国际植物基因组组织与计划概况及我国的应对策略

本文简要介绍了植物基因组领域主要的组织和计划,简单分析了国际植物基因组计划的特点和我国存在的问题,并初步提出我国的应对策略。     

美国国家科学基金会资助植物基因组研究现状及展望

简要回顾了美国国家科学基金会资助植物基因组研究的情况,包括研究方向和进展,资助项目特点和存在的问题等,并对2002件度的资助计划进行了展望。     

植物基因组表达序列标签(EST)计划研究进展

植物表达序列标签(EST)计划是随机挑选cDNA克隆,并对其3′或5′端进行大规模一次性测序,将得到的150～500 bp长度的DNA片段与数据库中的序列进行比较,获得对基因组结构、组织、表达等认识的基因组研究策略.就近年来国际植物EST计划的实施情况、植物EST计划的研究范围、生物信息学在EST研究中的应用、EST数据库及查询、植物EST研究中遇到的问题等方面内容进行了综述.     

植物的叶绿体基因组

对植物叶绿体基因组的特征,叶绿体编码基因,叶绿体基因表达调控以及叶绿体基因转化等内容进行了介绍和评述。     

用于基因组分析的模式植物拟南芥

长期以来,人们对植物结构和功能的认识,都是建立在对大量物种的研究,特别是对那些与农业相关物种的深入研究上。尽管已获得了大量信息,但对植物的开花、根的生长、激素运动以及植物对环境信号的反应等方面的认识仍很有限。为此,人们在深入研究植物的生长与发育时,曾经将玉米、番茄、豌豆、水稻、大麦、矮牵牛和金鱼草等植物作为模式模式基因系统来研究,但其结果都不尽人意。直至人们找到了拟南芥这种模式植物以后,才在广大的生物学家中达成共识。拟南芥（Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓｔｈａｌｉａｎａ）是十字花科一年生草本植物,高１５…     

美国资助植物基因组项目

ＡｇＢｉｏｔｅｃｈＲｅｐｏｒｔｅｒ１９９８年１５卷１０期报道：植物基因组研究项目终于拉开了序幕，美国玉米种植者协会率先与具体项目签署了协议，在今后５年中的总资金投入达到８５００万美元。在这个大项目下的２３个不同的小项目将使人们从基因组的水平上更好地了...     

八种植物线粒体基因组结构特征分析与比较

比较来源于GenBank中发表的8种植物(烟草、拟南芥、甜菜、油菜、高粱、水稻、小麦和玉米)线粒体基因组( mtDNA).结果显示,它们共同的特点是编码30 - 40个蛋白,3个核糖体RNA,15 -30个tRNA,G+C含量在40％ -45％之间;各植物线粒体基因组的编码区约占mtDNA的10％ -20％.比较发现,虽然8种作物线粒体基因组大小存在较大差异,基因排列顺序不同,但它们都编码几乎相同的基因产物.     

美启动烟草基因组测序计划

AgBiotechReporter 2 0 0 3年 2 0卷 1期 10页报道 :据悉 ,美国PhilipMorris公司已同意给北卡罗来纳州立大学拨款 17.6百万美元 ,用于绘制烟草基因图谱。北卡罗来纳州立大学的农业和生命科学学院在得到这笔款项后 ,将用 4年半的时间来完成烟草基因组测序的创新计划。北卡罗来纳     

植物病原生物基因组测序进展

随着基因组学的迅猛发展,越来越多的生物全基因组序列已经测定完成或正在进行之中。植物病原生物基因组序列的测定为理解植物与病原物互作分子机制有重要意义,并为植物病理学的发展作出了重要贡献。目前已有9种病原细菌和1种病原真菌的基因组序列彻底完成,另外还有更多的基因组草图正在组装或测序工作正在进行之中。对NCBI上主要的植物病原真菌和细菌全基因组测序进展作了整理和概述。     

基因芯片数据分析及在植物基因组研究中的应用

基因芯片作为一种新兴的技术手段已经在植物学、动物学、医学和农学等多个研究领域中发挥了重要作用。本文就基因芯片数据分析的各个环节,包括芯片数据的预处理、归一化、差异基因的判断、聚类分析以及基因芯片在植物功能基因组研究中的应用进行了综述。     

Fiber-FISH在植物基因组研究中的应用

FiberFISH是近几年发展起来的一项高分辨率和高灵敏度的荧光原位杂交技术,已被广泛应用于人类及动植物基因组的研究。本文对FiberFISH在植物基因组研究中的特点及其在染色体物理图谱的构建,染色体结构与分子构成分析和在比较基因组中的应用等进行了探讨。     

BAC-FISH在植物基因组研究中的应用

细菌人工染色体与荧光原位杂交合成技术(BAC-FISH)是90年代开始发展起来的一种新的定位技术.由于该技术较常规荧光原位杂交(FISH)技术的信号检出率高得多,近年来在植物基因组研究中得到了越来越多的应用.运用该技术已将一些重要的功能基因定位到相应植物染色体上.     

葛的学名及其在美国的入侵教训

葛(Pueraria montana),豆科多年生藤本,原产东亚、南亚和东南亚,热带和温带广泛栽培并逸为野生;不仅学名多而混乱,而且已成为美国危害最严重的外来入侵种之一.考证了葛的学名并给出异名,同时介绍葛在美国从鼓励引入到大量栽培,最后被列入联邦危害植物并全面禁止的引种教训.     

