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AFLP─一种DNA分子标记新技术 总被引:78,自引:2,他引:78
AFLP──ANovelTechniqueforDNAMolecularMarkerWengYuejin(InstituteofCropGermplasmResourees,ChineseAcademyofAgriculturalSciences,Beijing100081)公司科学家ZabeauMarc和VosPieter发明创建的一种DNA分子标记新技术,它不仅具备了其它DNA分子标记技术所具有的特点,多态性丰富,共显性表达,不受环境影响,无复等位效应,而且还具有带组丰富,用样量少,灵敏度高,快速高效等特殊优点.一个0.5mgDNA样品,可做4000个反应,获得8万个标记,650万条带纹。美国加利福尼亚大学MackillDavid[7]利用14份水稻为材料,比较AF… 相似文献
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AFLP在分子生物学研究中的应用 总被引:17,自引:0,他引:17
扩增片段长度多态性(AFLP)可靠性强,多态检出率高,因而被认为是最有效的DNA指纹分析技术。AFLP已广泛应用于分类学、病理学、种群遗传学、DNA指纹分析的研究和建立数量性状基因图谱,成为最主要的遗传标记。介绍了AFLP的原理、影响因素及其在分子生物学研究中的应用。 相似文献
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DNA指纹技术新进展 总被引:7,自引:0,他引:7
DNA指纹技术从原理上可以分为两大类:即传统的以Southern杂交为基础的RFLP技术和以聚合酶链式反应(PCR)为基础的一系列分子标记技术。RFLP需要样品DNA的量较大,对微量被测样品无能为力。至于与PCR相结合的RAPD、AP-PCR和DAF等技术则由于引物相对较短,对实验条件非常敏感,每一轮实验都需要筛选最合适的反应体系,增加了实验周期和复杂度。近几年新出现的AFLP(Am-pilified Fragment Length Polymorphism)、LP-RAPD(Long Primer RAPD)和DALP(Direct 相似文献
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糙皮侧耳(Pleurotus ostreatus)的AFLP指纹图谱分析 总被引:7,自引:0,他引:7
在对糙皮侧耳(Pleurotus ostreatus)的AFLP分析条件进行优化的基础上,利用该技术建立了14株产自不同地区的糙皮侧耳:DNA指纹图谱,并进行了数据分析。结果表明,在合成的14条引物的不同组合中,引物对E-3/M-3可以产生较多的DNA多态片段,E-AGC/M-CAT引物对的扩增效果最好,共获得184条DNA扩增带,其中多态性条带i101条,占54.89%。利用UPGMA法对所获数据进行聚类分析,计算得到糙皮侧耳菌株之间的遗传距离,发现不同品种间遗传距离差异较大,从0.192到0.754,说明糙皮侧耳的遗传多样性比较丰富。绘制的指纹分析树状图表明,14个糙皮侧耳菌株被分为6个组群,其中P17和杂3的相似性系数最高,达到了81.2%,而侧5与其他菌株的亲缘关系相对最远。 相似文献
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DNA指纹术的研究进展奇云一、DNA指纹图的发现与发展遗传分析需要有遗传标记。遗传标记是指生物体的某些性状或物质,它们能够稳定地遗传且遗传方式简单,可用以反映生物个体或群体的特征。直到70年代后期,利用的遗传标记主要为生物的各种外部表现性状、生理缺陷... 相似文献
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AFLP分子标记及其在植物育种上的应用 总被引:64,自引:0,他引:64
扩增酶切片段多态性(AmplifiedRstricitonfragmentpolymorphism,简称AFLP)是由Zabeau等1992年发明的一项新的DNA指纹技术,它结合了RFLP和PCR技术的特点,具有RFLP技术的可靠性和PCR技术高效性,其基本原理是对基因组DNA酶切片段的选择性扩增,AFLP扩增片段的谱带数取决于采用的内切酶及引物3′端选择碱基的种类数目和所研究基因组的复杂性,实验 相似文献
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天麻AFLP分析技术体系的建立 总被引:4,自引:3,他引:4
