BIOMETRIC METHODOLOGY

Matching in Studies of Classification Accuracy: Implications for Analysis, Efficiency, and Assessment of Incremental Value
Dans les études cas-témoins qui visent àévaluer une classification effectuée à partir d'un marqueur, il est courant d'apparier les témoins aux cas sur des facteurs liés à la maladie et au marqueur. Dans ce type d'études, par opposition aux études étiologiques, l'appariement n'a pas fait l'objet de travaux rigoureux. Nous étudions les implications de l'appariement sur le choix d'un modèle d'analyse statistique, sur l'efficacité et sur l'évaluation de l'apport supplémentaire du marqueur par rapport aux variables d'appariement. Nous observons que l'ajustement sur les variables d'appariement est essentiel car les mesures non ajustées des qualités du marqueur peuvent être biaisées. Dans de nombreuses situations, l'appariement est la plus efficace des méthodes d'échantillonnage en fonction des covariables et nous donnons une expression du rapport optimal nombre de cas/nombre de témoins. En revanche, nous montrons également que l'appariement complique sérieusement l'évaluation de l'apport supplémentaire du marqueur. Nous recommandons d'envisager l'intérêt d'un appariement à la lumière de ces résultats.     

Economies of affect

Cet article développe le concept des «économies de l'affect>> pour attirer l'attention des anthropologues sur le rôle de l'affect dans la facilitation des transformations économiques. Il s'appuie sur les résultats de deux projets de terrain ethnographiques, l'un au Mexique et l'autre en Indonésie, pour montrer comment l'affect a été mobilisé pour créer des sujets pouvant être appréhendés selon les normes néolibérales. Les auteurs montrent comment l'étreinte, les pleurs et les discours sur l'amour et le chagrin ont été associés à des transformations impliquant la cessation de prestations de l'État et l'application des lois du marché. En faisant de l'affect et de son articulation avec le changement économique un objet d'étude anthropologique, l'article affirme l'utilité d'une notion d'affect se démarquant d'autres approches qui mettent l'accent sur l'émotion. Les auteurs affirment que l'affect est utile parce qu'il est, par nature, réflexif et intersubjectif. L'affect renvoie aux relations pratiquées entre les individus, à la différence de l'émotion, toujours marquée par le spectre d'un individualisme psychologique.     

Estimating larger carnivore numbers from track counts and measurements

Résumé Avoir conscience de l'abondance des grands carnivores est très important pour la gestion de leur conservation. Cependant, l'évaluation directe des nombres de carnivores est souvent difficile, nècessitant beaucoup d'argent et de temps, ce qui importe que l'échantillonnage indirect est une alternative fiable et valable. Les techniques de recensement à distance se sont montrèes économiques, renouvelables, et objectives. Nous avons donc estimé le nombre de grands carnivores de six espèces dans une superficie assez petite au nord de l'Afrique du Sud, en comparant trois méthodes d'échantillonnage basèes sur des décomptes des traces et mesures: (i) une approche qualitative, où les individus furent identifiés de manière subjective en étudiant les différences dans les mesures des traces; (ii) une approche quantitative qui se sert de la forte corrélation linéaire de la densité des traces à la densité des carnivores démontrée dans d'autres études; et (iii) une approche quantitative qui impliquent des analyses répétées de la variance et des post-enquêtes sur les mesures des traces afin de disposer des données statistiques pour identifier les différences entre des services des traces. Les trois méthodes fournirent des résultats comparables qui semblent raisonnables et qui peuvent être une bonne indication du vrai nombre de grands carnivores dans la zone de l'étude. Les rèsultats étayent la fiabilité des estimations indirectes de l'abondance de grands carnivores basés sur les données des traces, et sont prometteurs pour des futures recherches et pour la conservation de ces animaux.     

