Imaging techniques in microbiology

Recent advances in optical imaging have dramatically expanded the capabilities of the light microscope and its usefulness in microbiology research. Some of these advances include improved fluorescent probes, better cameras, new techniques such as confocal and deconvolution microscopy, and the use of computers in imaging and image analysis. These new technologies have now been applied to microbiological problems with resounding success.     

纳米孔测序技术在环境微生物研究中的应用

高通量测序技术是研究环境微生物的有效手段,而以纳米孔测序为代表的第三代测序技术以其测序读长长、测序速度快、测序数据实时监控、仪器方便携带、无GC偏好性、无需经过PCR扩增等显著优势有力推动了环境微生物研究的发展.本文对纳米孔测序技术的技术原理和特点进行了简要概述,重点介绍了纳米孔测序技术在环境微生物扩增子测序、宏基因组...     

Standardisation of methods in soil microbiology: progress and challenges

A plethora of methods have been developed over the few last decades to enable a better understanding of the ecology of soil microbial communities and their roles in soil functioning. However, there is generally considerable variation (both subtle and more extensive) in the actual realisation of these methods, and limited efforts have been devoted to their standardisation, despite this being crucial to underpin data comparison and integration. Ensuring comparable data across studies through standardisation is arguably best-practice, as well as necessary to effectively meet the objectives of various schemas, which require assessment of the consequences of the global change and intensification of human activities on the functioning of the soil ecosystem and its biological diversity. This article presents an overview of the existing and forthcoming ISO standards in soil microbiology and highlights possible future research efforts to be undertaken for developing new standards. We also discuss some practical and theoretical bottlenecks and hurdles that have limited standardisation in soil microbiology up to now.     

我国微生物学相关方向研究生论文选题变化分析(1999-2018年)

【背景】当前微生物学研究正处于发展的重要时期,研究生学位论文作为研究生阶段的主要产出,在一定程度上体现了微生物学研究的热点和发展方向,但当前的大多文献计量分析以Web of Science、知网等收录的期刊论文为主,忽略了研究生论文数据库的重要作用。【目的】通过分析我国研究生学位论文的研究选题,为探究我国微生物学相关方向的研究生学位论文的选题热点及变化趋势提供数据支持。【方法】利用文献计量学方法,对1999-2018年收录于中国博硕士学位论文全文数据库的237 562篇以微生物为研究主题的论文进行分析。【结果】发现1999-2018年我国微生物学相关的研究生论文总体呈现增长趋势,学位论文发文量排名前三的科研机构是浙江大学、中国科学院大学和南京农业大学。通过关键词网络分析发现,近10年我国微生物学相关研究生论文的研究领域呈现多样化,关键词网络更加密集,研究主要集中于环境、人类医学和动物医学等领域,与国际热点领域基本一致,但基础微生物研究相对不足。近年来备受关注的一些新兴领域如宏基因组、蛋白质组、工程与药物等在研究生论文选题中仍需加强。【结论】文献分析结果为研究生及其导师选题、推动我国微生...     

Microbiology in the post-genomic era

Genomics has revolutionized every aspect of microbiology. Now, 13 years after the first bacterial genome was sequenced, it is important to pause and consider what has changed in microbiology research as a consequence of genomics. In this article, we review the evolving field of bacterial typing and the genomic technologies that enable comparative analysis of multiple genomes and the metagenomes of complex microbial environments, and address the implications of the genomic era for the future of microbiology.     

微生物学融合式网络课程建设方法探析

微生物学面授导学与网络课程的相互融合可有效推进微生物学教学改革、提升教学质量。从网络课程建设中“教学目标”、“教学内容”、“教学情境”、“教学效果”4个主要教学环节入手,提出将微生物学传统教学与网络教学相融合,构建面授导学与网络信息化有机整合的教学模式。通过增加教学过程中的兴趣性、自主性和创新性,实现教学质量与教学效果的有效提升。     

微生物学课堂教学培养大学生创新能力的尝试

介绍如何通过微生物学课堂教学培养大学生创新能力的一些尝试:结合自身科研实例授课;注意介绍学科前沿动态;重视原理的发现证明过程;开展研讨性课堂教学讨论;引导学生课外研究性阅读;组织工厂参观学习。     

A brief historical and evolutionary perspective on the origin of cellular microbiology research

Integrated with both a historical perspective and an evolutionary angle, this opinion article presents a brief and personal view of the emergence of cellular microbiology research. From the very first observations of phagocytosis by Goeze in 1777 to the exhaustive analysis of the cellular defence mechanisms performed in modern laboratories, the studies by cell biologists and microbiologists have converged into an integrative research field distinct from, but fully coupled to immunity: cellular microbiology. In addition, this brief article is thought as a humble patchwork of the motivations that have guided the research in my group over a quarter century.     

