黄体(yellow~0)是果蝇小体重的一个标记

标记辅助选择(marker-assisted selection,MAS)是现代育种的一种重要手段,但是在研究中经常发现与数量性状基因座位(quantitative trait loci,QTL)连锁的标记效应不稳定,这使得MAS在动物育种中成功应用的报道很少,人们甚至怀疑MAS在实际应用中的效果.本研究首次利用模式生物果蝇来研究是否能够找到应用到MAS中的有效标记.采用F2设计将带有黄体(y0)标记(X染色体上yellow基因的一个隐性突变)的品系分别与3个不带此标记的品系进行正反杂交,结果发现F2代中,y0标记与小体重显著相关(P<0.001),而且这种相关不随遗传背景的改变而消失.标记效应在雌雄中分别达到了0.95σP(表型标准差)和0.68σP.以y0为标记,通过20代标记辅助导入(marker-assisted introgression,MAI),将y0所处的DNA区段导入到野生型品系中,结果使野生型雌雄体重分别降低了13%和7%(P<0.0001),从而成功建立了小体重果蝇品系,实验证明确实存在一个与y0紧密连锁的小体重QTL.利用y0标记和白眼(white)标记进行深度MAI,进一步将一个小于...     

镜鲤体重的QTL定位

本研究利用217个微卫星标记和336个SNPs标记对德国镜鲤F2代68个个体基因组DNA进行基因型检测.其中507个标记共组成62个连锁群,覆盖基因组总长度为2 805.85 cM,标记间平均距离为6.31 cM;利用软件MapQTL 4.0采用区间作图法对体重性状进行QTL定位分析.研究结果共检测到14个与体重性状有关的QTLs,分布于9个连锁群.其中BW-5-1有最大的LOD值,为4.46;BW-1-1的LOD值最小,为2.25.单个QTL平均解释表型变异介于14.10%~45.50%之间,其中贡献率大于20%的主效QTLs有9个.通过BLASTX与斑马鱼蛋白质序列数据库进行序列比对,找到了与斑马鱼酰基辅酶A脱氢酶蛋白、胰淀粉酶α2蛋白、Apoeb protein和甘油醛-3-磷酸脱氢酶蛋白同源的分子标记.本研究结果对分子标记辅助育种具有重要应用价值.     

加性基因效应与分子标记回归方程的关系

控制数量性状的基因作用历来是遗传学工作者所关注的重要课题．本文对以正交表形式表现的共显性动物分子标记资料,根据加性效应基因控制的数量性状遗传模型配合了动物分子标记回归方程通式．结果表明：对以正交表形式表现的加性效应基因共显性分子标记资料配合的分子标记回归方程,可对加性等位基因的相对作用差加以估计,并可作为育种的依据．     

标记辅助选择改良数量性状的研究进展

本系统地介绍了近年来有关标记辅助选择改良数量性状的研究进展,主要包括标记辅助回交、指数选择与最佳线性无偏预测的理论和应用研究概况。理论与计算机模拟表明标记辅助选择比常规表型选择更有效,但在实际育种中并不理想。同时本还就当前标记辅助选择存在的问题和前景进行了讨论。     

作物分子标记辅助选择的研究进展、影响因素及其发展策略

随着分子标记技术及其检测手段的发展,开发和应用成本的降低,分子标记辅助选择(MAS)在作物育种上的应用优势日益明显。本文综述了近年来MAS在基因聚合、基因转移和数量性状改良上的研究进展。总结了MAS的影响因素,包括标记与基因间的距离、目标性状的遗传率、群体大小、所用分子标记的数目、类型和相位等。并提出育种和定位同步进行、选择合适分子标记类型和数量、简化DNA提取方法、背景选择的逐步选择法、确定合适选择方案等MAS发展策略。     

水稻回交世代中两个抗纹枯病主效数量基因的鉴定与标记辅助选择

对水稻品种特青与Lemont杂交组合的F2 单株无性系群体,进行 2年有重复的抗水稻纹枯病QTLs定位,在特青的第 9号染色体和Lemont的第 11号染色体上分别定位到了 1个主效抗纹枯病QTL,各自命名为qSB 9和qSB 11。从该F2 定位群体中,根据位点双侧标记带型,选取 2个位点均为感病等位基因纯合的 2个单株作为双感亲本,均为抗病等位基因纯合的 1个单株作为双抗亲本,分别与轮回亲本特青和Lemont进行回交。标记辅助选择始于BC2F1 及以后的各回交世代,并于BC2F1 和BC4F1 世代进行了病原菌人工接种鉴定。鉴定结果表明,qSB 9和qSB 11确实存在于原定位区间,各等位基因也在回交过程中被成功选择。BC3F2 采用秧田期大群体标记检测,从中选取符合要求的单株,分别混合得到特青背景下的双感纯合系, Lemont背景下的双感、双抗纯合系,将这些纯合系连同轮回亲本同时种植于扬州大学农学院试验田和江苏里下河农科所试验田, 2次重复,随机区组设计,进行接种实验。结果表明: 1 )相同背景下的不同纯合系间在发病程度上存在极显著的差异,不同纯合系的病情严重程度依次为:Lemont双感系>特青双感系>Lemont>特青 >Lemont双抗系; 2 )2个位点上的抗性等位基因qSB 9和qSB 11单独存在时,分别可减轻病级 1 2级左右,同时存在时可减轻病级 2级左右;     