CONSULTANT'S FORUM

The DNA Database Search Controversy Revisited: Bridging the Bayesian--Frequentist Gap
Deux quantités différentes ont été proposées pour mesurer l'évidence dans les cas où un suspect est identifiéà partir d'une base de données de profils ADN. Le rapport de vraisemblance, habituellement développé dans le cadre bayésien, est préféré par de nombreux experts du domaine. La règle dite np a été suggérée sur des arguments fréquentistes par l'American National Research council (NRC) et Stockmarr (1999). Ces deux quantités différent considérablement et sont à la source d'une controverse sérieuse sur l'utilisation des bases d'ADN. Bien que plusieurs auteurs aient critiqué ces différentes approches, une explication claire sur le pourquoi de ces différences observées n'a jamais été proposée. Dans cet article, nous montrons que le degré de signification P dans un contexte fréquentiste est approximativement égal au résultat de la règle np . Nous soutenons cependant qu'une procédure plus raisonnable consiste à utiliser une stratégie de test conditionnel qui génère un P directement lié aux probabilités a posteriori ainsi qu'un rapport de vraisemblance. Cette façon d'aborder le problème construit un pont entre les approches bayésienne et fréquentiste et indique également que la règle np ne doit pas être utilisée pour quantifier l'évidence.     

REGULAR ARTICLES

Marginal Analysis of Correlated Failure Time Data with Informative Cluster Sizes
Nous nous intéressons à la modélisation de données de survie corrélées quand la connaissance de la taille des strates peut fournir une information sur le critère de jugement. Celle-ci est basée sur une approche de ré-échantillonnage au sein des strates et sur une méthode de fonction de score pondérée. Nous déterminons les propriétés asymptotiques pour les estimateurs de ré-échantillonnage au sein des strates dans le cadre d'un modèle à risques proportionnel de Cox. Nous établissons la convergence et la normalité asymptotique des estimateurs des coefficients de régression et la propriété de convergence faible des estimateurs de la fonction de base du risque cumulé. La méthode de fonction du score pondérée consiste à prendre l'inverse de la taille des strates comme poids dans la fonction de score. Nous procédons à des études de simulations pour déterminer et comparer le comportement des estimateurs pour des échantillons finis et appliquons les méthodes proposées à une étude dentaire.     

REGULAR ARTICLES

Marginalized Models for Moderate to Long Series of Longitudinal Binary Response Data
Les modèles marginalisés (Heagerty, 1999) permettent l'inférence basée sur la vraisemblance lorsqu'on s'intéresse à des modèles marginaux de régression pour des données longitudinales binaires. Deux modèles de ce type sont le modèle de transition marginalisée, et le modèle à variable latente marginalisée. Le premier reflète la dépendance sérielle intra-sujet au sein des mesures répétées avec des termes de transition dans le modèle, tandis que le deuxième suppose l'échangeabilité ou la non-décroissance de la dépendance de la réponse avec des intercepts aléatoires. Dans cet article, nous étendons la classe des modèles marginalisés en proposant un modèle simple unifié décrivant à la fois la dépendance sérielle et la dépendance au long terme. Ce modèle est particulièrement utile dans des analyses longitudinales avec un nombre de mesures répétées par sujet modéré ou large, où aussi bien les formes sérielles et échangeables de la corrélation de la réponse peuvent être identifiées. Nous décrivons des approches bayésiennes et au maximum de vraisemblance pour l'estimation des paramètres et pour l'inférence, et nous étudions les caractéristiques opérationnelles pour de grands échantillons, sous deux types de mauvaise spécification du modèle de dépendance. On analyse les données de l'étude longitudinale de schizophrénie de Madras (Thara, 1994).     

