DNA条形码在生物多样性编目与评价中的应用

<正>DNA条形码是基于基因组中一段或几段短的、通用的标准DNA序列对生物物种进行识别和鉴定的技术(Hebert et al.,2003;Kress et al.,2005;Hollingsworth et al.,2011)。该技术突破了对经验的过度依赖,可实现标本鉴定过程的自动化和标准化,而且能对生物残片而非完整的生物标本进行鉴定,是传统分类学与物种鉴定的有力补充(罗亚皇等,2013)。随着DNA条形码技术十多年来的不断发展,     

植物DNA条形码在系统发育研究中的应用

<正>1常用植物DNA条形码物种的准确鉴定是开展科学研究和生物多样性保护的先决条件,但根据形态学特征进行物种鉴定对非专业人员而言比较困难。即使是专业人员,面对纷繁复杂的物种,要想逐一鉴定也难以实现。DNA条形码技术(DNA barcoding)为物种的快速、准确鉴定提供了可能(Hebert et al.,2003)。线粒体COI基因作为动物的DNA条形码已得到广泛应用。但对     

植物DNA条形码研究展望

<正>物种的鉴定是生物多样性研究的基石之一。在DNA双螺旋结构发现50年之际,加拿大学者提出了通过DNA条形码,即标准化的、较短的DNA序列对物种进行快速、准确鉴定的动议(Hebert et al.,2003)。经过12年的发展,DNA条形码已成为生物多样性研究领域发展最迅速的方向之一。一方面,DNA条形码和分子系统发育的研究使分类学、生态学、进化生物学等传统领域焕发出新的活力,极大     

DNA条形码在进化生态学研究中的应用

<正>DNA条形码是最近十几年发展起来的一门生物技术,具有标准、通用、快捷等优点,其主要目标是通过较短的DNA序列在物种水平上对现存生物类群和未知生物材料进行识别和鉴定(Hebert et al.,2003;裴男才和陈步峰,2013)。目前,植物DNA条形码已较成熟地应用于群落系统发育(或称谱系)与进化生态学研究,主要回答两大科学问题:(1)通过DNA条形码构建群落系统发育关系     

DNA条形码: 从物种到生物群区

<正>DNA条形码技术在过去十年多的时间里快速发展,现在已经成为分子生物学技术和方法在宏观生物学及其相关领域广泛应用的成功范例,尤其是为传统的生物分类学发展注入了新的活力(肖金花等,2004)。DNA条形码技术的建立源于DNA分类学的概念(Tautz et al.,2002,2003)。Hebert(2003a,b)选择动物线粒体COI基因作为条形码开展动物鉴定的尝试并获得成功,成为DNA条形码技术的创立者。     

神农架川金丝猴粪便和尿液中类固醇激素的检测

灵长类动物类固醇激素的研究已经在很多物种间展开(Cariso et al.,1999;Lutz et al.,2000;He et al.,2001;Yan and Jiang,2006;Brandon et al.,2008;Lu et al.,2010;Kim et al.,2012)。特别是对于没有明显发情特征的灵长类动物,类固醇激素的变化可以为它们的繁殖状态提供更多可靠的评估(Fujita et al.,2001)。自然状态下野生动     

Nanoscale storage encryption: data storage in synthetic DNA using a cryptosystem with a neural network

<正>Dear Editor,Synthetic DNA is emerging as a new data storage medium with high density and durable preservation capability potential(Ceze et al., 2019; Yazdi et al., 2015), thus enhancing the security of data stored in DNA is particularly important(Cherian et al., 2013; El-Zoghabi et al., 2013; Kalsi et al.,2018).     

DPB3 and DPB4 proteins regulate Medicago flowering and leaf anthocyanin biosynthesis

<正>As important subunits of the leading-strand DNA polymerase epsilon,chromatin remodeling,and histone acetylation complexes,the H2A/H2B-like histone-fold domain-containing proteins DNA PO-LYMERASE II SUBUNIT B3 (DPB3) and DPB4 play key roles in nucleosome assembly and heterochromatin maintenance during DNA replication in yeast,Drosophila,and mammals (He et al.,2017;Bellelli et al.,2018;Yu et al.,2018;Casari et al.,2021).     

A modified high-efficiency thermal asymmetric interlaced PCR method for amplifying long unknown flanking sequences

<正>Rapid and efficient isolation of unknown flanking DNA sequences adjacent to known regions is important for molecular biology research.For this purpose,several PCR-based methods have been reported,including inverse PCR(Uchiyama and Watanabe,2006),ligation-mediated PCR(Yan et al.,2003;Ballester et al.,2005;Wang et al.,2007;Trinh et al.,2012)and randomly primed PCR(Liu and Whittier,1995;Liu et al.,1995;Antal et al."2004;Liu and Chen,2007;Reddy et al.,2008;Wang     

果园三种天蛾的DNA条形码鉴定

DNA条形码(DNA Barcoding)可以利用一段通用基因短片段对物种(包括不同生活史阶段)进行区分。本文尝试应用该技术对深色白眉天蛾Hyles gallii(Rottemburg)、构月天蛾Parum colligata(Walker)、桃红六点天蛾Marumba gaschkewitschi(Bremer et Grey)等3种天蛾进行了鉴别。测定了3种天蛾的COⅠ基因序列,并在BOLD(Barcode of Life Data Systems)及GenBank中进行了检索。结果发现BOLD系统比GenBank更能帮助准确鉴定到物种,而在GenBank中只有1种能鉴定到种。将实验室获得序列与GenBank中下载的474条同源序列整合后,利用MEGA4.0的Kimura-2-Parameter模型进行了遗传距离分析,利用MEGA4.0及PAUP4.0进行了系统发育树的构建,结果发现待鉴定标本序列在各个系统发育树的位置基本一致,并能准确鉴定出一种天蛾。本研究表明,随着BOLD系统、GenBank等公共数据库的不断完善,DNA条形码将有助于更加有效地鉴定特定类群物种。