Nat Med:抑癌因子PTEN或可促癌

正最近,来自美国加州大学旧金山分校的研究人员发现在多种癌症类型中扮演抑制因子角色的PTEN并非总是发挥抗癌作用,该研究发现PTEN分子能够促进前体B细胞发生癌转化,因此靶向清除PTEN可能是治疗前体B细胞急性淋巴细胞白血病的一种新策略。许多研究表明PTEN是PI3K-AKT信号途径的一个负调控因子,也是一种强力的肿瘤抑制因子,许多癌症类型中都存在PTEN突变,PTEN     

抑癌基因PTEN在胃癌中的研究进展

近年来国内外的学者在多种肿瘤中发现抑癌基因PTEN的等位基因缺失、基因突变、甲基化,PTEN基因杂合性丢失(LOH)频繁的发生于胃癌,而该基因发生突变的频率较低,蛋白表达普遍下降.抑癌基因PTEN异常与胃癌的发生和发展相关,对PTEN功能的进一步研究将为胃癌的诊断和治疗提供新的思路.     

磷酸酶PTEN 在中枢神经系统中的研究进展

第10号染色体缺失的磷酸酶和张力蛋白同源等位基因PTEN,是1997年发现的一种新的肿瘤抑制基因.在中枢神经系统中,由于PTEN基因发生突变或功能障碍是导致神经胶质细胞瘤形成的重要致瘤因素.新近研究表明,PTEN除了与肿瘤形成有关外,还与其它脑部病变具有一定的联系,并在中枢神经系统的病理生理变化过程中起一定的作用.本文就PTEN在神经损伤、神经发育和精神疾病中的作用进行综述,并揭示以PTEN为分子治疗的靶点,探索治疗中枢神经系统疾病的一种新的治疗策略.     

抑癌基因PTEN及其与急性白血病相关性研究

抑癌基因PTEN是迄今为止发现的第一个具有双特异性磷酸酶活性的抑癌基因.PTEN基因的缺失或异常表达与多种肿瘤的发生发展密切相关.在急性白血病中,PTEN基因发生异常改变,影响了细胞增殖周期的调控和细胞凋亡等过程.PTEN基因的研究,为急性白血病的药物治疗及基因靶向治疗提供理论依据.     

PTEN研究的新进展

PTEN／MMACl／TEP1基因是目前发现的第一个具有磷酸酶活性的抑癌基因。PTEN基因位于染色体10q23区,与多种散发性肿瘤和几种家族性癌易患综合症有关。通过抑制Akt的活性调节细胞周期、细胞凋亡和粘连。本文讨论了PTEN的结构、功能及其相互关系,PTEN在肿瘤抑制中的作用机制。     

p53：一个具有双面性的癌基因

根据经典的癌症遗传学，有两类癌症诱发的基因突变：一类是原癌基因（Oncogenes），其突变后增加了表达或功能；另一类是肿瘤抑制基因tumour suppressor genes），突变后导致其丧失表达或功能，这些都作为肿瘤的诱发事件。从1979年发现到1980年代后期，p53都被认作原癌基因。但是后来的研究又对该基因进行了重新分类，这是由于发现在肿瘤细胞中p53突变和基因缺失，     

MicroRNA与肿瘤相关的信号转导通路

信号转导通路在细胞代谢、生长、增殖、应激、发育和凋亡等生命活动中具有极为重要的作用。干扰这些通路将可能影响细胞的正常发育, 甚至导致肿瘤。MicroRNA(miRNA)是近年来在真核生物中发现的、在转录后水平负调节基因表达的一类长度约22个核苷酸的非编码小RNA, 其靶基因数目众多, 生物学功能广泛。在多种肿瘤中发现了miRNA的异常表达, 提示后者与肿瘤发生有关, 可能机制为调控癌基因或肿瘤抑制基因的表达。此外亦发现miRNA的靶基因有许多作用于肿瘤相关的信号转导通路。miRNA在肿瘤发生过程中的重要调控功能预示其将成为人类癌症诊断和治疗方面的新星。     

PTEN和PTEN-Long的关系及其抑瘤作用

第10号染色体同源缺失性磷酸酶-张力蛋白(phosphatase and tensin homolog deleted on chromosome ten,PTEN)是继P53之后发现的又一抑癌基因,其编码的蛋白产物包括了张力蛋白样结构域和双重特异性的磷酸酶结构域。令人吃惊的是,2013年研究人员发现该抑癌基因的mRNA在翻译过程中因选择不同的翻译起始密码子,会产生一种具有类似于病毒穿膜机制的蛋白产物,该蛋白产物稍长于PTEN,也具有抑癌作用,故命名为PTEN-Long。由于PTEN-Long既具有分泌和穿过细胞膜的能力,又能像传统抑癌蛋白那样对肿瘤起杀伤作用,这使得PTEN-Long在肿瘤治疗中具有很好的前景。PTEN和PTEN-Long既有共性,又有各自的特异性,本文就PTEN和PTEN-Long基因及其编码的蛋白在结构和功能的异同及其抑瘤作用作一综述,为进一步研究PTEN和PTEN-Long提供理论基础。     