Hunters, ritual, and freedom: dozo sacrifice as a technology of the self in the Benkadi movement of Côte d'Ivoire

L'article affirme que dans les années 1990, les chasseurs dozo de Côte-d'Ivoire ont utilisé le sacrifice pour se constituer en police officieuse au sein d'un groupement de sécurité qu'ils ont appelé Benkadi . Les chercheurs ont noté une évolution similaire par laquelle d'autres chasseurs d'Afrique de l'Ouest devenaient soldats, garde-chasse ou agents de développement, dans le contexte des changements politiques, économiques et écologiques. Bien que ces changements aient créé les conditions dans lesquelles les dozo s se sont chargés de fonctions de sûreté nationale, ces conditions ne suffisent pas à expliquer comment ils en sont venus à constituer une force de l'ordre. L'auteur explore le sacrifice des dozos comme une «technologie de soi>>, selon les termes de Foucault, pour avancer qu'ils ont librement endossé des rôles de sûreté impliquant des responsabilités éthiques proches de celles implicitement contenues dans leurs chasses et leurs pratiques occultes. Il invoque Frankl et Laidlaw pour expliquer les aspects émotionnels et pratiques de cet auto-façonnage. L'analyse culturelle des rituels des dozos éclaircit la manière dont ils ont agi pour donner forme aux effets de l'économie et de l'écologie politiques sur leurs pratiques.     

DISCUSSION PAPER

R. L. Prentice, M. Pettinger, and G. L. Anderson          899
Statistical Issues Arising in the Women's Health Initiative
Nous proposons un bref panorama du plan de l'essai clinique et de l'étude observationnelle de la WHI, ainsi qu'un résumé des résultats obtenus à partir de la partie de l'essai clinique dévolue à la thérapeutique hormonale post-ménopause. Depuis son démarrage en 1992, la WHI a été confrontée à plusieurs questions de nature statistique pour lesquelles de plus amples développements méthodologiques étaient nécessaires. Parmi ceux-ci, la modélisation des erreurs de mesure, et des méthodes d'analyse pour l'évaluation de la diététique et de l'activité physique; des méthodes de surveillance d'essai clinique lorsque les traitements peuvent concerner plusieurs champs cliniques aussi bien en bénéfice qu'en réaction adverse; le plan d'étude et les procédures d'analyse pour des données génomiques et protéiques de dimension élevée; et aussi des procédures d'analyse de données de durée lorsque les rapports de risque dépendent du temps. Ce dernier point apparaît important pour comprendre les différences entre les résultats de l'essai clinique et ceux de l'étude observationnelle en ce qui concerne le traitement hormonal postménopause et la pathologie cardio-vasculaire.     

Etude Ultrastructurale de la Sporulation de Paramarteilia orchestiae gen. n., sp. n., Parasite de l'Amphipode Orchestia gammarellus (Pallas)

RESUME. L'individualisation de 2 spores bicellulaires à partir d'un měme pansporoblaste caractérise la sporulation du parasite de l'Amphipode Orchestia gammarellus (Pallas) précédemment décrit sous le nom de Marteilia sp. Cette sporulation le distingue des espèces du měme genre parasite d'Hutres qui sont toutes caractérisées par la production de spores tricellulaires. Les conditions semblables dans lesquelles les pansporoblastes paraissent se differencier à partir d'une cellule souche dans laquelle ils poursuivent leur évolution vers la sporogenèse ainsi que divers caractères cytologiques communs, nous incitent à maintenir tous ces parasites dans une měme famille mais à placer celui de l'Amphipode dans un genre différent. Nous proposons de le nommer Paramarteilia orchestiae gen. n., sp. n.
Ces parasites ne peuvent ětre maintenus dans les Protozoaires en raison de leur évolution vers la pluricellularité et de l'individualisation de ces éléments somatiques que représentent la cellule souche primaire, les pansporoblastes et cellules sporales (à l'exception des sporoplasmes). Il semble logique de les inclure dans l'embranchement des Myxozoaires créé par Grassé pour les Myxosporidies et Actinomyxidies qui différencient également des spores pluricellulaires et des éléments somatiques. Les centrioles à 9 singlets de P. orchestiae ainsi que les cellules primaires uninucléées, quel que soit le nombre de pansporoblastes qu'elles contiennent, peuvent ětre considérés comme des caractères résiduels d'Unicellulaires.     

