单核苷酸多态性检测方法的研究进展

单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism, SNP）的研究已成为人类后基因组时代的主要内容之一。因此建立高度自动化和高通量的SNP检测分析技术十分重要。文章系统地介绍了最新发展的几种SNP检测技术的原理和检测平台,详细阐述了等位基因特异性杂交、内切酶酶切技术、引物延伸法、寡核苷酸连接反应等SNP检测原理,以及平板读数仪、基因芯片、微球阵列技术和质谱仪等检测平台,并对SNP高通量检测技术的发展进行了展望。     

单核苷酸多态性检测技术的研究进展

单核苷酸多态性是指在基因组水平上单个核苷酸变异引起的一种DNA序列多态性。因其具有密度高,遗传稳定,易于进行自动化、规模化分析等优势它已成为第三代分子标记,因此其检测技术也在近几年得到了快速的发展。将对未知单核苷酸突变位点的检测方法和已知单核苷酸突变位点的检测方法这两部分的研究进展作一综述。     

MALDI-TOF质谱技术研究铁蛋白蛋白壳表层的电荷分布

采用Sephacryl S-300排阻层析和DEAE－纤维素层析技术分离纯化Hong鱼肝铁蛋白（Liver ferritin of Dasyatis Akajei,DALF）。纯化后的DALF经梯度聚丙烯酰胺凝胶再次分离后,显示出两条凝胶事,即单分子DALF和双聚态DALF。选用基质辅助激光解吸离子化飞行时间质谱技术（MALDI－TOF MS）研究DALF的电荷分布时,发现DALF蛋白壳表层上显示出三种不同质荷比的分子离子峰,其质荷比为10369.41m/z、20710.33m/z和41809.43m/z。当DALF亚基被解离后,这三个分子离子峰随之消失,因而推测DALF蛋白壳表层存在着高密度正电荷区域,并与该蛋白形成非电惰性有着密切联系。通过拟出DALF蛋白壳表面电荷分布模型,进一步阐明DALF从铂电极上接受电子的机理。     

单核苷酸多态性的检测及其在医药领域的应用

单核苷酸多态性 (ｓｉｎｇｌｅｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｐｏｌｙ ｍｏｒｐｈｉｓｍ ,ＳＮＰ)是人类基因组作图的第三代多态性标记 ,它是指ＤＮＡ序列中单个核苷酸的差异 ,与限制性片段长度多态 (ＲＦＬＰ)、短串联重复序列 (ＳＴＲ)相比 ,ＳＮＰ更丰富地存在于基因组中 ,据估计在人类基因组中每千个核苷酸就有一个以上的ＳＮＰ ,其中有 2 0万存在于编码区 ,称作ｃＳＮＰ(ｃｏｄｉｎｇＳＮＰ) [1] 。而ＳＮＰ之所以引起几乎整个生命科学领域的重视 ,不仅因为它是一种理想的做图标记 ,更在于它可以成为研究基因组多态性和识别、定位疾病相关基因…     

单核苷酸多态性检测方法研究进展

：单核苷酸多态性（singlenucleotidepolymorphism,SNP）是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异引起的一种DNA序列多态性。SNP作为第三代分子标记,具有数量多、分布广等特点,已成为人类后基因组时代的主要研究内容之一。单核苷酸多态性在医学研究、临床诊断、药物开发与合理用药、法医学、遗传学的发展方面具有重要意义。因此,建立高度自动化和高通量的SNP检测分析技术十分重要。各种SNP分型检测方法都由等位基因特异性的识别反应和等住基因识别产物的分析检测两个部分组成。本文系统的介绍了引物延伸反应、序列杂交反应、酶连接反应、酶切割反应、核酸链构象差异反应等SNP检测的等位基因特异性的识别原理,以及质谱、荧光共振和偏振信号、化学发光、毛细管电泳测序、生物传感器等分析检测手段,并简要介绍了相关识别原理和分析检测手段的优缺点及应用范围,并对SNP检测技术的发展进行了展望。     

人类基因组中单核苷酸多态性的检测技术

随着人类基因组测序工作的完成,单核苷酸多态性作为继限制性片段长度多态性和微卫星多态性这2种遗传标记之后的第3代遗传标记,已成为人类后基因组时代的主要研究内容之一。系统地介绍了人类基因组中单核苷酸多态性的传统检测方法、新的方法以及基于生物信息学的方法,并对SNP检测技术的发展进行了展望。     

单核苷酸多态性检测分析技术

单核苷酸多态性(SNP)作为第三代遗传标记已经广泛用于基因作图、疾病相关性分析、群体遗传学及药物研究等领域。 文中系统地介绍了目前国内外主要的SNP检测技术,任何一种SNP的检测方法都可将之看成由两部分组成,即区分SNP位点的原理方法和数据的检测分析手段,文章对这两部分做了较详细的介绍,并对SNP检测技术的发展进行了展望。 Abstract :As the third generation of genetic markers SNPs（single nucleotide polymorphisms）has been used extentively in gene mapping,disease-correlativity analysis ,population genetics and drug research.Here methods for detection are reviewed.Most SNP genotyping are a combination of method for interrogating SNPs and analysis tecnique.It described both parts and give a outlook for detection.     