“微生物学”全英文课程的建设改革与思考

“微生物学”是高等院校生物类、生物工程类及相关专业的专业基础课程。目前我国高等院校的“微生物学”以中文授课为主,但随着“双一流”建设等教改政策的推进及学生求学多元化需求的增加,全英文“微生物学”课程建设已势在必行。华东理工大学自2016年即开始“微生物学”全英文授课,并在授课方式和课程内容方面进行了改革和创新。“微生物学”全英文课程开设后,学生的学习兴趣有了很大的提高,科研能力和实践能力有了长足的进步,在专业英语的听、说、读、写能力方面也领先于同年级其他同学,为“双一流”建设背景下国家级一流本科专业创新性人才培养提供了重要支撑。     

华中农业大学《微生物学》系列教材的特点及发展

优秀教材是高水平课程教学的前提与基础.在此之前针对我国农业微生物学系列教材建设,国内外尚未有学者进行系统的总结和研究.本文对华中农业大学出版的《微生物学》系列教材的建设和发展状况进行了调查研究和分析比较,发掘和提炼老一辈微生物学家的教材建设思想,汲取其教学思想和教学改革的精华,以期为高等院校的农业微生物学教育和科研提供...     

培育基础医学微生物学专业 研究生人文素养和科学素养方式

微生物学是基础医学和生物学的重要基础学科,微生物学专业培养的研究生是微生物领域科学研究和教学的高级后备人才,随着基础医学的发展,对微生物学专业研究人员的人文素养和科学素养要求越来越高,本专业研究生全面发展培育方式的改革,已成为高等医学教育改革的重要课题。本研究针对基础医学微生物专业研究生培养的现状,根据基础医学微生物学专业研究生的特点,着重探讨其人文素养和科学素养培育方式的改革,为培养具有优良的科研能力、科学素养、健全人格的人才提供一定的思路。     

基于专业人才能力提升的食品微生物检验学CDIO教学模式创新

为提升食品微生物检验学专业人才能力,培养行业发展需要的有竞争力的人才,以构思-设计-实施-操作(Conceive-Design-Implement-Operate,CDIO)教育理念为核心,对食品微生物检验学课程进行教学模式创新研究。结合行业实际需求以及高等教育人才培养目标,对食品微生物检验学教学理念思路转变、教学模式方法革新、实践教学引进科研项目、教学基地融入实践过程等方面进行了教学改革,并对考核评估体系进行了模式创新。实践证明,食品微生物检验学教学改革和考核模式创新收到了良好的教育效果,培养了符合社会发展的专业知识水平与综合能力素质双优的专业人才。以期为同行提供有效的专业改革理念,给同类高等教育工程技术人才培养和专业教学改革提供借鉴。     

预测微生物学的研究进展

简要介绍了预测微生物学模型的2个类型(品质预测模型和安全评估模型),特定腐败菌在微生物预测中的特殊作用,可追溯技术、温度综合函数和生物指示器等新技术在微生物预测中的应用,以及国外的预测模型库和国内的研究现状,展望了预测微生物学未来的发展趋势。     

厌氧氨氧化生物脱氮技术的研究进展

厌氧氨氧化是指在厌氧条件下,厌氧氨氧化混合菌直接以NH4 为电子供体,以NO3-或NO2-为电子受体,将NH4^ 、NO3-或NO2-转变成N2的过程。厌氧氨氧化作为一种新型的污水处理工艺具有较高的理论意义和良好的应用前景。本文主要阐述了厌氧氨氧化生物脱氮技术原理、厌氧氨氧化的可能途径、方法及其应用现状,并且讨论了厌氧氨氧化反应的微生物学机理和厌氧氨氧化工艺的开发,提出了今后研究的主要方向。     

基于移动客户端云班课的微生物学教学改革与实践

为了进一步提升教学效果,让授课教师将知识以更高效的方式传递给学生,本教学研究以移动客户端为载体,构建了微生物学云班课辅助课堂教学,摆脱了授课时间和空间约束,可以使学生更快速便捷地掌握微生物学最新研究进展。该方法不仅提高了教学内容的深度和广度,还极大地促进了学生自主学习能力的培养。     

食品工程类专业微生物学教学改革与实践

《微生物学》是食品科学类专业重要的专业基础课,课程组结合学校粮油食品学科传统特色专业,对食品微生物学教学内容、多媒体课件运用及实验教学等进行了改革。结果显示,改革后的课程教学组织方式有利于加强学生对理论知识的理解和应用,有利于提高学生的动手能力、创新能力和科学思维能力。     

国家自然科学基金微生物学学科2000-2006年度资助面上项目概况及分析

对国家自然科学基金2000～2006年度资助微生物学各分支学科面上项目的数量和经费情况进行了总结分析,试图详细地展示我国微生物学各分支学科基础研究概况,指明了在未来一段时间里国家自然科学基金资助微生物学学科的重点研究方向。     

Oligonucleotide microarrays in microbial diagnostics

Oligonucleotide microarrays offer a fast, high-throughput alternative for the parallel detection of microbes from virtually any sample. The application potential spreads across most sectors of life sciences, including environmental microbiology and microbial ecology; human, veterinary, food and plant diagnostics; water quality control; industrial microbiology, and so on. The past two years have witnessed a rapid increase of research in this field. Many alternative techniques were developed and validated as seen in 'proof-of-concept' articles. Publications reporting on the application of oligonucleotide microarray technology for microbial diagnostics in microbiology driven projects have just started to appear. Current and future technical and bioinformatics developments will inevitably improve the potential of this technology further.     

2011-2015年度国家自然科学基金微生物学学科项目申请与资助情况分析

本文总结了国家自然科学基金委员会生命科学部微生物学学科2011-2015年度各类项目的申请和资助概况,统计分析了五年来项目依托单位和主要研究方向的变化情况,并从鼓励学科交叉、优化资助格局和加强人才培养的角度对微生物学科资助方向进行展望,以期为微生物学领域的科研工作者提供参考。