Nature:逆转肿瘤抑制子的缺失或称为治疗脑癌的关键

正近日,一项刊登在国际杂志Nature上的研究论文中,来自德克萨斯大学MD癌症研究中心的科学家们通过研究表示,一种名为PTEN的肿瘤抑制基因会受到其所在机体器官的微环境的影响,而且PTEN还可以被不同器官进行调节,对于脑癌转移患者而言,这并不是什么好事儿,因为PTEN的功能在大脑细胞中是处于关闭状态的,让科学家们更惊讶的是,一旦细胞迁移到了其他器官PTEN就会恢复。     

癌症抑制因子——肿瘤抑制基因

癌症抑制因子──肿瘤抑制基因杨杰（安徽教育学院生物系,２３００６１）张为民（焦作教育学院生物系）１、肿瘤抑制基因与癌症的关系１．ｌ肿瘤抑制基因的缺失引发多种癌症。肿瘤抑制基因的研究大约始于１９６９年。ＨｅｒｒｙＨａｍ＇ｓ等发现当高度恶化的鼠埃利希腹水...     

天然嵌合基因的结构特性及其对基因设计的启示

天然嵌合基因(natural chimeric gene)是由两个或两个以上的独立基因天然融合而成的新基因,该类型基因的发现,突破了“一个基因对应一个染色体座位”的经典认知,扩展了基因的概念。在人类癌症研究过程中,诸多的嵌合基因可导致肿瘤相关疾病,并作为癌症分子的诊断标志而受到人们的广泛关注。本文基于嵌合基因生物信息学方面的相关研究,以癌基因为切入点,从天然嵌合基因的融合特点、转录、调控,以及融合蛋白的结构域组合形式和功能等方面,结合本研究组前期的相关工作,综述了嵌合基因融合结构和功能的研究进展,探讨了当前研究工作的困难与挑战,并对嵌合规律在新基因设计的应用作了展望。     

抑癌基因PTEN及其假基因PTENP1在子宫内膜癌中的研究进展

子宫内膜癌的发病率在逐年上升,引起了人们的广泛关注,但其发病的分子遗传学机制仍不十分清楚。近年来基因改变致癌的研究成为热点。国内外研究报道发现：PTEN（与张力蛋白同源第10染色体丢失的磷酸酶基因）是目前已知的子宫内膜癌中突变率最高的基因,常发生在子宫内膜癌的早期,对其突变的检测有助于子宫内膜癌的早期诊断、治疗及预后评价,并为子宫内膜癌的基因治疗提供了新的靶点。另外,研究发现,PTENP1（PTEN的假基因）转录调控PTEN的表达,被认为与一些肿瘤的发生有关。本文就PTEN基因的结构、功能及在子宫内膜癌中的突变情况、临床意义及PTENP1的研究现状进行综述。     

癌症中DNA甲基化基因模块筛选

肿瘤的发生受遗传学和表观遗传学修饰的共同影响。DNA甲基化是一种重要的表观遗传修饰,在癌症的发生与发展中起着重大的作用。因此找到癌症的甲基化标记物在癌症的诊断和治疗中具有重大意义。本文利用权重基因共表达网络分析的方法（WGCNA）筛选出甲基化基因模块,并分析模块向量基因,进行功能注释,最后对基因模块进行功能分析,得到DNA甲基化与肿瘤间的关系。结果显示,这些甲基化异常的基因模块与癌症的发生有着显著的关联。同时还发现某些甲基化异常的基因模块与多种癌症的发生都有着显著的关联。     

发现跳跃癌症基因

研究人员发现了一种跳跃基因,可用于探测在肝脏肿瘤中非常容易受损伤的基因。该方法有望广泛应用于对其他类型癌症有影响的多种基因的探测。     

癌症相关microRNA与靶基因的生物信息学分析

MicroRNAs(miRNAs)是一类长度约为22nt的内源性非编码RNA,通过与靶基因转录本互补结合调控基因的表达。近年来,研究发现miRNA与癌症发生密切相关,miRNA可以直接充当癌基因或者抑癌基因而影响肿瘤的发生和生长。为更进一步揭示癌症相关miRNA的特征及靶基因的功能,文章通过数据库搜索及文献检索,在人类基因组中发现了475个癌症相关miRNA,系统地比较了癌症相关miRNA与非癌症miRNA以及基因内和基因间区癌症相关miRNA在保守性、SNP位点分布、癌谱及转录调控等特性。研究发现,癌症相关miRNA比非癌症miRNA保守性要强,发生SNP概率比较低,同时发现miRNA所涉及癌症数目与保守性成正相关。基因组定位分析发现,癌症相关miRNA比非癌症miRNA更倾向于成簇存在。进一步对宿主基因、癌症相关miRNA及作用的靶基因与癌症发生进行关联分析,发现一些非癌症miRNA的宿主基因倾向于被癌症miRNA作用。本研究结果为深入理解miRNA与癌症之间的关系,以及进一步为miRNA作为癌症诊断指示物提供理论依据。     

