     

中国柱隔孢菌属及其近似属的研究I.

本文报道柱隔孢菌属二新种和菌绒孢属一个中国新记录种。新种是天门冬柱隔孢Ramularia asparagi,寄生在百合科Liliaceae文竹Aspargis plumosus上;香茶菜柱隔孢Ramularia rabdosiae,寄生在唇形科Labiatae香茶菜Rabdosia amethystoides上。新记录种是甜苦菌绒孢Mycovellosiella dulcamarae。文中为新种提供了拉丁文描述和附图。研究标本保存于云南农业大学真菌标本室(MHYAU)。     

口腔厌氧菌研究进展(综述)

近二十多年来,由于厌氧微生物培养方法、鉴定手段等的发展,使得口腔厌氧菌的研究有了突破性的进展,在口腔环境内发现了许多新的厌氧菌种菌属,对许多原有的厌氧菌进行了重新分类和命名,极大地丰富了厌氧微生物学。同时,随着口     

中国热带地区的半知菌Ⅰ.云南尾孢菌属及其近似属的种

本文报道了云南热带地区尾孢菌属及其近似属真菌４５种,其中有一一个新种：番木瓜短胖孢寄生在番木瓜科番木瓜叶上。短胖孢属真菌在番木瓜科植物上是首次报道。文中为新种提供了拉丁文简介,描述并附图。模式标本保藏在中国科学院微生物研究所真菌标本室。     

中国绒泡菌属粘菌的分类学研究Ⅰ.：产自东北的三个新种

在近年来对中国绒泡菌粘菌的分类学研究中,观察到许多不寻常和有趣的标本,其中一些与目前已知的绒泡菌均不吻合,形态学研究表明它们是新种。本文报告了３个产自我国东北的绒泡菌属新种,它们是：产自吉林省的环柄绒泡菌Ｐｈｙｓａｒｕｍａｎｎｕｌｉｐｅｓ和青灰绒泡菌Ｐｈｙｓａｒｕｍｃａｅｓｉｕｍ及产自内蒙古自治区的木生绒泡菌Ｐｈｙｓａｒｕｍｘｙｌｏｐｈｉｌｕｎ。环柄绒泡菌的孢囊柄具有环带,较为特殊;青灰包菌的囊被     

广西夹竹桃内生真菌的多样性和抑制几种水产病原菌活性筛选

为研究夹竹桃(Nerium oleander)内生真菌的多样性并评价其次生代谢产物的活性，该研究对广西夹竹桃(Nerium oleander)的内生真菌进行分离纯化，采用形态学和ITS序列分析结合的方法进行鉴定，以5种指示菌(其中有3种弧菌)对内生真菌提取物进行抑菌活性筛选。结果表明：(1)从广西夹竹桃中共得到19株内生真菌，这19株内生真菌都属于子囊菌门，涵盖5个目7个属，包括炭疽菌属(Colletotrichum)、球座菌属(Guignardia)、叶点霉属(Phyllosticta)、新壳梭孢属(Neofusicoccum)、曲霉属(Aspergillus)、隔孢壳科新属(Nothophoma)和间座壳属(Diaporthe),优势属为炭疽菌属(分离率为36.85%)和球座菌属(分离率为21.05%),其中炭疽菌属主要分布于茎，球座菌属全部来源于叶。(2)jing-117(Neofusicoccum sp.)和ye-130(Guignardia sp.)对坎氏弧菌有较为特异的抑菌效果，ye-136(Aspergillus sp.)能同时抑制蜡样芽孢杆菌和坎氏弧菌，ye-135(A...     

中国假尾孢属的研究 I

假尾孢属(Pseudocercospora)是尾孢菌属(Cercospora)的近似属中最大的一个属,Deighton估计约有500种尾孢菌需要转到假尾孢属,目前全世界已描述假尾孢菌400多个种,且都是植物寄生菌,有些种能引致植物严重病害。Spegazzini于1910年建立了假尾孢属,但1976年以前,大多被归属于尾孢菌属内。1971年Ellis对此属的特征作了精简描述,1976年报导了3个新组合。1976年以后,假尾孢属虽先后有不少新种和新组合被其他作者发表,但系统研究此属的则系Deighton o Deighton 1976年对假尾孢属的研究史、与近似属的区别以及属的特征都作了详细描述,并报道了世界性假尾孢菌的21个新种,202个新组合和3个新名称,于1979年和1987年又报道了15个新种和39个新组合。假尾孢属与尾孢菌属,针尾孢属(Cercoseptoria)及假小尾孢属(Pseudocercosporella)非常相似,但不同的是尾孢菌属产孢细胞不具齿突,疤痕明显加厚,分生孢子梗不从表生菌丝上产生,分生孢子大多无色,针形;针尾孢属分生孢子窄(不超过3µm),针形,不呈倒棍棒形,无表生菌丝;假小尾孢属分生孢子梗和分生孢子均无色,子座与假尾孢属也不大相同. 本文报道中国产的假尾孢菌60个种,其中有一个新种(八角枫假尾孢),25个新组合和3个新记录.     

