文摘

９９００９０家蚕核型多角体病毒ｅｇｔ基因的克隆和序列分析［中］／季平…／／中国农业科学．－１９９８,３１（６）．－４４～４９从ｐＵＡｃ－ｅｇｔ中分离出ＥｃｏＲ１－ＸｂａＩ１．１ｋｂ的ｅｇｔ基因片段作探针,克隆了家蚕核型多角体病毒镇江株的ｅｇｔ基因,对该基因作了酶切分析和基因定位,测定了该基因的全序列。并与ＡｃＮＰＶ－Ｃ６株及ＢｍＮＰＶ－Ｔ３株的ｅｇｒ基因作了比较,发现它们之间的同源性在９５％以上,基因大小都为１５１８ｂｐ。（杨淑培）９９００９１冰核真菌成冰生物学特性研究［中］张敏…／／中国农业科…     

人造锌指蛋白的应用

C2H2锌指是真核细胞中最常见的DNA结合模体。由于C2H2锌指域靶位点特异性与结构和功能的模块性构成,使得C2H2锌指域成为构建特定的DNA结合蛋白的常用骨架。保持C2H2锌指的基本骨架不变,替换锌指特定位点的氨基酸残基,并融合表达其他功能域就可以得到具有靶向性的人造锌指蛋白(ZFP)。ZFP可以介导靶基因的转录调控,抑制或激活特定基因的表达与配体依赖的靶基因激活或抑制;对DNA进行修饰,如人造限制性内切酶,重组酶,整合酶;抗病毒感染等。因此,人造锌指蛋白应用前景广阔,研究价值显著,是未来人类基因治疗的革命性的工具。     

GATA—1红系特异性转录调节因子

ＧＡＴＡ－１是一种红系特异性转录调节因子,其结合基序广泛存在于红系特异表达基因的顺式调节元件中;ＧＡＴＡ－１具有锌指结构;能反式激活携带其结合基序的报告基因,在红系细胞分化发育中起重要作用。     

FMR—1同源基因在大鼠脑发育过程中持续表达

以克隆的人ＦＭＲ－１ ｃＤＮＡ片段为探针，进行ＲＮＡ印迹杂交，检测发育过程中大鼠脑组织ＦＭＲ－１同源基因的表达，结果显示从胚胎早期至出生后一个月该基因有持续表达，其中在胚胎发育晚期表达量较高，提示ＦＭＲ－１基因可能参与胎脑发育的调节。     

C2H2型锌指蛋白结合的DNA序列预测方法的研究进展

C2H2型锌指蛋白是哺乳动物中数量最多的一类转录调控因子.C2H2型锌指蛋白中含有的C2H2型锌指基序多是不相同的,表明它们很可能结合不同的DNA序列,从而调控不同的基因,行使多样化的调控功能.然而,目前大多数C2H2型锌指蛋白结合的DNA序列仍不明确,这阻碍了C2H2型锌指蛋白的功能研究.目前,针对C2H2型锌指蛋白的靶序列预测已有一些初步的研究.本文介绍了C2H2型锌指基序与DNA结合的经典模式,并对C2H2型锌指蛋白靶序列预测方法中所用到的算法、训练集、金标准数据集及相应工具进行了全面系统的总结归纳,旨在丰富对C2H2型锌指蛋白靶序列预测原理和工具的认识,为C2H2型锌指蛋白靶序列的精确预测和更深入的功能研究打下基础.     

锌指蛋白结构及功能研究进展

锌指蛋白是一类具有手指状结构域的转录因子,对基因调控起重要的作用。根据其保守结构域的不同,可将锌指蛋白主要分为C2H2型、C4型和C6型。锌指通过与靶分子DNA、RNA、DNA-RNA的序列特异性结合,以及与自身或其他锌指蛋白的结合,在转录和翻译水平上调控基因的表达。我们简要综述了近年来锌指蛋白结构、分类及其与核酸及蛋白质相互作用等方面的研究进展。     

C_2H_2型锌指蛋白研究进展

遗传信息的实现过程离不开基因表达的调控 ,至今为止发现的转录调控因子中有很多含有锌指模体 (ｚｉｎｃ ｆｉｎｇｅｒｍｏｔｉｆ)结构。锌指蛋白是指含有通过结合Ｚｎ2 稳定的短的可以自我折叠形成“手指”结构的一类蛋白质。由于其自身的结构特点 ,可以选择性的结合特异的靶结构 ,使锌指蛋白在基因的表达调控、细胞分化、胚胎发育等生命过程中发挥重要作用。自从 1 983年在爪蟾卵母细胞中发现第一个具有基因转录调控作用的锌指蛋白ＴＦⅢＡ以来 ,在多种生物中发现的锌指基因已有约 50 0多个 ,其中人基因组中的锌指蛋白基因达 2 0 0多个。…     