A Relational Analysis of American Kinship Terminology

As an alternative to traditional semantic analysis using class-product logic ("Componential analysis"), it is proposed that the possibilities of analysis in terms of relative products be explored in appropriate lexical-taxonomic domains, particularly kinship. In such analyses the order of components is intrinsic to meaning. The process is illustrated by an analysis of American kinship terminology.     

Evolution Analysis of Simple Sequence Repeats in Plant Genome

Simple sequence repeats (SSRs) are widespread units on genome sequences, and play many important roles in plants. In order to reveal the evolution of plant genomes, we investigated the evolutionary regularities of SSRs during the evolution of plant species and the plant kingdom by analysis of twelve sequenced plant genome sequences. First, in the twelve studied plant genomes, the main SSRs were those which contain repeats of 1–3 nucleotides combination. Second, in mononucleotide SSRs, the A/T percentage gradually increased along with the evolution of plants (except for P. patens). With the increase of SSRs repeat number the percentage of A/T in C. reinhardtii had no significant change, while the percentage of A/T in terrestrial plants species gradually declined. Third, in dinucleotide SSRs, the percentage of AT/TA increased along with the evolution of plant kingdom and the repeat number increased in terrestrial plants species. This trend was more obvious in dicotyledon than monocotyledon. The percentage of CG/GC showed the opposite pattern to the AT/TA. Forth, in trinucleotide SSRs, the percentages of combinations including two or three A/T were in a rising trend along with the evolution of plant kingdom; meanwhile with the increase of SSRs repeat number in plants species, different species chose different combinations as dominant SSRs. SSRs in C. reinhardtii, P. patens, Z. mays and A. thaliana showed their specific patterns related to evolutionary position or specific changes of genome sequences. The results showed that, SSRs not only had the general pattern in the evolution of plant kingdom, but also were associated with the evolution of the specific genome sequence. The study of the evolutionary regularities of SSRs provided new insights for the analysis of the plant genome evolution.     

人类肿瘤基因组系统性突变分析带来的机遇

最近发表于《科学》杂志(Science)的“人类乳腺癌和结直肠癌共有编码序列”一文,是继人类基因组计划完成后,对人类疾病状态下基因组改变的首次无偏倚系统性分析.对如何利用该研究发现的候选癌基因获得肿瘤治疗药物的新靶标作初步分析,并介绍这些候选癌基因在识别肿瘤高危人群和依据分子机制更新肿瘤分型方面的潜在应用价值.     

植物荧光原位杂交技术的发展及其在植物基因组分析中的应用

荧光原位杂交(FISH)是在染色体、间期核和DNA纤维上定位特定DNA序列的一种有效而精确的分子细胞遗传学方法。20年来,植物荧光原位杂交技术发展迅速:以增加检测的靶位数为目的,发展了双色FISH、多色FISH和多探针FISH鸡尾酒技术;为增加很小染色体目标的检测灵敏度,发展了BAC-FISH和酪胺信号放大FISH(TSA-FISH)等技术;以提高相邻杂交信号的空间分辨力为主要目的,发展了高分辨的粗线期染色体FISH、间期核FISH、DNA纤维FISH和超伸展的流式分拣植物染色体FISH技术。在植物基因组分析中,FISH技术发挥了不可替代的重要作用,它可用于:物理定位DNA序列,并为染色体的识别提供有效的标记;对相同DNA序列进行比较物理定位,探讨植物基因组的进化;构建植物基因组的物理图谱;揭示特定染色体区域的DNA分子组织;分析间期核中染色质的组织和细胞周期中染色体的动态变化;鉴定植物转基因。     

Regulating Transgenic Crops: A Comparative Analysis of Different Regulatory Processes

Transgenic crops have the potential to benefit both developed and developing countries. To ensure safe crops to humans and the environment, a strong, but not stifling, regulatory system needs to be established and properly implemented. This paper explores some essential components of a strong regulatory structure for transgenic crops. First, five different regulatory systems for transgenic crops--the United States, the European Union, South Africa, Taiwan, and Argentina--are described and explained. The major components of those systems are then compared to components necessary to a regulatory system that ensures safe products and engenders public trust. The key components discussed include: (1) mandatory pre-market approval; (2) established safety standards; (3) transparency; (4) public participation; (5) use of outside scientists for expert scientific advice; (6) independent agency decisions; (7) post-approval activities; and (8) enforcement authority and resources. Although no one of the existing systems analyzed adequately achieves all the necessary components of a strong regulatory system, those systems serve as models for deciding which regulatory procedures should be emulated and which should be avoided. A mandatory pre-market approval system that applies established safety standards in procedures that are transparent and allows for public participation with no pre-conceived notions or biases will best achieve both safe products and consumer trust.     

2008—2017年度国家自然科学基金医学病原微生物与感染领域肝炎病毒相关项目申请与资助情况分析

本文对2008—2017年申请国家自然科学基金及获得资助的医学病原微生物与感染科学领域肝炎病毒相关项目进行回顾分析,介绍面上项目、青年科学基金和地区科学基金项目的申请数量、资助项目数量及资助强度,并对医学病原微生物与感染科学领域肝炎病毒相关项目的特点及存在的问题进行分析。