雄性不交换条件下F2群体区间标记——QTL定位的相关方法（英文）

提出了雄性不交换条件下F2群体区间标记定位QTL的相关方法,并且对其适用的条件进行了讨论,通过对分子区间标记进行赋值,计算在无交叉干涉条件下分子标记与表型值的简单相关系数,并在此基础上进行连锁检验,在特定条件下可以估计数量性状座位（QTL）与分子标记座位间的连锁值。     

标记辅助导入中不同前景和背景选择方法的比较

标记辅助导入是分子遗传信息应用于动物育种的一个重要方面,其目的是在标记信息的辅助下将一个品种（供体）中的一个或多个优良基因导入另一个品种（受体）,同时还要尽可能地保持受体群体原有的遗传背景。标记辅助导入的过程包括3个阶段,第一阶段是杂交,即供体与受体杂交产生F1代个体,第二阶段是回交,即F1个体以及后续各个世代的后代个体重复地与受体回交,以使受体的遗传背景得到恢复,第三阶段是横交,即重复回交后得到的个体彼此问交配,以便获得供体基因的纯合个体,使该基因在群体中固定。在回交和横交阶段,都要对参与交配的个体进行选择。在选择中,要分别进行前景选择和背景选择,前景选择是对供体基因的选择,选择携带有供体基因个体参加配种,从而使该基因在回交过程中不会丢失,并在横交过程中能尽快固定,背景选择是对受体遗传背景的选择,选择那些含有受体基因组比例较高的个体参加配种,从而加快恢复受体遗传背景的速度。本研究通过计算机模拟对不同的前景选择方法和不同的背景选择方法进行了比较。前景选择方法包括对受体基因的直接选择（假设该基冈可以直接测定）、利用单个连锁标记的间接选择和利用两侧标记的间接选择3种,背景选择方法包括随机选择、基因组相似性选择、指数选择和标记辅助BLUP（MBLUP）选择4种。研究结果表明,对于前景选择来说,对供体基因的直接选择能保证该基因在回交的各个世代中保持一个稳定的频率（0．25）并在横交阶段迅速固定（2个世代）,用两侧标记的间接选择也能得到类似的结果,但如果仅利用单个连锁标记进行选择,则会导致供体基因的频率在回交阶段中有所下降,并在横交阶段不能被固定。对于背景选择来说,如果最终的目的是要完全恢复受体的遗传背景,基因组相似性选择或标记指数选择是最好的选择方法,它们可使受体的遗传背景在回交3个世代后就恢复到98％以上,而随机选择或MBLUP选择需要至少5个世代的回交才能达到这个水平。但如果最终的目的只是要恢复受体的某些优良性状,则MBLUP选择是值得推荐的方法,它可使影响这些性状的受体基因频率在回交3个世代后就达到99％以上,而且还能在整个基因导入过程中给这些性状带来最大的遗传进展。虽然用标记指数选择也有相似的结果,但与之相比,MBLUP的成本要低得多,更具有实际可行性。     

RIL群体区间分子标记-QTL定位的相关方法

分析了RIL群体中以分子区间标记进行QTL定位的相关方法．通过对分子标记赋值可获得与数量性状表型值的简单相关系数．然后,在此基础上进行连锁检验．此外．在特定情况下利用R值,可以估计数量性状座位(QTL)和分子标记位点(ML)间的重组值．     

标记辅助导入的原理与应用

标记辅助导入是分子遗传信息应用于动物育种的一个重要方面, 其目的是在标记信息的辅助下将一个品种(供体)中的一个或多个优良基因导入另一个品种(受体), 同时还要尽可能地保持受体群体原有的遗传背景。在标记辅助导入过程中, 标记信息既可用于辅助前景选择, 即对目标基因携带者的选择, 以保证目标基因的正确导入, 也可用于辅助背景选择, 即对受体基因组的选择, 以加快受体遗传背景的恢复。本文介绍了标记辅助导入的原理和基本方法, 综述了目前已提出的不同前景选择和背景选择方法以及消除遗传累赘(与目标基因连锁的不利基因)的方法, 同时列举了标记辅助导入在动物上的一些成功应用。     