福建真菌蚊亚科─新属新种（双翅目：菌蚊科）

福建真菌蚊亚科─新属新种（双翅目：菌蚊科）吴鸿，杨集昆（浙江农业大学杭州３１００２９）（北京农业大学北京１０００９４）真菌蚊亚科目前包括９个属，其中５个属仅分布于非洲，新热带Ｂ和新北区各有１属；其余２属广布，我国现有２属，即真菌蚊属（ＭｙｃｏｍｐａＲ...     

青藏高原食草动物粪栖真菌的多样性

分别利用真菌通用引物和厌氧真菌特异引物构建了西藏地区3种反刍动物和1种单胃动物共8份新鲜粪样的ITS克隆文库,以通过系统发育分析解析其中好氧真菌与厌氧真菌的多样性。通用引物ITS文库测得324条真菌序列,分别属于子囊菌门Ascomycota 3个目、担子菌门Basidiomycota 2个目、接合菌门Zygomycota的1个目和严格厌氧的新丽鞭毛菌门Neocallimastigomycota,共24个OTUs。其中,子囊菌门相对丰度最高,占80.6%;新丽鞭毛菌门相对丰度最低,仅占0.6%。大部分OTUs与已知真菌属、种关系较远。厌氧真菌特异引物文库测得661条序列,全部属于新丽鞭毛菌门,包括所有已知的厌氧霉属Anaeromyces、盲肠菌属Caecomyces、肠霉属Cyllamyces、新丽鞭毛属Neocallimastix、奥式霉属Orpinomyces、胃梨囊霉属Piromyces 6个属和3个未培养的属级类群(NG9、NG10、NG11),共29个OTUs。其中3个已知的单中心属存在于所有反刍动物样品中,并以Piromyces相对丰度最高(37.4%)。单胃动物马粪样中全部为NG9类群。NG9是本研究新发现的属级类群,研究中同时揭示有多个未培养种和潜在的新种。研究结果证明青藏高原反刍动物粪栖真菌多样性较高,并存在丰富的未培养种和潜在的新属及新种。     

根瘤菌分类的新进展

近十多年来,根瘤菌的分类几经变迁,不断地增加一些新的属种到这个重要的细菌群体。本文综述了《伯杰氏系统细菌学手册》第2版发表至今根瘤菌分类的新进展。近年来发表的相关文献表明:从不同豆科植物分离出来的根瘤菌之间存在着极大的多样性。目前,根瘤菌多数属于α-和β-变形菌纲以及1个属于γ-变形菌纲的属,共计17个属,近100个种。它们分别是:α-变形菌纲中的Rhizobium(根瘤菌属)、Sinorhizobium(中华根瘤菌属)、Ensifer(剑菌属)、Shinella(申氏杆菌属)、Neorhizobium(新根瘤菌属)、Pararhizobium(伴根瘤菌属)、Mesorhizobium(中慢生根瘤菌属)、Bradyrhizobium(慢生根瘤菌属)、Phyllobacterium(叶瘤杆菌属)、Methylobacterium(甲基杆菌属)、Microvirga(微枝形杆菌属)、Ocrhobactrum(苍白杆菌属)、Azorhizobium(固氮根瘤菌属)、Devosia(德沃斯氏菌属);β-变形菌纲中的Burkholderia(伯克氏菌属)、Cupriavidus(贪铜菌属,原青枯菌属);γ-变形菌纲的Pseudomonas(假单胞菌属)。目前世界各地约有748属19 700种豆科植物,而我国约有172属1 485种豆科植物,但在19 700种豆科植物中,只有23%的豆科植物经调查有结瘤能力。因此,有必要采用先进的方法研究不同地域的豆科植物,以此发现更多的根瘤菌新物种。