微生物蛋白质组学研究进展

微生物基因组研究作为人类基因组计划的一部分 ,对人类基因组计划及微生物学 ,甚至整个生命科学都产生巨大的影响[1] 。人类基因组测序已经取得突破性进展 ,现已绘制完毕人类基因组的工作草图 ,人类基因组计划即将提前完成。目前已采用ＤＮＡ ＲＮＡ芯片和基因表达序列分析 (ｓｅｒｉａｌａｎａｌｙｓｉｓｏｆｇｅｎｅｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ,ＳＡＧＥ)来研究基因组的功能[2 ,3 ] 。但随着对基因组研究的深入 ,人们认识到单纯从基因组信息并不可能完全揭示生命的奥秘。因为蛋白质是生物功能的体现者 ,这使我们不得不考虑基因编码的蛋白质有什…     

用基因表达连续分析进行基因组转录图谱分析

20 0 0年 6月 ,公用基金资助的人类基因组计划 (ｈｕｍａｎｇｅｎｏｍｅｐｒｏｊｅｃｔ,ＨＧＰ)和Ｃｅｌｅｒａ公司在美国白宫宣布了人类基因组草图的完成。这是关于人类基因组研究的标志性成果 ,象征成基因组的研究从结构基因组(ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌｇｅｎｏｍｉｃｓ)过渡到功能基因组 (ｆｕｎｃ ｔｉｏｎａｌｇｅｎｏｍｉｃｓ)的研究。他们的论文分别在Ｎａｔｕｒｅ[1] 和Ｓｃｉｅｎｃｅ[2 ] 上发表。他们从基因组预测的基因数分别为 31 778(ＨＧＰ的估计 )和2 6 588(Ｃｅｌｅｒａ公司 )条。这比预先估计的 6 00 0 0～ 1 0 0 0 0 0要少。…     

人类基因组研究进展及其产业化前景

人类基因组研究关系到人类生存与健康的各个方面 ,成为医药生物技术产业创新的重要源头 ,将产生巨大的社会效益和经济效益。 2 0世纪末启动的人类基因组计划被公认为是生命科学发展史上的里程碑 ,随着人类基因组、水稻基因组、拟南芥基因组及其它重要微生物等 5 0多种生物基因组全序列测定工作的完成 ,目前国际基因组研究开发的总体趋势已发生了变化 ,功能基因组研究成为竞争的焦点。我国在人类基因组研究方面已取得令人瞩目的成绩 ,如在世界上首次克隆了人神经性高频耳聋、遗传性乳光牙等一批疾病基因 ,收集、保存了一批宝贵的遗传资源 ,建立了国家级的、在国际上具有初步竞争实力的人类基因组研究基地等。综述了近年来人类基因组研究、开发现状及我国在该领域所具备的一些工作基础 ,并对加速我国人类基因组研究提出了一些建议。     

水稻(籼稻)全基因组框架序列研究简介

水稻为世界一半以上的人口提供了主要食物。水稻基因组的常染色质部分长约 43 0个ｍｂ ,是拟南芥基因组长度的 3 .7倍 ,约为人类基因组长度的七分之一。我们最近完成了水稻的籼亚种——— (ＯｒｙｚａｓａｔｉｖａＬ .ｓｓｐ .ｉｎｄｉｃａ)中的全基因组序列草图的绘制 (Ｓｃｉｅｎｃｅ ,2 96 :79～ 92 ,2 0 0 2 )。籼稻在中国与东南亚广泛种植。我们分析的籼稻品种 93＿1 1就是袁隆平院士培育的超级杂交水稻两优培 9(ＬＹＰ9)的父本。水稻基因组全长 46 6ｍｂ ,包含有 46 0 2 2～ 5 5 0 1 5个基因。在已测序的序列中功能区占 92 .0 %。通过…     