MALDI-TOF质谱源后衰变技术鉴定2D胶蛋白点

PMF方法由于具有高灵敏度、高通量和容易自动化等优点,在蛋白质组学鉴定中占有重要的地位。然而,许多样品(比如：小分子蛋白,混合物等)仅仅通过PMF方法不能明确鉴定。在这种情况下,在测定PMF的同一个样品上,选择一个酶解片段峰进行PSD测序,并把这些序列信息输入MS—Tag软件进行搜索,结合PMF方法,表观分子量等电点等参数,能够对胶上的点进行明确的鉴定。本文先用PSD方法对胶上的三个标准蛋白进行鉴定,都得到了非常准确的结果,同时鉴定了胶上的几个未知点。     

单核苷酸多态性

单核苷酸多态性指基因组内特定核苷酸位置上存在两种不同的碱基,且最少一种在群体的频率不小于1％。由于其丰富、稳定、易实现分析的自动化,大规模的SNP鉴定和公共SNP数据库的建立已经开始。它作为一种全新的研究工具,希望利用它对复杂疾病基因进行大规模的连锁不平衡与相关分析,从而促进多基因疾病发病机理的研究和药物基因组学的发展。     

人类基因组DNA单核苷酸多态性的检测方法

单核苷酸多态性（SNP）作为新的遗传标记对基因定位及相关疾病的研究意义重大。本文对近年来9种SNP检测方法的原理、应用及优缺点,包括基于FRET原理的Taqman法和分子灯塔法;基于分子杂交技术的寡核苷酸连接分析、等位基因特异性寡核苷酸探针杂交法、动态等位基因特异性杂交法及DNA芯片法;及质谱法、变性－高压液相色谱法和单个碱基延伸标记法进行综述。     

单核苷酸多态性研究进展及其在医学中的应用

单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）是人类基因组中单个碱基的变异,其最低基因频率不低于1％,是被受关注的第三代多态性遗传标记,为医学、药学等研究提供了新的方向,其在复杂疾病、遗传病研究及法医中个体识别、亲权鉴定和药学研究方面都有重要作用,本文就其研究最新进展、应用及检测手段作一综述。     

使用DNA芯片同时高精度检测数个单核苷酸多态性

东洋纺公司于2006年1月宣布．他们成功地开发出使用DNA芯片同时检测数个单核苷酸多态性的高精度的检测方法。东洋纺公司利用这项技术．跟大阪大学的山崎义光副教授共同合作开发出可以辨认跟糖尿病有关的100个基因的多态性芯片。山崎副教授设立的风险投资企业Signpost运用开发的芯片于2006年2月起开始进行糖尿病并发症的风险诊断。     

单核苷酸多态性分析在近交系大鼠遗传检测中的应用

目的研究SNP在近交系大鼠遗传检测中的应用。方法 选取大鼠20号染色体MHC所在P12区上的9个SNP位点,应用新建立的高保真酶特异性检测SNP基因分型技术对五种常用近交系大鼠(BN、F344、WKY、LEW、SHR)和两种新培育近交系大鼠(MIJ和HFJ)进行SNP多态性分析。结果五种常用近交系的SNP检测结果与Rat Genome Database网站提供的基因型数据一致,并检测确立了新品系的SNP基因型。同时绘制出七种近交系大鼠在该9个SNP位点的遗传扩增图谱。结论运用所筛选的9个SNP位点进行大鼠多态性分析,能够快速、可靠地对BN、F344、WKY、LEW、SHR及MIJ、HFJ进行遗传监测。     