标记辅助选择改良数量性状的研究进展

本文系统地介绍了近年来有关标记辅助选择改良数量性状的研究进展,主要包括标记辅助回交、指数选择与最佳线性无偏预测的理论和应用研究概况.理论与计算机模拟表明标记辅助选择比常规表型选择更有效,但在实际育种中并不理想.同时本文还就当前标记辅助选择存在的问题和前景进行了讨论。 Abstract:Recent advances on marker-assisted selection (MAS) in the improvement of quantitative traits are reviewed.These include theoretical researches and applications of marker-assisted backcrossing,index selection,and best linear unbiased prediction (BLUP) in animal and plant breeding.Theoretical and simulation studies show that marker-assisted selection can substantially increase the efficiency of selection in comparison to phenotypic selection,but is not yet a proven technology.Problems and prospects in MAS are also discussed.     

与水稻籼粳分化有关的穗颈维管束性状基因的分子标记定位

水稻穗颈维管束数及其与穗一次枝梗数之比（V／R）是与籼粳分化有关的重要性状,采用籼粳交（圭630／02428）杂种F1花药培养获得的DH群体,对水稻穗颈维管束数,穗一次枝梗数及V／R比进行了QTL分析,检测到3个控制穗颈维管束数的QTL;其中,效应最大的qVB-8的贡献率为31．1％,加性效应值为1．96％,增效等位基因来自灿稻亲本圭630,2个控制一次枝梗数的QTL效应较小,但分别与控制穗颈维管束数的2个QTL同位,检测到影响V／R比的3个QTL,其中,效应最大的qV/R-1的贡献率为25．3％,被定位于第1染色体上,与落粒性基因sh-2紧密连锁（亦或为一因多效）。此外,还检测到4对和2对分别控制穗颈维管束数和V／R比的互作QTL。结果分析表明,水稻穗颈维管束数与穗一次枝梗数受不同的多基因系统控制,但这2个多基因系统的某些位点在基因组中具有同位性;在第1染色体上,控制V／R比,且效应最大的qV/R-1所在的染色体区段在水稻籼粳分化过程中可能具有重要作用。     

BC群体不同连锁模式分子区间标记QTL作图相关方法的精确度分析

该文分析了BC群体不同连锁模式分子区间标记QTL作图相关方法的精确度,提出了相应参数的适用范匿,连锁顺序的检测方法,分析步骤,为QTL作图提供了理论基础。     

雄性不交换条件下F2群体高密度分子区间标记QTL的精确作图

提出雄性不交换条件下F2群体间标记定位QTL的相关方法，研究高密度分子标记存在强烈交叉干涉时，QTL的精确定位方法。     

分子标记辅助聚合两个棉纤维高强主效QTLs的选择效果

利用长江流域推广品种泗棉3号和优异纤维种质系7235为育种亲本,配置了系统育种和修饰回交聚合育种两套群体。基于来自7235的2个高强纤维主效QTL的分子标记,在上述育种群体中进行了分子标记辅助选择效率研究。高强纤维主效QTLfs1是利用(7235×TM1)F2分离群体,通过集团混合分离法检测到的,它可解释纤维强度表型变异的30%以上。高强纤维主效QTLfs2最初是利用(HS42710×TM1)F2分离群体检测到的,它可解释纤维强度表型变异的12.5%以上。进一步的研究表明,该QTL也位于7235优质系中,但与QTLfs1非等位。2套育种分离群体的2个高强纤维主效QTL的分子标记辅助选择效果表明:QTLfs1在不同环境条件下均稳定表达,它对不同遗传背景的育种群体均有显著的选择效果。尽管QTLfs2的选择效果低于QTLfs1,它在高世代育种群体中也表现较高的选择效率。利用分子标记辅助选择具有一定遗传距离的QTLfs1区间,其纤维强度的选择效率将大大增强。通过分子标记对位于不同连锁群上的2个QTL聚合选择,其中选单株的纤维强度显著提高。研究结果为利用分子标记辅助聚合优质QTL提供了成功实例。     

三黄果蝇(Drosophila trilutea)近黄果蝇（D.paraiautea）的有丝分裂中期染色体

这两种果蝇隶属果蝇科Drosophilidae果蝇属Drosophila （Sophophora）黑腹果蝇D.melanogaster种组（species group）中的D.takahashii亚组（subgroup）。Bock和Wheeler (1972）在报道新种的文献中，曾记述其有丝分裂中期染色体的形态结构为2对中着丝粒（V形），1对棒状（R）。其中X染色体为棒状，Y染色体稍短。据此，其二倍体染色体数目推测为2n=6。我们观察的结果则与之显然不同。     