Hot air and the Colonialist 'Other': the 'German-English-Dutch Airship Expedition' to New Guinea

Il est largement admis en anthropologie que les images de «l'Autre>> exotique font partie de la «technologie intellectuelle>> grâce à laquelle le colonialisme a étendu et maintenu son contrôle sur les frontières impériales. Faute d'analyse, toutefois, un autre type d'Autre se languit encore en anthropologie : le Colon à demeure. Dans les narrations analytiques standard, cette figure et le milieu dans lequel elle agit sont encore dépeints en termes radicalement uniformisés. En réalité, le colonialiste maison était un agent complexe, obligé de naviguer et de négocier entre plusieurs conjonctures culturelles et sociales dans le cadre du développement de projets coloniaux appelés àêtre exportés au loin. Dans le présent article, les auteurs cherchent à mettre en lumière l'Autre colonisateur et sa place dans le colonialisme en s'intéressant à la destinée de l' oberleutnant Paul Graztz, «héros>> colonial allemand de la fin du XIX^e siècle, et à sa tentative (vouée à l'échec) d'expédition topographique en Nouvelle-Guinée dans un aéronef «à air chaud>>.     

READER REACTION

A Note on Testing Separability in Spatial-Temporal Marked Point Processes
Dans l'analyse du risqué environnemental, il est usuel de supposer l'indépendance stochastique (ou séparabilité) entre les traces associées aux événements aléatoires d'un processus spatio-temporel. Schoenberg (2004, Biometrics 60, 471–481) a proposé plusieurs tests statistiques de cette hypothèse, et a utilisé des données simulées pour en évaluer la performance. Il a obtenu un test de type Cramer-Von Mises, puissant pour détecter des écarts graduels à la séparabilité, mais non uniformément puissant sur une classe large de modèles alternatifs. Nous présentons une approche semi-paramétrique pour modéliser les hypothèses alternatives de séparabilité, et obtenons une statistique de score test. Nous montrons une relation entre ce score test et certaines des statistiques proposées par Schoenberg. Plus précisément, toutes sont des versions différentes des statistiques pondérées de Cramer-Von Mises. Ceci éclaire les causes des ressemblances et des différences entre les performances des tests. Nous insistons également sur certaines difficultés au contrôle du risque d'erreur de première espèce dans le test des résidus de Schoenberg.     

The Virgin of Guadalupe: a nexus of affect

Par le biais d'une analyse des célébrations actuelles de la Vierge de Guadalupe à Rome, l'auteure discute de la manière dont la Vierge fait écho aux inquiétudes pour «la patrie et la foi>> ( patria y fe ) ainsi que sur la mobilisation de la foi catholique en réaction aux sécularisme. Les célébrations performatives de la Vierge révèlent une unité fantasmatique de la nation et de la famille par le biais de l'affect et de tensions raciales subtiles au sein, d'une part, de la migration transnationale religieuse liée à la politique diocésaine et missionnaire, et d'autre part à la diffusion à l'étranger de narrations culturelles et indigènes d'une identité mexicaine. En s'intéressant aux traces de la guerre des Cristeros au Mexique (1926-1929), remises en récit sous un angle affectif dans la Rome du XXI^e siècle, l'auteure affirme que la célébration de la Vierge de Guadalupe ne manifeste pas une religiosité liée au retour des dépossédés et à un symbole de libération (comme cela semble faire être le cas à la frontière entre le Mexique et les États-Unis) mais elle devient plutôt, dans ce contexte, un point de fusion des affects qui signale la montée en puissance d'une Église catholique transnationale empreinte d'orthodoxie ultramontaine.     