目的:建立一个适于天麻研究用的AFLP分析技术体系。方法:以11份天麻种质资源为试材,构建供试天麻的AFLP指纹图谱,同时对AFLP分析过程中DNA提取、酶切、连接、预扩增、引物筛选、选择性扩增、电泳和银染等多种因素进行分析。结果:AFLP分析体系要求DNA模板质量高,酶切连接可同时进行,37℃、9h效果较好,预扩增要求高质量DNA聚合酶,产物15倍稀释作为选择性扩增模板效果好,制胶前玻璃板的处理和银染时间的掌控对获得较好结果非常关键。P-GGA/M-GT引物构建的指纹图谱拥有可清晰辨认的扩增条带45条。结论:AFLP指纹技术具有稳定性高、重复性好等优点,可用于天麻DNA分析。 相似文献
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贵州小型香猪基因组DNA的AFLP检测研究 总被引:27,自引:0,他引:27
报道了AFLP标记在研究贵州小型香猪遗传多性方面的应用和该品系猪个体基因组DNA的AFLP扩增结果,分析了贵州小型香猪的群体遗传结构。实验应用10条AFLP引物,用PstⅠ酶切,对17头猪基因组DNA进行AFLP反应,共获得116个AFLP标记,单引物获得的标记数在2-22间,贵州小型香猪群体相似系数AFLP研究结果为0.866(0.760-0.967),该研究为贵州小型香猪的遗传稳定性提供了相关的参数,准确评价尚待和其它品种猪对研究后确定。 相似文献
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美洲黑杨无性系AFLP指纹分析 总被引:27,自引:0,他引:27
1992年由Zabeau和Vos发明的扩增酶切片段长度多态性AFLP标记技术(Europeanpatent,0535858A1,19930331),是目前国际上构建DNA指纹图谱的最新方法,AFLP能检测到大量的基因位点,因而灵敏度高。选用不同的... 相似文献
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AFLP分子标记及其应用 总被引:33,自引:0,他引:33
扩增片段长度多态性(Amplified fragment length polymorphism,AFLP),是Zabeau等(1992)发展的一种新DNA指纹技术。该技术原理简单,引物设计巧妙,既具有RFLP技术的可靠性又具有RAPD技术的高效性,被称为“最有力的分子标记”。系统介绍了AFLP分子标记的基本原理、技术流程和优化措施,对AFLP标记在植物居群生物学、保护生物学、分子系统学等领域中的应用作了简要介绍,并对其应用前景进行了展望。 相似文献
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用磁珠富集法从AFLP片段中分离微卫星DNA标记 总被引:9,自引:0,他引:9
将花生(Arachis hypogaea L.)基因组DNA经酶切后转变成AFLP DNA片段,然后用生物素标记的简单重复序列(SSR)作探针与其杂交,杂交复合物固定到包被有链亲和素的磁珠上,经过一系列的洗涤过程,含有SSR的AFLP片段被吸附在磁珠表面。这些片段经洗脱下来后,先用对应的AFLP引物扩增,再进行克隆和测序,根据SSR两端的保守序列设计引物,经过多态性分析后,便可得到微卫星DNA标记。整个实验过程操作简单、消耗少,可在一周内完成,可作为从植物中分离SSR的一种简单有效的方法。 相似文献
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AFLP分子标记及其应用(综述) 总被引:12,自引:0,他引:12
本文简述AFLP分子标记的原理、方法与特点,并综述其在植物遗传多态性及系统发育学研究、基因定位及高密度遗传图谱(或物理图谱)构建和品种鉴定及抗性育种特性性状的分子标记中的应用现状和前景。 相似文献
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萝卜品种指纹图谱SRAP与AFLP分析 总被引:6,自引:0,他引:6
应用SRAP与AFLP两种分子标记技术进行了萝卜品种鉴定分析。对萝卜基因组DNA的SRAP-PCR反应体系中引物、Mg2 、dNTPs浓度进行优化,确定最优体系为引物0.3μmol.L-1,dNTP 0.2 mmo.lL-1,Mg2 3.0 mmo.lL-1。对SRAP-PCR中的退火温度(50℃)设置了12个梯度处理,以em2-me2为引物时带型无明显差异。7个供试萝卜材料的SRAP和AFLP指纹图谱分析表明,供试材料均可被SRAP和14个AFLP引物准确鉴定,每对引物组合都产生独特的指纹图谱。11个SRAP引物组合共产生155条带,多态性条带84条。聚类分析与相对遗传距离(GD)表明,供试材料聚为4类,CB-03-2与SHCB-02-1亲缘关系最近(GD=0.054 9);齐虹大连和Heiseng的亲缘关系最远(GD=0.203 4)。基于16个AFLP标记引物组合分析结果表明,供试材料聚为3类,CB-03-2和SHCB-02-1的亲缘关系最近。SRAP与AFLP综合分析结果表明,供试材料可聚为3类,其中CB-03-2与SHCB-02-1亲缘关系最近(GD=0.047 6)。 相似文献
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