单核苷酸多态性检测方法的新进展

单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）是第三代遗传标记,在基因定位、遗传疾病和人类起源等理论研究中具有重大意义, 在抗药性或药物过敏反应中扮演着极其重要的角色,正逐步成为分子诊断、临床检验、新药研发的重要手段。随着人类基因组测序的完成,SNP分型和发现成为遗传和生命医学领域研究的热点之一。近年来,SNP的检测方法层出不穷,发展很快。文章综述和分析了几种新建立的SNP检测方法,包括基因芯片、分子探针、荧光偏振、荧光共振、质谱和磁性颗粒分析。在生物化学、工程学和分析软件等方面取得突破的基础上,有望建立灵敏准确、简便易行、高通量、低费用的SNP技术。Abstract: Single nucleotide polymorphism (SNP) is the third generation genetic marker. SNP detection now is becoming increasingly important means in molecular diagnostics, clinical assay and novel drug development. It plays an essential role in drug resistance and anaphylactic reaction and has the importamce in theoretical studies of gene location, hereditary diseases and human origin. With the accomplishment of human genome sequencing, the genotyping and discovering of SNP are becoming hot subjects in genetics and biomedicine researches. The methods for SNP detection were renewed rapidly and developed fast in past few years. In this review, several newly established detection methods including gene chip, molecular probe, fluorescence polarization and resonance, mass spectrometry, and bacterial magnetic particle are discussed. It could be expected that an accurate and sensitive, simple and easy-to-handle SNP technology with low cost and high throughput will be available on the basis of research breakthroughs of biochemistry, engineering and analytic software.     

单核苷酸多态性检测方法的研究进展

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)作为第三代遗传标记已经广泛应用于基因作图、疾病相关性分析、群体遗传学及药物研究等领域.因此建立高度自动化和高通量的SNP检测分析技术十分重要.简要介绍了国内外几种主要SNP检测技术的原理和检测分析手段,并对SNP高通量检测技术的发展进行了展望.     

利用染色体步移PCR检测辐射松的单核苷酸多态性

用染色体步移技术(chromosome walking)的基本原理以辐射松(Pinus radiata)肌动蛋白基因(actin)为例,利用获得的EST序列设计定向引物,向上游和下游进行了染色体序列的步移.获得了包括启动子、5′端非编码区和编码区及3′端非编码区辐射松肌动蛋白基因基因组序列2154 bp.通过对200株不同辐射松个体进行PCR扩增及测序,共获得了21个SNPs,其中启动子区域3个,编码区15个,3′端非编码区4个.实验结果为今后染色体步移技术在基因非编码区SNP的检测提供了理论与技术参考.     

单核苷酸多态性检测技术在法医学中的应用进展

单核苷酸多态性是新一代的法医学检测标记,本文结合市面上常见的商品化试剂盒,对单核苷酸多态性的检测原理、试剂选择及具体操作等进行了综述.并在此基础上提出了它们在法医学应用中需要注意的问题.     

微测序技术分析人类单核苷酸多态性

单核苷酸多态性 (singlenucleotidepolymorphism)是指染色体基因组水平上单个核苷酸变异引起的DNA序列多态性 ,即一种二等位基因标记。目前推断在基因组中至少有 30万个SNP[1 ] 。随着分子遗传学的发展 ,疾病研究从对单基因疾病的研究转向探讨多基因疾病 (如心血管疾病、神经系统疾病、各种肿瘤等 )的相关因素。因此 ,需要在人类基因组中找到一种数目众多、分布广泛且相对稳定的遗传标记 ,单核苷酸多态性正代表了这样一种标记。因此SNPs已成为继第一代限制性片段多态性标记 ,第二代微卫星多态性标记后具有重要研究价值的第三代基因遗传…     

双向凝胶电泳银染蛋白质点的肽质谱指纹图分析

对双向凝胶电泳后银染显色的蛋白质点经脱色与原位还原和烷基化处理后,用ＴＰＣＫ胰蛋白酶进行酶解,采用带有Ｃ１８反相载体的ＺｉｐＴｉｐ＾ＴＭ吸头进行脱盐处理,再进行ＭＡＬＤＩ－ＴＯＦ肽质谱指纹纹图分析,然后将肽质数据在ＥＭＢＬ数据库中进行搜寻从而对蛋白南点进行鉴定。结果表明用该实验程序可对银染的单一蛋白南点进行快速肽质谱指纹图ｉｐＴｉｐ＾ＴＭ的应用可以明显增加质谱分析的信噪比,提高分析灵敏度。用以上方     

单核苷酸多态性与大肠癌遗传易感性

大肠癌遗传易感性与单核苷酸多态性（SNP）的关系是近年来研究的热点。研究发现COX2,MTHFR等代谢相关基因的某些SNP与大肠癌的发病风险相关,其中携带COX29850G-10335A单倍型的个体可显著增加患大肠癌的风险。MMP家族是调控大肠癌侵袭转移的重要基因,MMP7-181G等位型频率可显著增加大肠癌淋巴结转移风险。进一步寻找大肠癌特异性SNP,对筛选大肠癌高危人群,预估发病风险,具有重要意义。