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Towards an improved apple reference transcriptome using RNA-seq 总被引:2,自引:0,他引:2
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Next-generation transcriptome assembly 总被引:1,自引:0,他引:1
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Jongeneel CV 《Briefings in bioinformatics》2000,1(1):76-92
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转录本组装是基于第二代测序技术研究转录组的关键环节,其质量好坏直接影响到下游结果的可靠性,也是目前的研究热点与难点。转录本组装方法可以分为Genome-guided和de novo两类,它们在理论基础与算法实现方面各有优劣。转录本组装质量的高低依赖于PCR扩增错误率、第二代测序技术准确率、组装算法和参考基因组完整性等方面,而现有的算法还无法完全处理由这些因素带来的影响。本文从转录本组装方法与软件、影响组装质量的因素和对组装质量的评价指标等方面进行讨论,以期能指导纯生物学家对分析软件的选择。 相似文献
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PacBio Sequencing and Its Applications 总被引:2,自引:0,他引:2
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