缺氧诱导因子1研究进展

缺氧诱导因子１（ＨＩＦ－１）在缺氧诱导的哺乳动物细胞中广泛表达,为缺氧应答的全局性调控因子。ＨＩＦ－１由ＨＩＦ－１α和ＨＩＦ－１β两亚基组成,为异源二聚体转录因子。ＨＩＦ－１α的ｂＨＬＨ和ＰＡＳ结构域与二聚化及ＤＮＡ结合活性有关,ＴＡＤ结构域则主要参与转录激 活。ＨＩＦ－１α的全长基因已克隆并在人和小鼠中定位。通过作用于靶基因的缺氧反应元件（ＨＲＥ０,ＨＩＦ－１参与缺氧诱导的一系列基因的表达调控。     

17个新的C2H2型锌指基因片段的分离与克隆

按照Ｃ２Ｈ２型锌指基因保守结构域的ＤＮＡ序列设计一对简并引物,以人基因组ＤＮＡ为模板进行ＰＣＲ同源扩增,将由此获得的锌指基因片段为探针,从人胎肾、骨骼肌、骨骼组织的ｃＤＮＡ分子库中筛选到２２个Ｃ２Ｈ２型锌指蛋白ｃＤＮＡ片段,经国际ＮＣＢＩ数据库查询检索,其中１７个为新的锌指基因片段。对从胎肾ｃＤＮＡ分子库中分离到的Ｋ３－４和Ｋ５－１２克隆进行了表达谱分析,发现Ｋ３－４在肾脏中的表达量明显高于其他几     

结合于GATA元件的Ⅳ型锌指蛋白

至今已发现了四种锌指蛋白（Ｚｆｐ）。Ⅰ型为Ｃｙｓ－Ｘ２－４－Ｃｙｓ－Ｘ３－Ｐｈｅ－Ｘ５－Ｌｅｕ－Ｘ２－Ｈｉｓ－Ｘ３－Ｈｉｓ,简写Ｃ２Ｈ２。ＴＦⅢＡ为Ｃ２Ｈ２×９,即９个锌指的重复单位。Ｓｐ１为Ｃ２Ｈ２×３。目前已发现有１０００种以上具有Ⅰ型锌指同源保...     

POZ锌指蛋白在发育和肿瘤发生中的作用北大核心CSCD

POZ锌指蛋白是一类在进化中高度保守的蛋白,具有多种重要的生物学功能。POZ锌指蛋白主要作为一种转录抑制因子而存在,通过POZ结构域招募一些转录辅阻遏物而调节靶基因的表达。近年来的研究发现,POZ锌指蛋白在发育和肿瘤的发生中有着重要的作用,综述5个POZ锌指蛋白在肿瘤的发生和生物体发育中的作用及功能,为人们进一步了解POZ锌指蛋白的功能提供资料。     

人免疫缺陷病毒1型Rev单链抗体细胞内免疫抗病毒基因治疗研究

应用抗ＨＩＶ－１Ｒｅｖ单链抗体细胞内免疫方法,研究在人Ｔ细胞和周围血淋巴单核细胞内抗病毒复制的效果,探讨细胞内免疫抗ＨＩＶ－１基因治疗的可行性。克隆抗ＨＩＶ－１Ｒｅｖ单链抗抗体（ｓＦｖ）基因,以逆转录病毒为基因载体,将名装后的含靶基因的逆转录病毒转导至人ＣＤ４阳性Ｔ－细胞株ＣＥＭ和ＳｕｐＴ１,以及ＨＩＶ－１阴性自愿者的周围血淋巴单核细胞（ＰＢＭＣ）,再分别用不同剂量（ＭＯＩ）的ＨＩＶ－１病毒株ＰＮ     

锌指蛋白核酸酶的作用原理及其应用

锌指蛋白核酸酶(Zinc finger nucleases,ZFN)因其能特异性识别并切割DNA序列以及可设计性,被用于基因定点突变和外源基因定点整合。目前,ZFN技术以其准确的靶位点设计能力和诱发高效率基因打靶的优势,越来越受到基因改造研究者的重视,已经成功应用于动植物细胞、胚胎的基因改造。随着鉴定靶DNA高亲和力的锌指蛋白(Zinc finger protein,ZFP)实验技术日渐成熟,可以预见到不久的将来这项技术会在基因工程和育种中得到广泛应用。文章介绍了锌指蛋白识别DNA靶位点和ZFN介导的基因打靶(Double strand break gene targeting,DSB-GT)的原理,同时还综述了目前ZFN技术用于基因改造的研究进展。     

转录调节因子KLF9的研究进展

KLF9是锌指蛋白Krüppel样转录因子(Krüppel-like factors, KLFs)家族的重要成员,通过C端的3个C2H2锌指蛋白结构,结合到靶基因启动子区富含GC的区域,调节靶基因的转录,从而参与调节细胞增殖、分化、凋亡和组织器官发育等多个生理过程。本文详细梳理了KLF9在机体代谢、氧化应激、肿瘤的发生发展等多个病理/生理过程中的作用,对近年来发表的KLF9相关文献做一简要概述,为深入解析KLF9的生理功能及其作用机制提供参考。     