水稻抗稻瘟病基因Pi-d（t）^1、Pi-b、Pi-tα^2的聚合及分子标记选择

冈46B(G46B)是水稻生产应用中的一个农艺性状十分优良的保持系,其主要的缺陷是稻瘟病抗性较弱,通过对地谷,BL-1,Pi-4号等三个分别含抗病基因Pi-d(t)^1、Pi-b、Pi-tα^2的稻瘟病抗性材料与G46B聚合杂交,并利用抗病基因连锁的分子标记对杂交后代进行辅助选择,在聚合杂交的F2代及B1C1代群体中共获得了15株含Pi-d(t)^1、Pi-b、Pi-tα^2等三个抗稻瘟病基因的材料,其可能的基因型分别为：三基因杂合体Pi-d(t)^1pi-d(t)^1,Pi-bpi-b／Pi-tα^2 pi-tα^2 4株,双基因杂合体10株,其中Pi-d(t)^1Pi-d(t)^1／Pi-bpi-b／Pi-tα^2pi-tα^2 6株,Pi-d(t)^1pi-d(t)^1／Pi-bpi-b／Pi-tα^2Pi-tα^2 3株,Pi-d(t)^1pi-d(t)^1,Pi-bPi-6,Pi-tα^2 pi-tα^2 1株,双基因纯合体Pi-d(t)^1Pi-d(t)^1/Pi-bpi-b/Pi-tα^2Pi-tα^2仅1株,这一研究结果为进一步改良G46B的稻瘟病抗性奠定了基础,同时这一研究结果表明利用分子标记可快速、有效地实现多个抗病基因的聚合,大大提高水稻抗病育种的效率。     

具交叉干涉的三点测交区间标记定位（QTL）的相关方法

本文提出在有交叉干涉条件下,在测交群体中对区间标记座位赋值后求其与待定位的数量性状表型值间的简单相关系数R,以此进行连锁测验,并且在一定条件下用R值求出该数量性状座位（QTL）与各标记座位（ML）间的重组值。     

Genetic analysis of tolerance to photo-oxidative stress induced by high light in winter wheat （Triticum aestivum L.）

High light induced photooxidation (HLIP) usually leads to leaf premature senescence and causes great yield loss in winter wheat. In order to explore the genetic control of wheat tolerance to HLIP stress, a quantitative trait loci (QTL) analysis was conducted on a set of doubled haploid population, derived from two winter wheat cultivars. Actual values of chlorophyll content (Chl), minimum fluorescence level (Fo), maximum fluorescence level (Fm), and the maximum quantum efficiency of photosystem Ⅱ (Fv/Fm) under both HLIP and non-stress conditions as well as the ratios of HLIP to non-stress were evaluated. HLIP considerably reduced Chl, Fm, and Fv/Fm, but increased Fo, compared with that under non-stress condition. A total of 27, 16, and 28 QTLs were associated with the investigated traits under HLIP and non-stress and the ratios of HLIP to non-stress, respectively. Most of the QTLs for the ratios of HLIP to non-stress collocated or nearly linked with those detected under HLIP condition. HLIP-induced QTLs were mapped on 15 chromosomes, involving in 1A, 1B, 1D,2A, 2B, 2D, 3A, 3B, 4A, 4D, 5B, 6A, 6B, 7A, and 7D while those expressed under non-stress condition involved in nine chromosomes, including 1B, 1D, 2A, 2B, 3B, 4A, 5A, 5B, and 7A. The expression patterns of QTLs under HLIP condition were different from that under non-stress condition except for six loci on five chromosomes. The phenotypic variance explained by individual QTL ranged from 5.0% to 19.7% under HLIP, 8.3% to 20.8% under non-stress, and 4.9% to 20.2% for the ratios of HLIP to non-stress, respectively. Some markers, for example,Xgwm192 and WMC331 on 4D regulating Chl, Fo, Fm, and Fv/Fm under HLIP condition, might be used in marker assistant selection.     

青虾生长性状相关的微卫星标记筛选

青虾,学名日本沼虾(Macrobrachium nipponense),又称河虾.属于甲客纲(Crustacea),十足目(Decapoda),长臂虾科(Palaemonidae),沼虾属(Macrobrachium)[1].具有适应性强、分布广、食性杂、生长快、养殖经济效益高等特点,是我国淡水虾类的一个重要养殖品种[2].也是主要淡水名特优养殖品种之一.目前,我国养殖青虾出现了个体小型化、性早熟以及生长速率慢等种质退化现象,极大地影响了日本沼虾养殖业的效益,迫切需要对其进行遗传改良[3,4].