ACETYLCHOLINESTERASE DU MUSCLE, DE LA MOELLE EPINIERE ET DU CERVEAU DE GYMNOTE

Résumé— Dans le but d'étudier la localisation cytologique de I'AChE dans divers tissus de Gymnote, nous avons préparé un antisérum anti-AChE en utilisant une préparation commerciale partiellement purifiée, contenant une forme globulaire de l'AChE G _p. Cet antisérum réagit dans le test de double diffusion avec l'enzyme purifié G _p, mais également avec la forme globulaire spontanée G _b, ainsi qu'avec les trois espèces 'natives' asymétriques A , C et D . Nous avons mis en évidence l'existence de ces quatres formes G _b, A , C et D dans des extraits de cerveau, de moelle épinière et de muscle de Gymnote. La forme globulaire G _b est particulièrement abondante dans la moelle épinière et à un moindre degré, dans le cerveau. La distribution des espèes est identique dans le muscle et l'organe électrique. Grâce à notre antisérum, nous avom Iocalisé par immunofluorescence indirecte l'AChE dans les terminaisons nerveuses sur le muscle, dans le cytoplasme de certains neurones situés dans le centre moteur de la décharge (moelle épinière) et au voisinage du noyau central de la décharge (cerveau).     

Caractéristiques Ultrastructurales du Cortex et des Membranelles du CiliéEspejoia mucicola (Oligohymenophora, Hymenostomata, Tetrahymenina)

RESUME. L' étude détaillée du cortex et des organelles buccaux adoraux d' Espejoia montre que ce Cilié possède une organisation ultrastructurale comparable à celle des Tétrahyméniens. Tout en restant conforme au plan général d'organisation de ces derniers, des variations spécifiques décelées tant au niveau du cortex d'une part, que des membranelles, d'autre part, font ressortir des affinités trés marquées pour le genre Glaucoma et autres Ciliés voisins. En conséquence, en nous appuyant en outre sur les données récentes de la morphogenèse, nous confirmons la position d' E. mucicola parmi les Tetrahymenina, dans la famille des Glaucomidae.     

DISCUSSION PAPER

C.-F. Burman and C. Sonesson              664
Les plans adaptatifs permettent, en cours d'étude, de modifier le plan d'expérience initial de façon importante. La taille de l'échantillon, en particulier, peut être réévaluée au vu de données intermédiaires ou d'informations extérieures à l'essai. Dans les plans adaptatifs standard, on associe ces modifications à un test pondéré qui garantit le contrôle de l'erreur de première espèce. Cette méthode, cependant, viole des principes de base de la statistique inférentielle. C'est ainsi que, dans un exemple portant sur des données indépendantes issues de la loi normale N (μ, 1), un test adaptatif peut rejeter l'hypothèse nulle μ≤ 0, alors même que la moyenne des observations est négative. Nous en concluons que les plans adaptatifs, au moins dans leur forme la plus générale où l'on recourt à un test pondéré, ne sont pas valides. Nous discutons plusieurs modifications possibles de cette méthodologie des plans adaptatifs, en nous concentrant sur la recherche de solutions satisfaisantes quant aux tests d'hypothèses.     

Islam, politics, anthropology

In this paper, we consider anthropology's long and, at times, problematic engagement with the study of Islam and Muslim societies. Specifically, we reflect critically on ongoing anthropological debates about the relationship between Islam and politics and suggest new terms of analysis. Although we pay attention to the state and formal politics, involving various social actors and organizations, we are also interested in everyday politics and micropolitics, arenas where anthropology proves especially adept. It is at the intersection of these multiple levels and where the field of politics is constituted in practice that we situate the analytical focus of the anthropology of Islam and politics in this Special Issue of the Journal of the Royal Anthropological Institute .  

Résumé

Les auteurs s'intéressent ici à la longue, et parfois problématique histoire, de l'étude de l'islam et des sociétés musulmanes par l'anthropologie. L'accent est mis plus précisément sur une réflexion critique relative aux débats anthropologiques actuels sur les liens entre islam et politique, et sur l'exploration de nouveaux termes d'analyse. Tout en prêtant de l'attention à l'État et aux institutions politiques, impliquant différents acteurs sociaux et organisations, nous nous intéressons également à la politique au quotidien et à la micropolitique, domaines dans lesquels l'anthropologie s'avère particulièrement compétente. C'est à l'intersection de ces multiples niveaux, et là où le champ du politique est constitué dans la pratique, que nous situons le point focal de l'analyse anthropologique de l'islam et du politique dans ce numéro spécial du Journal of the Royal Anthropological Institute .     