真核生物中锌指蛋白的结构与功能

真核生物中的许多蛋白质分子包含锌指结构区,这类蛋白称为锌指蛋白.锌指蛋白因其包含特殊的指状结构,在对DNA、蛋白质和RNA的识别和结合中起重要作用.许多锌指蛋白的锌指结构域包含能与DNA特异结合的区域,并与某些效应结构域（如KRAB、SCAN、BTB/POZ、SNAG、SANT和PLAG等）相连,这类锌指蛋白常作为转录因子起作用,可调控靶基因的转录.一些锌指蛋白包含蛋白质识别结构域（如LIM锌指、MYND锌指、PHD锌指和RING锌指等）,它们能够特异地介导蛋白质之间的相互作用,因此被称作蛋白适配器.此外,某些锌指蛋白还可以结合RNA,起转录后调控作用.本文就锌指蛋白与DNA、RNA以及蛋白质分子间的相互作用作一综述.     

水稻种子发育期间特异锌指蛋白基因的筛选与分析

.锌指蛋白基因是植物基因组中最大最复杂的基因家族之一.大部分的锌指模体存在于转录因子中,它们在转录水平上参与植物生长发育及植物对生物和非生物胁迫的反应.为了解锌指蛋白基因在水稻种子发育中的作用,本研究通过多种数据库搜索获得了878个水稻锌指蛋白基因.从中选取311个利用RT-PCR技术分析它们在水稻成熟期根、茎、叶、花及不同发育阶段种子中的表达特征.结果发现,共有196个基因能在至少1个水稻器官中表达,其中10个为种子特异性表达基因.进一步分析发现,10个特异表达基因在水稻种子不同发育阶段中的表达具有种子阶段表达特异性.同时分析它们的基因及蛋白结构特点,结果显示它们的结构较简单,其中3个蛋白含有线粒体靶肽,5个蛋白含有CCCH锌指结构域.另外,分析种子特异性表达基因上游调控区的顺式作用元件,结果表明它们都含有TATA-box、CAAT-box和种子特异调控元件,除此之外还发现了光、激素和胁迫反应相关调控元件.这些结果为进一步研究它们在种子发育过程中的生物学功能提供了有用的线索.     

红细胞丙酮酸激酶研究现状

丙酮酸激酶（ｐｙｒｕｖａｔｅｋｉｎａｓｅ，ＰＫ）有４个同工酶，Ｌ，Ｒ，Ｍ１，Ｍ２常成熟红细胞Ｒ型为主，由ＲＫＬ基因编码，人类Ｒ型和ＰＫ基因的启动子区域存在４个高度保守成份，Ｒ型ＰＫ表达调控主要在转录水平，与锌指家族成员作用有关，研究显示－２７０ｂｐ的上游区域是一个强启动子，位点控制区ＨＳ２及启动子上游３．７ｋｂ处一片段具有增强子作用，随着对Ｒ型ＰＫ的深入了解及分子生物学进展，为ＰＫ缺乏所致溶血性贫     

棉铃虫核多角体病毒iap2基因的克隆和序列分析

棉铃虫核多角体病毒（Helicoverpa armigera sinle-nucleocapsid nucleopolyhedrovirus,HaSNPV）基因组中发现了一个抗细胞凋亡基因iap2。该基因位于病毒基因组的BamH I-F片段,全长753个核苷酸,编码250个氨基酸,预计蛋白质分子量29.2kD。在iap2基因上游－30－－33的集团有一个TATA框,在－50－53的位置有一个早期转录信号CAAT,在终止密码子下游有一个poly(A)信号AATAAA,HaSNPV iap2基因编码一个锌指结构和两个BIR结构。与LdMNPV、AcMNPV、SeMNPV和OpMNPV的IAPs及果蝇DIAP2和人类XIAP等九种IAPs相比较,HaSNPV IAP2与其它的BIR（baculovirus IAP repeater）和RING结构在Cys/His基元（motif）位点上高度保守。     

斑马鱼新基因KLP的筛选、克隆及初步分析

通过重组cDNA表达文库的血清学分析(SEREX)获得来自斑马鱼的cDNA序列,提取斑马鱼总RNA通过RT-PCR得到该基因全长共5171 bp编码1574个氨基酸,运用生物信息学研究工具进行分析显示该基因为一新基因,命名为KLP,在斑马鱼胚胎各个发育时期用RT-PCR检测该基因的表达情况发现:在斑马鱼早期胚胎发育的几个重要时期该基因都有高表达。该基因含有8个锌指结构,其中3个KAISO蛋白特征性的C2H2锌指结构,且此区域在多个物种内高度保守,提示其在胚胎发育早期过程中具有非常重要的作用。