乳腺癌癌旁组织特异性表达基因分析

癌症研究中常用癌旁组织(normal tissues adjacent to the tumour, NAT)作对照,而癌旁组织与无肿瘤的正常组织的基因表达谱是有差异的。癌旁组织特异性表达基因的存在通常会干扰传统的转录图谱研究,然而目前关于癌旁与无肿瘤组织的基因表达谱差异的研究相对较少。本研究对14例乳腺癌患者的癌组织、癌旁组织和对侧正常乳腺组织样本进行高深度RNA测序和分析,发现癌旁组织相比对侧正常乳腺组织有102个差异表达基因。基因富集和蛋白-蛋白互作分析揭示这些差异表达基因显著富集在肿瘤坏死因子(tumour necrosis factor,TNF)和上皮间质转化(epithelial-mesenchymal transition, EMT)等癌症相关的基因集中。通过比较癌旁组织与癌组织、癌旁组织与对侧正常乳腺组织的转录图谱,发现23个癌旁组织特异性高表达的基因,即癌旁特异性激活(tumour-adjacent specific activation, TASA)基因。这些基因显著富集在TNF基因集中,其中15个是新发现的基因。结果表明,TASA基因在乳腺癌癌旁组织中普遍存在,并且与免疫系统的TNF信号有关。癌旁中存在类肿瘤型表达模式的基因,这些基因可能与肿瘤形成有关,但是往往在肿瘤-癌旁成对研究中被遗漏。     

《自然》：揭示正常细胞如何影响肿瘤生长

以往曾认为在乳腺肿瘤中的两类细胞——快速增长的恶性细胞和它们周围的正常细胞——独立存在，互不干扰。最近的研究表明，表面正常的细胞能促进肿瘤内细胞恶变。但这两类细胞间如何相互影响有待解答。一项由美国俄亥俄州立大学癌症研究人员主持的研究有助于解开这个谜团。它首次表明，如果肿瘤外围正常细胞缺失一种PTEN基因，将会改变肿瘤周围环境以促进肿瘤生长。     

基于集成的共表达网络分析方法研究3种癌症的肿瘤相关模块

在肿瘤/癌旁基因表达数据中,差异表达 (DE,differential expression) 代表各种生物条件下基因表达水平的变化,而差异共表达 (DC,differential co-expression) 代表基因对之间相关系数的变化。单独的DC和DE研究方法已经被广泛应用于人类疾病研究中。但是,目前仍然缺乏有效整合DC和DE的分析方法。文中提出一个新颖的分析框架DC&DEmodule,该框架可以基于共表达模块整合DC和DE的特征,并同时整合多个肿瘤/癌旁表达谱的信息,用以识别与疾病相关的基因共表达模块,包括激活模块 (肿瘤样本中上调且共表达增强) 和失能模块 (肿瘤样本中下调且失去共表达)。将该框架用于分析肝癌、胃癌和结直肠癌各两组微阵列数据,分别得到肝癌、胃癌和结直肠癌的2、5和2个激活模块以及5、5和1个失能模块。富集分析表明与同类方法相比,文中的方法在检测已知的肿瘤相关通路和发现新通路方面均具有更高的灵敏度。然后,进一步从这3种癌症的激活模块中鉴定出17、69和11个模块关键基因,其中包含53个已报道的预后生物标志物以及3个分别与3种癌症存活率显著相关的新预后标志物。基于关键基因训练了3种癌症的随机森林模型,用于区分TCGA(The Cancer Genome Atlas) 和GEO (Gene Expression Omnibus)数据库中的肿瘤和癌旁样本,结果显示其分类的平均准确性达到了93%。三种癌症的比较为不同癌症的共有和组织特异性机制提供了新的见解。一系列评估表明,DC&DEmodule框架能够整合公共数据库中快速积累的表达谱,发现更多疾病中功能失调的生物过程。     

USP22调控肿瘤中信号转导通路的研究进展

USP22作为肿瘤干细胞标志物之一,在几种类型的人类癌症中已被观察到,这表明USP22可能参与各种生理和病理过程,并作为致癌基因在癌症进展中起作用。然而,导致USP22转录激活的机制,特别是USP22介导人类肿瘤进展的机制,至今仍然未知。前期研究表明USP22主要通过调节正常T细胞和B细胞中丝裂原的激活诱导肿瘤发生。而最新研究发现,仅USP22过表达不足以诱导肿瘤发生, USP22是通过肿瘤相关信号通路的激活参与肿瘤进展的,该理论的出现为肿瘤机制的研究提出了新见解,也为USP22介导肿瘤治疗耐药性提供了新思路。该文对USP22参与肿瘤进展的相关信号通路进行概述和总结,以期发现USP22介导肿瘤发生发展的分子机制及不同信号通路之间的串扰对肿瘤进展的影响,为癌症治疗提供新思路。     

白血病发生的新基因

法国和比利时科学家最近发现一种引起急性淋巴细胞白血病的新基因。患者的细胞中,一种叫PTPN2的特殊基因停止了工作,造成癌症细胞长期生存并迅速发展。这项研究从遗传和功能上为PTPN2在肿瘤抑制中的作用提供了证据。