基因组数据的处理

随着人类基因组计划、小鼠基因组计划、各种微生物基因组计划、水稻基因组计划以及各种动植物基因组计划的顺利实施 ,基因数据不断增加。 1995年第一条全基因组数据 (Ｈａｅｍｏｐｈｉｌｕｓｉｎｆｌｕｅｎｚａｅ ,流感嗜血杆菌全基因组序列 )公布。以ＧｅｎＢａｎｋ收录的基因组数据为例 ,1996年 ,ＧｅｎＢａｎｋ仅收录了 2条全基因组数据 ,1997年就增加到 6条全基因组数据 ,到目前为止 ,ＧｅｎＢａｎｋ已收录了包括大肠杆菌在内的 10条全基因组数据。此外 ,至少有 32条微生物全基因组即将测序完毕 ,不久将收录ＧｅｎＢａｎｋ中[1] 。基因…     

龙蒿的组织培养和快繁

1　植物名称　龙蒿 (Ａｒｔｅｍｉｓｉａｄｒａｃｕｎｃｕｌｕｓ) ,又名狭叶青蒿。2　材料类别　嫩尖、茎段。3　培养条件　芽诱导培养基 :(1 ) 1 /3ＭＳ 6 ＢＡ1 .0ｍｇ·Ｌ- 1 (单位下同 ) ＩＢＡ 0 .2。增殖培养基 :(2 )ＭＳ 6 ＢＡ 0 .5 ＩＢＡ 0 .2 ;(3 )ＭＳ 6 ＢＡ 0 .2 ＩＢＡ 0 .2 ;(4)ＭＳ。生根培养基 :(5 ) 1 /2ＭＳ ＩＢＡ 0 .5 ;(6 ) 1 /2ＭＳ ＮＡＡ 0 .5 ;(7) 1 /2ＭＳ ＩＢＡ0 .5 ＮＡＡ 0 .5。以上培养基加入微生物多糖固化剂 4.5 ｇ·Ｌ- 1 ,蔗糖 3 % ,培养温度 (2 5± 2 )℃ ,ｐＨ5 .86 .0 ,光照度 1 5 0 0…     

美国微生物学会会讯摘要

1.近来对于微生物基因组中的功能性研究,已提到议事日程上.如对梅毒螺旋体基因组分析,推测共有1 030个开放阅读框架(ORF).将每一个ORF均转入噬菌体M13建成噬菌体展示库,使相应蛋白表达,从而可研究患者血清与该蛋白间的相互作用.又例如,发现结核分枝杆菌在培养基中与在感染巨噬细胞中,基因组的能量代谢途径有显著不同.在细胞中表达的一些基因原被视为"看家"基因,可具有毒力作用.因此,微生物基因组研究与微生物学间已出现了再次"联合"的阶段.     

部分已测序物种介绍

人(Homo sapiens)2003年4月14日,美国国际人类基因组研究项目总负责人弗朗西斯·柯林斯博士在华盛顿宣布,美、英、日、法、德和中国科学家经过13年努力共同绘制完成了人类基因组序列图,人类基因组计划所有目标全部实现。人类基因组遗传密码     

微生物完整基因组测定中的Gap closure策略

微生物基因组空缺区域(Gap)中可能存在重要的生物学信息,如果无法补齐所有Gap,不仅不能获得完整的基因组图谱,还会给后续的基因组信息解读造成很大困难。而基因组空缺区域填充(Gap closure)是获得微生物基因组完成图的关键,本文结合作者以及借鉴上海人类基因组研究中心在微生物基因组Gap closure中的经验,针对微生物基因组Gap closure常用的6种策略:参考序列比对、多引物PCR、基因组步移、基因组文库克隆末端测序、末端配对(Paired-End)以及基因组光学图谱技术进行综述。     

蛋白质组学及其意义

1　蛋白质组学的产生人类基因组计划 (Human Gemome Project HGP)是人类有史以来最伟大的认识自身的世纪工程 ,旨在阐明人类基因组 DNA3× 10 9核苷酸序列 ,希望在分子水平上破译人类所有的遗传信息。经过各国科学家十几年的努力 ,HGP已取得了巨大的成绩 ,预计在 2 0 0 5年完成全部测序的目标有望提前达到。那么 ,如何将这一计划获知的人类基因序列转变为对人类自身认识的知识 ?如何对这些基因加以利用呢 ?科学家认为 ,生命科学已进入了后基因组时代 ,而功能基因组 (FunctionalGenomics)的研究 ,则是这一时代的核心内容。可以说 ,HGP…