Les cellules immunitaires hepatiques de muges juvéniles (Liza sp.; Mugilidae; Teleostei): Approche ultrastructurale

La caracterisation ultrastructurale des cellules immunitaires hépatiques de juvéniles de muges ( Liza sp.) permet de distinguer des petits lymphocytes et des cellules appartenant à la lignée monocytaire (monocytes, macrophages, mélano-macrophages). Ces cellules immunitaires présentent des caractéristiques morphologiues comparables à celles observées chez divers chondrichthyens et téléostéens. Les macrophages manifestent la plus forte capacité phagocytaire. Les centres mélano-macrophages (CMM) sont essentiellement constirués de macrophages contenant des résidus d'origine hépatocytaire (corps résiduels à lipofuchsines). La structure et la taille des CMM reflètent l'activité non spécifique de phaocytose des macrophages en relation avec différents états physiologiques du Poisson. L'utilisation de ces critères, comme indicateurs de l'état sanitaire des muges juvéniles dans les milieux margino-littoraux plus fortement contamin i s, devrait être entreprise.     

Being and place: movement, ancestors, and personhood in East Java, Indonesia

This article is about the transformation of the frontier character of East Java and the impact that such a transformation and the migrations that precipitated it have on forms of personhood in a specific locality. Within this context, it enquires into the capacities of human subjects to create place and the capacity of place to create persons. In particular, it looks at the ways in which memories, kinship, and ritual practices are spatialized and the manner in which such practices, once solidified and coagulated into topographies that map social relations, give rise to particular conceptions of place and personhood as mutually constituting and equally fluid and alterable.  

Résumé

L'auteur traite de la transformation du caractère de frontière de l'est de Java et de l'impact de cette transformation et des migrations qui l'ont suscitée sur la notion de personne dans une localité spécifique. Dans ce contexte, il étudie la capacité des êtres humains à créer des lieux et la capacité des lieux à créer des personnes. Il examine en particulier la manière dont les souvenirs, la parenté et les pratiques rituelles sont spatialisés et dont ces pratiques, une fois agglomérées dans des topographies représentant les relations sociales, suscitent des conceptions particulières du lieu et de la personne comme constitutifs l'un de l'autre et tout aussi mouvants et changeant l'un que l'autre.     

CONSULTANT'S FORUM

Time-Varying Coefficient Models for the Analysis of Air Pollution and Health Outcome Data
Nous présentons un modèle à coefficient dépendant du temps pour étudier la relation entre exposition aiguë (à court terme) à la pollution atmosphérique et altérations de la santé. Ce modèle permet au risque relatif de varier en fonction du temps comme cela peut se produire en cas d'interaction avec la température ou de modification de la composition en polluants, par exemple en particules solides. Le modèle fournit une estimation lissée de ces effets dépendant du temps sans qu'il soit nécessaire de spécifier une forme paramétrique particulière. Cette forme est estimée à partir des données à l'aide de fonctions spline cubiques pénalisées. Nous développons des modèles de régression de Poisson dont les coefficients sont estimés soit en maximisant une quasi-vraisemblance par une procédure itérative de moindres carrés repondérés, soit par une approche bayésienne utilisant une méthode de Monte Carlo par chaîne de Markov (MCMC). L'efficacité de ces approches pour estimer différents effets dépendant du temps est évaluée par simulations et les modèles sont appliqués aux données recueillies dans quatre villes pour l'enquête NMMAPS (Enquête Nationale Morbidité, Mortalité et Pollution Atmosphérique).